MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 30284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25004	NC_006448	ATC	2	6	1491344	1491349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821660
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25006	NC_006448	TTAA	2	8	1491380	1491387	50 %	50 %	0 %	0 %	55821660
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25010	NC_006448	ATT	2	6	1491514	1491519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821661
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25014	NC_006448	TTTA	2	8	1491598	1491605	25 %	75 %	0 %	0 %	55821661
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25044	NC_006448	ATCC	2	8	1492896	1492903	25 %	25 %	0 %	50 %	55821662
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25119	NC_006448	GCAATG	2	12	1497699	1497710	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	55821667
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25238	NC_006448	AAACT	2	10	1504260	1504269	60 %	20 %	0 %	20 %	55821672
25239	NC_006448	CTA	2	6	1504290	1504295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821672
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25242	NC_006448	CTT	2	6	1504489	1504494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821672
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25253	NC_006448	CT	3	6	1505366	1505371	0 %	50 %	0 %	50 %	55821672
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25336	NC_006448	CTGC	2	8	1511127	1511134	0 %	25 %	25 %	50 %	55821676
25337	NC_006448	TGATT	2	10	1511187	1511196	20 %	60 %	20 %	0 %	55821676
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25340	NC_006448	TTC	2	6	1511421	1511426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821677
25341	NC_006448	TAGG	2	8	1511432	1511439	25 %	25 %	50 %	0 %	55821677
25342	NC_006448	GCT	2	6	1511537	1511542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821677
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25344	NC_006448	CCT	2	6	1511615	1511620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821677
25345	NC_006448	GCA	2	6	1511635	1511640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821677
25346	NC_006448	TTTG	2	8	1511681	1511688	0 %	75 %	25 %	0 %	55821677
25347	NC_006448	CTT	3	9	1511700	1511708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821677
25348	NC_006448	TAA	2	6	1511735	1511740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821677
25349	NC_006448	CGT	3	9	1511754	1511762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821677
25350	NC_006448	TGCT	2	8	1511784	1511791	0 %	50 %	25 %	25 %	55821677
25351	NC_006448	GAA	2	6	1511838	1511843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821677
25352	NC_006448	CAT	2	6	1511882	1511887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821677
25353	NC_006448	CCT	2	6	1511903	1511908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821677
25354	NC_006448	CACGCT	2	12	1511954	1511965	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	55821677
25355	NC_006448	AC	3	6	1512020	1512025	50 %	0 %	0 %	50 %	55821677
25356	NC_006448	TAT	2	6	1512315	1512320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821677
25357	NC_006448	GTT	2	6	1512355	1512360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821677
25358	NC_006448	A	9	9	1512369	1512377	100 %	0 %	0 %	0 %	55821677
25359	NC_006448	TGAT	2	8	1512401	1512408	25 %	50 %	25 %	0 %	55821677
25360	NC_006448	AT	3	6	1512407	1512412	50 %	50 %	0 %	0 %	55821677
25361	NC_006448	CAT	2	6	1512506	1512511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821678
25362	NC_006448	CCT	2	6	1512526	1512531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821678
25363	NC_006448	GT	3	6	1512553	1512558	0 %	50 %	50 %	0 %	55821678
25364	NC_006448	GGAAT	2	10	1512567	1512576	40 %	20 %	40 %	0 %	55821678
25365	NC_006448	TA	3	6	1512592	1512597	50 %	50 %	0 %	0 %	55821678
25366	NC_006448	TCA	2	6	1512747	1512752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821678
25367	NC_006448	TGAGCT	2	12	1512761	1512772	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	55821678
25368	NC_006448	ATG	2	6	1512787	1512792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821678
25369	NC_006448	ACT	2	6	1512800	1512805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821678
25370	NC_006448	TCA	2	6	1512813	1512818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821678
25371	NC_006448	TCC	2	6	1512828	1512833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821678
25372	NC_006448	AG	4	8	1512891	1512898	50 %	0 %	50 %	0 %	55821678
25373	NC_006448	ATT	2	6	1512905	1512910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821678
25374	NC_006448	ACC	2	6	1512926	1512931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821678
25375	NC_006448	TAG	2	6	1512957	1512962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821678
25376	NC_006448	TCAG	2	8	1513029	1513036	25 %	25 %	25 %	25 %	55821678
25377	NC_006448	CAT	2	6	1513051	1513056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821678
25378	NC_006448	CCAT	2	8	1513146	1513153	25 %	25 %	0 %	50 %	55821678
25379	NC_006448	ATA	2	6	1513157	1513162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821678
