MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 80127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_006511	TG	3	6	271112	271117	0 %	50 %	50 %	0 %	56412500
5002	NC_006511	TGAT	2	8	271142	271149	25 %	50 %	25 %	0 %	56412501
5003	NC_006511	TTG	2	6	271232	271237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412501
5004	NC_006511	GTGAA	2	10	271346	271355	40 %	20 %	40 %	0 %	56412501
5005	NC_006511	CTG	2	6	271486	271491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412501
5006	NC_006511	GGTA	2	8	271524	271531	25 %	25 %	50 %	0 %	56412501
5007	NC_006511	CAA	2	6	271548	271553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412501
5008	NC_006511	GAT	2	6	271582	271587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412501
5009	NC_006511	CGG	2	6	271599	271604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412501
5010	NC_006511	TCA	2	6	271617	271622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412501
5011	NC_006511	CGG	2	6	271653	271658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412501
5012	NC_006511	TGG	2	6	271775	271780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412501
5013	NC_006511	TGT	2	6	271802	271807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412501
5014	NC_006511	CGA	2	6	271827	271832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412501
5015	NC_006511	CG	3	6	271910	271915	0 %	0 %	50 %	50 %	56412501
5016	NC_006511	GGC	2	6	271931	271936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412502
5017	NC_006511	GC	3	6	272019	272024	0 %	0 %	50 %	50 %	56412502
5018	NC_006511	TTG	2	6	272122	272127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412502
5019	NC_006511	TTG	2	6	272151	272156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412502
5020	NC_006511	CCG	2	6	272177	272182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412502
5021	NC_006511	A	6	6	272259	272264	100 %	0 %	0 %	0 %	56412502
5022	NC_006511	CATT	2	8	272279	272286	25 %	50 %	0 %	25 %	56412502
5023	NC_006511	CCGT	2	8	272295	272302	0 %	25 %	25 %	50 %	56412502
5024	NC_006511	ATGCC	2	10	272437	272446	20 %	20 %	20 %	40 %	56412502
5025	NC_006511	GCG	2	6	272466	272471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412502
5026	NC_006511	CG	3	6	272470	272475	0 %	0 %	50 %	50 %	56412502
5027	NC_006511	TGC	2	6	272581	272586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412502
5028	NC_006511	CGC	2	6	272637	272642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412502
5029	NC_006511	A	6	6	272653	272658	100 %	0 %	0 %	0 %	56412502
5030	NC_006511	GC	3	6	272709	272714	0 %	0 %	50 %	50 %	56412502
5031	NC_006511	GAT	2	6	272720	272725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412502
5032	NC_006511	CTG	2	6	272742	272747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412502
5033	NC_006511	CGG	2	6	272758	272763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412502
5034	NC_006511	CTGG	2	8	272828	272835	0 %	25 %	50 %	25 %	56412502
5035	NC_006511	CTG	2	6	272877	272882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412502
5036	NC_006511	CAG	2	6	273015	273020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412502
5037	NC_006511	GGC	2	6	273044	273049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412502
5038	NC_006511	CA	3	6	273093	273098	50 %	0 %	0 %	50 %	56412503
5039	NC_006511	TGG	2	6	273141	273146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412503
5040	NC_006511	CCG	3	9	273159	273167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412503
5041	NC_006511	TCG	2	6	273192	273197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412503
5042	NC_006511	A	6	6	273212	273217	100 %	0 %	0 %	0 %	56412503
5043	NC_006511	CGT	2	6	273230	273235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412503
5044	NC_006511	CG	3	6	273287	273292	0 %	0 %	50 %	50 %	56412503
5045	NC_006511	TGA	2	6	273307	273312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412503
5046	NC_006511	CCA	2	6	273330	273335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412503
5047	NC_006511	GC	3	6	273349	273354	0 %	0 %	50 %	50 %	56412503
5048	NC_006511	GTG	2	6	273437	273442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412503
5049	NC_006511	GCG	2	6	273473	273478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412503
5050	NC_006511	GGC	2	6	273514	273519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412503
5051	NC_006511	GCA	2	6	273553	273558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412503
5052	NC_006511	CAC	2	6	273617	273622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412503
5053	NC_006511	ACT	2	6	273734	273739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412504
5054	NC_006511	GGC	2	6	273783	273788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412504
5055	NC_006511	TCG	2	6	273887	273892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412504
5056	NC_006511	CTG	2	6	273919	273924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412504
5057	NC_006511	GGC	2	6	273954	273959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412504
5058	NC_006511	AAT	2	6	273961	273966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412504
5059	NC_006511	CTGG	2	8	274050	274057	0 %	25 %	50 %	25 %	56412504
