MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 80127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_006511	ACG	2	6	639218	639223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412804
11502	NC_006511	TTG	2	6	639243	639248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412804
11503	NC_006511	GGGC	2	8	639262	639269	0 %	0 %	75 %	25 %	56412804
11504	NC_006511	CAG	2	6	639306	639311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412804
11505	NC_006511	GC	3	6	639329	639334	0 %	0 %	50 %	50 %	56412804
11506	NC_006511	CCG	2	6	639377	639382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412804
11507	NC_006511	CCG	2	6	639439	639444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412804
11508	NC_006511	CAG	2	6	639462	639467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412804
11509	NC_006511	CGT	3	9	639486	639494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412804
11510	NC_006511	CAGG	2	8	639495	639502	25 %	0 %	50 %	25 %	56412804
11511	NC_006511	CGA	2	6	639598	639603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412804
11512	NC_006511	TGC	2	6	639635	639640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412804
11513	NC_006511	ATA	2	6	639667	639672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412804
11514	NC_006511	GCG	2	6	639675	639680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412804
11515	NC_006511	CAG	2	6	639738	639743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412804
11516	NC_006511	CTGTC	2	10	639778	639787	0 %	40 %	20 %	40 %	56412804
11517	NC_006511	CCA	2	6	639836	639841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412804
11518	NC_006511	CGG	2	6	639858	639863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412804
11519	NC_006511	CGC	2	6	639899	639904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412804
11520	NC_006511	TGC	2	6	639930	639935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412804
11521	NC_006511	GAT	2	6	639969	639974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412804
11522	NC_006511	CCT	2	6	639986	639991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56412804
11523	NC_006511	CCG	2	6	640013	640018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412804
11524	NC_006511	GCT	2	6	640026	640031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412804
11525	NC_006511	CAT	2	6	640034	640039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412804
11526	NC_006511	GGC	2	6	640080	640085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412804
11527	NC_006511	GGT	2	6	640086	640091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412804
11528	NC_006511	ACC	2	6	640141	640146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412804
11529	NC_006511	T	7	7	640152	640158	0 %	100 %	0 %	0 %	56412804
11530	NC_006511	GCG	2	6	640165	640170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412804
11531	NC_006511	TGA	2	6	640197	640202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459642547
11532	NC_006511	CGCT	2	8	640269	640276	0 %	25 %	25 %	50 %	459642547
11533	NC_006511	ATA	2	6	640322	640327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459642547
11534	NC_006511	GCGCG	2	10	640339	640348	0 %	0 %	60 %	40 %	459642547
11535	NC_006511	ACG	2	6	640471	640476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459642547
11536	NC_006511	TGG	2	6	640515	640520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459642547
11537	NC_006511	CTGCG	2	10	640523	640532	0 %	20 %	40 %	40 %	459642547
11538	NC_006511	GGC	2	6	640535	640540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	459642547
11539	NC_006511	GCG	2	6	640541	640546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	459642547
11540	NC_006511	GCG	2	6	640590	640595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	459642547
11541	NC_006511	GC	3	6	640648	640653	0 %	0 %	50 %	50 %	459642547
11542	NC_006511	TCC	2	6	640655	640660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	459642547
11543	NC_006511	GAC	2	6	640742	640747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459642547
11544	NC_006511	CGG	2	6	640915	640920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	459642547
11545	NC_006511	ATCGAC	2	12	641012	641023	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	459642547
11546	NC_006511	TCG	2	6	641097	641102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459642547
11547	NC_006511	ACGGCA	2	12	641160	641171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459642547
11548	NC_006511	ATTG	2	8	641173	641180	25 %	50 %	25 %	0 %	459642547
11549	NC_006511	CGC	2	6	641198	641203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	459642547
11550	NC_006511	GTT	2	6	641229	641234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459642547