25380	NC_006448	CAC	2	6	1513208	1513213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821678
25381	NC_006448	GTC	2	6	1513277	1513282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821678
25382	NC_006448	TCT	2	6	1513303	1513308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821678
25383	NC_006448	ACTTGA	2	12	1513313	1513324	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	55821678
25384	NC_006448	TTCGCT	2	12	1513328	1513339	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	55821678
25385	NC_006448	TGA	2	6	1513364	1513369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821678
25386	NC_006448	TTTG	2	8	1513377	1513384	0 %	75 %	25 %	0 %	55821678
25387	NC_006448	GCTAG	2	10	1513425	1513434	20 %	20 %	40 %	20 %	55821678
25388	NC_006448	TAA	2	6	1513448	1513453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821678
25389	NC_006448	GCCAAA	2	12	1513755	1513766	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	55821679
25390	NC_006448	AGT	2	6	1513824	1513829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821679
25391	NC_006448	GTT	2	6	1514114	1514119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821680
25392	NC_006448	AACAA	2	10	1514151	1514160	80 %	0 %	0 %	20 %	55821680
25393	NC_006448	AAT	2	6	1514165	1514170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821680
25394	NC_006448	GAA	3	9	1514340	1514348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821680
25395	NC_006448	ATT	2	6	1514349	1514354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821680
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25398	NC_006448	ATC	2	6	1514420	1514425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821680
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25401	NC_006448	CTT	2	6	1514755	1514760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821681
25402	NC_006448	ATT	2	6	1514762	1514767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821681
25403	NC_006448	TAAC	2	8	1514806	1514813	50 %	25 %	0 %	25 %	55821681
25404	NC_006448	TGT	2	6	1514834	1514839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821681
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25408	NC_006448	T	6	6	1515417	1515422	0 %	100 %	0 %	0 %	55821682
25409	NC_006448	TCA	2	6	1515605	1515610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821682
25410	NC_006448	CTA	2	6	1515618	1515623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821682
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25412	NC_006448	TTC	2	6	1515775	1515780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821682
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25414	NC_006448	GA	3	6	1515802	1515807	50 %	0 %	50 %	0 %	55821682
25415	NC_006448	GCA	2	6	1515812	1515817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821682
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25417	NC_006448	TGA	2	6	1515849	1515854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821682
25418	NC_006448	TTTC	2	8	1515945	1515952	0 %	75 %	0 %	25 %	55821682
25419	NC_006448	CCA	2	6	1516011	1516016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821682
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25421	NC_006448	CTG	2	6	1516068	1516073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821682
25422	NC_006448	TCC	2	6	1516144	1516149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821682
25423	NC_006448	GAA	2	6	1516152	1516157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821682
25424	NC_006448	ATT	2	6	1516165	1516170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821682
25425	NC_006448	AAGGC	2	10	1516178	1516187	40 %	0 %	40 %	20 %	55821682
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25428	NC_006448	CTA	2	6	1516470	1516475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821682
25429	NC_006448	GCT	2	6	1516511	1516516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821682
25430	NC_006448	GAC	2	6	1516536	1516541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821682
25431	NC_006448	CTG	2	6	1516555	1516560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821682
25432	NC_006448	ATGT	2	8	1516574	1516581	25 %	50 %	25 %	0 %	55821682
25433	NC_006448	TCC	2	6	1516590	1516595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821683
25434	NC_006448	GAA	2	6	1516636	1516641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821683
25435	NC_006448	CATT	2	8	1516660	1516667	25 %	50 %	0 %	25 %	55821683
25436	NC_006448	TCA	2	6	1516720	1516725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821683
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25438	NC_006448	TAC	2	6	1516744	1516749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821683
25439	NC_006448	CAG	2	6	1516750	1516755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821683
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25441	NC_006448	TAAG	2	8	1516870	1516877	50 %	25 %	25 %	0 %	55821683
25442	NC_006448	CAA	2	6	1516885	1516890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821683
25443	NC_006448	CAT	2	6	1516966	1516971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821683
