MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 30284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_006448	GTATC	2	10	124565	124574	20 %	40 %	20 %	20 %	55820218
2002	NC_006448	AACA	2	8	124607	124614	75 %	0 %	0 %	25 %	55820218
2003	NC_006448	TGA	2	6	124644	124649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820218
2004	NC_006448	ATG	2	6	124663	124668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820218
2005	NC_006448	A	6	6	124760	124765	100 %	0 %	0 %	0 %	55820218
2006	NC_006448	TGC	2	6	124809	124814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820218
2007	NC_006448	TGA	2	6	124827	124832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820218
2008	NC_006448	TGA	2	6	124863	124868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820218
2009	NC_006448	AGC	3	9	124935	124943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820218
2010	NC_006448	CAA	2	6	124948	124953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820218
2011	NC_006448	CGA	2	6	124998	125003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820218
2012	NC_006448	A	6	6	125548	125553	100 %	0 %	0 %	0 %	55820219
2013	NC_006448	ACC	2	6	125555	125560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55820219
2014	NC_006448	GAA	2	6	125587	125592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820219
2015	NC_006448	TGG	2	6	125706	125711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820219
2016	NC_006448	TGG	2	6	125718	125723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820219
2017	NC_006448	TCT	2	6	125750	125755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820219
2018	NC_006448	CTT	2	6	125760	125765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820219
2019	NC_006448	TGG	2	6	125766	125771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820219
2020	NC_006448	CTC	2	6	125795	125800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55820219
2021	NC_006448	GAC	2	6	125809	125814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820219
2022	NC_006448	GTCATG	2	12	125957	125968	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	55820219
2023	NC_006448	ATG	2	6	126004	126009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820219
2024	NC_006448	CGT	2	6	126010	126015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820219
2025	NC_006448	CAA	2	6	126148	126153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820219
2026	NC_006448	GGT	2	6	126190	126195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820219
2027	NC_006448	TCA	2	6	126218	126223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820219
2028	NC_006448	AGC	2	6	126297	126302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820219
2029	NC_006448	TACC	2	8	126323	126330	25 %	25 %	0 %	50 %	55820219
2030	NC_006448	AAAGG	2	10	126394	126403	60 %	0 %	40 %	0 %	55820219
2031	NC_006448	ATG	2	6	126479	126484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820219
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2033	NC_006448	GTG	2	6	126521	126526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820219
2034	NC_006448	CAC	2	6	126539	126544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55820219
2035	NC_006448	A	6	6	126547	126552	100 %	0 %	0 %	0 %	55820219
2036	NC_006448	T	6	6	126556	126561	0 %	100 %	0 %	0 %	55820219
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2038	NC_006448	AAAG	2	8	126593	126600	75 %	0 %	25 %	0 %	55820219
2039	NC_006448	ATG	2	6	126728	126733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820220
2040	NC_006448	T	6	6	126740	126745	0 %	100 %	0 %	0 %	55820220
2041	NC_006448	AAG	2	6	126782	126787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820220
2042	NC_006448	GAT	2	6	126955	126960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820220
2043	NC_006448	GGA	2	6	126990	126995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55820220
2044	NC_006448	TAG	2	6	127040	127045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820220
2045	NC_006448	GAC	2	6	127052	127057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820220
2046	NC_006448	ATG	2	6	127069	127074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820220
2047	NC_006448	GCT	2	6	127129	127134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820220
2048	NC_006448	CA	3	6	127149	127154	50 %	0 %	0 %	50 %	55820220
2049	NC_006448	TATC	2	8	127226	127233	25 %	50 %	0 %	25 %	55820220
2050	NC_006448	CTTT	2	8	127278	127285	0 %	75 %	0 %	25 %	55820220
2051	NC_006448	ATT	2	6	127314	127319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820220
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2053	NC_006448	GTG	2	6	127485	127490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820221
2054	NC_006448	TAA	2	6	127525	127530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820221
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2056	NC_006448	TTA	2	6	127670	127675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820221
2057	NC_006448	A	6	6	127715	127720	100 %	0 %	0 %	0 %	55820221
2058	NC_006448	TGA	2	6	127798	127803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820221
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2061	NC_006448	A	7	7	127874	127880	100 %	0 %	0 %	0 %	55820221
2062	NC_006448	TGA	2	6	127891	127896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820221
2063	NC_006448	GTC	2	6	127943	127948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820221
2064	NC_006448	TAA	2	6	127975	127980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820221
2065	NC_006448	ATA	2	6	128046	128051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820221