11551	NC_006511	GCA	2	6	641265	641270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459642547
11552	NC_006511	CAT	2	6	641318	641323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459642547
11553	NC_006511	TTA	2	6	641641	641646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412806
11554	NC_006511	AAAC	2	8	641648	641655	75 %	0 %	0 %	25 %	56412806
11555	NC_006511	TTA	2	6	641686	641691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412806
11556	NC_006511	GGC	2	6	641759	641764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412806
11557	NC_006511	AGC	2	6	641773	641778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412806
11558	NC_006511	ATA	2	6	641827	641832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412806
11559	NC_006511	CCTG	2	8	641833	641840	0 %	25 %	25 %	50 %	56412806
11560	NC_006511	A	7	7	642003	642009	100 %	0 %	0 %	0 %	56412806
11561	NC_006511	TCAA	2	8	642039	642046	50 %	25 %	0 %	25 %	56412806
11562	NC_006511	A	6	6	642119	642124	100 %	0 %	0 %	0 %	56412806
11563	NC_006511	GCG	2	6	642130	642135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412806
11564	NC_006511	ATGC	2	8	642171	642178	25 %	25 %	25 %	25 %	56412806
11565	NC_006511	TAA	2	6	642272	642277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412807
11566	NC_006511	TG	3	6	642293	642298	0 %	50 %	50 %	0 %	56412807
11567	NC_006511	TTC	2	6	642332	642337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412807
11568	NC_006511	TCG	2	6	642366	642371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412807
11569	NC_006511	AT	3	6	642379	642384	50 %	50 %	0 %	0 %	56412807
11570	NC_006511	TCT	2	6	642432	642437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412807
11571	NC_006511	GTC	2	6	642470	642475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412807
11572	NC_006511	TCC	2	6	642525	642530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56412807
11573	NC_006511	CGC	2	6	642580	642585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412807
11574	NC_006511	CGC	2	6	642613	642618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412807
11575	NC_006511	CAG	2	6	642638	642643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412807
11576	NC_006511	CAT	2	6	642652	642657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412807
11577	NC_006511	TGCT	2	8	642952	642959	0 %	50 %	25 %	25 %	56412808
11578	NC_006511	A	7	7	642976	642982	100 %	0 %	0 %	0 %	56412808
11579	NC_006511	ATT	2	6	642987	642992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412808
11580	NC_006511	GGCG	2	8	643053	643060	0 %	0 %	75 %	25 %	56412808
11581	NC_006511	GAT	3	9	643138	643146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412808
11582	NC_006511	GCT	2	6	643194	643199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412808
11583	NC_006511	CGG	2	6	643209	643214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412808
11584	NC_006511	GCG	2	6	643258	643263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412808
11585	NC_006511	CGG	2	6	643269	643274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412808
11586	NC_006511	TAT	3	9	643321	643329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412808
11587	NC_006511	GAA	2	6	643366	643371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412808
11588	NC_006511	GC	3	6	643382	643387	0 %	0 %	50 %	50 %	56412808
11589	NC_006511	GCC	2	6	643696	643701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412809
11590	NC_006511	TGGC	2	8	643702	643709	0 %	25 %	50 %	25 %	56412809
11591	NC_006511	T	6	6	643713	643718	0 %	100 %	0 %	0 %	56412809
11592	NC_006511	TCA	2	6	643722	643727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412809
11593	NC_006511	GAT	2	6	643852	643857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412809
11594	NC_006511	GC	3	6	643862	643867	0 %	0 %	50 %	50 %	56412809
11595	NC_006511	CGC	2	6	643869	643874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412809
11596	NC_006511	CAG	2	6	643942	643947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412809
11597	NC_006511	CTGC	2	8	643990	643997	0 %	25 %	25 %	50 %	56412809
11598	NC_006511	TAA	2	6	644013	644018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412809
11599	NC_006511	TCGG	2	8	644020	644027	0 %	25 %	50 %	25 %	56412809
11600	NC_006511	TGG	2	6	644108	644113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412809
11601	NC_006511	CG	4	8	644137	644144	0 %	0 %	50 %	50 %	56412809
11602	NC_006511	GCC	2	6	644160	644165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412809
11603	NC_006511	GCC	2	6	644238	644243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412809
11604	NC_006511	TCA	2	6	644266	644271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412809
11605	NC_006511	CCGGC	2	10	644297	644306	0 %	0 %	40 %	60 %	56412809
