MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 80127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_006511	GGT	3	9	614987	614995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412780
11002	NC_006511	CG	3	6	615031	615036	0 %	0 %	50 %	50 %	56412780
11003	NC_006511	CGC	2	6	615041	615046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412780
11004	NC_006511	TGG	2	6	615070	615075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412780
11005	NC_006511	TCA	2	6	615157	615162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412780
11006	NC_006511	CG	3	6	615174	615179	0 %	0 %	50 %	50 %	56412780
11007	NC_006511	CTT	2	6	615185	615190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412780
11008	NC_006511	CTA	2	6	615209	615214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412780
11009	NC_006511	GCTGGC	2	12	615241	615252	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	56412780
11010	NC_006511	TGGAC	2	10	615289	615298	20 %	20 %	40 %	20 %	56412780
11011	NC_006511	GCC	2	6	615330	615335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412780
11012	NC_006511	CGC	2	6	615362	615367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412780
11013	NC_006511	GC	3	6	615405	615410	0 %	0 %	50 %	50 %	56412780
11014	NC_006511	GC	3	6	615443	615448	0 %	0 %	50 %	50 %	56412780
11015	NC_006511	AACC	2	8	615522	615529	50 %	0 %	0 %	50 %	56412780
11016	NC_006511	GGC	2	6	615615	615620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412780
11017	NC_006511	GCGT	2	8	615643	615650	0 %	25 %	50 %	25 %	56412780
11018	NC_006511	TTGA	2	8	615651	615658	25 %	50 %	25 %	0 %	56412780
11019	NC_006511	ATT	2	6	615679	615684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412780
11020	NC_006511	ACC	2	6	615745	615750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412780
11021	NC_006511	CGA	2	6	615761	615766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412780
11022	NC_006511	CGG	2	6	615829	615834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412780
11023	NC_006511	TGC	2	6	615836	615841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412780
11024	NC_006511	CG	3	6	615865	615870	0 %	0 %	50 %	50 %	56412780
11025	NC_006511	GGCAG	2	10	615932	615941	20 %	0 %	60 %	20 %	56412780
11026	NC_006511	CTGG	2	8	615981	615988	0 %	25 %	50 %	25 %	56412780
11027	NC_006511	CG	3	6	615989	615994	0 %	0 %	50 %	50 %	56412780
11028	NC_006511	CAA	2	6	616017	616022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412780
11029	NC_006511	CTG	2	6	616055	616060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412781
11030	NC_006511	GGT	2	6	616075	616080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412781
11031	NC_006511	CTG	2	6	616085	616090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412781
11032	NC_006511	GTC	2	6	616094	616099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412781
11033	NC_006511	CGT	2	6	616130	616135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412781
11034	NC_006511	CTG	2	6	616136	616141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412781
11035	NC_006511	GCTC	2	8	616188	616195	0 %	25 %	25 %	50 %	56412781
11036	NC_006511	AGA	2	6	616231	616236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412781
11037	NC_006511	GAT	2	6	616282	616287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412781
11038	NC_006511	GCT	3	9	616300	616308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412781
11039	NC_006511	GTG	2	6	616343	616348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412781
11040	NC_006511	TTC	2	6	616373	616378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412781
11041	NC_006511	TGA	2	6	616380	616385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412781
11042	NC_006511	CAA	3	9	616432	616440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412781
11043	NC_006511	GCT	2	6	616447	616452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412781
11044	NC_006511	GC	3	6	616462	616467	0 %	0 %	50 %	50 %	56412781
11045	NC_006511	GTG	2	6	616520	616525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412781
11046	NC_006511	GTCACC	2	12	616641	616652	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	56412781
11047	NC_006511	TTC	2	6	616730	616735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412781
11048	NC_006511	GTT	2	6	616783	616788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412781
11049	NC_006511	TGGC	2	8	616795	616802	0 %	25 %	50 %	25 %	56412781
11050	NC_006511	TTC	2	6	616850	616855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412781
11051	NC_006511	ATG	3	9	616856	616864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412781
11052	NC_006511	CGT	2	6	616881	616886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412781
11053	NC_006511	CCGCGT	2	12	616889	616900	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	56412781
11054	NC_006511	TGCC	2	8	616934	616941	0 %	25 %	25 %	50 %	56412781
11055	NC_006511	TCA	2	6	616950	616955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412781
