MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 80127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_006511	TGCG	2	8	589038	589045	0 %	25 %	50 %	25 %	56412757
10502	NC_006511	TCG	2	6	589074	589079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412757
10503	NC_006511	ATG	2	6	589083	589088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412757
10504	NC_006511	CGT	2	6	589112	589117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412757
10505	NC_006511	T	6	6	589132	589137	0 %	100 %	0 %	0 %	56412757
10506	NC_006511	GGC	2	6	589163	589168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412757
10507	NC_006511	TGA	2	6	589180	589185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412757
10508	NC_006511	CGC	2	6	589205	589210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412757
10509	NC_006511	GAA	2	6	589217	589222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412757
10510	NC_006511	GC	3	6	589299	589304	0 %	0 %	50 %	50 %	56412757
10511	NC_006511	GT	3	6	589361	589366	0 %	50 %	50 %	0 %	56412757
10512	NC_006511	GGA	2	6	589378	589383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56412757
10513	NC_006511	CG	3	6	589390	589395	0 %	0 %	50 %	50 %	56412757
10514	NC_006511	TGA	2	6	589399	589404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412757
10515	NC_006511	GCGCTG	2	12	589427	589438	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	56412757
10516	NC_006511	AGC	2	6	589509	589514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412758
10517	NC_006511	CATA	2	8	589522	589529	50 %	25 %	0 %	25 %	56412758
10518	NC_006511	TGG	2	6	589632	589637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412758
10519	NC_006511	CGG	2	6	589642	589647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412758
10520	NC_006511	ACC	2	6	589685	589690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412758
10521	NC_006511	CCG	2	6	589714	589719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412758
10522	NC_006511	CGC	2	6	589740	589745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412758
10523	NC_006511	GGC	2	6	589838	589843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412758
10524	NC_006511	TGG	2	6	589877	589882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412758
10525	NC_006511	AGC	2	6	589949	589954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412758
10526	NC_006511	CGC	2	6	590137	590142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412758
10527	NC_006511	CAG	2	6	590158	590163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412758
10528	NC_006511	AGC	2	6	590171	590176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412758
10529	NC_006511	TTG	2	6	590245	590250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412758
10530	NC_006511	GAG	2	6	590318	590323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56412758
10531	NC_006511	GC	3	6	590334	590339	0 %	0 %	50 %	50 %	56412758
10532	NC_006511	GGC	2	6	590341	590346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412758
10533	NC_006511	T	6	6	590388	590393	0 %	100 %	0 %	0 %	56412758
10534	NC_006511	GCGT	2	8	590421	590428	0 %	25 %	50 %	25 %	56412758
10535	NC_006511	CTG	2	6	590869	590874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412759
10536	NC_006511	CAG	2	6	590917	590922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412759
10537	NC_006511	GCG	2	6	591032	591037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412759
10538	NC_006511	CAT	2	6	591072	591077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412759
10539	NC_006511	TAT	2	6	591078	591083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412759
10540	NC_006511	GGC	2	6	591087	591092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412759
10541	NC_006511	ATT	2	6	591138	591143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412759
10542	NC_006511	A	6	6	591180	591185	100 %	0 %	0 %	0 %	56412759
10543	NC_006511	GGA	2	6	591189	591194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56412759
10544	NC_006511	ATT	2	6	591205	591210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412759
10545	NC_006511	AAT	2	6	591299	591304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412760
10546	NC_006511	GTA	2	6	591337	591342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412760
10547	NC_006511	A	6	6	591366	591371	100 %	0 %	0 %	0 %	56412760
10548	NC_006511	TC	3	6	591416	591421	0 %	50 %	0 %	50 %	56412760
10549	NC_006511	GCCAGC	2	12	591474	591485	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	56412760
10550	NC_006511	TGG	2	6	591502	591507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412760
10551	NC_006511	CAT	2	6	591518	591523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412760
10552	NC_006511	GC	3	6	591551	591556	0 %	0 %	50 %	50 %	56412760
10553	NC_006511	AAT	2	6	591571	591576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412760
10554	NC_006511	TGT	2	6	591622	591627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459642544
10555	NC_006511	TGG	2	6	591681	591686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459642544
10556	NC_006511	A	6	6	591692	591697	100 %	0 %	0 %	0 %	459642544
10557	NC_006511	GGC	3	9	591755	591763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	459642544
10558	NC_006511	TGG	2	6	591774	591779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459642544
10559	NC_006511	TAT	2	6	591832	591837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459642544
10560	NC_006511	TAA	2	6	591841	591846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459642544
10561	NC_006511	TGG	2	6	591915	591920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459642544
10562	NC_006511	GC	3	6	591935	591940	0 %	0 %	50 %	50 %	459642544
10563	NC_006511	AT	3	6	591955	591960	50 %	50 %	0 %	0 %	459642544
10564	NC_006511	CTT	2	6	592084	592089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459642544
10565	NC_006511	TG	3	6	592197	592202	0 %	50 %	50 %	0 %	459642544