11606	NC_006511	CGC	2	6	644410	644415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412809
11607	NC_006511	GAGC	2	8	644445	644452	25 %	0 %	50 %	25 %	56412809
11608	NC_006511	GAC	2	6	644562	644567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412809
11609	NC_006511	GCA	2	6	644576	644581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412809
11610	NC_006511	AGG	2	6	644717	644722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56412809
11611	NC_006511	GAT	2	6	644730	644735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412809
11612	NC_006511	TGC	2	6	644747	644752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412809
11613	NC_006511	CAT	2	6	644819	644824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412809
11614	NC_006511	CG	3	6	645135	645140	0 %	0 %	50 %	50 %	56412810
11615	NC_006511	ATT	2	6	645166	645171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412810
11616	NC_006511	CTG	2	6	645205	645210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412810
11617	NC_006511	TGAA	2	8	645212	645219	50 %	25 %	25 %	0 %	56412810
11618	NC_006511	TTA	2	6	645236	645241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412810
11619	NC_006511	ATC	2	6	645248	645253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412810
11620	NC_006511	ACT	2	6	645260	645265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412810
11621	NC_006511	GATG	2	8	645354	645361	25 %	25 %	50 %	0 %	56412810
11622	NC_006511	GCT	2	6	645369	645374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412810
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11625	NC_006511	CTG	2	6	645505	645510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412810
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11657	NC_006511	TGG	2	6	646833	646838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412811
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11721	NC_006511	CTATTT	2	12	650149	650160	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	56412815
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11725	NC_006511	TGAT	2	8	650289	650296	25 %	50 %	25 %	0 %	56412815
11726	NC_006511	T	7	7	650296	650302	0 %	100 %	0 %	0 %	56412815
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11730	NC_006511	ATT	2	6	650593	650598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412816
11731	NC_006511	ATT	2	6	650608	650613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412816
11732	NC_006511	AT	3	6	650625	650630	50 %	50 %	0 %	0 %	56412816
11733	NC_006511	TAT	3	9	650654	650662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412816
11734	NC_006511	GAC	2	6	651061	651066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412817
11735	NC_006511	CT	3	6	651080	651085	0 %	50 %	0 %	50 %	56412817
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11739	NC_006511	T	6	6	651249	651254	0 %	100 %	0 %	0 %	56412817
11740	NC_006511	CGCAA	2	10	651413	651422	40 %	0 %	20 %	40 %	56412817
11741	NC_006511	CGC	2	6	651549	651554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412817
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11743	NC_006511	CGC	2	6	651697	651702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412817
11744	NC_006511	GCG	2	6	651718	651723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412817
11745	NC_006511	GCG	2	6	651754	651759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412817
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11764	NC_006511	GCC	2	6	652602	652607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412818
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11774	NC_006511	CGA	2	6	652988	652993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412818
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11852	NC_006511	CTG	2	6	656592	656597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412820
11853	NC_006511	TGA	2	6	656605	656610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412820
11854	NC_006511	CAT	2	6	656625	656630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412820
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11856	NC_006511	GCG	2	6	656729	656734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412821
11857	NC_006511	GGC	2	6	656739	656744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412821
11858	NC_006511	TGA	2	6	656858	656863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412821
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11861	NC_006511	TGAC	2	8	656912	656919	25 %	25 %	25 %	25 %	56412821
11862	NC_006511	A	6	6	657037	657042	100 %	0 %	0 %	0 %	56412821
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11991	NC_006511	CAG	2	6	664367	664372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412827
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