MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus CNRZ1066 chromosome

Total Repeats: 30108

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25003	NC_006449	ATA	2	6	1497915	1497920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55823583
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25009	NC_006449	CTT	2	6	1498166	1498171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823583
25010	NC_006449	T	6	6	1498170	1498175	0 %	100 %	0 %	0 %	55823583
25011	NC_006449	ACTG	2	8	1498325	1498332	25 %	25 %	25 %	25 %	55823583
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25021	NC_006449	CTTC	2	8	1498860	1498867	0 %	50 %	0 %	50 %	55823584
25022	NC_006449	A	7	7	1498873	1498879	100 %	0 %	0 %	0 %	55823584
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25119	NC_006449	ATCCTC	2	12	1504612	1504623	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	55823588
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25229	NC_006449	ATTT	2	8	1512367	1512374	25 %	75 %	0 %	0 %	55823594
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25235	NC_006449	TCCAC	2	10	1512635	1512644	20 %	20 %	0 %	60 %	55823594
25236	NC_006449	TGGC	2	8	1512716	1512723	0 %	25 %	50 %	25 %	55823594
25237	NC_006449	AAG	2	6	1512747	1512752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55823594
25238	NC_006449	GAT	2	6	1512810	1512815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55823594
25239	NC_006449	AGA	2	6	1512929	1512934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55823594
25240	NC_006449	TCC	2	6	1512954	1512959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55823594
25241	NC_006449	CAA	2	6	1513019	1513024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55823594
25242	NC_006449	TTGAT	2	10	1513063	1513072	20 %	60 %	20 %	0 %	55823594
25243	NC_006449	ATC	2	6	1513089	1513094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823594
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25245	NC_006449	CTG	2	6	1513139	1513144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55823594
25246	NC_006449	TCCC	2	8	1513229	1513236	0 %	25 %	0 %	75 %	55823594
25247	NC_006449	TGC	2	6	1513264	1513269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55823594
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25249	NC_006449	GTA	2	6	1513314	1513319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55823594
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25252	NC_006449	TTC	2	6	1513532	1513537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823595
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25254	NC_006449	CTT	2	6	1513812	1513817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823595
25255	NC_006449	CAC	2	6	1513831	1513836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55823595
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25258	NC_006449	CAT	2	6	1514013	1514018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823595
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25264	NC_006449	GAT	2	6	1514297	1514302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55823595
25265	NC_006449	GA	3	6	1514325	1514330	50 %	0 %	50 %	0 %	55823595
25266	NC_006449	ATTG	2	8	1514509	1514516	25 %	50 %	25 %	0 %	55823595
25267	NC_006449	ATT	2	6	1514593	1514598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55823595
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25272	NC_006449	ATAG	2	8	1514938	1514945	50 %	25 %	25 %	0 %	55823595
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25299	NC_006449	CTT	3	9	1516329	1516337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823597
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25302	NC_006449	TGCT	2	8	1516413	1516420	0 %	50 %	25 %	25 %	55823597
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25312	NC_006449	AT	3	6	1517036	1517041	50 %	50 %	0 %	0 %	55823597
25313	NC_006449	CCT	2	6	1517155	1517160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55823598
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25317	NC_006449	TCA	2	6	1517376	1517381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823598
25318	NC_006449	TGAGCT	2	12	1517390	1517401	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	55823598
25319	NC_006449	ATG	2	6	1517416	1517421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55823598
25320	NC_006449	ACT	2	6	1517429	1517434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823598
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25322	NC_006449	ACC	2	6	1517555	1517560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55823599
25323	NC_006449	TAG	2	6	1517586	1517591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55823599
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25325	NC_006449	CAT	2	6	1517680	1517685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823599
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25327	NC_006449	ATA	2	6	1517785	1517790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55823600
