MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 80127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_006511	CCATG	2	10	424187	424196	20 %	20 %	20 %	40 %	512156988
7502	NC_006511	GTA	2	6	424199	424204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512156988
7503	NC_006511	GAT	2	6	424235	424240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512156988
7504	NC_006511	TCA	2	6	424264	424269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512156988
7505	NC_006511	TTGCCT	2	12	424303	424314	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	512156988
7506	NC_006511	CTT	2	6	424326	424331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512156988
7507	NC_006511	GCA	2	6	424694	424699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412610
7508	NC_006511	AGAT	2	8	424716	424723	50 %	25 %	25 %	0 %	56412610
7509	NC_006511	TCTG	2	8	424756	424763	0 %	50 %	25 %	25 %	56412610
7510	NC_006511	GCCAGT	2	12	424831	424842	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56412610
7511	NC_006511	ACG	2	6	424863	424868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412610
7512	NC_006511	CG	3	6	424892	424897	0 %	0 %	50 %	50 %	56412610
7513	NC_006511	TTGC	2	8	424928	424935	0 %	50 %	25 %	25 %	56412610
7514	NC_006511	GCT	2	6	424970	424975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412610
7515	NC_006511	CTGT	2	8	425055	425062	0 %	50 %	25 %	25 %	56412610
7516	NC_006511	T	6	6	425071	425076	0 %	100 %	0 %	0 %	56412610
7517	NC_006511	CCG	2	6	425099	425104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412610
7518	NC_006511	AGA	3	9	425121	425129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412610
7519	NC_006511	TTC	2	6	425176	425181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412610
7520	NC_006511	GGT	2	6	425277	425282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412611
7521	NC_006511	CTT	2	6	425330	425335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412611
7522	NC_006511	CGC	2	6	425388	425393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412611
7523	NC_006511	CCG	2	6	425407	425412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412611
7524	NC_006511	AGT	2	6	425427	425432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412611
7525	NC_006511	CGC	2	6	425471	425476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412611
7526	NC_006511	T	7	7	425516	425522	0 %	100 %	0 %	0 %	56412611
7527	NC_006511	TAT	2	6	425531	425536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412611
7528	NC_006511	ATA	2	6	425566	425571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412611
7529	NC_006511	GCG	2	6	425626	425631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412611
7530	NC_006511	CAAA	2	8	425675	425682	75 %	0 %	0 %	25 %	56412611
7531	NC_006511	T	8	8	425698	425705	0 %	100 %	0 %	0 %	56412611
7532	NC_006511	TCA	2	6	425711	425716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412611
7533	NC_006511	CTT	2	6	426002	426007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412612
7534	NC_006511	T	6	6	426006	426011	0 %	100 %	0 %	0 %	56412612
7535	NC_006511	TGC	2	6	426022	426027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412612
7536	NC_006511	AGA	2	6	426039	426044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412612
7537	NC_006511	AGA	3	9	426062	426070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412612
7538	NC_006511	TTC	2	6	426199	426204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412612
7539	NC_006511	TAT	2	6	426210	426215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412612
7540	NC_006511	GAA	2	6	426222	426227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412612
7541	NC_006511	TAA	3	9	426354	426362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412613
7542	NC_006511	TAA	2	6	426447	426452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412613
7543	NC_006511	TA	3	6	426580	426585	50 %	50 %	0 %	0 %	56412614
7544	NC_006511	TGG	2	6	426601	426606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412614
7545	NC_006511	TCCT	2	8	426620	426627	0 %	50 %	0 %	50 %	56412614
7546	NC_006511	TAC	2	6	426635	426640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412614
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7548	NC_006511	GCA	2	6	426748	426753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412614
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7550	NC_006511	TCT	2	6	426776	426781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412614
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7553	NC_006511	TGT	2	6	426920	426925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412614
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7555	NC_006511	TTG	2	6	426995	427000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412614
