MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus CNRZ1066 chromosome

Total Repeats: 30108

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_006449	AGA	2	6	279858	279863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822272
4502	NC_006449	TGG	2	6	279924	279929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822272
4503	NC_006449	GTG	2	6	280034	280039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822272
4504	NC_006449	TAT	2	6	280092	280097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822272
4505	NC_006449	A	6	6	280115	280120	100 %	0 %	0 %	0 %	55822272
4506	NC_006449	GAT	2	6	280143	280148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822272
4507	NC_006449	AAT	2	6	280273	280278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55822272
4508	NC_006449	AGA	2	6	280299	280304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822272
4509	NC_006449	CTA	2	6	280324	280329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822272
4510	NC_006449	AAG	2	6	280422	280427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822273
4511	NC_006449	TGGG	2	8	280494	280501	0 %	25 %	75 %	0 %	55822273
4512	NC_006449	TAA	2	6	280543	280548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55822273
4513	NC_006449	ACCT	2	8	280579	280586	25 %	25 %	0 %	50 %	55822273
4514	NC_006449	ACA	2	6	280618	280623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55822273
4515	NC_006449	GAA	2	6	280643	280648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822273
4516	NC_006449	TGA	2	6	280672	280677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822273
4517	NC_006449	ATT	2	6	280806	280811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822273
4518	NC_006449	CT	3	6	280866	280871	0 %	50 %	0 %	50 %	55822273
4519	NC_006449	GAA	2	6	281070	281075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822273
4520	NC_006449	CTG	2	6	281076	281081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822273
4521	NC_006449	TCG	2	6	281089	281094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822273
4522	NC_006449	CAT	2	6	281095	281100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822273
4523	NC_006449	A	6	6	281161	281166	100 %	0 %	0 %	0 %	55822273
4524	NC_006449	GAG	2	6	281173	281178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55822273
4525	NC_006449	A	6	6	281181	281186	100 %	0 %	0 %	0 %	55822273
4526	NC_006449	A	7	7	281300	281306	100 %	0 %	0 %	0 %	55822274
4527	NC_006449	TCCT	2	8	281339	281346	0 %	50 %	0 %	50 %	55822274
4528	NC_006449	ATG	2	6	281351	281356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822274
4529	NC_006449	CCT	2	6	281436	281441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55822274
4530	NC_006449	TGG	2	6	281491	281496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822274
4531	NC_006449	TGT	2	6	281533	281538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822274
4532	NC_006449	T	6	6	281609	281614	0 %	100 %	0 %	0 %	55822274
4533	NC_006449	ATA	2	6	281832	281837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55822274
4534	NC_006449	A	6	6	281855	281860	100 %	0 %	0 %	0 %	55822274
4535	NC_006449	TTCA	2	8	282025	282032	25 %	50 %	0 %	25 %	55822274
4536	NC_006449	TGC	2	6	282094	282099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822274
4537	NC_006449	CTG	2	6	282102	282107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822274
4538	NC_006449	TTC	2	6	282116	282121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822274
4539	NC_006449	CTT	2	6	282256	282261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822275
4540	NC_006449	T	6	6	282414	282419	0 %	100 %	0 %	0 %	55822275
4541	NC_006449	A	7	7	282448	282454	100 %	0 %	0 %	0 %	55822275
4542	NC_006449	GTT	2	6	282462	282467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822275
4543	NC_006449	CTTA	2	8	282501	282508	25 %	50 %	0 %	25 %	55822275
4544	NC_006449	CTTT	2	8	282525	282532	0 %	75 %	0 %	25 %	55822275
4545	NC_006449	TTA	2	6	282564	282569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822275
4546	NC_006449	AT	3	6	282663	282668	50 %	50 %	0 %	0 %	55822275
4547	NC_006449	GGC	2	6	282727	282732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55822275
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4549	NC_006449	TCA	2	6	282853	282858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822275
4550	NC_006449	CTGG	2	8	282879	282886	0 %	25 %	50 %	25 %	55822275
4551	NC_006449	TAG	2	6	282899	282904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822275
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4553	NC_006449	A	7	7	282978	282984	100 %	0 %	0 %	0 %	55822276
4554	NC_006449	TTA	2	6	283076	283081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822276
4555	NC_006449	GAA	2	6	283097	283102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822276
4556	NC_006449	TTCTT	2	10	283113	283122	0 %	80 %	0 %	20 %	55822276
4557	NC_006449	ATG	2	6	283236	283241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822276
4558	NC_006449	GAA	2	6	283277	283282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822276
4559	NC_006449	TGG	2	6	283360	283365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822276
4560	NC_006449	AGA	2	6	283371	283376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822276
4561	NC_006449	TGA	2	6	283426	283431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822276
4562	NC_006449	AAT	2	6	283439	283444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55822276
