MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 80127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_006511	GCT	2	6	384211	384216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412593
7002	NC_006511	TGGC	2	8	384260	384267	0 %	25 %	50 %	25 %	56412593
7003	NC_006511	GCC	2	6	384273	384278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412593
7004	NC_006511	GC	3	6	384312	384317	0 %	0 %	50 %	50 %	56412593
7005	NC_006511	GCT	2	6	384358	384363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412593
7006	NC_006511	GGC	2	6	384469	384474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412593
7007	NC_006511	TGC	2	6	384492	384497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412593
7008	NC_006511	GCT	2	6	384526	384531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412593
7009	NC_006511	GGC	2	6	384538	384543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412593
7010	NC_006511	TGG	2	6	384555	384560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412593
7011	NC_006511	GCA	2	6	384610	384615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412593
7012	NC_006511	TGCGC	2	10	384708	384717	0 %	20 %	40 %	40 %	56412593
7013	NC_006511	TGG	3	9	384720	384728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412593
7014	NC_006511	TGGC	2	8	384770	384777	0 %	25 %	50 %	25 %	56412593
7015	NC_006511	ACG	2	6	384797	384802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412593
7016	NC_006511	GTC	2	6	384803	384808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412593
7017	NC_006511	CAT	2	6	384818	384823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412593
7018	NC_006511	TCT	2	6	384859	384864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412593
7019	NC_006511	GT	3	6	384871	384876	0 %	50 %	50 %	0 %	56412593
7020	NC_006511	GCG	2	6	384881	384886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412593
7021	NC_006511	TGC	2	6	384954	384959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412593
7022	NC_006511	TGC	2	6	384975	384980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412593
7023	NC_006511	TCT	2	6	384987	384992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412593
7024	NC_006511	CGAT	2	8	385019	385026	25 %	25 %	25 %	25 %	56412594
7025	NC_006511	CGG	2	6	385028	385033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412594
7026	NC_006511	CGTC	2	8	385053	385060	0 %	25 %	25 %	50 %	56412594
7027	NC_006511	TCGTTT	2	12	385062	385073	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	56412594
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7029	NC_006511	ACG	2	6	385150	385155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412594
7030	NC_006511	CTGT	2	8	385176	385183	0 %	50 %	25 %	25 %	56412594
7031	NC_006511	TGTC	2	8	385185	385192	0 %	50 %	25 %	25 %	56412594
7032	NC_006511	TGG	2	6	385250	385255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412594
7033	NC_006511	CG	3	6	385478	385483	0 %	0 %	50 %	50 %	56412594
7034	NC_006511	GCG	2	6	385592	385597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412594
7035	NC_006511	CTG	2	6	385599	385604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412594
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7037	NC_006511	GCG	3	9	385657	385665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412594
7038	NC_006511	GCG	2	6	385679	385684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412594
7039	NC_006511	GCG	2	6	385690	385695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412594
7040	NC_006511	GCG	2	6	385759	385764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412594
7041	NC_006511	AC	3	6	385818	385823	50 %	0 %	0 %	50 %	56412594
7042	NC_006511	CAT	2	6	386013	386018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412595
7043	NC_006511	A	6	6	386037	386042	100 %	0 %	0 %	0 %	56412595
7044	NC_006511	GCA	2	6	386051	386056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412595
7045	NC_006511	GC	3	6	386062	386067	0 %	0 %	50 %	50 %	56412595
7046	NC_006511	TTG	2	6	386090	386095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412595
7047	NC_006511	TGC	2	6	386105	386110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412595
7048	NC_006511	GC	3	6	386128	386133	0 %	0 %	50 %	50 %	56412595
7049	NC_006511	ACG	2	6	386150	386155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412595
7050	NC_006511	TGG	2	6	386177	386182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412595
7051	NC_006511	CCA	2	6	386264	386269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412595
7052	NC_006511	GC	3	6	386298	386303	0 %	0 %	50 %	50 %	56412595
7053	NC_006511	TTC	2	6	386383	386388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412595
7054	NC_006511	AAC	2	6	386676	386681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412596
7055	NC_006511	CTG	2	6	386697	386702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412596
7056	NC_006511	CAG	2	6	386715	386720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412596
7057	NC_006511	T	6	6	386730	386735	0 %	100 %	0 %	0 %	56412596
7058	NC_006511	TGA	2	6	386773	386778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412596
7059	NC_006511	TGC	2	6	386796	386801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412596
7060	NC_006511	TGA	2	6	386810	386815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412596