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2067	NC_006448	AAGA	2	8	128339	128346	75 %	0 %	25 %	0 %	55820222
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2070	NC_006448	ATC	2	6	128392	128397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820222
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2072	NC_006448	TATT	2	8	128424	128431	25 %	75 %	0 %	0 %	55820222
2073	NC_006448	CTA	3	9	128486	128494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820222
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2078	NC_006448	TAT	2	6	128619	128624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820222
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2080	NC_006448	ACA	2	6	128659	128664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820222
2081	NC_006448	TAT	2	6	140600	140605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820223
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2083	NC_006448	TTC	2	6	140672	140677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820223
2084	NC_006448	GGGA	2	8	140759	140766	25 %	0 %	75 %	0 %	55820223
2085	NC_006448	AC	3	6	141109	141114	50 %	0 %	0 %	50 %	55820223
2086	NC_006448	A	7	7	141116	141122	100 %	0 %	0 %	0 %	55820223
2087	NC_006448	TA	3	6	141238	141243	50 %	50 %	0 %	0 %	55820223
2088	NC_006448	TCCTT	2	10	141248	141257	0 %	60 %	0 %	40 %	55820223
2089	NC_006448	ATC	2	6	141278	141283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820223
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2091	NC_006448	GGATC	2	10	141363	141372	20 %	20 %	40 %	20 %	55820223
2092	NC_006448	A	8	8	141457	141464	100 %	0 %	0 %	0 %	55820223
2093	NC_006448	ATA	2	6	141472	141477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820223
2094	NC_006448	T	6	6	141478	141483	0 %	100 %	0 %	0 %	55820223
2095	NC_006448	AAG	2	6	141555	141560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820223
2096	NC_006448	AAG	2	6	141585	141590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820223
2097	NC_006448	TCAA	3	12	141614	141625	50 %	25 %	0 %	25 %	55820223
2098	NC_006448	ATCA	2	8	141649	141656	50 %	25 %	0 %	25 %	55820223
2099	NC_006448	A	6	6	141760	141765	100 %	0 %	0 %	0 %	55820223
2100	NC_006448	TGA	2	6	141779	141784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820223
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2102	NC_006448	GCTCAA	2	12	141945	141956	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	55820223
2103	NC_006448	AAAC	2	8	141963	141970	75 %	0 %	0 %	25 %	55820223
2104	NC_006448	TGT	2	6	141998	142003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820223
2105	NC_006448	TGA	2	6	142028	142033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820223
2106	NC_006448	AAT	2	6	142038	142043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820223
2107	NC_006448	TGC	2	6	142064	142069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820223
2108	NC_006448	AGA	2	6	142073	142078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820223
2109	NC_006448	ACA	2	6	142152	142157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820223
2110	NC_006448	ATG	2	6	142189	142194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820223
2111	NC_006448	GCA	3	9	142206	142214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820223
2112	NC_006448	ATG	2	6	142237	142242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820223
2113	NC_006448	CTTG	2	8	142244	142251	0 %	50 %	25 %	25 %	55820223
2114	NC_006448	CAG	2	6	142255	142260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820223
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2116	NC_006448	TTGG	2	8	142316	142323	0 %	50 %	50 %	0 %	55820223
2117	NC_006448	CT	3	6	142331	142336	0 %	50 %	0 %	50 %	55820223
2118	NC_006448	GCA	2	6	142365	142370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820223
2119	NC_006448	GGTG	2	8	142415	142422	0 %	25 %	75 %	0 %	55820223
2120	NC_006448	AGT	2	6	142466	142471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820223
2121	NC_006448	AAGA	2	8	142476	142483	75 %	0 %	25 %	0 %	55820223
2122	NC_006448	AAAG	2	8	142512	142519	75 %	0 %	25 %	0 %	55820223
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2247	NC_006448	GAT	2	6	151103	151108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820231
2248	NC_006448	TGAA	2	8	151143	151150	50 %	25 %	25 %	0 %	55820231
2249	NC_006448	ATT	2	6	151151	151156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820231
2250	NC_006448	GAT	2	6	151172	151177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820231
2251	NC_006448	GAA	2	6	151190	151195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820231
2252	NC_006448	GAT	4	12	151202	151213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820231
2253	NC_006448	AT	3	6	151499	151504	50 %	50 %	0 %	0 %	55820232
2254	NC_006448	TGG	2	6	151514	151519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820232
2255	NC_006448	TGA	2	6	151676	151681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820232
2256	NC_006448	GACCTT	2	12	151695	151706	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	55820232
2257	NC_006448	TAC	2	6	151757	151762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820232
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2259	NC_006448	TGT	2	6	151898	151903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820232
2260	NC_006448	TGG	2	6	151916	151921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820232
2261	NC_006448	CA	3	6	152010	152015	50 %	0 %	0 %	50 %	55820232
2262	NC_006448	CTT	2	6	152019	152024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820232
