MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus CNRZ1066 chromosome

Total Repeats: 30108

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_006449	CTAT	2	8	459647	459654	25 %	50 %	0 %	25 %	55822457
7502	NC_006449	CAA	2	6	459713	459718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55822457
7503	NC_006449	TTG	2	6	459806	459811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822457
7504	NC_006449	GAA	2	6	459814	459819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822457
7505	NC_006449	TTGG	2	8	459928	459935	0 %	50 %	50 %	0 %	55822457
7506	NC_006449	TCG	2	6	459942	459947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822457
7507	NC_006449	TTC	2	6	459955	459960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822457
7508	NC_006449	CGTAG	2	10	460093	460102	20 %	20 %	40 %	20 %	55822457
7509	NC_006449	GTA	2	6	460117	460122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822457
7510	NC_006449	GCTAAA	2	12	460123	460134	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	55822457
7511	NC_006449	CTA	2	6	460143	460148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822457
7512	NC_006449	ACC	2	6	460211	460216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55822458
7513	NC_006449	TCG	2	6	460317	460322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822458
7514	NC_006449	GATTG	2	10	460345	460354	20 %	40 %	40 %	0 %	55822458
7515	NC_006449	GGT	2	6	460363	460368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822458
7516	NC_006449	ATC	2	6	460369	460374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822458
7517	NC_006449	GAT	2	6	460384	460389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822458
7518	NC_006449	CAG	2	6	460412	460417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55822458
7519	NC_006449	GAA	3	9	460483	460491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822458
7520	NC_006449	GAA	2	6	460507	460512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822458
7521	NC_006449	CAA	2	6	460514	460519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55822458
7522	NC_006449	ATG	3	9	460532	460540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822458
7523	NC_006449	A	8	8	460607	460614	100 %	0 %	0 %	0 %	55822458
7524	NC_006449	T	6	6	460850	460855	0 %	100 %	0 %	0 %	55822459
7525	NC_006449	TGGT	2	8	460924	460931	0 %	50 %	50 %	0 %	55822459
7526	NC_006449	CAA	2	6	460948	460953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55822459
7527	NC_006449	TTA	2	6	461031	461036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822459
7528	NC_006449	T	6	6	461043	461048	0 %	100 %	0 %	0 %	55822459
7529	NC_006449	ATTGAA	2	12	461057	461068	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	55822459
7530	NC_006449	TAA	2	6	461101	461106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55822459
7531	NC_006449	GTT	2	6	461127	461132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822459
7532	NC_006449	ATGG	2	8	461167	461174	25 %	25 %	50 %	0 %	55822459
7533	NC_006449	TTG	2	6	461224	461229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822459
7534	NC_006449	ACA	2	6	461258	461263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55822459
7535	NC_006449	AGA	2	6	461327	461332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822459
7536	NC_006449	ATC	2	6	461409	461414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822459
7537	NC_006449	GTC	2	6	461498	461503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822459
7538	NC_006449	GATT	2	8	461515	461522	25 %	50 %	25 %	0 %	55822459
7539	NC_006449	TTGG	2	8	461526	461533	0 %	50 %	50 %	0 %	55822459
7540	NC_006449	CTATG	2	10	461648	461657	20 %	40 %	20 %	20 %	55822459
7541	NC_006449	G	6	6	461664	461669	0 %	0 %	100 %	0 %	55822459
7542	NC_006449	TTC	2	6	461812	461817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822459
7543	NC_006449	TAT	2	6	461819	461824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822459
7544	NC_006449	ATG	2	6	461862	461867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822459
7545	NC_006449	CTTTC	2	10	461959	461968	0 %	60 %	0 %	40 %	55822459
7546	NC_006449	GGT	2	6	461973	461978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822459
7547	NC_006449	CT	3	6	461981	461986	0 %	50 %	0 %	50 %	55822459
7548	NC_006449	TGC	2	6	462026	462031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822459
7549	NC_006449	ATA	2	6	462046	462051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55822459
7550	NC_006449	A	7	7	462108	462114	100 %	0 %	0 %	0 %	55822459
7551	NC_006449	GAA	2	6	462127	462132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822459
7552	NC_006449	GTA	2	6	462400	462405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822460
7553	NC_006449	ACT	2	6	462453	462458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822460
7554	NC_006449	TCG	2	6	462488	462493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822460
7555	NC_006449	AC	3	6	462511	462516	50 %	0 %	0 %	50 %	55822460