5060	NC_006511	CGG	2	6	274089	274094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412504
5061	NC_006511	TGG	2	6	274142	274147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412504
5062	NC_006511	TGC	2	6	274242	274247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412504
5063	NC_006511	GAT	2	6	274315	274320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412504
5064	NC_006511	ACG	2	6	274352	274357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412504
5065	NC_006511	CGA	2	6	274368	274373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412504
5066	NC_006511	ATT	2	6	274391	274396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412504
5067	NC_006511	GCA	2	6	274401	274406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412504
5068	NC_006511	GAA	3	9	274420	274428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412504
5069	NC_006511	ACC	2	6	274552	274557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412504
5070	NC_006511	A	6	6	274573	274578	100 %	0 %	0 %	0 %	56412504
5071	NC_006511	GAA	2	6	274594	274599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412504
5072	NC_006511	GAA	2	6	274624	274629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412504
5073	NC_006511	TGG	2	6	274799	274804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412504
5074	NC_006511	CTG	2	6	274849	274854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412504
5075	NC_006511	GGC	2	6	275001	275006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412504
5076	NC_006511	GCC	2	6	275082	275087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412504
5077	NC_006511	GGC	2	6	275230	275235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412504
5078	NC_006511	ATC	2	6	275383	275388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412504
5079	NC_006511	GAT	2	6	275403	275408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412504
5080	NC_006511	CAA	2	6	275409	275414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412504
5081	NC_006511	GCG	2	6	275415	275420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412504
5082	NC_006511	GAA	2	6	275424	275429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412504
5083	NC_006511	CGC	2	6	275451	275456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412504
5084	NC_006511	A	7	7	275473	275479	100 %	0 %	0 %	0 %	56412504
5085	NC_006511	TGC	2	6	275489	275494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412504
5086	NC_006511	CGG	2	6	275510	275515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412504
5087	NC_006511	CG	3	6	275531	275536	0 %	0 %	50 %	50 %	56412504
5088	NC_006511	TGG	2	6	275594	275599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412504
5089	NC_006511	GAA	2	6	275668	275673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412504
5090	NC_006511	CT	3	6	275674	275679	0 %	50 %	0 %	50 %	56412504
5091	NC_006511	GCA	2	6	275697	275702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412504
5092	NC_006511	CAT	2	6	275739	275744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412504
5093	NC_006511	CGG	2	6	275799	275804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412504
5094	NC_006511	TGC	2	6	275813	275818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412504
5095	NC_006511	GGA	2	6	275844	275849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56412504
5096	NC_006511	TGG	2	6	275933	275938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412504
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5098	NC_006511	GGC	2	6	276042	276047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412504
5099	NC_006511	CCG	2	6	276056	276061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412504
5100	NC_006511	ACA	2	6	276068	276073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412504
5101	NC_006511	GTC	2	6	276082	276087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412504
5102	NC_006511	TGG	2	6	276092	276097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412504
5103	NC_006511	GCC	2	6	276129	276134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412504
5104	NC_006511	ATC	2	6	276238	276243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412504
5105	NC_006511	CG	3	6	276246	276251	0 %	0 %	50 %	50 %	56412504
5106	NC_006511	GGC	2	6	276259	276264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412504
5107	NC_006511	GC	3	6	276290	276295	0 %	0 %	50 %	50 %	56412504
5108	NC_006511	CCG	2	6	276318	276323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412504
5109	NC_006511	CCGCG	2	10	276375	276384	0 %	0 %	40 %	60 %	56412504
5110	NC_006511	TGA	2	6	276386	276391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412504
5111	NC_006511	GCC	2	6	276415	276420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412504
5112	NC_006511	GGT	2	6	276534	276539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412504
5113	NC_006511	ATCA	2	8	276589	276596	50 %	25 %	0 %	25 %	56412504
5114	NC_006511	CGG	2	6	276624	276629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412504
5115	NC_006511	CAC	2	6	276672	276677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412504
5116	NC_006511	CAG	2	6	276808	276813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412504
5117	NC_006511	TGA	2	6	276861	276866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412504
