MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus CNRZ1066 chromosome

Total Repeats: 30108

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_006449	ACC	2	6	1135148	1135153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55823202
19003	NC_006449	GAA	2	6	1135285	1135290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55823202
19004	NC_006449	GAA	2	6	1135318	1135323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55823202
19005	NC_006449	ACT	2	6	1135325	1135330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823202
19006	NC_006449	CAA	2	6	1135369	1135374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55823202
19007	NC_006449	TTCC	2	8	1135393	1135400	0 %	50 %	0 %	50 %	55823203
19008	NC_006449	T	6	6	1135406	1135411	0 %	100 %	0 %	0 %	55823203
19009	NC_006449	TAA	2	6	1135420	1135425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55823203
19010	NC_006449	TAG	2	6	1135446	1135451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55823203
19011	NC_006449	TCA	2	6	1135498	1135503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823203
19012	NC_006449	CAAG	2	8	1135573	1135580	50 %	0 %	25 %	25 %	55823203
19013	NC_006449	ACA	2	6	1135629	1135634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55823203
19014	NC_006449	TG	3	6	1135660	1135665	0 %	50 %	50 %	0 %	55823203
19015	NC_006449	A	6	6	1135696	1135701	100 %	0 %	0 %	0 %	55823203
19016	NC_006449	ACCA	2	8	1135766	1135773	50 %	0 %	0 %	50 %	55823203
19017	NC_006449	ATA	2	6	1135782	1135787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55823203
19018	NC_006449	CCT	2	6	1135806	1135811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55823203
19019	NC_006449	ACA	2	6	1135848	1135853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55823203
19020	NC_006449	AG	3	6	1135871	1135876	50 %	0 %	50 %	0 %	55823203
19021	NC_006449	TAT	2	6	1136046	1136051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55823204
19022	NC_006449	CAA	3	9	1136175	1136183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55823204
19023	NC_006449	TTA	2	6	1136216	1136221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55823204
19024	NC_006449	AGA	2	6	1136250	1136255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55823204
19025	NC_006449	TTC	2	6	1136275	1136280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823204
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19027	NC_006449	AGAA	2	8	1136413	1136420	75 %	0 %	25 %	0 %	55823204
19028	NC_006449	AAT	2	6	1136512	1136517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55823204
19029	NC_006449	AAGC	2	8	1136522	1136529	50 %	0 %	25 %	25 %	55823204
19030	NC_006449	ATT	2	6	1136564	1136569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55823204
19031	NC_006449	TATC	2	8	1136728	1136735	25 %	50 %	0 %	25 %	55823205
19032	NC_006449	TAT	2	6	1136912	1136917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55823205
19033	NC_006449	ACC	2	6	1137027	1137032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55823205
19034	NC_006449	TAT	2	6	1137050	1137055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55823205
19035	NC_006449	A	6	6	1137094	1137099	100 %	0 %	0 %	0 %	55823205
19036	NC_006449	GAC	2	6	1137113	1137118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55823205
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19038	NC_006449	CT	3	6	1137168	1137173	0 %	50 %	0 %	50 %	55823205
19039	NC_006449	AAC	2	6	1137225	1137230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55823205
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19041	NC_006449	AAAAG	2	10	1137415	1137424	80 %	0 %	20 %	0 %	55823205
19042	NC_006449	TCG	2	6	1137459	1137464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55823205
19043	NC_006449	ACT	2	6	1137513	1137518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823205
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19047	NC_006449	A	6	6	1137722	1137727	100 %	0 %	0 %	0 %	55823205
19048	NC_006449	CAA	2	6	1137743	1137748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55823205
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19050	NC_006449	TAT	2	6	1138030	1138035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55823206
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19052	NC_006449	T	6	6	1138233	1138238	0 %	100 %	0 %	0 %	55823206
19053	NC_006449	ATC	2	6	1138269	1138274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823206
19054	NC_006449	TGC	2	6	1138293	1138298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55823206
19055	NC_006449	TAA	2	6	1138358	1138363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55823206
19056	NC_006449	TAC	2	6	1138637	1138642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823207
19057	NC_006449	CCCA	2	8	1138746	1138753	25 %	0 %	0 %	75 %	55823207
19058	NC_006449	AT	3	6	1138847	1138852	50 %	50 %	0 %	0 %	55823208
19059	NC_006449	AT	3	6	1138881	1138886	50 %	50 %	0 %	0 %	55823208
19060	NC_006449	TGA	2	6	1138887	1138892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55823208
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19062	NC_006449	T	6	6	1139146	1139151	0 %	100 %	0 %	0 %	55823209
19063	NC_006449	CTT	2	6	1139167	1139172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823209
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19089	NC_006449	CAA	2	6	1140658	1140663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55823209
19090	NC_006449	TG	3	6	1140664	1140669	0 %	50 %	50 %	0 %	55823209
19091	NC_006449	TTC	2	6	1140671	1140676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823209
