MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 30284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27002	NC_006448	TCA	2	6	1615123	1615128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821778
27003	NC_006448	ATT	2	6	1615145	1615150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821778
27004	NC_006448	CTGAA	2	10	1615151	1615160	40 %	20 %	20 %	20 %	55821778
27005	NC_006448	GAAA	2	8	1615176	1615183	75 %	0 %	25 %	0 %	55821778
27006	NC_006448	TCC	2	6	1615268	1615273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821778
27007	NC_006448	CCA	2	6	1615320	1615325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821778
27008	NC_006448	TCA	2	6	1615341	1615346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821778
27009	NC_006448	GAT	2	6	1615363	1615368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821778
27010	NC_006448	AAT	2	6	1615382	1615387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821778
27011	NC_006448	CTG	2	6	1615400	1615405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821778
27012	NC_006448	TTC	2	6	1615409	1615414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821778
27013	NC_006448	TCTT	2	8	1615524	1615531	0 %	75 %	0 %	25 %	55821778
27014	NC_006448	ATCA	2	8	1615556	1615563	50 %	25 %	0 %	25 %	55821778
27015	NC_006448	ACT	2	6	1615816	1615821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821779
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27017	NC_006448	TCT	2	6	1615890	1615895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821779
27018	NC_006448	AT	3	6	1615911	1615916	50 %	50 %	0 %	0 %	55821779
27019	NC_006448	GTCG	2	8	1616011	1616018	0 %	25 %	50 %	25 %	55821779
27020	NC_006448	GAG	2	6	1616061	1616066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55821779
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27022	NC_006448	ATT	2	6	1616202	1616207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821779
27023	NC_006448	GTA	2	6	1616256	1616261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821779
27024	NC_006448	TAT	2	6	1616272	1616277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821779
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27028	NC_006448	ATC	2	6	1617523	1617528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821781
27029	NC_006448	GA	4	8	1617561	1617568	50 %	0 %	50 %	0 %	55821781
27030	NC_006448	ATGA	2	8	1617574	1617581	50 %	25 %	25 %	0 %	55821781
27031	NC_006448	CT	3	6	1617619	1617624	0 %	50 %	0 %	50 %	55821781
27032	NC_006448	GCT	2	6	1617644	1617649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821781
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27034	NC_006448	ATCA	2	8	1617664	1617671	50 %	25 %	0 %	25 %	55821781
27035	NC_006448	AAT	2	6	1617693	1617698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821781
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27037	NC_006448	CTGG	2	8	1617810	1617817	0 %	25 %	50 %	25 %	55821781
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27041	NC_006448	CTT	2	6	1617939	1617944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821781
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27044	NC_006448	TTCTGA	2	12	1618009	1618020	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	55821781
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27052	NC_006448	TAA	2	6	1618338	1618343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821781
27053	NC_006448	AAT	2	6	1618375	1618380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821781
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27055	NC_006448	A	6	6	1618421	1618426	100 %	0 %	0 %	0 %	55821781
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27059	NC_006448	ACG	2	6	1618581	1618586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821782
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27064	NC_006448	GAAAG	2	10	1618825	1618834	60 %	0 %	40 %	0 %	55821782
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27071	NC_006448	ACTC	2	8	1619069	1619076	25 %	25 %	0 %	50 %	55821782
27072	NC_006448	GACTT	2	10	1619117	1619126	20 %	40 %	20 %	20 %	55821782
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27102	NC_006448	TTC	2	6	1621212	1621217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821784
27103	NC_006448	ACCG	2	8	1621244	1621251	25 %	0 %	25 %	50 %	55821784
27104	NC_006448	GATAA	2	10	1621306	1621315	60 %	20 %	20 %	0 %	55821784
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27107	NC_006448	GCA	2	6	1621679	1621684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161611279
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27114	NC_006448	CTT	2	6	1622211	1622216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161611279
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27231	NC_006448	GCT	2	6	1629890	1629895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821795
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27234	NC_006448	CTT	2	6	1629950	1629955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821795
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27357	NC_006448	TGA	2	6	1637229	1637234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821806
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27472	NC_006448	CTT	2	6	1644768	1644773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821816
27473	NC_006448	T	6	6	1644772	1644777	0 %	100 %	0 %	0 %	55821816
27474	NC_006448	GAT	2	6	1644858	1644863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821816
27475	NC_006448	ATC	2	6	1644871	1644876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821816
27476	NC_006448	CAC	2	6	1644903	1644908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821816
27477	NC_006448	GCAT	2	8	1645070	1645077	25 %	25 %	25 %	25 %	55821816
27478	NC_006448	CTC	2	6	1645093	1645098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821816
27479	NC_006448	CCT	2	6	1645188	1645193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821816
27480	NC_006448	TCTCTT	2	12	1645215	1645226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821816
27481	NC_006448	CTT	2	6	1646019	1646024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821817
27482	NC_006448	ATT	2	6	1646056	1646061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821817
27483	NC_006448	ACT	2	6	1646243	1646248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821817
27484	NC_006448	CGA	2	6	1646291	1646296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821817
27485	NC_006448	T	6	6	1646397	1646402	0 %	100 %	0 %	0 %	55821817
27486	NC_006448	AAG	2	6	1646628	1646633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821818
27487	NC_006448	TTGC	2	8	1646703	1646710	0 %	50 %	25 %	25 %	55821818
27488	NC_006448	CAA	2	6	1646728	1646733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821818
27489	NC_006448	TCT	2	6	1646763	1646768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821818
27490	NC_006448	ATCA	2	8	1646773	1646780	50 %	25 %	0 %	25 %	55821818
27491	NC_006448	CCA	2	6	1646801	1646806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821818
27492	NC_006448	TCATA	2	10	1646826	1646835	40 %	40 %	0 %	20 %	55821818
27493	NC_006448	TTTG	2	8	1646850	1646857	0 %	75 %	25 %	0 %	55821819
27494	NC_006448	ATA	2	6	1646869	1646874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821819
27495	NC_006448	ATCC	2	8	1646917	1646924	25 %	25 %	0 %	50 %	55821819
27496	NC_006448	A	6	6	1646933	1646938	100 %	0 %	0 %	0 %	55821819
27497	NC_006448	CCA	2	6	1646974	1646979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821819
27498	NC_006448	AAG	2	6	1646984	1646989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821819
27499	NC_006448	CCT	2	6	1647010	1647015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821819
27500	NC_006448	GCA	2	6	1647079	1647084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821819

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