MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 30284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26002	NC_006448	ATC	2	6	1552247	1552252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821712
26003	NC_006448	GAT	2	6	1552286	1552291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821712
26004	NC_006448	TCT	2	6	1552308	1552313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821712
26005	NC_006448	CAT	2	6	1552432	1552437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821712
26006	NC_006448	ATT	2	6	1552482	1552487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821712
26007	NC_006448	CATC	2	8	1552601	1552608	25 %	25 %	0 %	50 %	55821713
26008	NC_006448	CAT	2	6	1552628	1552633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821713
26009	NC_006448	AAC	2	6	1552716	1552721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821713
26010	NC_006448	TAG	2	6	1552790	1552795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821713
26011	NC_006448	ACCT	2	8	1552878	1552885	25 %	25 %	0 %	50 %	55821713
26012	NC_006448	AAT	2	6	1552932	1552937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821713
26013	NC_006448	CAA	2	6	1552964	1552969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821713
26014	NC_006448	TCC	2	6	1553059	1553064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821713
26015	NC_006448	CAAT	2	8	1553078	1553085	50 %	25 %	0 %	25 %	55821714
26016	NC_006448	TAA	2	6	1553126	1553131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821714
26017	NC_006448	ATC	2	6	1553136	1553141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821714
26018	NC_006448	AAAT	2	8	1553170	1553177	75 %	25 %	0 %	0 %	55821714
26019	NC_006448	TCA	2	6	1553218	1553223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821714
26020	NC_006448	CAA	2	6	1553309	1553314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821714
26021	NC_006448	ACG	2	6	1553343	1553348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821714
26022	NC_006448	ATCA	2	8	1553370	1553377	50 %	25 %	0 %	25 %	55821714
26023	NC_006448	CTC	2	6	1553418	1553423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821714
26024	NC_006448	GTA	2	6	1553478	1553483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821714
26025	NC_006448	TGT	2	6	1553652	1553657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821714
26026	NC_006448	TTCT	2	8	1553736	1553743	0 %	75 %	0 %	25 %	55821714
26027	NC_006448	ATA	2	6	1553826	1553831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821714
26028	NC_006448	ATA	2	6	1553923	1553928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821714
26029	NC_006448	GAC	2	6	1553987	1553992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821714
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26032	NC_006448	CAAA	2	8	1554326	1554333	75 %	0 %	0 %	25 %	55821715
26033	NC_006448	ATTAG	2	10	1554412	1554421	40 %	40 %	20 %	0 %	55821715
26034	NC_006448	AAG	2	6	1554457	1554462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821715
26035	NC_006448	ATAA	2	8	1554546	1554553	75 %	25 %	0 %	0 %	55821715
26036	NC_006448	TGC	2	6	1554619	1554624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821715
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26038	NC_006448	TAG	2	6	1554662	1554667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821715
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26040	NC_006448	TAAG	2	8	1554795	1554802	50 %	25 %	25 %	0 %	55821716
26041	NC_006448	CCA	2	6	1554815	1554820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821716
26042	NC_006448	TAGC	2	8	1554834	1554841	25 %	25 %	25 %	25 %	55821716
26043	NC_006448	AAGAT	2	10	1554860	1554869	60 %	20 %	20 %	0 %	55821716
26044	NC_006448	CA	3	6	1554947	1554952	50 %	0 %	0 %	50 %	55821716
26045	NC_006448	A	6	6	1554992	1554997	100 %	0 %	0 %	0 %	55821716
26046	NC_006448	TTTAGT	2	12	1555119	1555130	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	55821716
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26048	NC_006448	CAAA	2	8	1555199	1555206	75 %	0 %	0 %	25 %	55821716
26049	NC_006448	TTC	2	6	1555218	1555223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821716
26050	NC_006448	TAGG	2	8	1555358	1555365	25 %	25 %	50 %	0 %	55821717
26051	NC_006448	TCA	2	6	1555367	1555372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821717
26052	NC_006448	AGA	2	6	1555373	1555378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821717
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26054	NC_006448	CAAT	2	8	1555496	1555503	50 %	25 %	0 %	25 %	55821717
26055	NC_006448	AAT	2	6	1555509	1555514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821717
26056	NC_006448	TCAA	2	8	1555586	1555593	50 %	25 %	0 %	25 %	55821717
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26063	NC_006448	A	6	6	1556539	1556544	100 %	0 %	0 %	0 %	55821719
26064	NC_006448	TTTC	2	8	1556663	1556670	0 %	75 %	0 %	25 %	55821720
26065	NC_006448	CTA	2	6	1556702	1556707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821720
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26118	NC_006448	GAC	2	6	1560116	1560121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821721
26119	NC_006448	TTGA	2	8	1560287	1560294	25 %	50 %	25 %	0 %	55821721
26120	NC_006448	ATG	2	6	1560296	1560301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821721
26121	NC_006448	TCTA	2	8	1560321	1560328	25 %	50 %	0 %	25 %	55821721
26122	NC_006448	ATGA	2	8	1560344	1560351	50 %	25 %	25 %	0 %	55821721
26123	NC_006448	A	6	6	1560362	1560367	100 %	0 %	0 %	0 %	55821721