10566	NC_006511	T	6	6	592252	592257	0 %	100 %	0 %	0 %	459642544
10567	NC_006511	ATG	2	6	592289	592294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459642544
10568	NC_006511	TATC	2	8	592297	592304	25 %	50 %	0 %	25 %	459642544
10569	NC_006511	GCG	2	6	592353	592358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	459642544
10570	NC_006511	CGC	2	6	592402	592407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	459642544
10571	NC_006511	TCA	2	6	592416	592421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459642544
10572	NC_006511	CGTC	2	8	592432	592439	0 %	25 %	25 %	50 %	459642544
10573	NC_006511	CG	3	6	592498	592503	0 %	0 %	50 %	50 %	459642544
10574	NC_006511	GGT	2	6	592522	592527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459642544
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10577	NC_006511	CCTG	2	8	592630	592637	0 %	25 %	25 %	50 %	459642544
10578	NC_006511	CTT	2	6	592651	592656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459642544
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10580	NC_006511	CGC	2	6	592700	592705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	459642544
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10583	NC_006511	TGG	2	6	592911	592916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459642544
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10585	NC_006511	GC	3	6	593011	593016	0 %	0 %	50 %	50 %	56412762
10586	NC_006511	GGC	2	6	593071	593076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412762
10587	NC_006511	TGA	2	6	593120	593125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412762
10588	NC_006511	CG	3	6	593234	593239	0 %	0 %	50 %	50 %	56412762
10589	NC_006511	GCGG	2	8	593353	593360	0 %	0 %	75 %	25 %	56412762
10590	NC_006511	GCG	2	6	593385	593390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412762
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10592	NC_006511	CAC	2	6	593470	593475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412762
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10594	NC_006511	AACA	2	8	593509	593516	75 %	0 %	0 %	25 %	56412762
10595	NC_006511	GGA	2	6	593535	593540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56412762
10596	NC_006511	CG	3	6	593575	593580	0 %	0 %	50 %	50 %	56412762
10597	NC_006511	GTC	2	6	593593	593598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412762
10598	NC_006511	GAT	2	6	593611	593616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412762
10599	NC_006511	ACT	2	6	593625	593630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412762
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10602	NC_006511	CAC	2	6	593737	593742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412762
10603	NC_006511	TCA	2	6	593787	593792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412762
10604	NC_006511	CATG	2	8	593802	593809	25 %	25 %	25 %	25 %	56412762
10605	NC_006511	ATT	2	6	593903	593908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412763
10606	NC_006511	CGATGG	2	12	593934	593945	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	56412763
10607	NC_006511	GCA	2	6	593968	593973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412763
10608	NC_006511	TAT	2	6	593989	593994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412763
10609	NC_006511	CGG	3	9	594015	594023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412763
10610	NC_006511	AAC	2	6	594125	594130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412763
10611	NC_006511	CGG	2	6	594175	594180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412763
10612	NC_006511	GTA	2	6	594233	594238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412763
10613	NC_006511	CGA	2	6	594333	594338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412763
10614	NC_006511	GAT	2	6	594398	594403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412763
10615	NC_006511	TGG	2	6	594429	594434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412763
10616	NC_006511	GGC	2	6	594448	594453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412763
10617	NC_006511	GC	3	6	594452	594457	0 %	0 %	50 %	50 %	56412763
10618	NC_006511	ATCG	2	8	594515	594522	25 %	25 %	25 %	25 %	56412763
10619	NC_006511	A	6	6	594546	594551	100 %	0 %	0 %	0 %	56412763
10620	NC_006511	TGG	2	6	594621	594626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412763
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10622	NC_006511	CCG	2	6	594720	594725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412763
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10984	NC_006511	CGC	2	6	614248	614253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412780
10985	NC_006511	GC	3	6	614252	614257	0 %	0 %	50 %	50 %	56412780
10986	NC_006511	TGGT	2	8	614290	614297	0 %	50 %	50 %	0 %	56412780
10987	NC_006511	CG	4	8	614321	614328	0 %	0 %	50 %	50 %	56412780
10988	NC_006511	TGC	2	6	614362	614367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412780
10989	NC_006511	GGC	2	6	614373	614378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412780
10990	NC_006511	GC	4	8	614455	614462	0 %	0 %	50 %	50 %	56412780
10991	NC_006511	GGC	3	9	614510	614518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412780
10992	NC_006511	GAT	2	6	614616	614621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412780
10993	NC_006511	CGC	2	6	614624	614629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412780
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10995	NC_006511	GC	3	6	614661	614666	0 %	0 %	50 %	50 %	56412780
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10997	NC_006511	A	6	6	614778	614783	100 %	0 %	0 %	0 %	56412780
10998	NC_006511	GGC	2	6	614831	614836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412780
10999	NC_006511	ATG	2	6	614925	614930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412780
11000	NC_006511	GGC	2	6	614931	614936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412780

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