MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 30284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_006448	GCC	2	6	1251491	1251496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55821402
21002	NC_006448	T	6	6	1251499	1251504	0 %	100 %	0 %	0 %	55821402
21003	NC_006448	T	7	7	1251507	1251513	0 %	100 %	0 %	0 %	55821402
21004	NC_006448	ATT	2	6	1251677	1251682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821403
21005	NC_006448	ATG	2	6	1251692	1251697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821403
21006	NC_006448	AT	3	6	1251733	1251738	50 %	50 %	0 %	0 %	55821403
21007	NC_006448	AATCA	2	10	1251786	1251795	60 %	20 %	0 %	20 %	55821403
21008	NC_006448	CAC	2	6	1251818	1251823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821403
21009	NC_006448	CTT	2	6	1251839	1251844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821403
21010	NC_006448	TTA	2	6	1251919	1251924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821403
21011	NC_006448	CT	3	6	1251989	1251994	0 %	50 %	0 %	50 %	55821403
21012	NC_006448	TCA	2	6	1252055	1252060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821403
21013	NC_006448	TGA	2	6	1252068	1252073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821403
21014	NC_006448	AAG	2	6	1252080	1252085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821403
21015	NC_006448	ACG	2	6	1252119	1252124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821403
21016	NC_006448	CCA	2	6	1252192	1252197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821403
21017	NC_006448	CTT	2	6	1252209	1252214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821403
21018	NC_006448	TA	3	6	1252244	1252249	50 %	50 %	0 %	0 %	55821403
21019	NC_006448	TCT	2	6	1252270	1252275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821403
21020	NC_006448	TAG	2	6	1252361	1252366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821403
21021	NC_006448	T	7	7	1252388	1252394	0 %	100 %	0 %	0 %	55821403
21022	NC_006448	GTC	2	6	1252486	1252491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821403
21023	NC_006448	TTTTC	2	10	1252517	1252526	0 %	80 %	0 %	20 %	55821403
21024	NC_006448	ACC	2	6	1252548	1252553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821403
21025	NC_006448	ATA	2	6	1252573	1252578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821403
21026	NC_006448	GGC	2	6	1252611	1252616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55821403
21027	NC_006448	CCA	2	6	1252633	1252638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821403
21028	NC_006448	ATA	2	6	1252642	1252647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821403
21029	NC_006448	TCT	2	6	1252666	1252671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821403
21030	NC_006448	ATTTT	2	10	1252675	1252684	20 %	80 %	0 %	0 %	55821403
21031	NC_006448	TCT	2	6	1252700	1252705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821404
21032	NC_006448	TTC	2	6	1252717	1252722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821404
21033	NC_006448	ATG	2	6	1252813	1252818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821404
21034	NC_006448	TGA	2	6	1252897	1252902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821404
21035	NC_006448	ATC	2	6	1252909	1252914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821404
21036	NC_006448	CCA	2	6	1252994	1252999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821404
21037	NC_006448	TCA	2	6	1253054	1253059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821404
21038	NC_006448	CTT	2	6	1253097	1253102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821404
21039	NC_006448	ATTTA	2	10	1253179	1253188	40 %	60 %	0 %	0 %	55821404
21040	NC_006448	AAC	2	6	1253219	1253224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821404
21041	NC_006448	CCA	3	9	1253234	1253242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821404
21042	NC_006448	TCA	2	6	1253249	1253254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821404
21043	NC_006448	CAA	2	6	1253334	1253339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821404
21044	NC_006448	TGG	2	6	1253462	1253467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55821405
21045	NC_006448	AT	3	6	1253469	1253474	50 %	50 %	0 %	0 %	55821405
21046	NC_006448	T	6	6	1253489	1253494	0 %	100 %	0 %	0 %	55821405
21047	NC_006448	CAT	2	6	1253518	1253523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821405
