MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus CNRZ1066 chromosome

Total Repeats: 30108

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_006449	GCT	2	6	1077784	1077789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55823145
18002	NC_006449	T	6	6	1077824	1077829	0 %	100 %	0 %	0 %	55823145
18003	NC_006449	ACCTT	2	10	1077931	1077940	20 %	40 %	0 %	40 %	55823145
18004	NC_006449	CTG	2	6	1078046	1078051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55823145
18005	NC_006449	A	6	6	1078115	1078120	100 %	0 %	0 %	0 %	55823145
18006	NC_006449	TCA	2	6	1078189	1078194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823145
18007	NC_006449	GATAA	2	10	1078214	1078223	60 %	20 %	20 %	0 %	55823145
18008	NC_006449	TTC	2	6	1078302	1078307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823145
18009	NC_006449	GGAA	2	8	1078316	1078323	50 %	0 %	50 %	0 %	55823145
18010	NC_006449	TAA	2	6	1078376	1078381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55823145
18011	NC_006449	T	7	7	1078385	1078391	0 %	100 %	0 %	0 %	55823145
18012	NC_006449	TTG	2	6	1078409	1078414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55823145
18013	NC_006449	TTCC	2	8	1078436	1078443	0 %	50 %	0 %	50 %	55823145
18014	NC_006449	GAG	2	6	1078479	1078484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55823145
18015	NC_006449	T	7	7	1078585	1078591	0 %	100 %	0 %	0 %	55823146
18016	NC_006449	ATA	2	6	1078635	1078640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55823146
18017	NC_006449	TTGA	2	8	1078686	1078693	25 %	50 %	25 %	0 %	55823146
18018	NC_006449	AGCT	2	8	1078694	1078701	25 %	25 %	25 %	25 %	55823146
18019	NC_006449	CTT	2	6	1078775	1078780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823146
18020	NC_006449	CAAA	2	8	1078859	1078866	75 %	0 %	0 %	25 %	55823146
18021	NC_006449	TCA	2	6	1078915	1078920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823146
18022	NC_006449	TCA	2	6	1078984	1078989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823146
18023	NC_006449	TGC	2	6	1079049	1079054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55823146
18024	NC_006449	TAA	2	6	1079096	1079101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55823146
18025	NC_006449	TGG	3	9	1079106	1079114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55823146
18026	NC_006449	TAA	2	6	1079117	1079122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55823146
18027	NC_006449	ACC	2	6	1079193	1079198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55823146
18028	NC_006449	ATTT	2	8	1079250	1079257	25 %	75 %	0 %	0 %	55823147
18029	NC_006449	TTC	2	6	1079281	1079286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823147
18030	NC_006449	TCA	2	6	1079402	1079407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823147
18031	NC_006449	GA	3	6	1079453	1079458	50 %	0 %	50 %	0 %	55823147
18032	NC_006449	CTA	2	6	1079481	1079486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823147
18033	NC_006449	ATT	2	6	1079488	1079493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55823147
18034	NC_006449	TTC	2	6	1079581	1079586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823147
18035	NC_006449	AGG	2	6	1079621	1079626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55823147
18036	NC_006449	TTC	2	6	1079641	1079646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823147
18037	NC_006449	CCA	2	6	1079667	1079672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55823147
18038	NC_006449	AACC	2	8	1079697	1079704	50 %	0 %	0 %	50 %	55823147
18039	NC_006449	ATC	2	6	1079800	1079805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823147
18040	NC_006449	ATA	2	6	1079819	1079824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55823147
18041	NC_006449	TC	3	6	1079901	1079906	0 %	50 %	0 %	50 %	55823147
18042	NC_006449	TTC	2	6	1079909	1079914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823147
18043	NC_006449	CAA	2	6	1079916	1079921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55823147
18044	NC_006449	ACG	2	6	1079965	1079970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55823147
18045	NC_006449	GAC	2	6	1080024	1080029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55823147
18046	NC_006449	TGAGC	2	10	1080072	1080081	20 %	20 %	40 %	20 %	55823147
18047	NC_006449	TGC	2	6	1080175	1080180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55823147
18048	NC_006449	GTA	2	6	1080230	1080235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55823147
18049	NC_006449	CCA	2	6	1080249	1080254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55823147
18050	NC_006449	TAGC	2	8	1080326	1080333	25 %	25 %	25 %	25 %	55823147
18051	NC_006449	CTG	2	6	1080348	1080353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55823147
18052	NC_006449	TCC	2	6	1080374	1080379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55823147
18053	NC_006449	CTA	2	6	1080420	1080425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823147
18054	NC_006449	TGC	2	6	1080440	1080445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55823147
18055	NC_006449	ACG	2	6	1080618	1080623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55823148
18056	NC_006449	GTTT	2	8	1080746	1080753	0 %	75 %	25 %	0 %	55823148
18057	NC_006449	CTTTA	2	10	1080780	1080789	20 %	60 %	0 %	20 %	55823148
18058	NC_006449	ACG	2	6	1080810	1080815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55823148
18059	NC_006449	AGA	2	6	1080826	1080831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55823148
18060	NC_006449	ATTTT	2	10	1080832	1080841	20 %	80 %	0 %	0 %	55823148
18061	NC_006449	TGGTA	2	10	1080854	1080863	20 %	40 %	40 %	0 %	55823148
