MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 80127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_006511	CTT	2	6	501653	501658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412681
9002	NC_006511	TCCA	2	8	501789	501796	25 %	25 %	0 %	50 %	56412681
9003	NC_006511	GC	3	6	501865	501870	0 %	0 %	50 %	50 %	56412681
9004	NC_006511	GTT	2	6	501912	501917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412681
9005	NC_006511	ATG	2	6	502009	502014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412681
9006	NC_006511	CCGC	2	8	502033	502040	0 %	0 %	25 %	75 %	56412681
9007	NC_006511	TGA	2	6	502046	502051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412681
9008	NC_006511	GTCAG	2	10	502096	502105	20 %	20 %	40 %	20 %	56412681
9009	NC_006511	CTT	2	6	502121	502126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412681
9010	NC_006511	ACGT	2	8	502194	502201	25 %	25 %	25 %	25 %	56412681
9011	NC_006511	TCA	2	6	502225	502230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412681
9012	NC_006511	TTC	2	6	502236	502241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412681
9013	NC_006511	CTC	2	6	502335	502340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56412681
9014	NC_006511	AGC	2	6	502348	502353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412681
9015	NC_006511	ATA	2	6	502354	502359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412681
9016	NC_006511	CTT	2	6	502376	502381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412681
9017	NC_006511	TTC	2	6	502383	502388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412681
9018	NC_006511	T	7	7	502496	502502	0 %	100 %	0 %	0 %	56412681
9019	NC_006511	TCT	2	6	502522	502527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412681
9020	NC_006511	CAG	3	9	502530	502538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412681
9021	NC_006511	GAC	2	6	502710	502715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412682
9022	NC_006511	CTT	2	6	502817	502822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412682
9023	NC_006511	AGC	2	6	502833	502838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412682
9024	NC_006511	CTT	2	6	502877	502882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412682
9025	NC_006511	TTCT	2	8	503288	503295	0 %	75 %	0 %	25 %	56412683
9026	NC_006511	AAC	2	6	503313	503318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412683
9027	NC_006511	TGA	2	6	503342	503347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412683
9028	NC_006511	GCA	2	6	503409	503414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412683
9029	NC_006511	GAA	2	6	503427	503432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412683
9030	NC_006511	GC	3	6	503468	503473	0 %	0 %	50 %	50 %	56412683
9031	NC_006511	CTT	2	6	503485	503490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412683
9032	NC_006511	CAC	2	6	503504	503509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412683
9033	NC_006511	ATCA	2	8	503513	503520	50 %	25 %	0 %	25 %	56412683
9034	NC_006511	CCAG	2	8	503598	503605	25 %	0 %	25 %	50 %	56412683
9035	NC_006511	GGT	2	6	503777	503782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412683
9036	NC_006511	T	6	6	503782	503787	0 %	100 %	0 %	0 %	56412683
9037	NC_006511	CTG	2	6	503819	503824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412683
9038	NC_006511	TTC	2	6	503861	503866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412683
9039	NC_006511	GCG	2	6	503945	503950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412683
9040	NC_006511	CG	4	8	503995	504002	0 %	0 %	50 %	50 %	56412683
9041	NC_006511	GCG	3	9	504000	504008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412683
9042	NC_006511	CCA	2	6	504049	504054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412683
9043	NC_006511	GCG	2	6	504199	504204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412683
9044	NC_006511	ATC	2	6	504656	504661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412684
9045	NC_006511	GC	3	6	504678	504683	0 %	0 %	50 %	50 %	56412684
9046	NC_006511	TGCG	2	8	504707	504714	0 %	25 %	50 %	25 %	56412684
9047	NC_006511	GC	3	6	504722	504727	0 %	0 %	50 %	50 %	56412684
9048	NC_006511	CAG	2	6	504859	504864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412684
9049	NC_006511	GC	3	6	504872	504877	0 %	0 %	50 %	50 %	56412684
9050	NC_006511	ATG	2	6	504935	504940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412684
9051	NC_006511	GGC	2	6	504959	504964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412684
9052	NC_006511	CGGCG	2	10	505015	505024	0 %	0 %	60 %	40 %	56412684
9053	NC_006511	A	6	6	505046	505051	100 %	0 %	0 %	0 %	56412684
9054	NC_006511	CAG	2	6	505063	505068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412684
9055	NC_006511	CAG	2	6	505093	505098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412684
9056	NC_006511	TCA	2	6	505134	505139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412684
9057	NC_006511	CCA	2	6	505174	505179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412684
9058	NC_006511	GCC	2	6	505186	505191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412684
9059	NC_006511	GCG	2	6	505231	505236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412684
9060	NC_006511	ATA	2	6	505276	505281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412684
9061	NC_006511	CGC	2	6	505284	505289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412684
9062	NC_006511	GAT	2	6	505307	505312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412684
9063	NC_006511	ATG	2	6	505552	505557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412685
9064	NC_006511	TTG	2	6	505583	505588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412685
9065	NC_006511	TCT	2	6	505648	505653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412685
9066	NC_006511	CGA	3	9	505695	505703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412685
9067	NC_006511	GAC	2	6	505711	505716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412685
9068	NC_006511	GAA	2	6	505723	505728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412685
9069	NC_006511	ATG	2	6	505793	505798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412685
9070	NC_006511	CGC	2	6	505811	505816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412685
9071	NC_006511	GCC	2	6	505830	505835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412685
9072	NC_006511	GCG	2	6	505861	505866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412685
