MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus CNRZ1066 chromosome

Total Repeats: 30108

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006449	TTTGCT	2	12	34207	34218	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	55822023
502	NC_006449	TGC	2	6	34279	34284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822023
503	NC_006449	CAG	2	6	34425	34430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55822023
504	NC_006449	TTCA	2	8	34490	34497	25 %	50 %	0 %	25 %	55822023
505	NC_006449	TACT	2	8	34555	34562	25 %	50 %	0 %	25 %	55822023
506	NC_006449	GCC	2	6	34575	34580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55822023
507	NC_006449	GCAA	2	8	34645	34652	50 %	0 %	25 %	25 %	55822023
508	NC_006449	AT	3	6	34663	34668	50 %	50 %	0 %	0 %	55822023
509	NC_006449	TGA	2	6	34678	34683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822023
510	NC_006449	CTT	2	6	34847	34852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822023
511	NC_006449	ACC	2	6	34875	34880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55822023
512	NC_006449	TGG	2	6	34900	34905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822023
513	NC_006449	GGT	2	6	34922	34927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822023
514	NC_006449	ACA	2	6	35000	35005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55822023
515	NC_006449	CAA	2	6	35039	35044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55822023
516	NC_006449	A	6	6	35054	35059	100 %	0 %	0 %	0 %	55822023
517	NC_006449	TTC	2	6	35074	35079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822023
518	NC_006449	CAA	2	6	35103	35108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55822023
519	NC_006449	TGT	2	6	35194	35199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822023
520	NC_006449	GGT	2	6	35240	35245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822023
521	NC_006449	GGT	2	6	35267	35272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822023
522	NC_006449	TTC	2	6	35281	35286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822023
523	NC_006449	GAA	2	6	35351	35356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822023
524	NC_006449	TGG	2	6	35428	35433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822023
525	NC_006449	TG	3	6	35438	35443	0 %	50 %	50 %	0 %	55822023
526	NC_006449	TGG	2	6	35559	35564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822023
527	NC_006449	AGA	2	6	35572	35577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822023
528	NC_006449	TTG	2	6	35685	35690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822023
529	NC_006449	CGT	2	6	35699	35704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822023
530	NC_006449	AGT	2	6	35731	35736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822023
531	NC_006449	GGT	2	6	35746	35751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822023
532	NC_006449	AGA	2	6	35773	35778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822023
533	NC_006449	CTG	2	6	35790	35795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822023
534	NC_006449	GGT	2	6	35912	35917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822023
535	NC_006449	ACA	2	6	35978	35983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55822023
536	NC_006449	TGC	2	6	36046	36051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822023
537	NC_006449	A	6	6	36149	36154	100 %	0 %	0 %	0 %	55822023
538	NC_006449	CTT	2	6	36185	36190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822023
539	NC_006449	TGG	2	6	36232	36237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822023
540	NC_006449	GAA	2	6	36263	36268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822023
541	NC_006449	ACC	2	6	36277	36282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55822023
542	NC_006449	ACA	2	6	36305	36310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55822023
543	NC_006449	GCT	2	6	36347	36352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822023
544	NC_006449	CTA	2	6	36364	36369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822023
545	NC_006449	GATT	2	8	36397	36404	25 %	50 %	25 %	0 %	55822023
546	NC_006449	TCA	2	6	36411	36416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822023
547	NC_006449	TGG	2	6	36487	36492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822023
548	NC_006449	CTTGCA	2	12	36506	36517	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	55822023
549	NC_006449	GGA	2	6	36587	36592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55822023
550	NC_006449	AGA	2	6	36766	36771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822023
551	NC_006449	CTG	2	6	36777	36782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822023
552	NC_006449	AGT	2	6	36814	36819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822023
553	NC_006449	AAG	2	6	36894	36899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822023
554	NC_006449	TGAA	2	8	36933	36940	50 %	25 %	25 %	0 %	55822023
555	NC_006449	TGT	2	6	36958	36963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822023
556	NC_006449	CAG	2	6	37020	37025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55822023