18062	NC_006449	GAA	2	6	1080956	1080961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55823148
18063	NC_006449	GCC	2	6	1080970	1080975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55823148
18064	NC_006449	ATC	2	6	1081003	1081008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823148
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18066	NC_006449	TTA	2	6	1081045	1081050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55823148
18067	NC_006449	CTA	2	6	1081118	1081123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823148
18068	NC_006449	TCT	2	6	1081132	1081137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823148
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18070	NC_006449	ATC	2	6	1081234	1081239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823148
18071	NC_006449	CCAA	2	8	1081286	1081293	50 %	0 %	0 %	50 %	55823148
18072	NC_006449	TTTCC	2	10	1081343	1081352	0 %	60 %	0 %	40 %	55823148
18073	NC_006449	TGC	2	6	1081392	1081397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55823148
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18079	NC_006449	GAAA	2	8	1081618	1081625	75 %	0 %	25 %	0 %	55823148
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18083	NC_006449	ACA	2	6	1081819	1081824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55823148
18084	NC_006449	GACAT	2	10	1081867	1081876	40 %	20 %	20 %	20 %	55823148
18085	NC_006449	ACCA	2	8	1081929	1081936	50 %	0 %	0 %	50 %	55823148
18086	NC_006449	T	6	6	1081993	1081998	0 %	100 %	0 %	0 %	55823148
18087	NC_006449	TGA	2	6	1082330	1082335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55823149
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18089	NC_006449	TCA	2	6	1082380	1082385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823149
18090	NC_006449	GAC	2	6	1082415	1082420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55823149
18091	NC_006449	GACAAT	2	12	1082441	1082452	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	55823149
18092	NC_006449	TTC	2	6	1082474	1082479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823149
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18098	NC_006449	TC	3	6	1083156	1083161	0 %	50 %	0 %	50 %	55823151
18099	NC_006449	ATG	2	6	1083287	1083292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55823151
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18102	NC_006449	TCA	3	9	1083525	1083533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823151
18103	NC_006449	AG	3	6	1083746	1083751	50 %	0 %	50 %	0 %	55823151
18104	NC_006449	GTT	2	6	1083765	1083770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55823151
18105	NC_006449	AAT	2	6	1083796	1083801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55823151
18106	NC_006449	ATG	2	6	1083830	1083835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55823151
18107	NC_006449	CAT	2	6	1083863	1083868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823151
18108	NC_006449	T	6	6	1083878	1083883	0 %	100 %	0 %	0 %	55823152
18109	NC_006449	CAT	2	6	1083925	1083930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823152
18110	NC_006449	TAA	2	6	1083996	1084001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55823152
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18113	NC_006449	GAA	2	6	1084069	1084074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55823152
18114	NC_006449	ACT	2	6	1084100	1084105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823152
18115	NC_006449	CTT	2	6	1084168	1084173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823152
18116	NC_006449	AAAG	2	8	1084185	1084192	75 %	0 %	25 %	0 %	55823152
18117	NC_006449	CAT	2	6	1084254	1084259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823152
18118	NC_006449	CGA	2	6	1084282	1084287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55823152
18119	NC_006449	CCCA	2	8	1084313	1084320	25 %	0 %	0 %	75 %	55823152
18120	NC_006449	ATA	2	6	1084420	1084425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55823152
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18122	NC_006449	GTC	2	6	1084596	1084601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55823153
18123	NC_006449	AAG	2	6	1084604	1084609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55823153
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18146	NC_006449	CTC	3	9	1086231	1086239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55823155
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18155	NC_006449	CAG	2	6	1086824	1086829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55823155
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18237	NC_006449	AACC	2	8	1091243	1091250	50 %	0 %	0 %	50 %	55823162
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18474	NC_006449	TGA	2	6	1105305	1105310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55823175
18475	NC_006449	ATT	2	6	1105311	1105316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55823175
18476	NC_006449	AAG	2	6	1105324	1105329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55823175
18477	NC_006449	ATA	2	6	1105359	1105364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55823175
18478	NC_006449	GAT	2	6	1105365	1105370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55823175
18479	NC_006449	ATA	2	6	1105396	1105401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55823175
18480	NC_006449	A	6	6	1105550	1105555	100 %	0 %	0 %	0 %	55823176
18481	NC_006449	TAT	2	6	1105580	1105585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55823176
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18492	NC_006449	TTC	2	6	1106232	1106237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823177
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