11056	NC_006511	CGG	2	6	616968	616973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412781
11057	NC_006511	ATT	2	6	617028	617033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412782
11058	NC_006511	GAT	2	6	617067	617072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412782
11059	NC_006511	CG	3	6	617165	617170	0 %	0 %	50 %	50 %	56412782
11060	NC_006511	TG	3	6	617207	617212	0 %	50 %	50 %	0 %	56412782
11061	NC_006511	TC	3	6	617237	617242	0 %	50 %	0 %	50 %	56412782
11062	NC_006511	TCT	2	6	617312	617317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412782
11063	NC_006511	GAA	2	6	617329	617334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412782
11064	NC_006511	CTG	2	6	617422	617427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412782
11065	NC_006511	TCCGG	2	10	617431	617440	0 %	20 %	40 %	40 %	56412782
11066	NC_006511	AAGCC	2	10	617519	617528	40 %	0 %	20 %	40 %	56412782
11067	NC_006511	TGT	2	6	617652	617657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412783
11068	NC_006511	CAT	2	6	617752	617757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412783
11069	NC_006511	GTG	2	6	617774	617779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412783
11070	NC_006511	ATG	2	6	617780	617785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412783
11071	NC_006511	CGG	2	6	617794	617799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412783
11072	NC_006511	CGG	2	6	617853	617858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412783
11073	NC_006511	TGC	3	9	618003	618011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412783
11074	NC_006511	TGG	3	9	618021	618029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412783
11075	NC_006511	GTCG	2	8	618038	618045	0 %	25 %	50 %	25 %	56412783
11076	NC_006511	CG	3	6	618089	618094	0 %	0 %	50 %	50 %	56412783
11077	NC_006511	GGA	2	6	618106	618111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56412783
11078	NC_006511	GC	3	6	618112	618117	0 %	0 %	50 %	50 %	56412783
11079	NC_006511	AC	3	6	618130	618135	50 %	0 %	0 %	50 %	56412784
11080	NC_006511	CCG	2	6	618189	618194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412784
11081	NC_006511	CTG	2	6	618199	618204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412784
11082	NC_006511	TGC	2	6	618356	618361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412784
11083	NC_006511	ATT	2	6	618438	618443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412785
11084	NC_006511	ATTG	2	8	618449	618456	25 %	50 %	25 %	0 %	56412785
11085	NC_006511	CTG	2	6	618465	618470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412785
11086	NC_006511	TC	3	6	618475	618480	0 %	50 %	0 %	50 %	56412785
11087	NC_006511	TC	3	6	618500	618505	0 %	50 %	0 %	50 %	56412785
11088	NC_006511	GGC	2	6	618536	618541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412785
11089	NC_006511	GGAT	2	8	618562	618569	25 %	25 %	50 %	0 %	56412785
11090	NC_006511	TTC	2	6	618570	618575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412785
11091	NC_006511	CAGC	2	8	618596	618603	25 %	0 %	25 %	50 %	56412785
11092	NC_006511	GTCG	2	8	618620	618627	0 %	25 %	50 %	25 %	56412785
11093	NC_006511	CT	3	6	618681	618686	0 %	50 %	0 %	50 %	56412785
11094	NC_006511	CTT	2	6	618761	618766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412785
11095	NC_006511	TGG	2	6	618796	618801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412785
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11097	NC_006511	GAA	2	6	618899	618904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412785
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11100	NC_006511	TGC	2	6	619078	619083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412785
11101	NC_006511	GCG	2	6	619087	619092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412785
11102	NC_006511	CGGT	2	8	619093	619100	0 %	25 %	50 %	25 %	56412785
11103	NC_006511	CGC	2	6	619178	619183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412785
11104	NC_006511	CCG	2	6	619195	619200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412785
11105	NC_006511	GCAC	2	8	619215	619222	25 %	0 %	25 %	50 %	56412785
11106	NC_006511	TGA	2	6	619237	619242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412785
11107	NC_006511	TGG	2	6	619261	619266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412785
11108	NC_006511	TAT	2	6	619268	619273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412785
11109	NC_006511	CGC	2	6	619304	619309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412785
11110	NC_006511	CCA	2	6	619348	619353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412785
11111	NC_006511	GCG	2	6	619404	619409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412785
11112	NC_006511	TGA	2	6	619420	619425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412785
11113	NC_006511	CTT	2	6	619433	619438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412785
11114	NC_006511	GCT	2	6	619445	619450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412785