7556	NC_006449	GCT	2	6	462540	462545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822460
7557	NC_006449	AGA	2	6	462548	462553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822460
7558	NC_006449	CTT	2	6	462747	462752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822460
7559	NC_006449	GAA	2	6	462816	462821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822460
7560	NC_006449	CTT	2	6	462855	462860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822460
7561	NC_006449	TGA	2	6	462881	462886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822460
7562	NC_006449	CAT	3	9	462947	462955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822460
7563	NC_006449	TGA	2	6	462961	462966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822460
7564	NC_006449	CCAGAA	2	12	462987	462998	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	55822460
7565	NC_006449	TTG	2	6	463017	463022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822460
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7567	NC_006449	TTG	2	6	463120	463125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822460
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7570	NC_006449	TGA	2	6	463187	463192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822460
7571	NC_006449	CTT	2	6	463221	463226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822460
7572	NC_006449	TGA	2	6	463241	463246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822460
7573	NC_006449	TCAA	2	8	463281	463288	50 %	25 %	0 %	25 %	55822460
7574	NC_006449	CA	3	6	463291	463296	50 %	0 %	0 %	50 %	55822460
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7580	NC_006449	AGA	2	6	463873	463878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822461
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7584	NC_006449	TGC	2	6	464008	464013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822461
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7587	NC_006449	TGT	2	6	464095	464100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822461
7588	NC_006449	CGT	2	6	464117	464122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822461
7589	NC_006449	ACT	2	6	464124	464129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822461
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7591	NC_006449	A	6	6	464156	464161	100 %	0 %	0 %	0 %	55822461
7592	NC_006449	ATC	2	6	464195	464200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822461
7593	NC_006449	TGT	2	6	464201	464206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822461
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7601	NC_006449	GGT	2	6	464525	464530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822461
7602	NC_006449	AAT	2	6	464577	464582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55822461
7603	NC_006449	AG	3	6	464903	464908	50 %	0 %	50 %	0 %	55822462
7604	NC_006449	GTGGC	2	10	464946	464955	0 %	20 %	60 %	20 %	55822462
7605	NC_006449	ATA	2	6	464994	464999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55822462
7606	NC_006449	TGC	2	6	465037	465042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822462
7607	NC_006449	TCG	2	6	465043	465048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822462
7608	NC_006449	AAT	2	6	465182	465187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55822462
7609	NC_006449	TTG	2	6	465221	465226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822462
7610	NC_006449	AGCTGA	2	12	465349	465360	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	55822462
7611	NC_006449	GAA	2	6	465401	465406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822462
7612	NC_006449	ATT	2	6	465428	465433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822462
7613	NC_006449	TTAT	2	8	465439	465446	25 %	75 %	0 %	0 %	55822462
7614	NC_006449	TTAT	2	8	465534	465541	25 %	75 %	0 %	0 %	55822463
7615	NC_006449	GTC	2	6	465635	465640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822463
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7617	NC_006449	AG	3	6	465736	465741	50 %	0 %	50 %	0 %	55822463
7618	NC_006449	GAA	2	6	465841	465846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822463
7619	NC_006449	TGA	2	6	465882	465887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822463
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7621	NC_006449	AG	3	6	465971	465976	50 %	0 %	50 %	0 %	55822463
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7995	NC_006449	GTC	2	6	487472	487477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822491
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7997	NC_006449	ACT	2	6	487510	487515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822491
7998	NC_006449	AGG	2	6	487534	487539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55822491
7999	NC_006449	TTA	2	6	487641	487646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822492
8000	NC_006449	GTG	2	6	487689	487694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822492

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