19092	NC_006449	GCAT	2	8	1140696	1140703	25 %	25 %	25 %	25 %	55823209
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19107	NC_006449	CAG	2	6	1141393	1141398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55823209
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19109	NC_006449	T	6	6	1141438	1141443	0 %	100 %	0 %	0 %	55823209
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19111	NC_006449	TAAC	2	8	1141497	1141504	50 %	25 %	0 %	25 %	55823209
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19115	NC_006449	CTT	2	6	1141975	1141980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823210
19116	NC_006449	GCAAA	2	10	1141981	1141990	60 %	0 %	20 %	20 %	55823210
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19119	NC_006449	TGC	2	6	1142073	1142078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55823210
19120	NC_006449	CAT	2	6	1142125	1142130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823210
19121	NC_006449	TTC	2	6	1142156	1142161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823210
19122	NC_006449	TAT	2	6	1142233	1142238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55823210
19123	NC_006449	TTC	2	6	1142285	1142290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823210
19124	NC_006449	CTT	2	6	1142293	1142298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823210
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19223	NC_006449	AC	3	6	1148255	1148260	50 %	0 %	0 %	50 %	55823213
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19229	NC_006449	AG	3	6	1148577	1148582	50 %	0 %	50 %	0 %	55823214
19230	NC_006449	GAAT	2	8	1148595	1148602	50 %	25 %	25 %	0 %	55823214
19231	NC_006449	GCT	2	6	1148615	1148620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55823214
19232	NC_006449	GCATG	2	10	1148655	1148664	20 %	20 %	40 %	20 %	55823214
19233	NC_006449	TCA	2	6	1148669	1148674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823214
19234	NC_006449	CAA	2	6	1148880	1148885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55823214
19235	NC_006449	TGT	2	6	1148901	1148906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55823214
19236	NC_006449	GAT	2	6	1148908	1148913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55823214
19237	NC_006449	CTT	2	6	1148964	1148969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823214
19238	NC_006449	TTG	2	6	1148978	1148983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55823214
19239	NC_006449	CTG	2	6	1149006	1149011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55823214
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19242	NC_006449	CTC	2	6	1149139	1149144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55823214
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19472	NC_006449	ATGCTG	2	12	1163899	1163910	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	55823229
19473	NC_006449	T	6	6	1163968	1163973	0 %	100 %	0 %	0 %	55823229
19474	NC_006449	TGT	2	6	1164044	1164049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55823229
19475	NC_006449	AATCA	2	10	1164083	1164092	60 %	20 %	0 %	20 %	55823229
19476	NC_006449	TCA	2	6	1164105	1164110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823229
19477	NC_006449	ACT	2	6	1164123	1164128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823229
19478	NC_006449	CTG	2	6	1164142	1164147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55823229
19479	NC_006449	GCCACC	2	12	1164179	1164190	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	55823229
19480	NC_006449	AGC	2	6	1164218	1164223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55823229
19481	NC_006449	CAT	2	6	1164229	1164234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823229
19482	NC_006449	GAA	2	6	1164350	1164355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55823230
19483	NC_006449	TGAT	2	8	1164377	1164384	25 %	50 %	25 %	0 %	55823230
19484	NC_006449	ACA	2	6	1164424	1164429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55823230
19485	NC_006449	TCC	3	9	1164462	1164470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55823230
19486	NC_006449	ATA	2	6	1164577	1164582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55823230
19487	NC_006449	CTA	2	6	1164656	1164661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823230
19488	NC_006449	AGCTAA	2	12	1164672	1164683	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	55823230
19489	NC_006449	TAT	2	6	1164782	1164787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55823230
19490	NC_006449	AAT	2	6	1164816	1164821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55823230
19491	NC_006449	ATT	2	6	1164966	1164971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55823230
19492	NC_006449	GAAA	2	8	1165005	1165012	75 %	0 %	25 %	0 %	55823230
19493	NC_006449	CTT	2	6	1165025	1165030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823230
19494	NC_006449	TGAC	2	8	1165074	1165081	25 %	25 %	25 %	25 %	55823230
19495	NC_006449	CTT	2	6	1165094	1165099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823230
19496	NC_006449	AGA	2	6	1165132	1165137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55823230
19497	NC_006449	GCT	2	6	1165144	1165149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55823230
19498	NC_006449	TCAC	2	8	1165156	1165163	25 %	25 %	0 %	50 %	55823230
19499	NC_006449	TGC	2	6	1165209	1165214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55823230
19500	NC_006449	CTTTT	2	10	1165247	1165256	0 %	80 %	0 %	20 %	55823230

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