MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus CNRZ1066 chromosome

Total Repeats: 30108

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_006449	ACC	2	6	252038	252043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55822232
4002	NC_006449	ATC	2	6	252093	252098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822232
4003	NC_006449	CGC	2	6	252122	252127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55822232
4004	NC_006449	CTC	2	6	252143	252148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55822232
4005	NC_006449	TTG	2	6	252155	252160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822232
4006	NC_006449	ATG	2	6	252198	252203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822232
4007	NC_006449	TGC	2	6	252278	252283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822232
4008	NC_006449	GAA	2	6	252299	252304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822232
4009	NC_006449	AGC	2	6	252392	252397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55822232
4010	NC_006449	T	6	6	252400	252405	0 %	100 %	0 %	0 %	55822232
4011	NC_006449	CTT	2	6	252406	252411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822232
4012	NC_006449	CGTT	2	8	252432	252439	0 %	50 %	25 %	25 %	55822232
4013	NC_006449	CGAA	2	8	252530	252537	50 %	0 %	25 %	25 %	55822232
4014	NC_006449	ATA	2	6	252555	252560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55822232
4015	NC_006449	TGA	2	6	252601	252606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822232
4016	NC_006449	GAC	2	6	252619	252624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55822232
4017	NC_006449	CCAG	2	8	252641	252648	25 %	0 %	25 %	50 %	55822232
4018	NC_006449	CA	3	6	252674	252679	50 %	0 %	0 %	50 %	55822232
4019	NC_006449	GCA	2	6	252705	252710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55822232
4020	NC_006449	CTT	2	6	252930	252935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822233
4021	NC_006449	GTT	2	6	253000	253005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822233
4022	NC_006449	TAA	2	6	253093	253098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55822233
4023	NC_006449	TCAA	2	8	253227	253234	50 %	25 %	0 %	25 %	55822234
4024	NC_006449	TTG	2	6	253267	253272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822234
4025	NC_006449	GTG	2	6	253340	253345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822234
4026	NC_006449	TTC	2	6	253352	253357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822234
4027	NC_006449	GAG	2	6	253372	253377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55822234
4028	NC_006449	TTG	2	6	253469	253474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822234
4029	NC_006449	AAAC	2	8	253486	253493	75 %	0 %	0 %	25 %	55822234
4030	NC_006449	CT	3	6	253509	253514	0 %	50 %	0 %	50 %	55822234
4031	NC_006449	GGA	2	6	253536	253541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55822234
4032	NC_006449	CAG	2	6	253580	253585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55822234
4033	NC_006449	TGC	2	6	253587	253592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822234
4034	NC_006449	ATG	2	6	253598	253603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822234
4035	NC_006449	AGA	2	6	253643	253648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822234
4036	NC_006449	A	6	6	253726	253731	100 %	0 %	0 %	0 %	55822234
4037	NC_006449	CT	3	6	253757	253762	0 %	50 %	0 %	50 %	55822234
4038	NC_006449	AGAC	2	8	253793	253800	50 %	0 %	25 %	25 %	55822234
4039	NC_006449	GCCAG	2	10	253890	253899	20 %	0 %	40 %	40 %	55822234
4040	NC_006449	AG	3	6	253902	253907	50 %	0 %	50 %	0 %	55822234
4041	NC_006449	TGTTGC	2	12	253914	253925	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	55822234
4042	NC_006449	TAT	3	9	254048	254056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822235
4043	NC_006449	AGA	2	6	254066	254071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822235
4044	NC_006449	GTT	2	6	254091	254096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822235
4045	NC_006449	GTTA	2	8	254184	254191	25 %	50 %	25 %	0 %	55822235
4046	NC_006449	A	6	6	254211	254216	100 %	0 %	0 %	0 %	55822235
4047	NC_006449	GGT	2	6	254247	254252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822235
4048	NC_006449	T	6	6	254264	254269	0 %	100 %	0 %	0 %	55822235
4049	NC_006449	TAT	2	6	254271	254276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822235
4050	NC_006449	TAA	2	6	254297	254302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55822235
4051	NC_006449	A	6	6	254367	254372	100 %	0 %	0 %	0 %	55822235
4052	NC_006449	ATC	2	6	254382	254387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822235
4053	NC_006449	CCG	2	6	254418	254423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55822235
4054	NC_006449	TGG	2	6	254452	254457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822235
4055	NC_006449	AAG	2	6	254476	254481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822235
4056	NC_006449	T	6	6	254520	254525	0 %	100 %	0 %	0 %	55822235
4057	NC_006449	TTG	2	6	254653	254658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822236
4058	NC_006449	CAG	2	6	254677	254682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55822236
4059	NC_006449	CT	4	8	254707	254714	0 %	50 %	0 %	50 %	55822236
4060	NC_006449	ATT	2	6	254740	254745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822236
