MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 30284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_006448	TCA	2	6	95266	95271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820185
1502	NC_006448	ATGT	2	8	95734	95741	25 %	50 %	25 %	0 %	55820186
1503	NC_006448	TCG	2	6	95811	95816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820186
1504	NC_006448	GAT	2	6	95872	95877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820186
1505	NC_006448	GGC	2	6	95889	95894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55820186
1506	NC_006448	TTA	2	6	96002	96007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820186
1507	NC_006448	TTGA	2	8	96043	96050	25 %	50 %	25 %	0 %	55820186
1508	NC_006448	CAA	2	6	96126	96131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820186
1509	NC_006448	GA	3	6	96236	96241	50 %	0 %	50 %	0 %	55820186
1510	NC_006448	TGG	2	6	96339	96344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820186
1511	NC_006448	GCTTC	2	10	96531	96540	0 %	40 %	20 %	40 %	55820186
1512	NC_006448	ACA	2	6	96552	96557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820186
1513	NC_006448	ATG	2	6	96596	96601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820186
1514	NC_006448	AGA	2	6	96651	96656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820186
1515	NC_006448	AAGCC	2	10	96660	96669	40 %	0 %	20 %	40 %	55820186
1516	NC_006448	GGC	2	6	96699	96704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55820186
1517	NC_006448	GAT	2	6	96709	96714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820186
1518	NC_006448	CTGTT	2	10	96740	96749	0 %	60 %	20 %	20 %	55820186
1519	NC_006448	ATG	2	6	96782	96787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820186
1520	NC_006448	A	6	6	96809	96814	100 %	0 %	0 %	0 %	55820186
1521	NC_006448	GAA	3	9	96841	96849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820186
1522	NC_006448	TGA	2	6	96855	96860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820186
1523	NC_006448	AGC	2	6	96891	96896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820186
1524	NC_006448	CAA	2	6	96903	96908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820186
1525	NC_006448	CAG	2	6	96920	96925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820186
1526	NC_006448	TGA	2	6	96936	96941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820186
1527	NC_006448	GCT	2	6	96946	96951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820186
1528	NC_006448	CTT	2	6	96964	96969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820186
1529	NC_006448	AGG	2	6	96977	96982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55820186
1530	NC_006448	TTA	2	6	97023	97028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820187
1531	NC_006448	A	6	6	97176	97181	100 %	0 %	0 %	0 %	55820187
1532	NC_006448	TTA	2	6	97275	97280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820187
1533	NC_006448	AGA	2	6	97351	97356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820187
1534	NC_006448	GTTG	2	8	97357	97364	0 %	50 %	50 %	0 %	55820187
1535	NC_006448	TGA	2	6	97375	97380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820187
1536	NC_006448	ATGA	2	8	97682	97689	50 %	25 %	25 %	0 %	55820188
1537	NC_006448	TGT	2	6	97723	97728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820188
1538	NC_006448	TGA	2	6	97789	97794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820188
1539	NC_006448	CTT	2	6	97946	97951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820189
1540	NC_006448	AGA	2	6	98011	98016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820189
1541	NC_006448	AAC	2	6	98468	98473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820190
1542	NC_006448	AATC	2	8	98479	98486	50 %	25 %	0 %	25 %	55820190
1543	NC_006448	AAAC	2	8	98543	98550	75 %	0 %	0 %	25 %	55820190
1544	NC_006448	AAG	2	6	98613	98618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820190
1545	NC_006448	TCA	2	6	98675	98680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820190
1546	NC_006448	GT	3	6	98695	98700	0 %	50 %	50 %	0 %	55820190
1547	NC_006448	TC	3	6	98720	98725	0 %	50 %	0 %	50 %	55820190
1548	NC_006448	TTA	2	6	98728	98733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820190
1549	NC_006448	TTA	2	6	98848	98853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820190
1550	NC_006448	AAG	2	6	98971	98976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820190
1551	NC_006448	ATGG	2	8	99003	99010	25 %	25 %	50 %	0 %	55820190
1552	NC_006448	TGA	2	6	99104	99109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820190
1553	NC_006448	GAT	2	6	99110	99115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820190
1554	NC_006448	TATG	2	8	99176	99183	25 %	50 %	25 %	0 %	55820190
1555	NC_006448	A	7	7	99212	99218	100 %	0 %	0 %	0 %	55820191
1556	NC_006448	GAAA	2	8	99259	99266	75 %	0 %	25 %	0 %	55820191
1557	NC_006448	ATC	2	6	99359	99364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820191
1558	NC_006448	TG	3	6	99365	99370	0 %	50 %	50 %	0 %	55820191
1559	NC_006448	CAG	2	6	99477	99482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820191
1560	NC_006448	GGA	2	6	99589	99594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55820191
1561	NC_006448	AAC	2	6	99649	99654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820191
1562	NC_006448	AAATA	2	10	99714	99723	80 %	20 %	0 %	0 %	55820191
1563	NC_006448	AT	3	6	99729	99734	50 %	50 %	0 %	0 %	55820192
1564	NC_006448	CAG	2	6	99761	99766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820192
1565	NC_006448	ATG	2	6	99794	99799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820192
