MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 30284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
27501	NC_006448	CCAA	2	8	1647126	1647133	50 %	0 %	0 %	50 %	55821819
27502	NC_006448	TAA	2	6	1647152	1647157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821819
27503	NC_006448	CAA	2	6	1647245	1647250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821819
27504	NC_006448	GAAGC	2	10	1647329	1647338	40 %	0 %	40 %	20 %	55821819
27505	NC_006448	ACT	2	6	1647391	1647396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821819
27506	NC_006448	AAG	2	6	1647405	1647410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821819
27507	NC_006448	ATC	2	6	1647444	1647449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821819
27508	NC_006448	ATTG	2	8	1647472	1647479	25 %	50 %	25 %	0 %	55821819
27509	NC_006448	GCT	2	6	1647511	1647516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821819
27510	NC_006448	A	7	7	1647530	1647536	100 %	0 %	0 %	0 %	55821819
27511	NC_006448	C	6	6	1647598	1647603	0 %	0 %	0 %	100 %	55821819
27512	NC_006448	CAATTC	2	12	1647611	1647622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821819
27513	NC_006448	ATAG	2	8	1647626	1647633	50 %	25 %	25 %	0 %	55821819
27514	NC_006448	TTC	2	6	1647663	1647668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821819
27515	NC_006448	CAA	2	6	1647680	1647685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821819
27516	NC_006448	TAT	2	6	1647758	1647763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821819
27517	NC_006448	ACC	2	6	1647789	1647794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821819
27518	NC_006448	CCA	2	6	1647850	1647855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821819
27519	NC_006448	ACT	2	6	1648053	1648058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821820
27520	NC_006448	ATC	2	6	1648064	1648069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821820
27521	NC_006448	AAT	2	6	1648076	1648081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821820
27522	NC_006448	CAT	2	6	1648130	1648135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821820
27523	NC_006448	CAC	2	6	1648150	1648155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821820
27524	NC_006448	CAT	2	6	1648190	1648195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821820
27525	NC_006448	CTT	2	6	1648265	1648270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821820
27526	NC_006448	GGT	2	6	1648300	1648305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55821820
27527	NC_006448	TCA	2	6	1648329	1648334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821820
27528	NC_006448	CAAG	2	8	1648494	1648501	50 %	0 %	25 %	25 %	55821820
27529	NC_006448	TCA	2	6	1648515	1648520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821820
27530	NC_006448	ACCTT	2	10	1648536	1648545	20 %	40 %	0 %	40 %	55821820
27531	NC_006448	CTACG	2	10	1648552	1648561	20 %	20 %	20 %	40 %	55821820
27532	NC_006448	TCC	2	6	1648578	1648583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821820
27533	NC_006448	TAAC	2	8	1648588	1648595	50 %	25 %	0 %	25 %	55821820
27534	NC_006448	TCT	2	6	1648674	1648679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821821
27535	NC_006448	ATC	2	6	1648787	1648792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821821
27536	NC_006448	TGGC	2	8	1648824	1648831	0 %	25 %	50 %	25 %	55821821
27537	NC_006448	A	6	6	1648889	1648894	100 %	0 %	0 %	0 %	55821821
27538	NC_006448	TTC	2	6	1648934	1648939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821821
27539	NC_006448	AAT	2	6	1648952	1648957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821821
27540	NC_006448	TCC	2	6	1648967	1648972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821822
27541	NC_006448	CCT	2	6	1649036	1649041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821822
27542	NC_006448	TTC	2	6	1649141	1649146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821822
27543	NC_006448	AAG	2	6	1649366	1649371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821823
27544	NC_006448	TGG	2	6	1649472	1649477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55821823
27545	NC_006448	GTA	2	6	1649593	1649598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821823
27546	NC_006448	AC	3	6	1649649	1649654	50 %	0 %	0 %	50 %	55821823
27547	NC_006448	TATC	2	8	1649667	1649674	25 %	50 %	0 %	25 %	55821823
27548	NC_006448	GCA	2	6	1649714	1649719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821823
27549	NC_006448	GTC	2	6	1649752	1649757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821823
27550	NC_006448	CCAA	2	8	1649774	1649781	50 %	0 %	0 %	50 %	55821823
27551	NC_006448	GAA	2	6	1649782	1649787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821823
27552	NC_006448	ATT	2	6	1649821	1649826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821823
27553	NC_006448	A	7	7	1649858	1649864	100 %	0 %	0 %	0 %	55821823
27554	NC_006448	AAT	2	6	1649947	1649952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821823
27555	NC_006448	AAG	3	9	1649978	1649986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821823
27556	NC_006448	GTG	2	6	1649996	1650001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55821823
27557	NC_006448	AAGGT	2	10	1650083	1650092	40 %	20 %	40 %	0 %	55821823
27558	NC_006448	TTC	2	6	1650115	1650120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821823