7556	NC_006511	AGCC	2	8	427017	427024	25 %	0 %	25 %	50 %	56412614
7557	NC_006511	ATTA	2	8	427060	427067	50 %	50 %	0 %	0 %	56412614
7558	NC_006511	TAT	2	6	427116	427121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412614
7559	NC_006511	TAT	2	6	427156	427161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412614
7560	NC_006511	A	6	6	427198	427203	100 %	0 %	0 %	0 %	56412614
7561	NC_006511	TGGC	2	8	427216	427223	0 %	25 %	50 %	25 %	56412614
7562	NC_006511	ATA	2	6	427268	427273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412614
7563	NC_006511	TTA	2	6	427306	427311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412614
7564	NC_006511	CGT	2	6	427374	427379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412614
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7566	NC_006511	T	6	6	427472	427477	0 %	100 %	0 %	0 %	56412614
7567	NC_006511	AGTG	2	8	427524	427531	25 %	25 %	50 %	0 %	56412614
7568	NC_006511	CGG	2	6	427540	427545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412614
7569	NC_006511	CG	3	6	427597	427602	0 %	0 %	50 %	50 %	56412614
7570	NC_006511	T	6	6	427632	427637	0 %	100 %	0 %	0 %	56412614
7571	NC_006511	CT	3	6	427708	427713	0 %	50 %	0 %	50 %	56412614
7572	NC_006511	TGC	2	6	427778	427783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412614
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7574	NC_006511	GGAC	2	8	427857	427864	25 %	0 %	50 %	25 %	56412614
7575	NC_006511	GCC	2	6	427875	427880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412614
7576	NC_006511	CTG	2	6	427896	427901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412614
7577	NC_006511	TCT	2	6	427929	427934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412614
7578	NC_006511	GAC	2	6	427971	427976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412614
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7583	NC_006511	T	6	6	428190	428195	0 %	100 %	0 %	0 %	56412614
7584	NC_006511	GTTTG	2	10	428211	428220	0 %	60 %	40 %	0 %	56412614
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7589	NC_006511	CAG	2	6	428470	428475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412614
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7591	NC_006511	GAA	2	6	428683	428688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412614
7592	NC_006511	TAT	2	6	428756	428761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412614
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7594	NC_006511	GCCA	2	8	428855	428862	25 %	0 %	25 %	50 %	56412615
7595	NC_006511	CTG	2	6	428880	428885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412615
7596	NC_006511	CGG	2	6	428985	428990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412615
7597	NC_006511	GTG	2	6	428992	428997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412615
7598	NC_006511	GTTG	2	8	429008	429015	0 %	50 %	50 %	0 %	56412615
7599	NC_006511	T	6	6	429063	429068	0 %	100 %	0 %	0 %	56412615
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7605	NC_006511	GCT	2	6	429299	429304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412615
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7608	NC_006511	ATTG	2	8	429377	429384	25 %	50 %	25 %	0 %	56412615
7609	NC_006511	TGA	2	6	429418	429423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412615
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7612	NC_006511	AGAC	2	8	429561	429568	50 %	0 %	25 %	25 %	56412615
7613	NC_006511	GCC	3	9	429769	429777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412615
7614	NC_006511	GC	3	6	429784	429789	0 %	0 %	50 %	50 %	56412615
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7619	NC_006511	TTC	2	6	429990	429995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412615
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7622	NC_006511	ACGTA	2	10	430074	430083	40 %	20 %	20 %	20 %	56412615
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7872	NC_006511	GAT	2	6	443901	443906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412626
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7993	NC_006511	CGCC	2	8	449831	449838	0 %	0 %	25 %	75 %	56412633
7994	NC_006511	GCT	2	6	449871	449876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412633
7995	NC_006511	GCC	2	6	449938	449943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412633
7996	NC_006511	GCT	2	6	449973	449978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412633
7997	NC_006511	CTG	2	6	449980	449985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412633
7998	NC_006511	GCC	2	6	449988	449993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412633
7999	NC_006511	GC	3	6	450047	450052	0 %	0 %	50 %	50 %	56412633
8000	NC_006511	GCT	2	6	450117	450122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412633

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