MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 30284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24001	NC_006448	AGCC	2	8	1425014	1425021	25 %	0 %	25 %	50 %	55821584
24002	NC_006448	A	7	7	1425036	1425042	100 %	0 %	0 %	0 %	55821584
24003	NC_006448	AAG	2	6	1425102	1425107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821584
24004	NC_006448	TCTT	2	8	1425144	1425151	0 %	75 %	0 %	25 %	55821584
24005	NC_006448	GATT	2	8	1425242	1425249	25 %	50 %	25 %	0 %	55821584
24006	NC_006448	CTG	2	6	1425265	1425270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821584
24007	NC_006448	CTTT	2	8	1425319	1425326	0 %	75 %	0 %	25 %	55821584
24008	NC_006448	AAAAT	2	10	1425330	1425339	80 %	20 %	0 %	0 %	55821584
24009	NC_006448	ATAGCC	2	12	1425348	1425359	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	55821584
24010	NC_006448	GAC	2	6	1425413	1425418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821584
24011	NC_006448	CTT	2	6	1425476	1425481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821584
24012	NC_006448	CTT	2	6	1425499	1425504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821584
24013	NC_006448	ATG	2	6	1425600	1425605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821584
24014	NC_006448	A	7	7	1425669	1425675	100 %	0 %	0 %	0 %	55821584
24015	NC_006448	GAA	2	6	1425676	1425681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821584
24016	NC_006448	ACT	2	6	1425823	1425828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821585
24017	NC_006448	TCA	2	6	1425851	1425856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821585
24018	NC_006448	CA	3	6	1425906	1425911	50 %	0 %	0 %	50 %	55821585
24019	NC_006448	TCT	2	6	1425912	1425917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821585
24020	NC_006448	TCAA	2	8	1425986	1425993	50 %	25 %	0 %	25 %	55821585
24021	NC_006448	TCA	2	6	1426031	1426036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821585
24022	NC_006448	TTC	2	6	1426240	1426245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821585
24023	NC_006448	TCT	2	6	1426278	1426283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821585
24024	NC_006448	TAGC	2	8	1426289	1426296	25 %	25 %	25 %	25 %	55821585
24025	NC_006448	TTG	2	6	1426303	1426308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821585
24026	NC_006448	TCC	2	6	1426336	1426341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821585
24027	NC_006448	AAT	2	6	1426360	1426365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821585
24028	NC_006448	TTG	3	9	1426374	1426382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821585
24029	NC_006448	ACCA	2	8	1426411	1426418	50 %	0 %	0 %	50 %	55821585
24030	NC_006448	ACC	2	6	1426474	1426479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821585
24031	NC_006448	TTA	2	6	1426563	1426568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821586
24032	NC_006448	TCA	2	6	1426613	1426618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821586
24033	NC_006448	GAC	2	6	1426631	1426636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821586
24034	NC_006448	CTG	2	6	1426728	1426733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821586
24035	NC_006448	CTG	2	6	1426737	1426742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821586
24036	NC_006448	CGTGC	2	10	1426775	1426784	0 %	20 %	40 %	40 %	55821586
24037	NC_006448	TAA	2	6	1426819	1426824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821586
24038	NC_006448	GAA	2	6	1426829	1426834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821586
24039	NC_006448	ACGAAC	2	12	1426917	1426928	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	55821586
24040	NC_006448	CTA	2	6	1427031	1427036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821587
24041	NC_006448	ACG	2	6	1427046	1427051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821587
24042	NC_006448	AGA	2	6	1427064	1427069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821587
24043	NC_006448	TC	3	6	1427102	1427107	0 %	50 %	0 %	50 %	55821587
24044	NC_006448	CAT	2	6	1427139	1427144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821587
24045	NC_006448	TGA	2	6	1427166	1427171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821587
24046	NC_006448	CAT	2	6	1427235	1427240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821587
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24048	NC_006448	T	6	6	1427856	1427861	0 %	100 %	0 %	0 %	55821588
24049	NC_006448	ATC	2	6	1427874	1427879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821588
24050	NC_006448	ATTT	2	8	1428082	1428089	25 %	75 %	0 %	0 %	55821589
24051	NC_006448	T	6	6	1428087	1428092	0 %	100 %	0 %	0 %	55821589
24052	NC_006448	ACTGTT	2	12	1428100	1428111	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	55821589
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24054	NC_006448	ATTC	2	8	1428161	1428168	25 %	50 %	0 %	25 %	55821589
24055	NC_006448	AGC	2	6	1428228	1428233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821589
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24057	NC_006448	AAT	3	9	1428426	1428434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821589
24058	NC_006448	CGCT	2	8	1428435	1428442	0 %	25 %	25 %	50 %	55821589
24059	NC_006448	TAT	2	6	1428485	1428490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821589
24060	NC_006448	T	6	6	1428506	1428511	0 %	100 %	0 %	0 %	55821589