21048	NC_006448	CAT	2	6	1253617	1253622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821405
21049	NC_006448	CAT	2	6	1253680	1253685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821405
21050	NC_006448	ATG	2	6	1253760	1253765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821405
21051	NC_006448	TCA	2	6	1253778	1253783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821405
21052	NC_006448	CTT	3	9	1253801	1253809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821405
21053	NC_006448	TCA	2	6	1254580	1254585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821406
21054	NC_006448	GAT	2	6	1254599	1254604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821406
21055	NC_006448	TCA	2	6	1254637	1254642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821406
21056	NC_006448	AGG	2	6	1254742	1254747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55821406
21057	NC_006448	CG	4	8	1254764	1254771	0 %	0 %	50 %	50 %	55821406
21058	NC_006448	TCA	2	6	1254778	1254783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821406
21059	NC_006448	CTG	2	6	1254884	1254889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821406
21060	NC_006448	T	6	6	1254944	1254949	0 %	100 %	0 %	0 %	55821406
21061	NC_006448	AAC	2	6	1255056	1255061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821406
21062	NC_006448	TCT	2	6	1255223	1255228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821407
21063	NC_006448	CCTTTA	2	12	1255265	1255276	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	55821407
21064	NC_006448	TCA	2	6	1255307	1255312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821407
21065	NC_006448	T	6	6	1255328	1255333	0 %	100 %	0 %	0 %	55821407
21066	NC_006448	TCAAA	2	10	1255365	1255374	60 %	20 %	0 %	20 %	55821407
21067	NC_006448	TGGC	2	8	1255442	1255449	0 %	25 %	50 %	25 %	55821407
21068	NC_006448	ACA	2	6	1255547	1255552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821407
21069	NC_006448	ATC	2	6	1255586	1255591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821407
21070	NC_006448	TCAG	2	8	1255673	1255680	25 %	25 %	25 %	25 %	55821407
21071	NC_006448	TGA	2	6	1255703	1255708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821407
21072	NC_006448	CTTA	2	8	1255720	1255727	25 %	50 %	0 %	25 %	55821407
21073	NC_006448	CCA	2	6	1255734	1255739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821407
21074	NC_006448	TAA	2	6	1255833	1255838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821407
21075	NC_006448	T	6	6	1255872	1255877	0 %	100 %	0 %	0 %	55821407
21076	NC_006448	CAT	2	6	1255918	1255923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821407
21077	NC_006448	GGTT	2	8	1255961	1255968	0 %	50 %	50 %	0 %	55821407
21078	NC_006448	ATA	2	6	1255973	1255978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821407
21079	NC_006448	TTGA	2	8	1255990	1255997	25 %	50 %	25 %	0 %	55821407
21080	NC_006448	TAT	2	6	1256010	1256015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821407
21081	NC_006448	A	6	6	1256068	1256073	100 %	0 %	0 %	0 %	55821407
21082	NC_006448	GA	3	6	1256100	1256105	50 %	0 %	50 %	0 %	55821407
21083	NC_006448	TAC	2	6	1256106	1256111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821407
21084	NC_006448	ACA	2	6	1256174	1256179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821407
21085	NC_006448	TTC	2	6	1256213	1256218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821407
21086	NC_006448	ACG	2	6	1256223	1256228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821408
21087	NC_006448	TTCATC	2	12	1256334	1256345	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	55821408
21088	NC_006448	AAG	2	6	1256347	1256352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821408
21089	NC_006448	AT	3	6	1256375	1256380	50 %	50 %	0 %	0 %	55821408
21090	NC_006448	GAC	2	6	1256445	1256450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821408
21091	NC_006448	ATCA	2	8	1256484	1256491	50 %	25 %	0 %	25 %	55821408
21092	NC_006448	ATA	2	6	1256512	1256517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821408
21093	NC_006448	ATC	2	6	1256523	1256528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821408
21094	NC_006448	A	7	7	1256728	1256734	100 %	0 %	0 %	0 %	55821408
21095	NC_006448	A	6	6	1256784	1256789	100 %	0 %	0 %	0 %	55821408
