MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 30284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24501	NC_006448	CCAA	2	8	1458439	1458446	50 %	0 %	0 %	50 %	55821619
24502	NC_006448	A	6	6	1458445	1458450	100 %	0 %	0 %	0 %	55821619
24503	NC_006448	CCA	2	6	1458451	1458456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821619
24504	NC_006448	AGG	2	6	1458490	1458495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55821619
24505	NC_006448	CAT	2	6	1458554	1458559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821619
24506	NC_006448	CAA	2	6	1458635	1458640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821619
24507	NC_006448	CT	3	6	1458808	1458813	0 %	50 %	0 %	50 %	55821619
24508	NC_006448	AAT	2	6	1458840	1458845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821619
24509	NC_006448	AAG	2	6	1458891	1458896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821619
24510	NC_006448	AAT	2	6	1458918	1458923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821619
24511	NC_006448	AGA	2	6	1458991	1458996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821619
24512	NC_006448	CCTT	2	8	1459035	1459042	0 %	50 %	0 %	50 %	55821620
24513	NC_006448	ACA	2	6	1459046	1459051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821620
24514	NC_006448	T	7	7	1459081	1459087	0 %	100 %	0 %	0 %	55821620
24515	NC_006448	TCT	2	6	1459156	1459161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821620
24516	NC_006448	TCG	2	6	1459168	1459173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821620
24517	NC_006448	TA	3	6	1459223	1459228	50 %	50 %	0 %	0 %	55821620
24518	NC_006448	TTGA	2	8	1459315	1459322	25 %	50 %	25 %	0 %	55821621
24519	NC_006448	CAC	2	6	1459401	1459406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821621
24520	NC_006448	CAT	2	6	1459407	1459412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821621
24521	NC_006448	GTA	2	6	1459417	1459422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821621
24522	NC_006448	ATA	2	6	1459427	1459432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821621
24523	NC_006448	ACC	2	6	1459441	1459446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821621
24524	NC_006448	TCT	2	6	1459467	1459472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821621
24525	NC_006448	TGA	2	6	1459503	1459508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821621
24526	NC_006448	GCT	2	6	1459550	1459555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821621
24527	NC_006448	CTT	2	6	1459690	1459695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821621
24528	NC_006448	GCCA	2	8	1459702	1459709	25 %	0 %	25 %	50 %	55821621
24529	NC_006448	TCA	2	6	1459760	1459765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821621
24530	NC_006448	TCC	2	6	1459825	1459830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821622
24531	NC_006448	ACG	2	6	1459866	1459871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821622
24532	NC_006448	TTG	2	6	1459909	1459914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821622
24533	NC_006448	ATGA	2	8	1459968	1459975	50 %	25 %	25 %	0 %	55821622
24534	NC_006448	GAT	2	6	1459989	1459994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821622
24535	NC_006448	GAT	2	6	1460010	1460015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821622
24536	NC_006448	TCA	2	6	1460087	1460092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821622
24537	NC_006448	GGA	2	6	1460096	1460101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55821622
24538	NC_006448	CA	3	6	1460136	1460141	50 %	0 %	0 %	50 %	55821622
24539	NC_006448	CCA	2	6	1460156	1460161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821622
24540	NC_006448	TG	3	6	1460270	1460275	0 %	50 %	50 %	0 %	55821622
24541	NC_006448	TTC	2	6	1460298	1460303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821622
24542	NC_006448	GTC	2	6	1460308	1460313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821622
24543	NC_006448	AATC	2	8	1460366	1460373	50 %	25 %	0 %	25 %	55821622
24544	NC_006448	CAA	2	6	1460417	1460422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821622
24545	NC_006448	GTG	2	6	1460471	1460476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55821622
24546	NC_006448	T	6	6	1460751	1460756	0 %	100 %	0 %	0 %	55821622
24547	NC_006448	AAT	2	6	1460861	1460866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821623
24548	NC_006448	CTT	2	6	1460873	1460878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821623
