MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 80127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006511	CCG	2	6	28620	28625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412298
502	NC_006511	TTC	2	6	28753	28758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412298
503	NC_006511	GGCG	2	8	28759	28766	0 %	0 %	75 %	25 %	56412298
504	NC_006511	ATG	2	6	28803	28808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412298
505	NC_006511	TCG	2	6	28884	28889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412298
506	NC_006511	CCG	2	6	28938	28943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412298
507	NC_006511	A	6	6	29111	29116	100 %	0 %	0 %	0 %	56412298
508	NC_006511	ATG	2	6	29277	29282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412298
509	NC_006511	ACA	2	6	29357	29362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412298
510	NC_006511	GAC	2	6	29495	29500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412299
511	NC_006511	AAC	2	6	29623	29628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412299
512	NC_006511	ATG	2	6	29805	29810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412299
513	NC_006511	AAT	2	6	29831	29836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412299
514	NC_006511	CGG	2	6	29937	29942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412299
515	NC_006511	ATGA	2	8	29964	29971	50 %	25 %	25 %	0 %	56412299
516	NC_006511	AT	3	6	30525	30530	50 %	50 %	0 %	0 %	56412300
517	NC_006511	TGCT	2	8	30534	30541	0 %	50 %	25 %	25 %	56412300
518	NC_006511	TATC	2	8	30590	30597	25 %	50 %	0 %	25 %	56412300
519	NC_006511	GTAA	2	8	30627	30634	50 %	25 %	25 %	0 %	56412300
520	NC_006511	TGG	2	6	30677	30682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412300
521	NC_006511	CGC	2	6	30733	30738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412300
522	NC_006511	ATT	2	6	30740	30745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412300
523	NC_006511	GC	3	6	30756	30761	0 %	0 %	50 %	50 %	56412300
524	NC_006511	GGT	2	6	30779	30784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412300
525	NC_006511	CGG	2	6	30791	30796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412300
526	NC_006511	CCG	2	6	30805	30810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412300
527	NC_006511	CGC	2	6	30839	30844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412300
528	NC_006511	TTCG	2	8	30889	30896	0 %	50 %	25 %	25 %	56412300
529	NC_006511	GCA	2	6	30941	30946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412300
530	NC_006511	ATCTG	2	10	30958	30967	20 %	40 %	20 %	20 %	56412300
531	NC_006511	TTACG	2	10	31013	31022	20 %	40 %	20 %	20 %	56412300
532	NC_006511	TTA	2	6	31029	31034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412300
533	NC_006511	GC	3	6	31046	31051	0 %	0 %	50 %	50 %	56412300
534	NC_006511	TAT	2	6	31263	31268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412301
535	NC_006511	TAT	2	6	31270	31275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412301
536	NC_006511	CGC	2	6	31344	31349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412301
537	NC_006511	CGG	2	6	31382	31387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412301
538	NC_006511	GTCA	2	8	31399	31406	25 %	25 %	25 %	25 %	56412301
539	NC_006511	GGT	2	6	31425	31430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412301
540	NC_006511	CGC	2	6	31467	31472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412301
541	NC_006511	CAG	2	6	31495	31500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412301
542	NC_006511	CAA	2	6	31507	31512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412301
543	NC_006511	AGC	2	6	31561	31566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412301
544	NC_006511	GCG	2	6	31597	31602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412301
545	NC_006511	GTG	2	6	31632	31637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412301
546	NC_006511	T	6	6	31715	31720	0 %	100 %	0 %	0 %	56412301
547	NC_006511	GGC	2	6	31746	31751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412301
548	NC_006511	GGGCG	2	10	31782	31791	0 %	0 %	80 %	20 %	56412301
549	NC_006511	GCC	2	6	31903	31908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412301
550	NC_006511	AAG	2	6	31913	31918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412301
551	NC_006511	AGC	2	6	31924	31929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412301
552	NC_006511	ATG	2	6	31940	31945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412301
553	NC_006511	CTC	2	6	31948	31953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56412301
554	NC_006511	GCA	2	6	31971	31976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412301
555	NC_006511	GTC	2	6	32005	32010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412301
556	NC_006511	TGCGT	2	10	32161	32170	0 %	40 %	40 %	20 %	56412302
557	NC_006511	ACCG	2	8	32219	32226	25 %	0 %	25 %	50 %	56412302
558	NC_006511	GTT	2	6	32250	32255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412302
559	NC_006511	AGGC	2	8	32257	32264	25 %	0 %	50 %	25 %	56412302
560	NC_006511	ATA	2	6	32302	32307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412302
561	NC_006511	TAT	2	6	32327	32332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412302
562	NC_006511	ATT	2	6	32386	32391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412302
563	NC_006511	AAAAG	2	10	32555	32564	80 %	0 %	20 %	0 %	56412303
564	NC_006511	A	7	7	32575	32581	100 %	0 %	0 %	0 %	56412303