25328	NC_006449	TTTG	2	8	1517813	1517820	0 %	75 %	25 %	0 %	55823600
25329	NC_006449	CAC	2	6	1517836	1517841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55823600
25330	NC_006449	GTC	2	6	1517905	1517910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55823600
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25332	NC_006449	ACTTGA	2	12	1517941	1517952	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	55823600
25333	NC_006449	TTCGCT	2	12	1517956	1517967	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	55823600
25334	NC_006449	TGA	2	6	1517992	1517997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55823600
25335	NC_006449	TTTG	2	8	1518005	1518012	0 %	75 %	25 %	0 %	55823600
25336	NC_006449	GCTAG	2	10	1518053	1518062	20 %	20 %	40 %	20 %	55823600
25337	NC_006449	TAA	2	6	1518076	1518081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55823600
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25342	NC_006449	TGA	3	9	1518312	1518320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55823601
25343	NC_006449	TAG	2	6	1518326	1518331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55823601
25344	NC_006449	AGT	2	6	1518454	1518459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55823601
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25346	NC_006449	AACAA	2	10	1518781	1518790	80 %	0 %	0 %	20 %	55823602
25347	NC_006449	AAT	2	6	1518795	1518800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55823602
25348	NC_006449	GAA	3	9	1518970	1518978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55823602
25349	NC_006449	ATT	2	6	1518979	1518984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55823602
25350	NC_006449	CAA	2	6	1518986	1518991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55823602
25351	NC_006449	TA	3	6	1519002	1519007	50 %	50 %	0 %	0 %	55823602
25352	NC_006449	ATC	2	6	1519050	1519055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823602
25353	NC_006449	AGC	2	6	1519058	1519063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55823602
25354	NC_006449	CTGA	2	8	1519364	1519371	25 %	25 %	25 %	25 %	55823603
25355	NC_006449	CTT	2	6	1519385	1519390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823603
25356	NC_006449	ATT	2	6	1519392	1519397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55823603
25357	NC_006449	TAAC	2	8	1519436	1519443	50 %	25 %	0 %	25 %	55823603
25358	NC_006449	TGT	2	6	1519464	1519469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55823603
25359	NC_006449	GTA	3	9	1519471	1519479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55823603
25360	NC_006449	CTT	4	12	1519502	1519513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823603
25361	NC_006449	TTGACC	2	12	1519975	1519986	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	55823604
25362	NC_006449	T	6	6	1520046	1520051	0 %	100 %	0 %	0 %	55823604
25363	NC_006449	TCA	2	6	1520234	1520239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823604
25364	NC_006449	CTA	2	6	1520247	1520252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823604
25365	NC_006449	CG	3	6	1520347	1520352	0 %	0 %	50 %	50 %	55823604
25366	NC_006449	TTC	2	6	1520404	1520409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823604
25367	NC_006449	AAC	2	6	1520425	1520430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55823604
25368	NC_006449	GA	3	6	1520431	1520436	50 %	0 %	50 %	0 %	55823604
25369	NC_006449	GCA	2	6	1520441	1520446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55823604
25370	NC_006449	AC	4	8	1520449	1520456	50 %	0 %	0 %	50 %	55823604
25371	NC_006449	TGA	2	6	1520478	1520483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55823604
25372	NC_006449	TTTC	2	8	1520574	1520581	0 %	75 %	0 %	25 %	55823604
25373	NC_006449	CCA	2	6	1520640	1520645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55823604
25374	NC_006449	CAA	2	6	1520679	1520684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55823604
25375	NC_006449	CTG	2	6	1520697	1520702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55823604
25376	NC_006449	TCC	2	6	1520773	1520778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55823604
25377	NC_006449	GAA	2	6	1520781	1520786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55823604
25378	NC_006449	ATT	2	6	1520794	1520799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55823604
25379	NC_006449	AAGGC	2	10	1520807	1520816	40 %	0 %	40 %	20 %	55823604
25380	NC_006449	ACT	2	6	1520927	1520932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823604
25381	NC_006449	ATA	2	6	1521080	1521085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55823604
25382	NC_006449	CTA	2	6	1521099	1521104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823604
25383	NC_006449	GCT	2	6	1521140	1521145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55823604
25384	NC_006449	GAC	2	6	1521165	1521170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55823604
25385	NC_006449	CTG	2	6	1521184	1521189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55823604