24549	NC_006448	CAG	2	6	1460924	1460929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821623
24550	NC_006448	ATT	2	6	1460997	1461002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821623
24551	NC_006448	GAA	2	6	1461009	1461014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821623
24552	NC_006448	ATACCA	2	12	1461259	1461270	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	55821623
24553	NC_006448	TAA	2	6	1461290	1461295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821623
24554	NC_006448	TCTTT	2	10	1461311	1461320	0 %	80 %	0 %	20 %	55821623
24555	NC_006448	TC	3	6	1461325	1461330	0 %	50 %	0 %	50 %	55821623
24556	NC_006448	TGACCT	2	12	1461338	1461349	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	55821623
24557	NC_006448	ATC	2	6	1461465	1461470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821623
24558	NC_006448	CCT	2	6	1461512	1461517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821623
24559	NC_006448	CCAG	2	8	1461520	1461527	25 %	0 %	25 %	50 %	55821623
24560	NC_006448	TCA	2	6	1461598	1461603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821623
24561	NC_006448	ATC	2	6	1461729	1461734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821623
24562	NC_006448	CAC	2	6	1461776	1461781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821623
24563	NC_006448	ATT	2	6	1461801	1461806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821623
24564	NC_006448	AGG	2	6	1461829	1461834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55821623
24565	NC_006448	TAA	2	6	1461855	1461860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821623
24566	NC_006448	CCA	2	6	1461861	1461866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821623
24567	NC_006448	AAC	2	6	1461940	1461945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821624
24568	NC_006448	AAAT	2	8	1461980	1461987	75 %	25 %	0 %	0 %	55821624
24569	NC_006448	TAT	2	6	1462278	1462283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821624
24570	NC_006448	A	6	6	1462284	1462289	100 %	0 %	0 %	0 %	55821624
24571	NC_006448	TA	3	6	1462294	1462299	50 %	50 %	0 %	0 %	55821624
24572	NC_006448	AAT	2	6	1462330	1462335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821624
24573	NC_006448	CTT	2	6	1462497	1462502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821625
24574	NC_006448	CTC	2	6	1462567	1462572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821625
24575	NC_006448	CGC	2	6	1462666	1462671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55821625
24576	NC_006448	CGA	2	6	1462745	1462750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821625
24577	NC_006448	CAG	2	6	1462767	1462772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821625
24578	NC_006448	A	6	6	1462821	1462826	100 %	0 %	0 %	0 %	55821625
24579	NC_006448	TCC	2	6	1462840	1462845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821625
24580	NC_006448	AAAG	2	8	1462849	1462856	75 %	0 %	25 %	0 %	55821625
24581	NC_006448	CGCC	2	8	1462937	1462944	0 %	0 %	25 %	75 %	55821625
24582	NC_006448	ACA	2	6	1462958	1462963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821625
24583	NC_006448	TCACC	2	10	1463373	1463382	20 %	20 %	0 %	60 %	55821626
24584	NC_006448	TCA	2	6	1463423	1463428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821626
24585	NC_006448	ACG	2	6	1463444	1463449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821626
24586	NC_006448	ACG	2	6	1463524	1463529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821626
24587	NC_006448	AAAT	2	8	1463564	1463571	75 %	25 %	0 %	0 %	55821626
24588	NC_006448	CTT	2	6	1463574	1463579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821626
24589	NC_006448	CAG	2	6	1463583	1463588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821626
24590	NC_006448	CCA	3	9	1463594	1463602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821626
24591	NC_006448	GAA	2	6	1463626	1463631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821626
24592	NC_006448	TGT	2	6	1463670	1463675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821626
24593	NC_006448	CTT	2	6	1463679	1463684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821626
24594	NC_006448	TTGGT	2	10	1463738	1463747	0 %	60 %	40 %	0 %	55821626
24595	NC_006448	CTC	2	6	1463749	1463754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821626
24596	NC_006448	CCA	2	6	1463930	1463935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821626