5118	NC_006511	G	6	6	276874	276879	0 %	0 %	100 %	0 %	56412504
5119	NC_006511	CCGC	2	8	276890	276897	0 %	0 %	25 %	75 %	56412504
5120	NC_006511	TGA	2	6	276972	276977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412504
5121	NC_006511	CTA	2	6	277044	277049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412504
5122	NC_006511	TGCGCG	2	12	277062	277073	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	56412504
5123	NC_006511	TC	3	6	277100	277105	0 %	50 %	0 %	50 %	56412504
5124	NC_006511	GCC	2	6	277265	277270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412505
5125	NC_006511	GAA	2	6	277300	277305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412505
5126	NC_006511	A	6	6	277322	277327	100 %	0 %	0 %	0 %	56412505
5127	NC_006511	GC	3	6	277387	277392	0 %	0 %	50 %	50 %	56412505
5128	NC_006511	TGA	2	6	277437	277442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412505
5129	NC_006511	TGA	2	6	277446	277451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412505
5130	NC_006511	GGCG	2	8	277455	277462	0 %	0 %	75 %	25 %	56412505
5131	NC_006511	TGA	2	6	277476	277481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412505
5132	NC_006511	TCG	2	6	277490	277495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412505
5133	NC_006511	CG	3	6	277503	277508	0 %	0 %	50 %	50 %	56412505
5134	NC_006511	TGA	2	6	277526	277531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412505
5135	NC_006511	TCA	2	6	277539	277544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412505
5136	NC_006511	A	6	6	277565	277570	100 %	0 %	0 %	0 %	56412505
5137	NC_006511	TCG	2	6	277572	277577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412505
5138	NC_006511	GGC	2	6	277795	277800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412505
5139	NC_006511	CGG	2	6	277803	277808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412505
5140	NC_006511	TGC	2	6	277844	277849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412505
5141	NC_006511	GCT	2	6	277927	277932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412505
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5144	NC_006511	CAT	2	6	277986	277991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412505
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5147	NC_006511	GAT	2	6	278095	278100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412505
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5149	NC_006511	CGT	2	6	278110	278115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412505
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5152	NC_006511	GCCGC	2	10	278399	278408	0 %	0 %	40 %	60 %	56412506
5153	NC_006511	AGT	2	6	278417	278422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412506
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5155	NC_006511	AGG	2	6	278601	278606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56412506
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5157	NC_006511	CGG	2	6	278685	278690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412506
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5161	NC_006511	TGG	2	6	279057	279062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412506
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5167	NC_006511	CTA	2	6	279283	279288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412506
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5171	NC_006511	ATT	2	6	279522	279527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412506
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5175	NC_006511	GCCGG	2	10	279629	279638	0 %	0 %	60 %	40 %	56412506
5176	NC_006511	CGAC	2	8	279687	279694	25 %	0 %	25 %	50 %	56412506
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5198	NC_006511	TGA	3	9	280920	280928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412507
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5202	NC_006511	GCG	2	6	281214	281219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412507
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5207	NC_006511	GATT	2	8	281433	281440	25 %	50 %	25 %	0 %	56412507
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5220	NC_006511	TGCTC	2	10	282198	282207	0 %	40 %	20 %	40 %	56412507
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5229	NC_006511	CTG	2	6	283190	283195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412509
5230	NC_006511	CCGG	2	8	283217	283224	0 %	0 %	50 %	50 %	56412509
5231	NC_006511	CTT	2	6	283268	283273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412509
5232	NC_006511	GA	3	6	283285	283290	50 %	0 %	50 %	0 %	56412509
5233	NC_006511	T	6	6	283381	283386	0 %	100 %	0 %	0 %	56412509
5234	NC_006511	GC	4	8	283393	283400	0 %	0 %	50 %	50 %	56412509
5235	NC_006511	GCG	2	6	283414	283419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412509
5236	NC_006511	GCG	2	6	283436	283441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412509
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5239	NC_006511	CT	3	6	283544	283549	0 %	50 %	0 %	50 %	56412509
5240	NC_006511	TTGATG	2	12	283553	283564	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	56412509
5241	NC_006511	CGG	2	6	283574	283579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412509