25386	NC_006449	ATGT	2	8	1521203	1521210	25 %	50 %	25 %	0 %	55823604
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25388	NC_006449	GAA	2	6	1521265	1521270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55823605
25389	NC_006449	CATT	2	8	1521289	1521296	25 %	50 %	0 %	25 %	55823605
25390	NC_006449	TCA	2	6	1521349	1521354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823605
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25392	NC_006449	TAC	2	6	1521373	1521378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823605
25393	NC_006449	CAG	2	6	1521379	1521384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55823605
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25395	NC_006449	TAAG	2	8	1521499	1521506	50 %	25 %	25 %	0 %	55823605
25396	NC_006449	CAA	2	6	1521514	1521519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55823605
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25400	NC_006449	TTGGT	2	10	1521717	1521726	0 %	60 %	40 %	0 %	55823605
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25402	NC_006449	TACC	2	8	1521796	1521803	25 %	25 %	0 %	50 %	55823605
25403	NC_006449	CTG	2	6	1521805	1521810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55823605
25404	NC_006449	AGCT	2	8	1521911	1521918	25 %	25 %	25 %	25 %	55823605
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25424	NC_006449	AGG	2	6	1522989	1522994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55823606
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25433	NC_006449	AG	3	6	1523449	1523454	50 %	0 %	50 %	0 %	55823606
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25445	NC_006449	AGTCA	2	10	1524094	1524103	40 %	20 %	20 %	20 %	55823607
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25463	NC_006449	CTTCT	2	10	1525256	1525265	0 %	60 %	0 %	40 %	55823609
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25466	NC_006449	AAG	3	9	1526050	1526058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55823610
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25470	NC_006449	ACG	2	6	1526137	1526142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55823610
25471	NC_006449	AAG	2	6	1526189	1526194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55823610
25472	NC_006449	CTTGA	2	10	1526224	1526233	20 %	40 %	20 %	20 %	55823610
25473	NC_006449	T	6	6	1526355	1526360	0 %	100 %	0 %	0 %	55823610
25474	NC_006449	AGGT	2	8	1526497	1526504	25 %	25 %	50 %	0 %	55823610
25475	NC_006449	GGT	2	6	1526523	1526528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55823610
25476	NC_006449	TCC	2	6	1526573	1526578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55823610
25477	NC_006449	ATC	2	6	1526599	1526604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823610
25478	NC_006449	CTG	2	6	1526613	1526618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55823610
25479	NC_006449	CTC	2	6	1526656	1526661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55823610
25480	NC_006449	CAA	2	6	1526667	1526672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55823610
25481	NC_006449	AATCC	2	10	1526725	1526734	40 %	20 %	0 %	40 %	55823610
25482	NC_006449	ATT	2	6	1526776	1526781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55823610
25483	NC_006449	CTG	2	6	1526800	1526805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55823610
25484	NC_006449	TCT	2	6	1526847	1526852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823610
25485	NC_006449	TCT	2	6	1526888	1526893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823610
25486	NC_006449	AAGGTC	2	12	1526933	1526944	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	55823610
25487	NC_006449	AAC	2	6	1526950	1526955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55823610
25488	NC_006449	ATA	2	6	1527035	1527040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55823610
25489	NC_006449	AAT	2	6	1527205	1527210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55823610
25490	NC_006449	ATCA	2	8	1527214	1527221	50 %	25 %	0 %	25 %	55823610
25491	NC_006449	GCAAG	2	10	1527276	1527285	40 %	0 %	40 %	20 %	55823610
25492	NC_006449	ATA	2	6	1527340	1527345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55823610
25493	NC_006449	AG	3	6	1527432	1527437	50 %	0 %	50 %	0 %	55823610
25494	NC_006449	AAG	2	6	1527502	1527507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55823610
25495	NC_006449	ATT	2	6	1527622	1527627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55823610
25496	NC_006449	AGG	2	6	1527767	1527772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55823610
25497	NC_006449	GCT	2	6	1527844	1527849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55823610
25498	NC_006449	CTT	2	6	1527867	1527872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823610
25499	NC_006449	TCA	2	6	1527893	1527898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823610
25500	NC_006449	TAT	2	6	1527900	1527905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55823610

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