4563	NC_006449	GAA	2	6	283460	283465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822276
4564	NC_006449	T	6	6	283466	283471	0 %	100 %	0 %	0 %	55822276
4565	NC_006449	TTCA	2	8	283491	283498	25 %	50 %	0 %	25 %	55822276
4566	NC_006449	TCA	2	6	283525	283530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822276
4567	NC_006449	TCA	2	6	283543	283548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822276
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4569	NC_006449	TTTC	2	8	283591	283598	0 %	75 %	0 %	25 %	55822276
4570	NC_006449	ATT	2	6	283647	283652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822276
4571	NC_006449	TAT	2	6	283816	283821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822277
4572	NC_006449	A	7	7	283829	283835	100 %	0 %	0 %	0 %	55822277
4573	NC_006449	TGCT	2	8	283875	283882	0 %	50 %	25 %	25 %	55822277
4574	NC_006449	AAG	2	6	283905	283910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822277
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4578	NC_006449	AGA	2	6	284146	284151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822277
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4580	NC_006449	ATG	2	6	284238	284243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822277
4581	NC_006449	GTT	2	6	284267	284272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822277
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4588	NC_006449	GAA	2	6	284561	284566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822277
4589	NC_006449	A	6	6	284660	284665	100 %	0 %	0 %	0 %	55822277
4590	NC_006449	A	7	7	284837	284843	100 %	0 %	0 %	0 %	55822278
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4593	NC_006449	GAT	2	6	284924	284929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822278
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4595	NC_006449	AAC	2	6	285119	285124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55822278
4596	NC_006449	CTA	2	6	285252	285257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822278
4597	NC_006449	CTG	2	6	285408	285413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822278
4598	NC_006449	TCA	2	6	285434	285439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822278
4599	NC_006449	GTT	2	6	285452	285457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822278
4600	NC_006449	AAC	2	6	285458	285463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55822278
4601	NC_006449	CAA	3	9	285473	285481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55822278
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4603	NC_006449	TAA	2	6	285559	285564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55822278
4604	NC_006449	CAAA	2	8	285579	285586	75 %	0 %	0 %	25 %	55822278
4605	NC_006449	ATG	2	6	285624	285629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822278
4606	NC_006449	ATG	2	6	285648	285653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822278
4607	NC_006449	GAA	2	6	285806	285811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822279
4608	NC_006449	AGC	2	6	285813	285818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55822279
4609	NC_006449	ATG	2	6	285834	285839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822279
4610	NC_006449	A	6	6	285884	285889	100 %	0 %	0 %	0 %	55822279
4611	NC_006449	TGC	2	6	285925	285930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822279
4612	NC_006449	T	6	6	285945	285950	0 %	100 %	0 %	0 %	55822279
4613	NC_006449	ATT	2	6	286043	286048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822279
4614	NC_006449	GAT	2	6	286100	286105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822279
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4616	NC_006449	GAT	3	9	286154	286162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822279
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4619	NC_006449	CAA	2	6	286387	286392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55822280
4620	NC_006449	ATT	2	6	286397	286402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822280
4621	NC_006449	TGTC	2	8	286413	286420	0 %	50 %	25 %	25 %	55822280
4622	NC_006449	TACT	2	8	286481	286488	25 %	50 %	0 %	25 %	55822280
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4624	NC_006449	CGT	2	6	286664	286669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822280
4625	NC_006449	TAT	2	6	286685	286690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822280
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4627	NC_006449	GAA	2	6	286892	286897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822281
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4651	NC_006449	TCA	2	6	288468	288473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822283
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4871	NC_006449	TTAC	2	8	301253	301260	25 %	50 %	0 %	25 %	55822294
4872	NC_006449	ATT	2	6	301345	301350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822295
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4993	NC_006449	A	6	6	306948	306953	100 %	0 %	0 %	0 %	55822299
4994	NC_006449	CCTTG	2	10	307122	307131	0 %	40 %	20 %	40 %	55822300
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4997	NC_006449	T	6	6	307275	307280	0 %	100 %	0 %	0 %	55822300
4998	NC_006449	TTG	3	9	307288	307296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822300
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