565	NC_006511	TTA	2	6	32608	32613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412303
566	NC_006511	CAG	2	6	32654	32659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412303
567	NC_006511	CCTG	2	8	32693	32700	0 %	25 %	25 %	50 %	56412303
568	NC_006511	TGT	2	6	32734	32739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412303
569	NC_006511	TCG	2	6	32745	32750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412303
570	NC_006511	CAG	2	6	32751	32756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412303
571	NC_006511	AAG	2	6	32760	32765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412303
572	NC_006511	ATC	2	6	32824	32829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412303
573	NC_006511	CGCA	2	8	32883	32890	25 %	0 %	25 %	50 %	56412303
574	NC_006511	T	6	6	32910	32915	0 %	100 %	0 %	0 %	56412303
575	NC_006511	ATT	2	6	32929	32934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412303
576	NC_006511	TAAA	2	8	32953	32960	75 %	25 %	0 %	0 %	56412303
577	NC_006511	TTA	2	6	32965	32970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412303
578	NC_006511	A	6	6	33368	33373	100 %	0 %	0 %	0 %	56412304
579	NC_006511	A	7	7	33378	33384	100 %	0 %	0 %	0 %	56412304
580	NC_006511	TTA	2	6	33418	33423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412304
581	NC_006511	GCG	2	6	33471	33476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412304
582	NC_006511	TC	3	6	33478	33483	0 %	50 %	0 %	50 %	56412304
583	NC_006511	CTT	2	6	33489	33494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412304
584	NC_006511	TTAT	2	8	33522	33529	25 %	75 %	0 %	0 %	56412304
585	NC_006511	TGA	2	6	33718	33723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412304
586	NC_006511	AT	3	6	33728	33733	50 %	50 %	0 %	0 %	56412304
587	NC_006511	A	7	7	33753	33759	100 %	0 %	0 %	0 %	56412304
588	NC_006511	ATC	2	6	33807	33812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412304
589	NC_006511	GAT	2	6	33839	33844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412304
590	NC_006511	TTTG	2	8	33876	33883	0 %	75 %	25 %	0 %	56412304
591	NC_006511	A	6	6	33895	33900	100 %	0 %	0 %	0 %	56412304
592	NC_006511	TTGG	2	8	33906	33913	0 %	50 %	50 %	0 %	56412304
593	NC_006511	A	6	6	33919	33924	100 %	0 %	0 %	0 %	56412304
594	NC_006511	TA	3	6	33931	33936	50 %	50 %	0 %	0 %	56412304
595	NC_006511	TGC	2	6	33944	33949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412304
596	NC_006511	TCT	2	6	33981	33986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412304
597	NC_006511	TTA	2	6	34052	34057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412304
598	NC_006511	GTT	2	6	34086	34091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412304
599	NC_006511	A	6	6	34093	34098	100 %	0 %	0 %	0 %	56412304
600	NC_006511	GCG	2	6	34151	34156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412304
601	NC_006511	TATAA	2	10	34158	34167	60 %	40 %	0 %	0 %	56412304
602	NC_006511	TAC	2	6	34171	34176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412304
603	NC_006511	TGA	2	6	34184	34189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412304
604	NC_006511	AAT	2	6	34190	34195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412304
605	NC_006511	A	6	6	34257	34262	100 %	0 %	0 %	0 %	56412304
606	NC_006511	CTTT	2	8	34286	34293	0 %	75 %	0 %	25 %	56412304
607	NC_006511	GAAG	2	8	34326	34333	50 %	0 %	50 %	0 %	56412304
608	NC_006511	TAAA	2	8	34378	34385	75 %	25 %	0 %	0 %	56412305
609	NC_006511	A	6	6	34414	34419	100 %	0 %	0 %	0 %	56412305
610	NC_006511	TA	3	6	34426	34431	50 %	50 %	0 %	0 %	56412305
611	NC_006511	CTT	2	6	34440	34445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412305
612	NC_006511	T	7	7	34444	34450	0 %	100 %	0 %	0 %	56412305
613	NC_006511	AGA	2	6	34453	34458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412305
614	NC_006511	ATA	2	6	34484	34489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412305
615	NC_006511	A	7	7	34530	34536	100 %	0 %	0 %	0 %	56412305
616	NC_006511	CGC	2	6	34565	34570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412305
617	NC_006511	CTT	2	6	34616	34621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412305
618	NC_006511	C	6	6	34623	34628	0 %	0 %	0 %	100 %	56412305
619	NC_006511	GTT	2	6	34644	34649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412305
620	NC_006511	T	6	6	34648	34653	0 %	100 %	0 %	0 %	56412305
621	NC_006511	ATAA	2	8	34654	34661	75 %	25 %	0 %	0 %	56412305
622	NC_006511	TTG	2	6	34666	34671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412305
623	NC_006511	AT	3	6	34685	34690	50 %	50 %	0 %	0 %	56412305
624	NC_006511	ATC	2	6	34724	34729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412305
625	NC_006511	T	6	6	34745	34750	0 %	100 %	0 %	0 %	56412305
626	NC_006511	GTGC	2	8	34777	34784	0 %	25 %	50 %	25 %	56412305
627	NC_006511	TTAA	2	8	34787	34794	50 %	50 %	0 %	0 %	56412305
628	NC_006511	ATG	2	6	34805	34810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412305
629	NC_006511	AT	3	6	35431	35436	50 %	50 %	0 %	0 %	56412306
630	NC_006511	AAC	2	6	35438	35443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412306
631	NC_006511	TGA	2	6	35544	35549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412306
632	NC_006511	TGT	2	6	35571	35576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412306
633	NC_006511	AGCGA	2	10	35581	35590	40 %	0 %	40 %	20 %	56412306
634	NC_006511	ATG	2	6	35615	35620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412306