5242	NC_006511	GCTG	2	8	283596	283603	0 %	25 %	50 %	25 %	56412509
5243	NC_006511	TGGCGC	2	12	283662	283673	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	56412509
5244	NC_006511	CGA	2	6	283675	283680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412509
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5246	NC_006511	ACA	2	6	283762	283767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412509
5247	NC_006511	ACG	2	6	283772	283777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412509
5248	NC_006511	GTC	2	6	283778	283783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412509
5249	NC_006511	CTGC	2	8	283811	283818	0 %	25 %	25 %	50 %	56412509
5250	NC_006511	GGC	2	6	283847	283852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412509
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5259	NC_006511	TCAT	2	8	284438	284445	25 %	50 %	0 %	25 %	56412510
5260	NC_006511	GCA	2	6	284475	284480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412511
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5264	NC_006511	ATG	2	6	284953	284958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412512
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5275	NC_006511	GGT	2	6	285453	285458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412513
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5293	NC_006511	GTAT	3	12	286283	286294	25 %	50 %	25 %	0 %	56412514
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5322	NC_006511	CG	3	6	287866	287871	0 %	0 %	50 %	50 %	56412515
5323	NC_006511	TCA	2	6	287901	287906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412515
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5329	NC_006511	GTT	2	6	288137	288142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412515
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5332	NC_006511	TA	3	6	288205	288210	50 %	50 %	0 %	0 %	56412515
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5337	NC_006511	AAAT	2	8	288582	288589	75 %	25 %	0 %	0 %	56412516
5338	NC_006511	CGT	2	6	288619	288624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412516
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5343	NC_006511	GGGC	2	8	288910	288917	0 %	0 %	75 %	25 %	56412516
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5346	NC_006511	TGA	2	6	288950	288955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412516
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5348	NC_006511	GACCA	2	10	289057	289066	40 %	0 %	20 %	40 %	56412516
5349	NC_006511	GCT	2	6	289135	289140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412516
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5353	NC_006511	CGC	2	6	289331	289336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412517
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5355	NC_006511	ATA	2	6	289543	289548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412517
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5357	NC_006511	TCA	2	6	289718	289723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412518
5358	NC_006511	T	6	6	289744	289749	0 %	100 %	0 %	0 %	56412518
5359	NC_006511	CTGG	2	8	289855	289862	0 %	25 %	50 %	25 %	56412518
5360	NC_006511	TGA	2	6	289875	289880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412518
5361	NC_006511	GCG	2	6	289923	289928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412518
5362	NC_006511	CAA	2	6	289938	289943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412518
5363	NC_006511	CGA	2	6	289965	289970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412518
5364	NC_006511	GCA	3	9	290031	290039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412518
5365	NC_006511	GGTCG	2	10	290059	290068	0 %	20 %	60 %	20 %	56412518
5366	NC_006511	GATTT	2	10	290111	290120	20 %	60 %	20 %	0 %	56412518
5367	NC_006511	T	7	7	290118	290124	0 %	100 %	0 %	0 %	56412518
5368	NC_006511	TTTC	2	8	290313	290320	0 %	75 %	0 %	25 %	56412518
5369	NC_006511	TGC	2	6	290348	290353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412518
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5472	NC_006511	GA	3	6	301060	301065	50 %	0 %	50 %	0 %	56412524
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5485	NC_006511	AAT	2	6	301643	301648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412525
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5492	NC_006511	ATC	2	6	302060	302065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412525
5493	NC_006511	GC	3	6	302221	302226	0 %	0 %	50 %	50 %	56412525
5494	NC_006511	CAG	2	6	302375	302380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412525
5495	NC_006511	CAT	2	6	302419	302424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412525
5496	NC_006511	ACTG	2	8	302427	302434	25 %	25 %	25 %	25 %	56412525
5497	NC_006511	GTT	2	6	302461	302466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412525
5498	NC_006511	TTA	2	6	302472	302477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412525
5499	NC_006511	ACA	2	6	302491	302496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412525
5500	NC_006511	TCA	2	6	302619	302624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412526

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