11115	NC_006511	GAACA	2	10	619491	619500	60 %	0 %	20 %	20 %	56412785
11116	NC_006511	TGG	2	6	619555	619560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412785
11117	NC_006511	G	6	6	619559	619564	0 %	0 %	100 %	0 %	56412785
11118	NC_006511	CTT	2	6	619601	619606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412785
11119	NC_006511	CTGG	2	8	619623	619630	0 %	25 %	50 %	25 %	56412785
11120	NC_006511	TGG	2	6	619660	619665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412785
11121	NC_006511	GAT	2	6	619709	619714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412785
11122	NC_006511	TCATGC	2	12	619745	619756	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	56412785
11123	NC_006511	CCA	2	6	619772	619777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412785
11124	NC_006511	TGA	2	6	619795	619800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412785
11125	NC_006511	GC	3	6	619819	619824	0 %	0 %	50 %	50 %	56412785
11126	NC_006511	GCC	2	6	619832	619837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412785
11127	NC_006511	TGC	2	6	619849	619854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412785
11128	NC_006511	AACTG	2	10	619862	619871	40 %	20 %	20 %	20 %	56412785
11129	NC_006511	GT	3	6	619882	619887	0 %	50 %	50 %	0 %	56412785
11130	NC_006511	TGGCTG	2	12	619944	619955	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	56412785
11131	NC_006511	ACGC	2	8	619961	619968	25 %	0 %	25 %	50 %	56412785
11132	NC_006511	GC	3	6	619990	619995	0 %	0 %	50 %	50 %	56412785
11133	NC_006511	CTG	2	6	620004	620009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412785
11134	NC_006511	TGG	2	6	620016	620021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412785
11135	NC_006511	GCT	2	6	620090	620095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412785
11136	NC_006511	TGA	2	6	620119	620124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412785
11137	NC_006511	GCT	2	6	620237	620242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412785
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11141	NC_006511	CCG	2	6	620679	620684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412786
11142	NC_006511	GCT	2	6	620770	620775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412786
11143	NC_006511	TGG	2	6	620778	620783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412786
11144	NC_006511	CTT	2	6	620851	620856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412786
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11149	NC_006511	TTC	2	6	621029	621034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412786
11150	NC_006511	GCT	2	6	621136	621141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412786
11151	NC_006511	CTG	2	6	621173	621178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412786
11152	NC_006511	CTT	2	6	621187	621192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412786
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11154	NC_006511	TGGC	2	8	621232	621239	0 %	25 %	50 %	25 %	56412786
11155	NC_006511	CCG	2	6	621267	621272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412786
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11157	NC_006511	CTG	2	6	621320	621325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412786
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11160	NC_006511	GAT	2	6	621541	621546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412786
11161	NC_006511	TG	3	6	621582	621587	0 %	50 %	50 %	0 %	56412786
11162	NC_006511	ATG	2	6	621626	621631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412786
11163	NC_006511	GGC	2	6	621632	621637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412786
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11165	NC_006511	GAT	2	6	621766	621771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412786
11166	NC_006511	TGC	2	6	621825	621830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412786
11167	NC_006511	GCCA	2	8	621866	621873	25 %	0 %	25 %	50 %	56412786
11168	NC_006511	TGG	2	6	621921	621926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412786
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11175	NC_006511	CTG	2	6	622397	622402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459642546
11176	NC_006511	CGCT	2	8	622496	622503	0 %	25 %	25 %	50 %	459642546
11177	NC_006511	CCG	3	9	622533	622541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	459642546
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11183	NC_006511	GC	3	6	622743	622748	0 %	0 %	50 %	50 %	459642546
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11200	NC_006511	AG	3	6	623722	623727	50 %	0 %	50 %	0 %	56412788
11201	NC_006511	AAC	2	6	623818	623823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412788
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11203	NC_006511	TC	3	6	623974	623979	0 %	50 %	0 %	50 %	56412788
11204	NC_006511	CG	3	6	624049	624054	0 %	0 %	50 %	50 %	56412788