7061	NC_006511	CAA	2	6	386828	386833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412596
7062	NC_006511	CG	3	6	386871	386876	0 %	0 %	50 %	50 %	56412596
7063	NC_006511	AGC	2	6	386893	386898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412596
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7065	NC_006511	GGA	2	6	386969	386974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56412596
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7067	NC_006511	TTC	2	6	386996	387001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412596
7068	NC_006511	GC	3	6	387013	387018	0 %	0 %	50 %	50 %	56412596
7069	NC_006511	GCA	2	6	387044	387049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412596
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7071	NC_006511	TCG	2	6	387112	387117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412596
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7073	NC_006511	CGT	2	6	387255	387260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412596
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7080	NC_006511	ATCG	2	8	387618	387625	25 %	25 %	25 %	25 %	56412596
7081	NC_006511	TGA	2	6	387640	387645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412596
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7083	NC_006511	CACG	2	8	388100	388107	25 %	0 %	25 %	50 %	56412597
7084	NC_006511	ACC	2	6	388125	388130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412597
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7088	NC_006511	AT	3	6	388274	388279	50 %	50 %	0 %	0 %	56412597
7089	NC_006511	AGA	2	6	388310	388315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412597
7090	NC_006511	CTG	2	6	388320	388325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412597
7091	NC_006511	GC	3	6	388352	388357	0 %	0 %	50 %	50 %	56412597
7092	NC_006511	CGT	2	6	388398	388403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412597
7093	NC_006511	A	6	6	388404	388409	100 %	0 %	0 %	0 %	56412597
7094	NC_006511	CTGG	2	8	388436	388443	0 %	25 %	50 %	25 %	56412597
7095	NC_006511	TGG	3	9	388476	388484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412597
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7098	NC_006511	ACG	2	6	388611	388616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412597
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7105	NC_006511	GC	3	6	388972	388977	0 %	0 %	50 %	50 %	56412597
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7110	NC_006511	GC	4	8	389487	389494	0 %	0 %	50 %	50 %	56412598
7111	NC_006511	CGC	2	6	389574	389579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412598
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7115	NC_006511	GATC	2	8	389710	389717	25 %	25 %	25 %	25 %	56412598
7116	NC_006511	GCGG	2	8	389744	389751	0 %	0 %	75 %	25 %	56412598
7117	NC_006511	CG	3	6	389752	389757	0 %	0 %	50 %	50 %	56412598
7118	NC_006511	CTG	2	6	389792	389797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412598
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7123	NC_006511	ATC	2	6	390020	390025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412598
7124	NC_006511	CGGGC	2	10	390040	390049	0 %	0 %	60 %	40 %	56412598
7125	NC_006511	GGC	2	6	390080	390085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412598
7126	NC_006511	GCGT	2	8	390114	390121	0 %	25 %	50 %	25 %	56412598
7127	NC_006511	ACG	2	6	390138	390143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412598
7128	NC_006511	CG	3	6	390173	390178	0 %	0 %	50 %	50 %	56412598
7129	NC_006511	TGA	2	6	390193	390198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412598
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7132	NC_006511	CG	3	6	390505	390510	0 %	0 %	50 %	50 %	56412599
7133	NC_006511	CGG	2	6	390599	390604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412599
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7139	NC_006511	ACG	2	6	391004	391009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412599
7140	NC_006511	TGA	2	6	391032	391037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412599
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7144	NC_006511	GGT	2	6	391198	391203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412599
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7148	NC_006511	TTGTT	2	10	391280	391289	0 %	80 %	20 %	0 %	56412599
7149	NC_006511	TGT	2	6	391326	391331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412599
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7152	NC_006511	TGT	2	6	391533	391538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412599
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7155	NC_006511	CTT	2	6	391681	391686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412600
7156	NC_006511	GCTG	2	8	391705	391712	0 %	25 %	50 %	25 %	56412600
7157	NC_006511	GC	3	6	391734	391739	0 %	0 %	50 %	50 %	56412600
7158	NC_006511	TGGC	2	8	391744	391751	0 %	25 %	50 %	25 %	56412600
7159	NC_006511	AGC	2	6	391760	391765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412600
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7161	NC_006511	TGC	2	6	391786	391791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412600
7162	NC_006511	CGG	2	6	391818	391823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412600
7163	NC_006511	CGC	2	6	391852	391857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412600