21096	NC_006448	CAA	2	6	1256799	1256804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821408
21097	NC_006448	ATA	2	6	1256833	1256838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821408
21098	NC_006448	ATT	2	6	1256841	1256846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821408
21099	NC_006448	AGA	2	6	1256875	1256880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821408
21100	NC_006448	CCA	2	6	1256885	1256890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821408
21101	NC_006448	A	6	6	1256896	1256901	100 %	0 %	0 %	0 %	55821408
21102	NC_006448	A	7	7	1257201	1257207	100 %	0 %	0 %	0 %	55821409
21103	NC_006448	TAT	2	6	1257208	1257213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821409
21104	NC_006448	AG	3	6	1257216	1257221	50 %	0 %	50 %	0 %	55821409
21105	NC_006448	CAA	2	6	1257226	1257231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821409
21106	NC_006448	ATG	2	6	1257575	1257580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821410
21107	NC_006448	CAA	2	6	1257583	1257588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821410
21108	NC_006448	ATAG	2	8	1257686	1257693	50 %	25 %	25 %	0 %	55821410
21109	NC_006448	CAACC	2	10	1257718	1257727	40 %	0 %	0 %	60 %	55821410
21110	NC_006448	ATT	2	6	1257972	1257977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821411
21111	NC_006448	TG	3	6	1257982	1257987	0 %	50 %	50 %	0 %	55821411
21112	NC_006448	TAC	2	6	1258023	1258028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821411
21113	NC_006448	AGAACT	2	12	1258033	1258044	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	55821411
21114	NC_006448	CAG	2	6	1258143	1258148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821411
21115	NC_006448	TAT	2	6	1258221	1258226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821411
21116	NC_006448	CTG	2	6	1258281	1258286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821411
21117	NC_006448	CTT	2	6	1258419	1258424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821411
21118	NC_006448	AGA	2	6	1258555	1258560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821411
21119	NC_006448	TGCT	2	8	1258575	1258582	0 %	50 %	25 %	25 %	55821411
21120	NC_006448	GGTC	2	8	1258611	1258618	0 %	25 %	50 %	25 %	55821411
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21124	NC_006448	GTT	2	6	1258875	1258880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821411
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21132	NC_006448	AAT	2	6	1259446	1259451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821411
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21151	NC_006448	GCA	2	6	1260352	1260357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821412
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21357	NC_006448	AT	3	6	1271601	1271606	50 %	50 %	0 %	0 %	55821423
21358	NC_006448	TAGTC	2	10	1271610	1271619	20 %	40 %	20 %	20 %	55821423
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21462	NC_006448	GTTT	2	8	1276843	1276850	0 %	75 %	25 %	0 %	55821428
21463	NC_006448	TTGAGC	2	12	1276857	1276868	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	55821428
21464	NC_006448	CTTTGG	2	12	1276946	1276957	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	55821428
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21471	NC_006448	TCT	2	6	1277252	1277257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821428
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21473	NC_006448	TAT	2	6	1277336	1277341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821428
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21475	NC_006448	GATCC	2	10	1277441	1277450	20 %	20 %	20 %	40 %	55821428
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21477	NC_006448	GAT	2	6	1277530	1277535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821428
21478	NC_006448	AAG	2	6	1277553	1277558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821428
21479	NC_006448	TA	3	6	1277570	1277575	50 %	50 %	0 %	0 %	55821428
21480	NC_006448	T	7	7	1277691	1277697	0 %	100 %	0 %	0 %	55821428
21481	NC_006448	GT	3	6	1277699	1277704	0 %	50 %	50 %	0 %	55821428
21482	NC_006448	TCCC	2	8	1278047	1278054	0 %	25 %	0 %	75 %	55821428
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21488	NC_006448	CAT	2	6	1278686	1278691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821429
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