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11209	NC_006511	CGG	2	6	624267	624272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412788
11210	NC_006511	ATA	2	6	624299	624304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412788
11211	NC_006511	GC	3	6	624340	624345	0 %	0 %	50 %	50 %	56412788
11212	NC_006511	ATCA	2	8	624409	624416	50 %	25 %	0 %	25 %	56412788
11213	NC_006511	GCG	2	6	624456	624461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412788
11214	NC_006511	TGCC	2	8	624468	624475	0 %	25 %	25 %	50 %	56412788
11215	NC_006511	CAG	2	6	624580	624585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412788
11216	NC_006511	TCA	2	6	624620	624625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412788
11217	NC_006511	TCC	2	6	624910	624915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56412789
11218	NC_006511	GGC	2	6	624975	624980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412789
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11220	NC_006511	CGGGC	2	10	625113	625122	0 %	0 %	60 %	40 %	56412789
11221	NC_006511	GC	3	6	625157	625162	0 %	0 %	50 %	50 %	56412789
11222	NC_006511	CAA	2	6	625178	625183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412789
11223	NC_006511	CGT	2	6	625244	625249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412789
11224	NC_006511	TTC	2	6	625272	625277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412789
11225	NC_006511	CACG	2	8	625337	625344	25 %	0 %	25 %	50 %	56412789
11226	NC_006511	GAT	2	6	625424	625429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412789
11227	NC_006511	CGC	2	6	625511	625516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412789
11228	NC_006511	TAA	2	6	625560	625565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412789
11229	NC_006511	A	7	7	625615	625621	100 %	0 %	0 %	0 %	56412789
11230	NC_006511	CAT	2	6	625688	625693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412790
11231	NC_006511	CCA	2	6	625712	625717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412790
11232	NC_006511	TGCGC	2	10	625759	625768	0 %	20 %	40 %	40 %	56412790
11233	NC_006511	TGGATG	2	12	625801	625812	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	56412790
11234	NC_006511	GAT	2	6	625815	625820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412790
11235	NC_006511	TGG	2	6	625867	625872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412790
11236	NC_006511	GGC	2	6	626002	626007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412790
11237	NC_006511	GGCGCA	2	12	626036	626047	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	56412790
11238	NC_006511	GGTTT	2	10	626068	626077	0 %	60 %	40 %	0 %	56412790
11239	NC_006511	TCA	2	6	626141	626146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412790
11240	NC_006511	AAACCG	2	12	626152	626163	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	56412790
11241	NC_006511	GAGAAT	2	12	626198	626209	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	56412791
11242	NC_006511	TGA	3	9	626237	626245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412791
11243	NC_006511	CCG	2	6	626299	626304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412791
11244	NC_006511	CG	3	6	626331	626336	0 %	0 %	50 %	50 %	56412791
11245	NC_006511	TAT	2	6	626388	626393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412791
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11251	NC_006511	GCCA	2	8	626746	626753	25 %	0 %	25 %	50 %	56412792
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11353	NC_006511	TCAG	2	8	631443	631450	25 %	25 %	25 %	25 %	56412796
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11364	NC_006511	GCC	2	6	632042	632047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412796
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11473	NC_006511	CTG	2	6	637600	637605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412803
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11485	NC_006511	GC	3	6	638379	638384	0 %	0 %	50 %	50 %	56412803
11486	NC_006511	GA	3	6	638409	638414	50 %	0 %	50 %	0 %	56412803
11487	NC_006511	GC	3	6	638436	638441	0 %	0 %	50 %	50 %	56412803
11488	NC_006511	CCGC	2	8	638529	638536	0 %	0 %	25 %	75 %	56412803
11489	NC_006511	GCG	2	6	638596	638601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412803
11490	NC_006511	ATA	2	6	638605	638610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412803
11491	NC_006511	TGG	2	6	638661	638666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412803
11492	NC_006511	GC	3	6	638689	638694	0 %	0 %	50 %	50 %	56412803
11493	NC_006511	ATG	2	6	638710	638715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412803
11494	NC_006511	TC	3	6	638769	638774	0 %	50 %	0 %	50 %	56412803
11495	NC_006511	TTTCGC	2	12	638817	638828	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	56412803
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11499	NC_006511	GCC	2	6	639050	639055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412803
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