7164	NC_006511	GCA	2	6	391918	391923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412600
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7170	NC_006511	CGCTG	2	10	392059	392068	0 %	20 %	40 %	40 %	56412600
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7173	NC_006511	GC	4	8	392160	392167	0 %	0 %	50 %	50 %	56412600
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7181	NC_006511	TGT	2	6	392593	392598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412601
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7196	NC_006511	ACGGT	2	10	393415	393424	20 %	20 %	40 %	20 %	56412601
7197	NC_006511	CGG	2	6	393730	393735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412602
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7200	NC_006511	GC	4	8	393830	393837	0 %	0 %	50 %	50 %	56412602
7201	NC_006511	CGG	2	6	393849	393854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412602
7202	NC_006511	TGG	2	6	393903	393908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412602
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7213	NC_006511	CGA	2	6	394300	394305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412602
7214	NC_006511	CGG	2	6	394329	394334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412602
7215	NC_006511	CGT	2	6	394417	394422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412602
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7217	NC_006511	CTG	2	6	394472	394477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412602
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7226	NC_006511	AC	3	6	394965	394970	50 %	0 %	0 %	50 %	56412602
7227	NC_006511	TGA	2	6	395004	395009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412602
7228	NC_006511	AAT	2	6	395126	395131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412603
7229	NC_006511	GCC	2	6	395230	395235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412603
7230	NC_006511	GCG	2	6	395260	395265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412603
7231	NC_006511	A	7	7	395306	395312	100 %	0 %	0 %	0 %	56412603
7232	NC_006511	GCAA	2	8	397903	397910	50 %	0 %	25 %	25 %	56412604
7233	NC_006511	CGG	2	6	397919	397924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412604
7234	NC_006511	TAG	2	6	397947	397952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412604
7235	NC_006511	GCGCC	2	10	397965	397974	0 %	0 %	40 %	60 %	56412604
7236	NC_006511	GGC	2	6	397981	397986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412604
7237	NC_006511	GCG	2	6	398072	398077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412604
7238	NC_006511	ATCG	2	8	398120	398127	25 %	25 %	25 %	25 %	56412604
7239	NC_006511	CGC	2	6	398236	398241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412604
7240	NC_006511	ACC	4	12	398381	398392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412604
7241	NC_006511	CTG	2	6	398417	398422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412604
7242	NC_006511	GCGG	2	8	398444	398451	0 %	0 %	75 %	25 %	56412604
7243	NC_006511	CGA	2	6	398464	398469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412604
7244	NC_006511	GGT	2	6	398485	398490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412604
7245	NC_006511	TGT	2	6	398506	398511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412604
7246	NC_006511	GAA	2	6	398545	398550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412604
7247	NC_006511	GAC	2	6	398557	398562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412604
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7268	NC_006511	CCG	2	6	399729	399734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412605
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7352	NC_006511	ATA	2	6	404021	404026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412605
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7356	NC_006511	TGA	2	6	404327	404332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412605
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7362	NC_006511	GATG	2	8	404565	404572	25 %	25 %	50 %	0 %	56412605
7363	NC_006511	A	6	6	404596	404601	100 %	0 %	0 %	0 %	56412605
7364	NC_006511	TGACGG	2	12	404618	404629	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	56412605
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7368	NC_006511	GACGG	2	10	404824	404833	20 %	0 %	60 %	20 %	56412605
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7370	NC_006511	AAG	2	6	405047	405052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412605
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7493	NC_006511	G	7	7	423801	423807	0 %	0 %	100 %	0 %	512156988
7494	NC_006511	GCCT	2	8	423840	423847	0 %	25 %	25 %	50 %	512156988
7495	NC_006511	CCG	2	6	423886	423891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512156988
7496	NC_006511	A	6	6	424006	424011	100 %	0 %	0 %	0 %	512156988
7497	NC_006511	AAG	3	9	424053	424061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512156988
7498	NC_006511	GCT	2	6	424101	424106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512156988
7499	NC_006511	TTG	2	6	424117	424122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512156988
7500	NC_006511	CAA	2	6	424163	424168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512156988

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