MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 30284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25502	NC_006448	AGA	2	6	1520188	1520193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821687
25503	NC_006448	TAT	2	6	1520254	1520259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821687
25504	NC_006448	ATC	2	6	1520309	1520314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821687
25505	NC_006448	TTG	2	6	1520321	1520326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821687
25506	NC_006448	TCA	2	6	1520340	1520345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821687
25507	NC_006448	CAAG	2	8	1520391	1520398	50 %	0 %	25 %	25 %	55821687
25508	NC_006448	T	7	7	1520619	1520625	0 %	100 %	0 %	0 %	55821687
25509	NC_006448	CTTCT	2	10	1520627	1520636	0 %	60 %	0 %	40 %	55821687
25510	NC_006448	TTC	2	6	1520652	1520657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821687
25511	NC_006448	GGTC	2	8	1521384	1521391	0 %	25 %	50 %	25 %	55821688
25512	NC_006448	AAG	3	9	1521421	1521429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821688
25513	NC_006448	AAC	2	6	1521451	1521456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821688
25514	NC_006448	TCT	2	6	1521461	1521466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821688
25515	NC_006448	TCT	2	6	1521479	1521484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821688
25516	NC_006448	ACG	2	6	1521508	1521513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821688
25517	NC_006448	AAG	2	6	1521560	1521565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821688
25518	NC_006448	CTTGA	2	10	1521595	1521604	20 %	40 %	20 %	20 %	55821688
25519	NC_006448	T	6	6	1521726	1521731	0 %	100 %	0 %	0 %	55821688
25520	NC_006448	AGGT	2	8	1521868	1521875	25 %	25 %	50 %	0 %	55821688
25521	NC_006448	GGT	2	6	1521894	1521899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55821688
25522	NC_006448	TCC	2	6	1521944	1521949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821688
25523	NC_006448	ATC	2	6	1521970	1521975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821688
25524	NC_006448	CTG	2	6	1521984	1521989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821688
25525	NC_006448	CTC	2	6	1522027	1522032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821688
25526	NC_006448	CAA	2	6	1522038	1522043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821688
25527	NC_006448	AATCC	2	10	1522096	1522105	40 %	20 %	0 %	40 %	55821688
25528	NC_006448	ATT	2	6	1522147	1522152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821688
25529	NC_006448	CTG	2	6	1522171	1522176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821688
25530	NC_006448	TCT	2	6	1522218	1522223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821688
25531	NC_006448	TCT	2	6	1522259	1522264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821688
25532	NC_006448	AAGGTC	2	12	1522304	1522315	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	55821688
25533	NC_006448	AAC	2	6	1522321	1522326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821688
25534	NC_006448	ATA	2	6	1522406	1522411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821688
25535	NC_006448	AAT	2	6	1522576	1522581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821688
25536	NC_006448	ATCA	2	8	1522585	1522592	50 %	25 %	0 %	25 %	55821688
25537	NC_006448	GCAAG	2	10	1522647	1522656	40 %	0 %	40 %	20 %	55821688
25538	NC_006448	ATA	2	6	1522711	1522716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821688
25539	NC_006448	AG	3	6	1522803	1522808	50 %	0 %	50 %	0 %	55821688
25540	NC_006448	AAG	2	6	1522873	1522878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821688
25541	NC_006448	ATT	2	6	1522993	1522998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821688
25542	NC_006448	AGG	2	6	1523138	1523143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55821688
25543	NC_006448	GCT	2	6	1523215	1523220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821688
25544	NC_006448	CTT	2	6	1523238	1523243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821688
25545	NC_006448	TCA	2	6	1523264	1523269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821688
25546	NC_006448	TAT	2	6	1523271	1523276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821688
25547	NC_006448	CCA	2	6	1523559	1523564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821688
25548	NC_006448	TAGA	2	8	1523583	1523590	50 %	25 %	25 %	0 %	55821688
25549	NC_006448	CCA	2	6	1523637	1523642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821688
25550	NC_006448	TTC	2	6	1523689	1523694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821688
25551	NC_006448	TAGG	2	8	1523811	1523818	25 %	25 %	50 %	0 %	55821688
25552	NC_006448	ATC	2	6	1523821	1523826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821688
25553	NC_006448	TTG	2	6	1523906	1523911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821688
25554	NC_006448	CCT	2	6	1523975	1523980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821688
25555	NC_006448	GTT	2	6	1523994	1523999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821688
25556	NC_006448	GAG	2	6	1524001	1524006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55821688
25557	NC_006448	TCC	2	6	1524008	1524013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821688
25558	NC_006448	AAG	2	6	1524046	1524051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821688