557	NC_006449	AGC	2	6	37042	37047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55822023
558	NC_006449	GTG	2	6	37113	37118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822023
559	NC_006449	ATC	2	6	37124	37129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822023
560	NC_006449	ATG	2	6	37227	37232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822023
561	NC_006449	CCAA	2	8	37233	37240	50 %	0 %	0 %	50 %	55822023
562	NC_006449	GAC	2	6	37360	37365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55822023
563	NC_006449	GAA	2	6	37367	37372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822023
564	NC_006449	CAAG	2	8	37491	37498	50 %	0 %	25 %	25 %	55822023
565	NC_006449	ATT	2	6	37508	37513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822023
566	NC_006449	ATA	2	6	37621	37626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55822023
567	NC_006449	GAA	2	6	37820	37825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822024
568	NC_006449	TGC	2	6	37858	37863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822024
569	NC_006449	TC	3	6	37924	37929	0 %	50 %	0 %	50 %	55822024
570	NC_006449	ATG	2	6	37932	37937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822024
571	NC_006449	TC	3	6	37972	37977	0 %	50 %	0 %	50 %	55822024
572	NC_006449	GCT	2	6	38024	38029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822024
573	NC_006449	GAA	2	6	38173	38178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822024
574	NC_006449	TCG	2	6	38230	38235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822024
575	NC_006449	CAT	2	6	38247	38252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822024
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577	NC_006449	CTT	2	6	38306	38311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822024
578	NC_006449	AGT	2	6	38425	38430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822024
579	NC_006449	GTT	2	6	38468	38473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822024
580	NC_006449	ATC	2	6	38474	38479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822024
581	NC_006449	GAT	2	6	38480	38485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822024
582	NC_006449	ACA	2	6	38510	38515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55822024
583	NC_006449	TCA	2	6	38675	38680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822024
584	NC_006449	GAA	2	6	38705	38710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822024
585	NC_006449	AAATG	2	10	38722	38731	60 %	20 %	20 %	0 %	55822024
586	NC_006449	A	6	6	38740	38745	100 %	0 %	0 %	0 %	55822024
587	NC_006449	CCAA	2	8	38770	38777	50 %	0 %	0 %	50 %	55822024
588	NC_006449	CT	3	6	38813	38818	0 %	50 %	0 %	50 %	55822024
589	NC_006449	GTT	2	6	38831	38836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822024
590	NC_006449	AAC	2	6	38881	38886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55822024
591	NC_006449	CGT	2	6	38891	38896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822024
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594	NC_006449	CA	3	6	39023	39028	50 %	0 %	0 %	50 %	55822024
595	NC_006449	AGA	2	6	39031	39036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822024
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597	NC_006449	TTGA	2	8	39089	39096	25 %	50 %	25 %	0 %	55822024
598	NC_006449	TGG	2	6	39127	39132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822024
599	NC_006449	TG	3	6	39137	39142	0 %	50 %	50 %	0 %	55822024
600	NC_006449	ACT	2	6	39144	39149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822024
601	NC_006449	A	6	6	39186	39191	100 %	0 %	0 %	0 %	55822024
602	NC_006449	GAA	2	6	39209	39214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822024
603	NC_006449	CTT	2	6	39219	39224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822024
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608	NC_006449	TGCT	2	8	39471	39478	0 %	50 %	25 %	25 %	55822025
609	NC_006449	TG	3	6	39515	39520	0 %	50 %	50 %	0 %	55822025
610	NC_006449	TG	3	6	39525	39530	0 %	50 %	50 %	0 %	55822025
611	NC_006449	TG	3	6	39644	39649	0 %	50 %	50 %	0 %	55822025
612	NC_006449	TGG	2	6	39670	39675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822025
613	NC_006449	CTG	2	6	39681	39686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822025
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618	NC_006449	ACTC	2	8	39837	39844	25 %	25 %	0 %	50 %	55822025
619	NC_006449	TCG	2	6	39847	39852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822025
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625	NC_006449	GGT	3	9	40004	40012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822025
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627	NC_006449	GAA	2	6	40130	40135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822025
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629	NC_006449	GAA	2	6	40249	40254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822025
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760	NC_006449	CA	3	6	47871	47876	50 %	0 %	0 %	50 %	55822034
761	NC_006449	ACT	2	6	47886	47891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822034
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