4061	NC_006449	TTG	2	6	254770	254775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822236
4062	NC_006449	T	7	7	254788	254794	0 %	100 %	0 %	0 %	55822236
4063	NC_006449	GTG	2	6	254800	254805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822236
4064	NC_006449	AAG	2	6	254810	254815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822236
4065	NC_006449	ATC	2	6	254883	254888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822236
4066	NC_006449	TCT	2	6	254941	254946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822236
4067	NC_006449	TTAA	2	8	255138	255145	50 %	50 %	0 %	0 %	55822236
4068	NC_006449	TAT	2	6	255153	255158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822236
4069	NC_006449	GATG	2	8	255180	255187	25 %	25 %	50 %	0 %	55822236
4070	NC_006449	TTA	2	6	255223	255228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822236
4071	NC_006449	GTCT	2	8	255464	255471	0 %	50 %	25 %	25 %	55822237
4072	NC_006449	T	6	6	255492	255497	0 %	100 %	0 %	0 %	55822237
4073	NC_006449	GTAG	2	8	255578	255585	25 %	25 %	50 %	0 %	55822237
4074	NC_006449	GTT	2	6	256050	256055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822238
4075	NC_006449	AG	3	6	256067	256072	50 %	0 %	50 %	0 %	55822238
4076	NC_006449	TTA	2	6	256131	256136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822238
4077	NC_006449	AG	3	6	256147	256152	50 %	0 %	50 %	0 %	55822238
4078	NC_006449	TAGG	2	8	256153	256160	25 %	25 %	50 %	0 %	55822238
4079	NC_006449	T	6	6	256190	256195	0 %	100 %	0 %	0 %	55822238
4080	NC_006449	ATC	2	6	256196	256201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822238
4081	NC_006449	TAG	2	6	256225	256230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822238
4082	NC_006449	ATC	2	6	256301	256306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822238
4083	NC_006449	TTTGG	2	10	256371	256380	0 %	60 %	40 %	0 %	55822238
4084	NC_006449	A	6	6	256563	256568	100 %	0 %	0 %	0 %	55822239
4085	NC_006449	CGG	2	6	256602	256607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55822239
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4088	NC_006449	CG	3	6	256903	256908	0 %	0 %	50 %	50 %	55822239
4089	NC_006449	TCT	2	6	256953	256958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822239
4090	NC_006449	CTTT	2	8	256988	256995	0 %	75 %	0 %	25 %	55822239
4091	NC_006449	GGT	2	6	257009	257014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822239
4092	NC_006449	TCT	2	6	257016	257021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822239
4093	NC_006449	ATC	2	6	257043	257048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822239
4094	NC_006449	GAA	2	6	257051	257056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822239
4095	NC_006449	CTT	2	6	257143	257148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822239
4096	NC_006449	GCT	2	6	257189	257194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822239
4097	NC_006449	GGT	2	6	257264	257269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822239
4098	NC_006449	TGC	2	6	257311	257316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822239
4099	NC_006449	TGA	2	6	257344	257349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822239
4100	NC_006449	ACC	2	6	257529	257534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55822239
4101	NC_006449	TTCG	2	8	257721	257728	0 %	50 %	25 %	25 %	55822239
4102	NC_006449	AAG	2	6	257745	257750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822239
4103	NC_006449	TCG	2	6	257770	257775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822239
4104	NC_006449	ATGA	2	8	257786	257793	50 %	25 %	25 %	0 %	55822239
4105	NC_006449	GATTT	2	10	257814	257823	20 %	60 %	20 %	0 %	55822239
4106	NC_006449	TAA	3	9	257874	257882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55822240
4107	NC_006449	AAG	2	6	257890	257895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822240
4108	NC_006449	CCTT	2	8	257930	257937	0 %	50 %	0 %	50 %	55822240
4109	NC_006449	GAA	2	6	257984	257989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822240
4110	NC_006449	CTT	2	6	258011	258016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822240
4111	NC_006449	TAG	3	9	258263	258271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822240
4112	NC_006449	CTG	2	6	258281	258286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822240
4113	NC_006449	ACTT	2	8	258289	258296	25 %	50 %	0 %	25 %	55822240
4114	NC_006449	T	6	6	258295	258300	0 %	100 %	0 %	0 %	55822240
4115	NC_006449	GAT	2	6	258301	258306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822240
4116	NC_006449	CT	3	6	258335	258340	0 %	50 %	0 %	50 %	55822240
4117	NC_006449	T	6	6	258369	258374	0 %	100 %	0 %	0 %	55822240
4118	NC_006449	TAAG	2	8	258402	258409	50 %	25 %	25 %	0 %	55822240
4119	NC_006449	ATT	2	6	258661	258666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822241
4120	NC_006449	CAAA	2	8	258720	258727	75 %	0 %	0 %	25 %	55822241
4121	NC_006449	ATG	2	6	258781	258786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822241
4122	NC_006449	GCA	2	6	258790	258795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55822241
4123	NC_006449	ATT	2	6	258841	258846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822241
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4125	NC_006449	A	6	6	258880	258885	100 %	0 %	0 %	0 %	55822241
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