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644	NC_006511	TCT	2	6	36030	36035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412306
645	NC_006511	TTC	2	6	36059	36064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412306
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647	NC_006511	ATT	2	6	36209	36214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412306
648	NC_006511	CGC	2	6	36221	36226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412306
649	NC_006511	GC	3	6	36239	36244	0 %	0 %	50 %	50 %	56412306
650	NC_006511	CAA	2	6	36306	36311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412306
651	NC_006511	TAT	2	6	36384	36389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412306
652	NC_006511	TTA	2	6	36430	36435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412306
653	NC_006511	GAT	3	9	36445	36453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412306
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655	NC_006511	GCA	2	6	36525	36530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412306
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658	NC_006511	TTG	2	6	36625	36630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412306
659	NC_006511	GTG	2	6	36652	36657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412306
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663	NC_006511	TA	3	6	37189	37194	50 %	50 %	0 %	0 %	56412307
664	NC_006511	CCA	2	6	37229	37234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412307
665	NC_006511	TCT	2	6	37280	37285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412307
666	NC_006511	CAA	2	6	37311	37316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412307
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756	NC_006511	TTG	2	6	45032	45037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412311
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762	NC_006511	GAC	2	6	45358	45363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412311
763	NC_006511	AGG	2	6	45431	45436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56412311
764	NC_006511	CGT	2	6	45483	45488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412311
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766	NC_006511	TGA	2	6	45558	45563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412311
767	NC_006511	CCG	2	6	45580	45585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412311
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771	NC_006511	CAG	2	6	45712	45717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412311
772	NC_006511	TGA	2	6	45756	45761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412311
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776	NC_006511	T	6	6	46174	46179	0 %	100 %	0 %	0 %	56412312
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780	NC_006511	CGC	2	6	46215	46220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412312
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782	NC_006511	TGT	2	6	46334	46339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412312
783	NC_006511	GCC	2	6	46453	46458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412312
784	NC_006511	CGG	2	6	46461	46466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412312
785	NC_006511	GAT	2	6	46467	46472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412312
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789	NC_006511	CAT	2	6	46656	46661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412312
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791	NC_006511	GGC	2	6	46713	46718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412312
792	NC_006511	GCT	2	6	46740	46745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412312
793	NC_006511	GCG	2	6	46754	46759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412312
794	NC_006511	TA	3	6	46775	46780	50 %	50 %	0 %	0 %	56412312
795	NC_006511	CGG	2	6	46805	46810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412312
796	NC_006511	CTT	2	6	46857	46862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412312
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802	NC_006511	TG	3	6	47156	47161	0 %	50 %	50 %	0 %	56412312
803	NC_006511	TTA	2	6	47225	47230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412312
804	NC_006511	GTG	2	6	47275	47280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412312
805	NC_006511	GC	4	8	47295	47302	0 %	0 %	50 %	50 %	56412312
806	NC_006511	TAT	2	6	47417	47422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412313
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822	NC_006511	CGG	2	6	48228	48233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412313
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876	NC_006511	GC	3	6	51175	51180	0 %	0 %	50 %	50 %	56412315
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880	NC_006511	TAA	2	6	51278	51283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412315
881	NC_006511	TCA	2	6	51349	51354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412315
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884	NC_006511	GC	3	6	51475	51480	0 %	0 %	50 %	50 %	56412315
885	NC_006511	GAC	2	6	51520	51525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412315
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888	NC_006511	CAG	2	6	51689	51694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412315
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