9073	NC_006511	CCG	2	6	505867	505872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412685
9074	NC_006511	CAG	2	6	505933	505938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412685
9075	NC_006511	GCC	2	6	505953	505958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412685
9076	NC_006511	GCC	2	6	505965	505970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412685
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9078	NC_006511	CCG	2	6	505987	505992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412685
9079	NC_006511	CGC	3	9	506024	506032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412685
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9082	NC_006511	CAT	2	6	506155	506160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412685
9083	NC_006511	CAG	2	6	506200	506205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412685
9084	NC_006511	CGGCC	2	10	506265	506274	0 %	0 %	40 %	60 %	56412685
9085	NC_006511	TGC	2	6	506405	506410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412685
9086	NC_006511	GCA	2	6	506418	506423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412685
9087	NC_006511	TGA	2	6	506430	506435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412685
9088	NC_006511	CGT	2	6	506445	506450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412685
9089	NC_006511	GAT	2	6	506469	506474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412685
9090	NC_006511	CGC	2	6	506477	506482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412685
9091	NC_006511	AAC	3	9	506623	506631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412686
9092	NC_006511	CAT	2	6	506658	506663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412686
9093	NC_006511	GATG	2	8	506681	506688	25 %	25 %	50 %	0 %	56412686
9094	NC_006511	GGCGC	2	10	506796	506805	0 %	0 %	60 %	40 %	56412686
9095	NC_006511	TGA	2	6	506867	506872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412686
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9102	NC_006511	TGC	2	6	507337	507342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412686
9103	NC_006511	GTG	2	6	507468	507473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412686
9104	NC_006511	CG	3	6	507522	507527	0 %	0 %	50 %	50 %	56412686
9105	NC_006511	GGCTT	2	10	507706	507715	0 %	40 %	40 %	20 %	56412686
9106	NC_006511	GGT	2	6	507731	507736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412686
9107	NC_006511	GGT	2	6	507767	507772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412686
9108	NC_006511	GCG	2	6	507904	507909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412686
9109	NC_006511	GATG	2	8	507953	507960	25 %	25 %	50 %	0 %	56412686
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9118	NC_006511	T	6	6	508296	508301	0 %	100 %	0 %	0 %	56412686
9119	NC_006511	AG	3	6	508307	508312	50 %	0 %	50 %	0 %	56412686
9120	NC_006511	GTGAT	2	10	508318	508327	20 %	40 %	40 %	0 %	56412686
9121	NC_006511	GGCA	2	8	508493	508500	25 %	0 %	50 %	25 %	56412686
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9123	NC_006511	GCG	2	6	508539	508544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412686
9124	NC_006511	TGA	2	6	508589	508594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412686
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9126	NC_006511	CGG	2	6	508751	508756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412687
9127	NC_006511	GCT	2	6	508785	508790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412687
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9129	NC_006511	CTG	2	6	508866	508871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412688
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9131	NC_006511	TGG	2	6	508939	508944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412688
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9143	NC_006511	GCA	2	6	509333	509338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412688
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9155	NC_006511	A	6	6	509770	509775	100 %	0 %	0 %	0 %	56412688
9156	NC_006511	AGT	2	6	509782	509787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412688
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9235	NC_006511	TGCG	2	8	515422	515429	0 %	25 %	50 %	25 %	56412693
9236	NC_006511	GT	3	6	515466	515471	0 %	50 %	50 %	0 %	56412693
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9239	NC_006511	AT	3	6	515657	515662	50 %	50 %	0 %	0 %	56412693
9240	NC_006511	TAA	2	6	515675	515680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412693
9241	NC_006511	GCTG	2	8	515788	515795	0 %	25 %	50 %	25 %	56412693
9242	NC_006511	GAC	2	6	515864	515869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412693
9243	NC_006511	TGC	2	6	515878	515883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412693
9244	NC_006511	GC	3	6	515917	515922	0 %	0 %	50 %	50 %	56412693
9245	NC_006511	CGA	2	6	515996	516001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412693
9246	NC_006511	ATG	2	6	516009	516014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412693
9247	NC_006511	CGG	2	6	516115	516120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412693
9248	NC_006511	GCT	2	6	516161	516166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412693
9249	NC_006511	TCA	2	6	516232	516237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412693
9250	NC_006511	GAA	2	6	516249	516254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412693
9251	NC_006511	TC	3	6	516262	516267	0 %	50 %	0 %	50 %	56412693
9252	NC_006511	TGA	2	6	516329	516334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412693
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9255	NC_006511	GAT	2	6	516443	516448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412693
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9282	NC_006511	GCGCTG	2	12	519102	519113	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	56412694
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9493	NC_006511	GCC	2	6	532123	532128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412704
9494	NC_006511	AGC	2	6	532313	532318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412704
9495	NC_006511	CTGG	2	8	532330	532337	0 %	25 %	50 %	25 %	56412704
9496	NC_006511	ATA	2	6	532347	532352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412704
9497	NC_006511	A	6	6	532368	532373	100 %	0 %	0 %	0 %	56412704
9498	NC_006511	GAT	2	6	534434	534439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412705
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