MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus CNRZ1066 chromosome

Total Repeats: 30108

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_006449	A	6	6	95959	95964	100 %	0 %	0 %	0 %	55822075
1502	NC_006449	TTA	2	6	96058	96063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822075
1503	NC_006449	AGA	2	6	96134	96139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822075
1504	NC_006449	GTTG	2	8	96140	96147	0 %	50 %	50 %	0 %	55822075
1505	NC_006449	TGA	2	6	96158	96163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822075
1506	NC_006449	ATGA	2	8	96465	96472	50 %	25 %	25 %	0 %	55822076
1507	NC_006449	TGT	2	6	96506	96511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822076
1508	NC_006449	TGA	2	6	96572	96577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822076
1509	NC_006449	CTT	2	6	96729	96734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822077
1510	NC_006449	AGA	2	6	96794	96799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822077
1511	NC_006449	AAC	2	6	97251	97256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55822078
1512	NC_006449	AATC	2	8	97262	97269	50 %	25 %	0 %	25 %	55822078
1513	NC_006449	AAAC	2	8	97326	97333	75 %	0 %	0 %	25 %	55822078
1514	NC_006449	AAG	2	6	97396	97401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822078
1515	NC_006449	TCA	2	6	97458	97463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822078
1516	NC_006449	GT	3	6	97478	97483	0 %	50 %	50 %	0 %	55822078
1517	NC_006449	TC	3	6	97503	97508	0 %	50 %	0 %	50 %	55822078
1518	NC_006449	TTA	2	6	97511	97516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822078
1519	NC_006449	TTA	2	6	97631	97636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822078
1520	NC_006449	AAG	2	6	97754	97759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822078
1521	NC_006449	ATGG	2	8	97786	97793	25 %	25 %	50 %	0 %	55822078
1522	NC_006449	TGA	2	6	97887	97892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822078
1523	NC_006449	GAT	2	6	97893	97898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822078
1524	NC_006449	TATG	2	8	97959	97966	25 %	50 %	25 %	0 %	55822078
1525	NC_006449	A	7	7	97995	98001	100 %	0 %	0 %	0 %	55822079
1526	NC_006449	GAAA	2	8	98042	98049	75 %	0 %	25 %	0 %	55822079
1527	NC_006449	ATC	2	6	98142	98147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822079
1528	NC_006449	TG	3	6	98148	98153	0 %	50 %	50 %	0 %	55822079
1529	NC_006449	CAG	2	6	98260	98265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55822079
1530	NC_006449	GGA	2	6	98372	98377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55822079
1531	NC_006449	AAC	2	6	98432	98437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55822079
1532	NC_006449	AAATA	2	10	98497	98506	80 %	20 %	0 %	0 %	55822079
1533	NC_006449	AT	3	6	98512	98517	50 %	50 %	0 %	0 %	55822080
1534	NC_006449	CAG	2	6	98544	98549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55822080
1535	NC_006449	ATG	2	6	98577	98582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822080
1536	NC_006449	GAT	2	6	98612	98617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822080
1537	NC_006449	AAG	2	6	98679	98684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822080
1538	NC_006449	TCG	2	6	98737	98742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822080
1539	NC_006449	TGA	2	6	98758	98763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822080
1540	NC_006449	TCA	2	6	98783	98788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822080
1541	NC_006449	GGC	2	6	98881	98886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55822080
1542	NC_006449	TC	3	6	98905	98910	0 %	50 %	0 %	50 %	55822080
1543	NC_006449	GGC	2	6	98917	98922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55822080
1544	NC_006449	TGA	2	6	99010	99015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822080
1545	NC_006449	ATC	2	6	99021	99026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822080
1546	NC_006449	ATT	2	6	99062	99067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822080
1547	NC_006449	CTT	2	6	99092	99097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822080
1548	NC_006449	A	6	6	99149	99154	100 %	0 %	0 %	0 %	55822080
1549	NC_006449	GCT	2	6	99236	99241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822080
1550	NC_006449	TTA	2	6	99291	99296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822080
1551	NC_006449	TAAAGT	2	12	99374	99385	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	55822080
1552	NC_006449	GAT	2	6	99875	99880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822081
1553	NC_006449	ATG	2	6	99897	99902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822081
1554	NC_006449	CT	3	6	99913	99918	0 %	50 %	0 %	50 %	55822081
1555	NC_006449	CGA	2	6	99981	99986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55822081
1556	NC_006449	ATA	2	6	100020	100025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55822081
1557	NC_006449	ATC	3	9	100026	100034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822081
1558	NC_006449	TAT	2	6	100037	100042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822081
1559	NC_006449	TGA	2	6	100054	100059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822081
1560	NC_006449	GTT	2	6	100139	100144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822081
1561	NC_006449	TAGT	2	8	100171	100178	25 %	50 %	25 %	0 %	55822081
1562	NC_006449	GTG	2	6	100353	100358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822082
1563	NC_006449	GCT	2	6	100378	100383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822082
1564	NC_006449	GGT	2	6	100460	100465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822082
1565	NC_006449	ATCA	2	8	100470	100477	50 %	25 %	0 %	25 %	55822082
1566	NC_006449	AGA	2	6	100525	100530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822082
1567	NC_006449	CGAA	2	8	100594	100601	50 %	0 %	25 %	25 %	55822082
1568	NC_006449	TTC	2	6	100610	100615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822082
1569	NC_006449	GAAT	2	8	100641	100648	50 %	25 %	25 %	0 %	55822082
1570	NC_006449	AATC	2	8	100669	100676	50 %	25 %	0 %	25 %	55822082
1571	NC_006449	GAT	2	6	100811	100816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822082