2263	NC_006448	GCT	2	6	152037	152042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820232
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2267	NC_006448	CTG	2	6	152494	152499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820232
2268	NC_006448	GCTGAT	2	12	152520	152531	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	55820232
2269	NC_006448	ATC	2	6	152535	152540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820232
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2271	NC_006448	ATG	2	6	152608	152613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820232
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2274	NC_006448	GGT	2	6	152772	152777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820232
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2276	NC_006448	GTA	2	6	152853	152858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820232
2277	NC_006448	CGT	2	6	152862	152867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820232
2278	NC_006448	CACCGT	2	12	152868	152879	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	55820232
2279	NC_006448	TTG	2	6	152995	153000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820232
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2288	NC_006448	TGA	2	6	153420	153425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820233
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2355	NC_006448	CAG	2	6	157487	157492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820240
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2361	NC_006448	CAA	2	6	157726	157731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820240
2362	NC_006448	TGAT	2	8	157769	157776	25 %	50 %	25 %	0 %	55820240
2363	NC_006448	CCTT	2	8	157904	157911	0 %	50 %	0 %	50 %	55820240
2364	NC_006448	CAT	2	6	158004	158009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820240
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2366	NC_006448	CAGG	2	8	158171	158178	25 %	0 %	50 %	25 %	55820240
2367	NC_006448	TAA	2	6	158236	158241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820241
2368	NC_006448	CTA	2	6	158334	158339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820241
2369	NC_006448	ATC	2	6	158369	158374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820241
2370	NC_006448	CTG	2	6	158415	158420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820241
2371	NC_006448	CTGGT	2	10	158469	158478	0 %	40 %	40 %	20 %	55820241
2372	NC_006448	A	7	7	158519	158525	100 %	0 %	0 %	0 %	55820241
2373	NC_006448	T	6	6	158556	158561	0 %	100 %	0 %	0 %	55820241
2374	NC_006448	ATA	2	6	158605	158610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820242
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2376	NC_006448	GAT	2	6	158742	158747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820242
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2378	NC_006448	CAA	2	6	158867	158872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820242
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2381	NC_006448	TCTA	2	8	159042	159049	25 %	50 %	0 %	25 %	55820242
2382	NC_006448	TGTT	2	8	159057	159064	0 %	75 %	25 %	0 %	55820242
2383	NC_006448	TGT	2	6	159084	159089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820242
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2387	NC_006448	TA	3	6	159345	159350	50 %	50 %	0 %	0 %	55820243
2388	NC_006448	ATG	2	6	159427	159432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820243
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2405	NC_006448	CT	3	6	160792	160797	0 %	50 %	0 %	50 %	55820243
2406	NC_006448	TGC	2	6	160799	160804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820243
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2410	NC_006448	GAGAT	2	10	161038	161047	40 %	20 %	40 %	0 %	55820243
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2480	NC_006448	TGC	2	6	165951	165956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820249
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2483	NC_006448	GAA	2	6	166016	166021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820249
2484	NC_006448	CAT	2	6	166026	166031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820249
2485	NC_006448	T	6	6	166031	166036	0 %	100 %	0 %	0 %	55820249
2486	NC_006448	ATA	2	6	166045	166050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820249
2487	NC_006448	GGTTG	2	10	166098	166107	0 %	40 %	60 %	0 %	55820249
2488	NC_006448	ATCA	2	8	166131	166138	50 %	25 %	0 %	25 %	55820249
2489	NC_006448	TGGC	2	8	166141	166148	0 %	25 %	50 %	25 %	55820249
2490	NC_006448	AAT	2	6	166152	166157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820249
2491	NC_006448	T	8	8	166271	166278	0 %	100 %	0 %	0 %	55820250
2492	NC_006448	TC	3	6	166308	166313	0 %	50 %	0 %	50 %	55820250
2493	NC_006448	TCT	2	6	166342	166347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820250
2494	NC_006448	TGA	2	6	166375	166380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820250
2495	NC_006448	AGA	2	6	166415	166420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820250
2496	NC_006448	ATGG	2	8	166425	166432	25 %	25 %	50 %	0 %	55820250
2497	NC_006448	GAG	2	6	166589	166594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55820250
2498	NC_006448	CTT	2	6	166597	166602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820250
2499	NC_006448	TAT	2	6	166603	166608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820250
2500	NC_006448	GCT	2	6	166623	166628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820250

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