25559	NC_006448	ATT	2	6	1524070	1524075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821688
25560	NC_006448	CTTGGC	2	12	1524082	1524093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821688
25561	NC_006448	CAA	2	6	1524148	1524153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821688
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25563	NC_006448	AC	3	6	1524459	1524464	50 %	0 %	0 %	50 %	55821688
25564	NC_006448	GAAA	2	8	1524554	1524561	75 %	0 %	25 %	0 %	55821688
25565	NC_006448	CTC	2	6	1524568	1524573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821688
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25567	NC_006448	CTG	2	6	1524858	1524863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821688
25568	NC_006448	A	6	6	1524869	1524874	100 %	0 %	0 %	0 %	55821688
25569	NC_006448	TCC	2	6	1524894	1524899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821689
25570	NC_006448	T	6	6	1524905	1524910	0 %	100 %	0 %	0 %	55821689
25571	NC_006448	CTTC	2	8	1525012	1525019	0 %	50 %	0 %	50 %	55821689
25572	NC_006448	TTGAT	2	10	1525095	1525104	20 %	60 %	20 %	0 %	55821689
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25576	NC_006448	CCA	2	6	1525263	1525268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821689
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25582	NC_006448	GA	3	6	1525699	1525704	50 %	0 %	50 %	0 %	55821689
25583	NC_006448	CT	3	6	1525710	1525715	0 %	50 %	0 %	50 %	55821689
25584	NC_006448	ATC	2	6	1525784	1525789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821689
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25586	NC_006448	GTG	2	6	1525850	1525855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55821689
25587	NC_006448	GGAT	2	8	1525866	1525873	25 %	25 %	50 %	0 %	55821689
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25589	NC_006448	GTT	2	6	1525925	1525930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821689
25590	NC_006448	GTC	2	6	1525938	1525943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821689
25591	NC_006448	TTC	2	6	1525970	1525975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821689
25592	NC_006448	GTC	2	6	1526019	1526024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821689
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25598	NC_006448	T	6	6	1526549	1526554	0 %	100 %	0 %	0 %	55821689
25599	NC_006448	GTC	2	6	1526633	1526638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821689
25600	NC_006448	TGG	2	6	1526743	1526748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55821689
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25602	NC_006448	TTTG	2	8	1526824	1526831	0 %	75 %	25 %	0 %	55821689
25603	NC_006448	ATA	2	6	1526972	1526977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821689
25604	NC_006448	ACC	2	6	1527008	1527013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821689
25605	NC_006448	CCA	2	6	1527097	1527102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821689
25606	NC_006448	TTC	2	6	1527122	1527127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821689
25607	NC_006448	ATA	2	6	1527137	1527142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821689
25608	NC_006448	CTC	2	6	1527191	1527196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821689
25609	NC_006448	CAAG	2	8	1527202	1527209	50 %	0 %	25 %	25 %	55821689
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25613	NC_006448	TGTC	2	8	1527415	1527422	0 %	50 %	25 %	25 %	55821689
25614	NC_006448	TGG	2	6	1527555	1527560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55821689
25615	NC_006448	CCT	3	9	1527589	1527597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821689
25616	NC_006448	AAG	2	6	1527681	1527686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821689
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25618	NC_006448	CAA	2	6	1527722	1527727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821689
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25724	NC_006448	TC	3	6	1535637	1535642	0 %	50 %	0 %	50 %	55821697
25725	NC_006448	AAAAC	2	10	1535675	1535684	80 %	0 %	0 %	20 %	55821697
25726	NC_006448	CA	3	6	1535697	1535702	50 %	0 %	0 %	50 %	55821697
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25731	NC_006448	TCA	2	6	1535945	1535950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821697
25732	NC_006448	A	6	6	1535995	1536000	100 %	0 %	0 %	0 %	55821697
25733	NC_006448	TGA	2	6	1536014	1536019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821697
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25856	NC_006448	TTC	2	6	1543703	1543708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821702
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25974	NC_006448	TGTC	2	8	1550595	1550602	0 %	50 %	25 %	25 %	55821709
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25977	NC_006448	AAATC	2	10	1550642	1550651	60 %	20 %	0 %	20 %	55821709
25978	NC_006448	TAT	2	6	1550652	1550657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821709
25979	NC_006448	GAT	2	6	1550692	1550697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821709
25980	NC_006448	ATC	2	6	1550764	1550769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821709
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25983	NC_006448	AGTC	2	8	1550892	1550899	25 %	25 %	25 %	25 %	55821709
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