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1573	NC_006449	CTGA	2	8	100868	100875	25 %	25 %	25 %	25 %	55822082
1574	NC_006449	T	6	6	100879	100884	0 %	100 %	0 %	0 %	55822082
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1577	NC_006449	CTC	2	6	101046	101051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55822082
1578	NC_006449	TGA	2	6	101062	101067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822082
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1583	NC_006449	CACAC	2	10	101627	101636	40 %	0 %	0 %	60 %	55822083
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1591	NC_006449	CAA	2	6	101898	101903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55822083
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1593	NC_006449	A	6	6	102057	102062	100 %	0 %	0 %	0 %	55822084
1594	NC_006449	AGA	2	6	102068	102073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822084
1595	NC_006449	CAAC	2	8	102107	102114	50 %	0 %	0 %	50 %	55822084
1596	NC_006449	ACG	2	6	102145	102150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55822084
1597	NC_006449	GGT	2	6	102168	102173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822084
1598	NC_006449	CTT	2	6	102222	102227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822084
1599	NC_006449	CTT	2	6	102270	102275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822084
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1602	NC_006449	ATTC	2	8	102681	102688	25 %	50 %	0 %	25 %	55822085
1603	NC_006449	ATT	2	6	102726	102731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822085
1604	NC_006449	ATG	2	6	102927	102932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822086
1605	NC_006449	ACAT	2	8	102965	102972	50 %	25 %	0 %	25 %	55822086
1606	NC_006449	AGT	2	6	103066	103071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822086
1607	NC_006449	ATT	3	9	103076	103084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822086
1608	NC_006449	ATA	2	6	103105	103110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55822086
1609	NC_006449	TGG	2	6	103426	103431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822087
1610	NC_006449	GTT	2	6	103446	103451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822087
1611	NC_006449	A	7	7	104349	104355	100 %	0 %	0 %	0 %	55822088
1612	NC_006449	ATG	2	6	104371	104376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822088
1613	NC_006449	AGC	2	6	104380	104385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55822088
1614	NC_006449	TTG	2	6	104411	104416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822088
1615	NC_006449	GGA	2	6	104453	104458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55822088
1616	NC_006449	TTG	2	6	104536	104541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822088
1617	NC_006449	ATT	2	6	104579	104584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822088
1618	NC_006449	AAAC	2	8	104613	104620	75 %	0 %	0 %	25 %	55822088
1619	NC_006449	TCA	2	6	104640	104645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822088
1620	NC_006449	AGT	2	6	104646	104651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822088
1621	NC_006449	AGA	2	6	104654	104659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822088
1622	NC_006449	T	6	6	104666	104671	0 %	100 %	0 %	0 %	55822088
1623	NC_006449	AAG	2	6	104686	104691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822088
1624	NC_006449	A	6	6	104715	104720	100 %	0 %	0 %	0 %	55822088
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1626	NC_006449	TTG	2	6	104776	104781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822088
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1754	NC_006449	GTA	2	6	112403	112408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822093
1755	NC_006449	CTTT	2	8	112447	112454	0 %	75 %	0 %	25 %	55822093
1756	NC_006449	TTGAGC	2	12	112488	112499	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	55822093
1757	NC_006449	GTT	2	6	112527	112532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822093
1758	NC_006449	TTC	2	6	112569	112574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822094
1759	NC_006449	ATT	2	6	112712	112717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822094
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1761	NC_006449	TTG	2	6	113211	113216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822095
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1765	NC_006449	CTC	2	6	113365	113370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55822095
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1778	NC_006449	ATC	2	6	113859	113864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822095
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1780	NC_006449	CAT	2	6	113928	113933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822095
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1783	NC_006449	GATT	2	8	114061	114068	25 %	50 %	25 %	0 %	55822095
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1852	NC_006449	GGT	2	6	118679	118684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822103
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1863	NC_006449	TA	3	6	119216	119221	50 %	50 %	0 %	0 %	55822104
1864	NC_006449	GAA	2	6	119302	119307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822104
1865	NC_006449	CAT	2	6	119403	119408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822104
1866	NC_006449	GTG	2	6	119466	119471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822104
1867	NC_006449	TGG	2	6	119487	119492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822104
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1869	NC_006449	T	7	7	119506	119512	0 %	100 %	0 %	0 %	55822104
1870	NC_006449	GT	3	6	119516	119521	0 %	50 %	50 %	0 %	55822104
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1874	NC_006449	GGT	3	9	119692	119700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822104
1875	NC_006449	TCG	2	6	119708	119713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822104
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1999	NC_006449	GAC	2	6	125836	125841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55822110
2000	NC_006449	GTCATG	2	12	125984	125995	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	55822110

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