27559	NC_006448	CAT	2	6	1650132	1650137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821823
27560	NC_006448	ACT	2	6	1650166	1650171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821823
27561	NC_006448	GAA	2	6	1650175	1650180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821823
27562	NC_006448	TAC	2	6	1650199	1650204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821823
27563	NC_006448	G	6	6	1650214	1650219	0 %	0 %	100 %	0 %	55821823
27564	NC_006448	CAA	2	6	1650263	1650268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821823
27565	NC_006448	AAG	2	6	1650364	1650369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821823
27566	NC_006448	ACT	2	6	1650401	1650406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821823
27567	NC_006448	TAT	2	6	1650465	1650470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821824
27568	NC_006448	TAAA	2	8	1650479	1650486	75 %	25 %	0 %	0 %	55821824
27569	NC_006448	ATT	2	6	1650502	1650507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821824
27570	NC_006448	TCT	2	6	1650514	1650519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821824
27571	NC_006448	GCT	3	9	1650562	1650570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821824
27572	NC_006448	TAG	2	6	1650584	1650589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821824
27573	NC_006448	CTGAT	2	10	1650596	1650605	20 %	40 %	20 %	20 %	55821824
27574	NC_006448	GCT	2	6	1650682	1650687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821824
27575	NC_006448	TCAC	2	8	1650712	1650719	25 %	25 %	0 %	50 %	55821824
27576	NC_006448	ACCT	2	8	1650728	1650735	25 %	25 %	0 %	50 %	55821824
27577	NC_006448	ACT	2	6	1650781	1650786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821824
27578	NC_006448	ACT	2	6	1650859	1650864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821824
27579	NC_006448	TAAG	2	8	1650977	1650984	50 %	25 %	25 %	0 %	55821824
27580	NC_006448	CA	3	6	1651005	1651010	50 %	0 %	0 %	50 %	55821824
27581	NC_006448	CTG	2	6	1651025	1651030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821824
27582	NC_006448	TGG	2	6	1651089	1651094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55821824
27583	NC_006448	GCCAAA	2	12	1651174	1651185	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	55821824
27584	NC_006448	A	6	6	1651183	1651188	100 %	0 %	0 %	0 %	55821824
27585	NC_006448	CAT	2	6	1651260	1651265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821825
27586	NC_006448	AT	3	6	1651365	1651370	50 %	50 %	0 %	0 %	55821825
27587	NC_006448	CAA	2	6	1651436	1651441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821825
27588	NC_006448	GAG	2	6	1651470	1651475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55821825
27589	NC_006448	CAT	2	6	1651599	1651604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821825
27590	NC_006448	ATC	2	6	1651657	1651662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821825
27591	NC_006448	AAG	2	6	1651701	1651706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821825
27592	NC_006448	A	6	6	1651846	1651851	100 %	0 %	0 %	0 %	55821825
27593	NC_006448	AATCA	2	10	1652106	1652115	60 %	20 %	0 %	20 %	55821826
27594	NC_006448	CTG	2	6	1652155	1652160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821826
27595	NC_006448	GCA	2	6	1652196	1652201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821826
27596	NC_006448	TGA	2	6	1652211	1652216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821826
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27598	NC_006448	AATA	2	8	1652330	1652337	75 %	25 %	0 %	0 %	55821826
27599	NC_006448	AAAGA	2	10	1652352	1652361	80 %	0 %	20 %	0 %	55821826
27600	NC_006448	T	7	7	1652407	1652413	0 %	100 %	0 %	0 %	55821826
27601	NC_006448	TAA	2	6	1652429	1652434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821826
27602	NC_006448	TGT	2	6	1652543	1652548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821827
27603	NC_006448	ATA	2	6	1652620	1652625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821827
27604	NC_006448	AGA	2	6	1652677	1652682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821827
27605	NC_006448	ATA	2	6	1652761	1652766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821827
27606	NC_006448	CTA	2	6	1652780	1652785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821827
27607	NC_006448	CAA	2	6	1652873	1652878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821827
27608	NC_006448	AGA	2	6	1652887	1652892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821827
27609	NC_006448	TCT	2	6	1653183	1653188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821828
27610	NC_006448	CTT	2	6	1653202	1653207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821828
27611	NC_006448	ACG	2	6	1653253	1653258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821828
27612	NC_006448	ATG	2	6	1653285	1653290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821828
27613	NC_006448	CATCT	2	10	1653308	1653317	20 %	40 %	0 %	40 %	55821828
27614	NC_006448	TTA	2	6	1653339	1653344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821828
27615	NC_006448	TTC	2	6	1653667	1653672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821829
27616	NC_006448	AACA	2	8	1653685	1653692	75 %	0 %	0 %	25 %	55821829
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