MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus CNRZ1066 chromosome

Total Repeats: 30108

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_006449	GTC	2	6	696620	696625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822706
11502	NC_006449	TCT	2	6	696634	696639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822706
11503	NC_006449	GAC	2	6	696642	696647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55822706
11504	NC_006449	AAG	2	6	696966	696971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822707
11505	NC_006449	GAT	2	6	696998	697003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822707
11506	NC_006449	TAC	2	6	697036	697041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822707
11507	NC_006449	GAA	2	6	697058	697063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822707
11508	NC_006449	TGA	2	6	697078	697083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822707
11509	NC_006449	CAGT	2	8	697103	697110	25 %	25 %	25 %	25 %	55822707
11510	NC_006449	CAG	3	9	697149	697157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55822707
11511	NC_006449	GAA	2	6	697211	697216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822707
11512	NC_006449	TTC	2	6	697239	697244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822707
11513	NC_006449	CTTAG	2	10	697349	697358	20 %	40 %	20 %	20 %	55822707
11514	NC_006449	TTG	2	6	697382	697387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822707
11515	NC_006449	CAAC	2	8	697388	697395	50 %	0 %	0 %	50 %	55822707
11516	NC_006449	GTT	2	6	697436	697441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822707
11517	NC_006449	ATTC	2	8	697641	697648	25 %	50 %	0 %	25 %	55822707
11518	NC_006449	AAG	2	6	697710	697715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822707
11519	NC_006449	A	7	7	697725	697731	100 %	0 %	0 %	0 %	55822707
11520	NC_006449	TAAAT	2	10	697753	697762	60 %	40 %	0 %	0 %	55822707
11521	NC_006449	TAA	2	6	698084	698089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55822708
11522	NC_006449	GAA	2	6	698115	698120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822708
11523	NC_006449	CGT	2	6	698136	698141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822708
11524	NC_006449	ATG	2	6	698179	698184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822708
11525	NC_006449	CCT	2	6	698187	698192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55822708
11526	NC_006449	TGGG	2	8	698297	698304	0 %	25 %	75 %	0 %	55822708
11527	NC_006449	TATC	2	8	698546	698553	25 %	50 %	0 %	25 %	55822708
11528	NC_006449	TGGTCA	2	12	698574	698585	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	55822708
11529	NC_006449	GATACT	2	12	698685	698696	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	55822708
11530	NC_006449	TTG	2	6	698701	698706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822708
11531	NC_006449	ACA	2	6	698715	698720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55822708
11532	NC_006449	TTG	2	6	698812	698817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822708
11533	NC_006449	GAA	2	6	698859	698864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822708
11534	NC_006449	GTG	2	6	698887	698892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822708
11535	NC_006449	AAATC	2	10	698900	698909	60 %	20 %	0 %	20 %	55822708
11536	NC_006449	TGA	2	6	698939	698944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822708
11537	NC_006449	ACA	2	6	698970	698975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55822708
11538	NC_006449	GTA	2	6	699060	699065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822708
11539	NC_006449	AACG	2	8	699072	699079	50 %	0 %	25 %	25 %	55822708
11540	NC_006449	ATG	2	6	699087	699092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822708
11541	NC_006449	CTT	2	6	699171	699176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822708
11542	NC_006449	AGA	2	6	699182	699187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822708
11543	NC_006449	TC	3	6	699190	699195	0 %	50 %	0 %	50 %	55822708
11544	NC_006449	ATC	2	6	699231	699236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822708
11545	NC_006449	ACA	2	6	699346	699351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55822708
11546	NC_006449	GTG	2	6	699364	699369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822708
11547	NC_006449	TCT	2	6	699415	699420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822708
11548	NC_006449	GAA	2	6	699450	699455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822708
11549	NC_006449	TGG	2	6	699504	699509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822708
11550	NC_006449	TCT	2	6	699527	699532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822708
11551	NC_006449	CA	3	6	699545	699550	50 %	0 %	0 %	50 %	55822708
11552	NC_006449	TG	3	6	699599	699604	0 %	50 %	50 %	0 %	55822708
11553	NC_006449	GTT	2	6	699633	699638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822708
11554	NC_006449	TGGT	2	8	699701	699708	0 %	50 %	50 %	0 %	55822708
11555	NC_006449	TCA	2	6	699714	699719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822708