24061	NC_006448	ACT	2	6	1428532	1428537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821589
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24063	NC_006448	T	7	7	1428686	1428692	0 %	100 %	0 %	0 %	55821589
24064	NC_006448	T	7	7	1428701	1428707	0 %	100 %	0 %	0 %	55821589
24065	NC_006448	TTCA	2	8	1428715	1428722	25 %	50 %	0 %	25 %	55821589
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24118	NC_006448	AGA	2	6	1432389	1432394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821591
24119	NC_006448	CAG	2	6	1432406	1432411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821591
24120	NC_006448	TTCA	2	8	1432434	1432441	25 %	50 %	0 %	25 %	55821591
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24122	NC_006448	TCT	2	6	1432576	1432581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821591
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24132	NC_006448	CTC	2	6	1433319	1433324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821592
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24141	NC_006448	CGA	2	6	1434013	1434018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821592
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24146	NC_006448	CTT	2	6	1434419	1434424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821593
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24152	NC_006448	CCATG	2	10	1434937	1434946	20 %	20 %	20 %	40 %	55821594
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24189	NC_006448	CAT	2	6	1437320	1437325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821597
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24194	NC_006448	TTC	2	6	1437615	1437620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821597
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24196	NC_006448	GTCA	2	8	1437782	1437789	25 %	25 %	25 %	25 %	55821598
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24198	NC_006448	GTTTAT	2	12	1437928	1437939	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	55821598
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24200	NC_006448	GTT	2	6	1438019	1438024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821598
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24202	NC_006448	T	6	6	1438298	1438303	0 %	100 %	0 %	0 %	55821599
24203	NC_006448	ATG	3	9	1438336	1438344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821599
24204	NC_006448	AAG	2	6	1438387	1438392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821599
24205	NC_006448	TAAT	2	8	1438403	1438410	50 %	50 %	0 %	0 %	55821599
24206	NC_006448	ACCAA	2	10	1438528	1438537	60 %	0 %	0 %	40 %	55821599
24207	NC_006448	ACC	2	6	1438611	1438616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821599
24208	NC_006448	GCAG	2	8	1438672	1438679	25 %	0 %	50 %	25 %	55821599
24209	NC_006448	ATA	2	6	1438774	1438779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821599
24210	NC_006448	CA	3	6	1438847	1438852	50 %	0 %	0 %	50 %	55821599
24211	NC_006448	AGACC	2	10	1438949	1438958	40 %	0 %	20 %	40 %	55821599
24212	NC_006448	TACT	2	8	1438979	1438986	25 %	50 %	0 %	25 %	55821599
24213	NC_006448	A	6	6	1439034	1439039	100 %	0 %	0 %	0 %	55821599
24214	NC_006448	TCA	2	6	1439114	1439119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821599
24215	NC_006448	ATC	2	6	1439170	1439175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821599
24216	NC_006448	CCA	2	6	1439308	1439313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821600
24217	NC_006448	TCCCAA	2	12	1439409	1439420	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	55821600
24218	NC_006448	AAT	2	6	1439428	1439433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821600
24219	NC_006448	GAA	2	6	1439584	1439589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821600
24220	NC_006448	ATA	2	6	1439600	1439605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821600
24221	NC_006448	TCT	2	6	1439763	1439768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821601
24222	NC_006448	GCT	2	6	1439901	1439906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821601
24223	NC_006448	TGG	2	6	1439925	1439930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55821601
24224	NC_006448	AGATG	2	10	1440047	1440056	40 %	20 %	40 %	0 %	55821601
24225	NC_006448	GAT	2	6	1440068	1440073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821601
24226	NC_006448	TTC	2	6	1440113	1440118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821601
24227	NC_006448	CCA	2	6	1440192	1440197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821601
24228	NC_006448	GCT	2	6	1440207	1440212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821601
24229	NC_006448	AAG	2	6	1440216	1440221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821601
24230	NC_006448	TTGG	2	8	1440248	1440255	0 %	50 %	50 %	0 %	55821601
24231	NC_006448	CAT	2	6	1440256	1440261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821601
24232	NC_006448	CGG	2	6	1440297	1440302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55821601
24233	NC_006448	GCT	2	6	1440402	1440407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821601
24234	NC_006448	CTT	2	6	1440409	1440414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821601
24235	NC_006448	TCA	2	6	1440447	1440452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821601
24236	NC_006448	ACC	2	6	1440479	1440484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821601