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24598	NC_006448	CAT	2	6	1464171	1464176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821627
24599	NC_006448	CAT	2	6	1464182	1464187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821627
24600	NC_006448	CAAA	3	12	1464267	1464278	75 %	0 %	0 %	25 %	55821627
24601	NC_006448	TAA	2	6	1464321	1464326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821627
24602	NC_006448	AAG	2	6	1464564	1464569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821628
24603	NC_006448	GAA	2	6	1464571	1464576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821628
24604	NC_006448	CTT	2	6	1464591	1464596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821628
24605	NC_006448	TCA	2	6	1464614	1464619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821628
24606	NC_006448	ATAA	2	8	1464679	1464686	75 %	25 %	0 %	0 %	55821628
24607	NC_006448	TGAC	2	8	1464698	1464705	25 %	25 %	25 %	25 %	55821628
24608	NC_006448	GATT	2	8	1464742	1464749	25 %	50 %	25 %	0 %	55821628
24609	NC_006448	ACCA	2	8	1464760	1464767	50 %	0 %	0 %	50 %	55821628
24610	NC_006448	CAAG	2	8	1464798	1464805	50 %	0 %	25 %	25 %	55821628
24611	NC_006448	ACC	2	6	1464859	1464864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821628
24612	NC_006448	GTA	2	6	1464880	1464885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821628
24613	NC_006448	CTT	2	6	1464921	1464926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821628
24614	NC_006448	TCG	2	6	1464944	1464949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821628
24615	NC_006448	CCTT	2	8	1464977	1464984	0 %	50 %	0 %	50 %	55821628
24616	NC_006448	ACG	2	6	1465003	1465008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821628
24617	NC_006448	ACG	2	6	1465048	1465053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821628
24618	NC_006448	ATC	2	6	1465102	1465107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821628
24619	NC_006448	GTT	2	6	1465131	1465136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821628
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24621	NC_006448	TCAA	2	8	1465372	1465379	50 %	25 %	0 %	25 %	55821629
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24640	NC_006448	TAGT	2	8	1466806	1466813	25 %	50 %	25 %	0 %	55821630
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24652	NC_006448	TCTT	2	8	1467898	1467905	0 %	75 %	0 %	25 %	55821631
24653	NC_006448	CTTC	2	8	1467914	1467921	0 %	50 %	0 %	50 %	55821631
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24972	NC_006448	GAG	2	6	1488110	1488115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55821653
24973	NC_006448	ATC	2	6	1488153	1488158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821653
24974	NC_006448	CTC	2	6	1488488	1488493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821654
24975	NC_006448	CCT	2	6	1488544	1488549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821654
24976	NC_006448	T	6	6	1488876	1488881	0 %	100 %	0 %	0 %	55821655
24977	NC_006448	TGA	2	6	1489007	1489012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821655
24978	NC_006448	CTT	2	6	1489068	1489073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821655
24979	NC_006448	AG	3	6	1489166	1489171	50 %	0 %	50 %	0 %	55821655
24980	NC_006448	GCA	2	6	1489204	1489209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821655
24981	NC_006448	AGT	2	6	1489413	1489418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821656
24982	NC_006448	ATATA	2	10	1489493	1489502	60 %	40 %	0 %	0 %	55821656
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24984	NC_006448	AAG	2	6	1489634	1489639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821657
24985	NC_006448	ATGGT	2	10	1489662	1489671	20 %	40 %	40 %	0 %	55821657
24986	NC_006448	ACT	2	6	1489855	1489860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821658
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24992	NC_006448	ACC	2	6	1490279	1490284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821659
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24996	NC_006448	ATCT	2	8	1490817	1490824	25 %	50 %	0 %	25 %	55821660
24997	NC_006448	GTT	2	6	1490854	1490859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821660
24998	NC_006448	TCTT	2	8	1490895	1490902	0 %	75 %	0 %	25 %	55821660
24999	NC_006448	AAG	2	6	1490927	1490932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821660
25000	NC_006448	AGCT	2	8	1491067	1491074	25 %	25 %	25 %	25 %	55821660

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