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11557	NC_006449	TTC	2	6	699871	699876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822708
11558	NC_006449	ATG	2	6	699907	699912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822708
11559	NC_006449	AC	3	6	699970	699975	50 %	0 %	0 %	50 %	55822708
11560	NC_006449	CAA	2	6	700012	700017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55822708
11561	NC_006449	AT	3	6	700058	700063	50 %	50 %	0 %	0 %	55822708
11562	NC_006449	CGT	2	6	700233	700238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822708
11563	NC_006449	TCT	2	6	700252	700257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822708
11564	NC_006449	TCCT	2	8	700297	700304	0 %	50 %	0 %	50 %	55822708
11565	NC_006449	AGA	2	6	700313	700318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822708
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11569	NC_006449	CTAT	2	8	700516	700523	25 %	50 %	0 %	25 %	55822708
11570	NC_006449	CTG	2	6	700627	700632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822708
11571	NC_006449	TTCA	2	8	700649	700656	25 %	50 %	0 %	25 %	55822708
11572	NC_006449	GTC	2	6	700693	700698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822708
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11579	NC_006449	AAT	3	9	701198	701206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55822709
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11581	NC_006449	AAG	2	6	701311	701316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822710
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11584	NC_006449	AAACT	2	10	701410	701419	60 %	20 %	0 %	20 %	55822710
11585	NC_006449	TGG	2	6	701590	701595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822711
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11587	NC_006449	GTA	3	9	701672	701680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822711
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11591	NC_006449	CTG	3	9	702105	702113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822712
11592	NC_006449	GGT	2	6	702116	702121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822712
11593	NC_006449	CTCAA	2	10	702136	702145	40 %	20 %	0 %	40 %	55822712
11594	NC_006449	CTT	2	6	702153	702158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822712
11595	NC_006449	ATGG	2	8	702159	702166	25 %	25 %	50 %	0 %	55822712
11596	NC_006449	TTC	2	6	702212	702217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822712
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11599	NC_006449	TAC	2	6	702406	702411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822712
11600	NC_006449	ATT	2	6	702419	702424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822712
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11602	NC_006449	TGG	2	6	702457	702462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822712
11603	NC_006449	AGC	2	6	702523	702528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55822712
11604	NC_006449	GTT	2	6	702530	702535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822712
11605	NC_006449	CTT	2	6	702623	702628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822712
11606	NC_006449	GGAT	2	8	702629	702636	25 %	25 %	50 %	0 %	55822712
11607	NC_006449	AGC	2	6	702751	702756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55822712
11608	NC_006449	GCT	2	6	702824	702829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822712
11609	NC_006449	TGAA	2	8	702966	702973	50 %	25 %	25 %	0 %	55822712
11610	NC_006449	AGA	2	6	703000	703005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822712
11611	NC_006449	ATT	2	6	703064	703069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822712
11612	NC_006449	TTC	3	9	703070	703078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822712
11613	NC_006449	AAT	2	6	703093	703098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55822712
11614	NC_006449	ACA	2	6	703130	703135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55822712
11615	NC_006449	GAA	2	6	703177	703182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822712
11616	NC_006449	T	6	6	703427	703432	0 %	100 %	0 %	0 %	161936371
11617	NC_006449	CGTC	2	8	703449	703456	0 %	25 %	25 %	50 %	161936371
11618	NC_006449	TG	3	6	703461	703466	0 %	50 %	50 %	0 %	161936371
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11984	NC_006449	AAT	2	6	723344	723349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55822736
11985	NC_006449	TGA	2	6	723368	723373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822736
11986	NC_006449	AATT	2	8	723393	723400	50 %	50 %	0 %	0 %	55822736
11987	NC_006449	AT	3	6	723406	723411	50 %	50 %	0 %	0 %	55822736
11988	NC_006449	TTAG	2	8	723727	723734	25 %	50 %	25 %	0 %	55822737
11989	NC_006449	CTG	2	6	723752	723757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822737
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11991	NC_006449	CCA	2	6	723832	723837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55822737
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