24237	NC_006448	CTT	2	6	1440637	1440642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821601
24238	NC_006448	CTT	2	6	1440679	1440684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821601
24239	NC_006448	CTT	2	6	1440709	1440714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821601
24240	NC_006448	TCT	2	6	1440822	1440827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821601
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24242	NC_006448	AGT	2	6	1440958	1440963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821601
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24343	NC_006448	TCA	2	6	1447374	1447379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821610
24344	NC_006448	CTT	2	6	1447423	1447428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821610
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24348	NC_006448	TGTT	2	8	1447870	1447877	0 %	75 %	25 %	0 %	55821611
24349	NC_006448	TTC	2	6	1447888	1447893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821611
24350	NC_006448	CAA	2	6	1447915	1447920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821611
24351	NC_006448	ACT	2	6	1447931	1447936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821611
24352	NC_006448	GTC	3	9	1447963	1447971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821611
24353	NC_006448	AAT	2	6	1447996	1448001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821611
24354	NC_006448	ACC	3	9	1448020	1448028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821611
24355	NC_006448	ATC	2	6	1448065	1448070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821611
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24357	NC_006448	GTT	2	6	1448169	1448174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821611
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24359	NC_006448	TTG	2	6	1448204	1448209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821611
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24363	NC_006448	AGC	2	6	1448293	1448298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821611
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24368	NC_006448	TCA	2	6	1448820	1448825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821612
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24385	NC_006448	CAT	2	6	1449511	1449516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821612
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24387	NC_006448	ATC	2	6	1449543	1449548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821612
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24389	NC_006448	ATC	2	6	1449575	1449580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821612
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24445	NC_006448	GA	3	6	1454698	1454703	50 %	0 %	50 %	0 %	55821617
24446	NC_006448	GCTTT	2	10	1454705	1454714	0 %	60 %	20 %	20 %	55821617
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24454	NC_006448	CTG	2	6	1455127	1455132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821617
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24461	NC_006448	TTCC	2	8	1455715	1455722	0 %	50 %	0 %	50 %	55821618
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24465	NC_006448	CT	3	6	1455978	1455983	0 %	50 %	0 %	50 %	55821618
24466	NC_006448	TTTG	2	8	1456000	1456007	0 %	75 %	25 %	0 %	55821618
24467	NC_006448	CAT	2	6	1456037	1456042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821618
24468	NC_006448	TGA	2	6	1456049	1456054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821618
24469	NC_006448	TCAC	2	8	1456150	1456157	25 %	25 %	0 %	50 %	55821618
24470	NC_006448	ATG	2	6	1456237	1456242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821618
24471	NC_006448	TCA	2	6	1456243	1456248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821618
24472	NC_006448	ATT	2	6	1456290	1456295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821618
24473	NC_006448	GAC	2	6	1456302	1456307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821618
24474	NC_006448	TTCT	2	8	1456949	1456956	0 %	75 %	0 %	25 %	55821619
24475	NC_006448	ATCAT	2	10	1456981	1456990	40 %	40 %	0 %	20 %	55821619
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24477	NC_006448	GA	3	6	1457016	1457021	50 %	0 %	50 %	0 %	55821619
24478	NC_006448	GAT	2	6	1457100	1457105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821619
24479	NC_006448	A	6	6	1457119	1457124	100 %	0 %	0 %	0 %	55821619
24480	NC_006448	AGTG	2	8	1457162	1457169	25 %	25 %	50 %	0 %	55821619
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24482	NC_006448	TAAA	2	8	1457307	1457314	75 %	25 %	0 %	0 %	55821619
24483	NC_006448	CAG	2	6	1457438	1457443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821619
24484	NC_006448	AG	3	6	1457451	1457456	50 %	0 %	50 %	0 %	55821619
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24489	NC_006448	CAT	2	6	1457741	1457746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821619
24490	NC_006448	TGGT	2	8	1457770	1457777	0 %	50 %	50 %	0 %	55821619
24491	NC_006448	AAG	2	6	1457827	1457832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821619
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24494	NC_006448	AAG	2	6	1458081	1458086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821619
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24500	NC_006448	A	7	7	1458406	1458412	100 %	0 %	0 %	0 %	55821619

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