1566	NC_006448	GAT	2	6	99829	99834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820192
1567	NC_006448	AAG	2	6	99896	99901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820192
1568	NC_006448	TCG	2	6	99954	99959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820192
1569	NC_006448	TGA	2	6	99975	99980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820192
1570	NC_006448	TCA	2	6	100000	100005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820192
1571	NC_006448	GGC	2	6	100098	100103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55820192
1572	NC_006448	TC	3	6	100122	100127	0 %	50 %	0 %	50 %	55820192
1573	NC_006448	GGC	2	6	100134	100139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55820192
1574	NC_006448	TGA	2	6	100227	100232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820192
1575	NC_006448	ATC	2	6	100238	100243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820192
1576	NC_006448	ATT	2	6	100279	100284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820192
1577	NC_006448	CTT	2	6	100309	100314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820192
1578	NC_006448	A	6	6	100366	100371	100 %	0 %	0 %	0 %	55820192
1579	NC_006448	GCT	2	6	100453	100458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820192
1580	NC_006448	TTA	2	6	100508	100513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820192
1581	NC_006448	TAAAGT	2	12	100591	100602	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	55820192
1582	NC_006448	TGA	2	6	100932	100937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820193
1583	NC_006448	AAATG	2	10	100947	100956	60 %	20 %	20 %	0 %	55820193
1584	NC_006448	GAC	2	6	100962	100967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820193
1585	NC_006448	AAC	2	6	100969	100974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820193
1586	NC_006448	GAT	2	6	101092	101097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820193
1587	NC_006448	ATG	2	6	101114	101119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820193
1588	NC_006448	CT	3	6	101130	101135	0 %	50 %	0 %	50 %	55820193
1589	NC_006448	CGA	2	6	101198	101203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820193
1590	NC_006448	ATA	2	6	101237	101242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820193
1591	NC_006448	ATC	3	9	101243	101251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820193
1592	NC_006448	TAT	2	6	101254	101259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820193
1593	NC_006448	TGA	2	6	101271	101276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820193
1594	NC_006448	A	6	6	101351	101356	100 %	0 %	0 %	0 %	55820193
1595	NC_006448	GTT	2	6	101357	101362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820193
1596	NC_006448	GTG	2	6	101571	101576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820194
1597	NC_006448	GCT	2	6	101596	101601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820194
1598	NC_006448	GGT	2	6	101678	101683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820194
1599	NC_006448	ATCA	2	8	101688	101695	50 %	25 %	0 %	25 %	55820194
1600	NC_006448	AGA	2	6	101743	101748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820194
1601	NC_006448	CGAA	2	8	101812	101819	50 %	0 %	25 %	25 %	55820194
1602	NC_006448	TTC	2	6	101828	101833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820194
1603	NC_006448	GAAT	2	8	101859	101866	50 %	25 %	25 %	0 %	55820194
1604	NC_006448	AATC	2	8	101887	101894	50 %	25 %	0 %	25 %	55820194
1605	NC_006448	GAT	2	6	102029	102034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820194
1606	NC_006448	ATA	2	6	102047	102052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820194
1607	NC_006448	CTGA	2	8	102086	102093	25 %	25 %	25 %	25 %	55820194
1608	NC_006448	T	6	6	102097	102102	0 %	100 %	0 %	0 %	55820194
1609	NC_006448	TCA	2	6	102138	102143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820194
1610	NC_006448	AATT	2	8	102219	102226	50 %	50 %	0 %	0 %	55820194
1611	NC_006448	CTC	2	6	102264	102269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55820194
1612	NC_006448	TGA	2	6	102280	102285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820194
1613	NC_006448	CAGA	2	8	102371	102378	50 %	0 %	25 %	25 %	55820194
1614	NC_006448	AACAA	2	10	102711	102720	80 %	0 %	0 %	20 %	55820195
1615	NC_006448	AGT	2	6	102803	102808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820195
1616	NC_006448	A	6	6	102827	102832	100 %	0 %	0 %	0 %	55820195
1617	NC_006448	CACAC	2	10	102845	102854	40 %	0 %	0 %	60 %	55820195
1618	NC_006448	TTA	2	6	102880	102885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820195
1619	NC_006448	A	6	6	102912	102917	100 %	0 %	0 %	0 %	55820195
1620	NC_006448	CTA	2	6	102932	102937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820195
1621	NC_006448	CACT	2	8	102938	102945	25 %	25 %	0 %	50 %	55820195
1622	NC_006448	GGT	2	6	102957	102962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820195
1623	NC_006448	CAG	2	6	102976	102981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820195
1624	NC_006448	CA	3	6	103042	103047	50 %	0 %	0 %	50 %	55820195
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1626	NC_006448	GCACAA	2	12	103185	103196	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	55820196
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1754	NC_006448	A	6	6	110790	110795	100 %	0 %	0 %	0 %	55820203
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1782	NC_006448	T	6	6	112299	112304	0 %	100 %	0 %	0 %	55820204
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