25444	NC_006448	ACT	2	6	1516989	1516994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821683
25445	NC_006448	AAG	2	6	1517072	1517077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821683
25446	NC_006448	TTGGT	2	10	1517088	1517097	0 %	60 %	40 %	0 %	55821683
25447	NC_006448	TCA	2	6	1517125	1517130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821683
25448	NC_006448	TACC	2	8	1517167	1517174	25 %	25 %	0 %	50 %	55821683
25449	NC_006448	CTG	2	6	1517176	1517181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821683
25450	NC_006448	AGCT	2	8	1517282	1517289	25 %	25 %	25 %	25 %	55821683
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25452	NC_006448	A	6	6	1517516	1517521	100 %	0 %	0 %	0 %	55821684
25453	NC_006448	CAA	2	6	1517554	1517559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821684
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25455	NC_006448	ACTT	2	8	1517632	1517639	25 %	50 %	0 %	25 %	55821684
25456	NC_006448	AGA	2	6	1517644	1517649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821684
25457	NC_006448	ACC	2	6	1517654	1517659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821684
25458	NC_006448	CCG	2	6	1517715	1517720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55821684
25459	NC_006448	CTT	2	6	1517743	1517748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821684
25460	NC_006448	ATG	2	6	1517826	1517831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821684
25461	NC_006448	TCC	2	6	1517882	1517887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821684
25462	NC_006448	TAA	2	6	1517888	1517893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821684
25463	NC_006448	ATTG	2	8	1517957	1517964	25 %	50 %	25 %	0 %	55821684
25464	NC_006448	TTG	2	6	1518025	1518030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821684
25465	NC_006448	AT	3	6	1518135	1518140	50 %	50 %	0 %	0 %	55821684
25466	NC_006448	TAA	2	6	1518163	1518168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821684
25467	NC_006448	ATG	2	6	1518197	1518202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821684
25468	NC_006448	CTTTGA	2	12	1518219	1518230	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	55821684
25469	NC_006448	GAAT	2	8	1518325	1518332	50 %	25 %	25 %	0 %	55821684
25470	NC_006448	AGG	2	6	1518360	1518365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55821684
25471	NC_006448	AGC	2	6	1518383	1518388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821684
25472	NC_006448	ACA	2	6	1518390	1518395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821684
25473	NC_006448	CAA	2	6	1518419	1518424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821684
25474	NC_006448	ACCA	2	8	1518470	1518477	50 %	0 %	0 %	50 %	55821684
25475	NC_006448	ATC	2	6	1518513	1518518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821684
25476	NC_006448	ACT	2	6	1518585	1518590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821684
25477	NC_006448	AGA	2	6	1518684	1518689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821684
25478	NC_006448	ACCA	2	8	1518716	1518723	50 %	0 %	0 %	50 %	55821684
25479	NC_006448	AG	3	6	1518820	1518825	50 %	0 %	50 %	0 %	55821684
25480	NC_006448	AAT	2	6	1518941	1518946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821684
25481	NC_006448	TGC	2	6	1518960	1518965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821684
25482	NC_006448	T	6	6	1518998	1519003	0 %	100 %	0 %	0 %	55821684
25483	NC_006448	TCT	2	6	1519009	1519014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821684
25484	NC_006448	CCT	2	6	1519107	1519112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821685
25485	NC_006448	TTC	2	6	1519214	1519219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821685
25486	NC_006448	CCT	2	6	1519290	1519295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821685
25487	NC_006448	CTT	2	6	1519314	1519319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821685
25488	NC_006448	AGA	2	6	1519391	1519396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821685
25489	NC_006448	AAC	3	9	1519405	1519413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821685
25490	NC_006448	GA	3	6	1519431	1519436	50 %	0 %	50 %	0 %	55821685
25491	NC_006448	AGTCA	2	10	1519465	1519474	40 %	20 %	20 %	20 %	55821685
25492	NC_006448	TCT	2	6	1519612	1519617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821686
25493	NC_006448	CTGA	2	8	1519634	1519641	25 %	25 %	25 %	25 %	55821686
25494	NC_006448	ATC	2	6	1519649	1519654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821686
25495	NC_006448	AAT	2	6	1519682	1519687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821686
25496	NC_006448	AAATGG	2	12	1519696	1519707	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	55821686
25497	NC_006448	GA	3	6	1519782	1519787	50 %	0 %	50 %	0 %	55821686
25498	NC_006448	ATC	2	6	1519830	1519835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821686
25499	NC_006448	ATC	2	6	1520123	1520128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821687
25500	NC_006448	AGG	2	6	1520149	1520154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55821687

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