MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 30284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_006448	GTT	2	6	1158945	1158950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821309
19503	NC_006448	ATT	2	6	1159163	1159168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821310
19504	NC_006448	ACC	2	6	1159169	1159174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821310
19505	NC_006448	CAG	2	6	1159183	1159188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821310
19506	NC_006448	GAGCT	2	10	1159210	1159219	20 %	20 %	40 %	20 %	55821310
19507	NC_006448	A	6	6	1159256	1159261	100 %	0 %	0 %	0 %	55821310
19508	NC_006448	CACC	2	8	1159282	1159289	25 %	0 %	0 %	75 %	55821310
19509	NC_006448	TCA	2	6	1159290	1159295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821310
19510	NC_006448	TCG	2	6	1159308	1159313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821310
19511	NC_006448	A	6	6	1159416	1159421	100 %	0 %	0 %	0 %	55821310
19512	NC_006448	A	6	6	1159458	1159463	100 %	0 %	0 %	0 %	55821310
19513	NC_006448	CTT	2	6	1159498	1159503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821310
19514	NC_006448	TCC	2	6	1159578	1159583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821310
19515	NC_006448	TAG	2	6	1159658	1159663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821310
19516	NC_006448	AAG	2	6	1160108	1160113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821311
19517	NC_006448	TTTAC	2	10	1160127	1160136	20 %	60 %	0 %	20 %	55821311
19518	NC_006448	TTA	2	6	1160140	1160145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821311
19519	NC_006448	TGG	2	6	1160172	1160177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55821311
19520	NC_006448	TGG	2	6	1160181	1160186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55821311
19521	NC_006448	TGG	2	6	1160211	1160216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55821311
19522	NC_006448	TTC	2	6	1160227	1160232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821311
19523	NC_006448	TCAC	2	8	1160357	1160364	25 %	25 %	0 %	50 %	55821311
19524	NC_006448	ACT	2	6	1160377	1160382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821311
19525	NC_006448	TAC	2	6	1160408	1160413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821311
19526	NC_006448	TCA	2	6	1160420	1160425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821311
19527	NC_006448	AAC	2	6	1160436	1160441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821311
19528	NC_006448	AAC	2	6	1160762	1160767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821312
19529	NC_006448	CAA	2	6	1160772	1160777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821312
19530	NC_006448	ATT	2	6	1160783	1160788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821312
19531	NC_006448	TAA	2	6	1160797	1160802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821312
19532	NC_006448	CGTA	2	8	1160854	1160861	25 %	25 %	25 %	25 %	55821312
19533	NC_006448	AAT	2	6	1160926	1160931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821312
19534	NC_006448	TGC	2	6	1161031	1161036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821312
19535	NC_006448	A	6	6	1161074	1161079	100 %	0 %	0 %	0 %	55821312
19536	NC_006448	AT	3	6	1161092	1161097	50 %	50 %	0 %	0 %	55821312
19537	NC_006448	ATAA	2	8	1161103	1161110	75 %	25 %	0 %	0 %	55821312
19538	NC_006448	TGT	2	6	1161127	1161132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821312
19539	NC_006448	AG	3	6	1161159	1161164	50 %	0 %	50 %	0 %	55821312
19540	NC_006448	A	6	6	1161201	1161206	100 %	0 %	0 %	0 %	55821312
19541	NC_006448	TCA	2	6	1161335	1161340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821312
19542	NC_006448	AGT	2	6	1161408	1161413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821312
19543	NC_006448	TTC	2	6	1161587	1161592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821313
19544	NC_006448	CTT	2	6	1161603	1161608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821313
19545	NC_006448	TGC	2	6	1161693	1161698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821313
19546	NC_006448	ACC	2	6	1161701	1161706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821313
19547	NC_006448	TTAA	2	8	1161753	1161760	50 %	50 %	0 %	0 %	55821313
19548	NC_006448	ATA	2	6	1161763	1161768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821313
19549	NC_006448	AC	3	6	1161775	1161780	50 %	0 %	0 %	50 %	55821313
19550	NC_006448	T	7	7	1161793	1161799	0 %	100 %	0 %	0 %	55821313
19551	NC_006448	TTC	2	6	1161836	1161841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821313
19552	NC_006448	TGA	2	6	1161849	1161854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821313
19553	NC_006448	AAC	2	6	1161875	1161880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821313
19554	NC_006448	ACG	2	6	1161890	1161895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821313
19555	NC_006448	CGTAA	2	10	1161897	1161906	40 %	20 %	20 %	20 %	55821313
19556	NC_006448	AGT	2	6	1161989	1161994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821313
19557	NC_006448	TCCAGA	2	12	1162001	1162012	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	55821313
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19559	NC_006448	TAT	2	6	1162112	1162117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821313
19560	NC_006448	TC	3	6	1162133	1162138	0 %	50 %	0 %	50 %	55821314
19561	NC_006448	T	6	6	1162237	1162242	0 %	100 %	0 %	0 %	55821314
19562	NC_006448	CAT	2	6	1162290	1162295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821314
19563	NC_006448	GTC	2	6	1162339	1162344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821314
19564	NC_006448	AGA	2	6	1162352	1162357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821314
19565	NC_006448	CTT	2	6	1162413	1162418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821314
19566	NC_006448	CT	4	8	1162516	1162523	0 %	50 %	0 %	50 %	55821314
19567	NC_006448	CAT	2	6	1162638	1162643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821314
19568	NC_006448	T	6	6	1162693	1162698	0 %	100 %	0 %	0 %	55821314
19569	NC_006448	TTTA	2	8	1162795	1162802	25 %	75 %	0 %	0 %	55821314
19570	NC_006448	CT	3	6	1162842	1162847	0 %	50 %	0 %	50 %	55821314
19571	NC_006448	TCT	2	6	1162865	1162870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821314
19572	NC_006448	AAT	3	9	1163008	1163016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821314