26124	NC_006448	GAA	2	6	1560391	1560396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821721
26125	NC_006448	AT	3	6	1560397	1560402	50 %	50 %	0 %	0 %	55821721
26126	NC_006448	CGAGGA	2	12	1560403	1560414	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	55821721
26127	NC_006448	GGCA	2	8	1560460	1560467	25 %	0 %	50 %	25 %	55821721
26128	NC_006448	ATC	2	6	1560512	1560517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821721
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26131	NC_006448	GTT	2	6	1560695	1560700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821721
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26133	NC_006448	A	6	6	1560939	1560944	100 %	0 %	0 %	0 %	55821722
26134	NC_006448	AGCT	2	8	1560989	1560996	25 %	25 %	25 %	25 %	55821722
26135	NC_006448	TC	3	6	1560997	1561002	0 %	50 %	0 %	50 %	55821722
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26138	NC_006448	TTG	2	6	1561111	1561116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821722
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26141	NC_006448	CTT	2	6	1561176	1561181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821722
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26149	NC_006448	CTT	2	6	1561341	1561346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821722
26150	NC_006448	TTA	2	6	1561387	1561392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821722
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26159	NC_006448	CAA	2	6	1561755	1561760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821723
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26222	NC_006448	TAA	2	6	1564673	1564678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821728
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26224	NC_006448	TAG	2	6	1564709	1564714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821728
26225	NC_006448	T	7	7	1564798	1564804	0 %	100 %	0 %	0 %	55821728
26226	NC_006448	TAG	2	6	1564810	1564815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821728
26227	NC_006448	A	6	6	1564822	1564827	100 %	0 %	0 %	0 %	55821728
26228	NC_006448	AT	3	6	1565532	1565537	50 %	50 %	0 %	0 %	55821729
26229	NC_006448	TCG	2	6	1565595	1565600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821729
26230	NC_006448	CCT	2	6	1565604	1565609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821729
26231	NC_006448	ACCT	2	8	1565636	1565643	25 %	25 %	0 %	50 %	55821729
26232	NC_006448	CTA	2	6	1565664	1565669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821729
26233	NC_006448	ACA	2	6	1565694	1565699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821729
26234	NC_006448	AGA	2	6	1565781	1565786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821729
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26236	NC_006448	TAC	2	6	1565818	1565823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821729
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26473	NC_006448	ACTG	2	8	1581381	1581388	25 %	25 %	25 %	25 %	55821743
26474	NC_006448	A	6	6	1581467	1581472	100 %	0 %	0 %	0 %	55821743
26475	NC_006448	CAA	2	6	1581474	1581479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821743
26476	NC_006448	CTT	2	6	1581483	1581488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821743
26477	NC_006448	AGT	2	6	1581511	1581516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821743
26478	NC_006448	ACC	2	6	1581536	1581541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821743
26479	NC_006448	TGAGC	2	10	1581594	1581603	20 %	20 %	40 %	20 %	55821743
26480	NC_006448	ACT	2	6	1581613	1581618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821743
26481	NC_006448	TCC	2	6	1581681	1581686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821744
26482	NC_006448	AGG	2	6	1581734	1581739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55821744
26483	NC_006448	GCA	2	6	1581900	1581905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821744
26484	NC_006448	ATT	2	6	1581956	1581961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821744
26485	NC_006448	ACG	2	6	1581962	1581967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821744
26486	NC_006448	ACA	2	6	1581987	1581992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821744
26487	NC_006448	CAA	3	9	1582123	1582131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821744
26488	NC_006448	A	6	6	1582173	1582178	100 %	0 %	0 %	0 %	55821744
26489	NC_006448	TCACTG	2	12	1582216	1582227	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	55821744
26490	NC_006448	CAA	2	6	1582256	1582261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821744
26491	NC_006448	T	6	6	1582311	1582316	0 %	100 %	0 %	0 %	55821744
26492	NC_006448	TAT	2	6	1582340	1582345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821744
26493	NC_006448	AGT	2	6	1582352	1582357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821744
26494	NC_006448	T	6	6	1582586	1582591	0 %	100 %	0 %	0 %	55821745
26495	NC_006448	ATC	2	6	1582696	1582701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821745
26496	NC_006448	A	7	7	1582703	1582709	100 %	0 %	0 %	0 %	55821745
26497	NC_006448	ACA	2	6	1582718	1582723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821745
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26499	NC_006448	AATC	2	8	1582819	1582826	50 %	25 %	0 %	25 %	55821746
26500	NC_006448	GAA	2	6	1582835	1582840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821746

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