19573	NC_006448	T	6	6	1163041	1163046	0 %	100 %	0 %	0 %	55821314
19574	NC_006448	ATA	2	6	1163135	1163140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821315
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19576	NC_006448	TCAA	2	8	1163263	1163270	50 %	25 %	0 %	25 %	55821315
19577	NC_006448	TAATT	2	10	1163274	1163283	40 %	60 %	0 %	0 %	55821315
19578	NC_006448	TA	3	6	1163324	1163329	50 %	50 %	0 %	0 %	55821315
19579	NC_006448	TAA	2	6	1163412	1163417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821315
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19587	NC_006448	ATG	2	6	1163843	1163848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821316
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19591	NC_006448	GTTT	2	8	1163986	1163993	0 %	75 %	25 %	0 %	55821316
19592	NC_006448	GAA	2	6	1164013	1164018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821316
19593	NC_006448	AGGT	2	8	1164023	1164030	25 %	25 %	50 %	0 %	55821316
19594	NC_006448	ATG	2	6	1164095	1164100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821316
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19597	NC_006448	TTGAA	2	10	1164224	1164233	40 %	40 %	20 %	0 %	55821316
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19602	NC_006448	ACT	2	6	1164518	1164523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821316
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19604	NC_006448	ATC	2	6	1164563	1164568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821316
19605	NC_006448	CAA	2	6	1164790	1164795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821316
19606	NC_006448	TA	3	6	1164821	1164826	50 %	50 %	0 %	0 %	55821316
19607	NC_006448	A	6	6	1164897	1164902	100 %	0 %	0 %	0 %	55821316
19608	NC_006448	TGC	2	6	1164977	1164982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821316
19609	NC_006448	ATAG	2	8	1164996	1165003	50 %	25 %	25 %	0 %	55821316
19610	NC_006448	GAT	2	6	1165174	1165179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821316
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19613	NC_006448	TAAA	2	8	1165463	1165470	75 %	25 %	0 %	0 %	55821317
19614	NC_006448	TAA	2	6	1165472	1165477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821317
19615	NC_006448	TTTTTA	2	12	1165568	1165579	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	55821317
19616	NC_006448	CAA	2	6	1165625	1165630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821317
19617	NC_006448	AAT	2	6	1165680	1165685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821317
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19619	NC_006448	GAA	2	6	1165841	1165846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821317
19620	NC_006448	ACG	2	6	1165905	1165910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821317
19621	NC_006448	AAC	2	6	1166013	1166018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821317
19622	NC_006448	ATGCTG	2	12	1166030	1166041	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	55821317
19623	NC_006448	T	6	6	1166099	1166104	0 %	100 %	0 %	0 %	55821317
19624	NC_006448	TGT	2	6	1166175	1166180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821317
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19626	NC_006448	TCA	2	6	1166236	1166241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821317
19627	NC_006448	ACT	2	6	1166254	1166259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821317
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19629	NC_006448	GCCACC	2	12	1166310	1166321	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	55821317
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19633	NC_006448	TGAT	2	8	1166508	1166515	25 %	50 %	25 %	0 %	55821318
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19645	NC_006448	CTT	2	6	1167225	1167230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821318
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19649	NC_006448	TGC	2	6	1167340	1167345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821318
19650	NC_006448	CTTTT	2	10	1167378	1167387	0 %	80 %	0 %	20 %	55821318
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19734	NC_006448	TTGG	2	8	1174607	1174614	0 %	50 %	50 %	0 %	55821328
19735	NC_006448	CTT	2	6	1174642	1174647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821328
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19974	NC_006448	TCA	2	6	1188129	1188134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821344
19975	NC_006448	GGC	2	6	1188135	1188140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55821344
19976	NC_006448	ATT	2	6	1188202	1188207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821344
19977	NC_006448	TTCT	2	8	1188301	1188308	0 %	75 %	0 %	25 %	55821344
19978	NC_006448	CTT	2	6	1188396	1188401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821344
19979	NC_006448	CTT	2	6	1188523	1188528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821344
19980	NC_006448	CAT	2	6	1188646	1188651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821344
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19982	NC_006448	CTT	2	6	1189053	1189058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821345
19983	NC_006448	C	7	7	1189117	1189123	0 %	0 %	0 %	100 %	55821345
19984	NC_006448	TCT	2	6	1189214	1189219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821345
19985	NC_006448	GA	3	6	1189251	1189256	50 %	0 %	50 %	0 %	55821345
19986	NC_006448	GCCA	2	8	1189263	1189270	25 %	0 %	25 %	50 %	55821345
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19989	NC_006448	ACTT	2	8	1189423	1189430	25 %	50 %	0 %	25 %	55821345
19990	NC_006448	TCC	2	6	1189436	1189441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821345
19991	NC_006448	TTC	2	6	1189523	1189528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821345
19992	NC_006448	CAG	2	6	1189554	1189559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821345
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19995	NC_006448	CAT	2	6	1189698	1189703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821345
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19997	NC_006448	TGA	2	6	1189731	1189736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821345
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19999	NC_006448	TC	3	6	1189758	1189763	0 %	50 %	0 %	50 %	55821345
20000	NC_006448	CAT	2	6	1189782	1189787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821345

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