MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 30284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_006448	ATTG	2	8	1128254	1128261	25 %	50 %	25 %	0 %	55821282
19002	NC_006448	TCA	2	6	1128406	1128411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821282
19003	NC_006448	GTTG	2	8	1128427	1128434	0 %	50 %	50 %	0 %	55821282
19004	NC_006448	T	6	6	1128505	1128510	0 %	100 %	0 %	0 %	55821282
19005	NC_006448	CTAT	2	8	1128514	1128521	25 %	50 %	0 %	25 %	55821282
19006	NC_006448	AAT	2	6	1128581	1128586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821282
19007	NC_006448	CCCA	2	8	1128594	1128601	25 %	0 %	0 %	75 %	55821282
19008	NC_006448	CCA	2	6	1128703	1128708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821283
19009	NC_006448	GACT	2	8	1128747	1128754	25 %	25 %	25 %	25 %	55821283
19010	NC_006448	CTTA	2	8	1128834	1128841	25 %	50 %	0 %	25 %	55821283
19011	NC_006448	TTA	2	6	1128850	1128855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821283
19012	NC_006448	AATT	2	8	1128882	1128889	50 %	50 %	0 %	0 %	55821283
19013	NC_006448	CAA	2	6	1128911	1128916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821283
19014	NC_006448	AAC	2	6	1128924	1128929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821283
19015	NC_006448	TTC	2	6	1129046	1129051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821284
19016	NC_006448	CAAAG	2	10	1129061	1129070	60 %	0 %	20 %	20 %	55821284
19017	NC_006448	ATC	2	6	1129088	1129093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821284
19018	NC_006448	GA	3	6	1129135	1129140	50 %	0 %	50 %	0 %	55821284
19019	NC_006448	ATA	2	6	1129161	1129166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821284
19020	NC_006448	ATA	2	6	1129188	1129193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821284
19021	NC_006448	TCA	2	6	1129197	1129202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821284
19022	NC_006448	ACC	2	6	1129271	1129276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821284
19023	NC_006448	CTT	2	6	1129345	1129350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821284
19024	NC_006448	GCT	2	6	1129365	1129370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821284
19025	NC_006448	CAG	2	6	1129417	1129422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821284
19026	NC_006448	AAT	3	9	1129487	1129495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821284
19027	NC_006448	TTC	2	6	1129496	1129501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821284
19028	NC_006448	AAG	2	6	1129515	1129520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821284
19029	NC_006448	TCA	2	6	1129533	1129538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821284
19030	NC_006448	CTT	2	6	1129594	1129599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821284
19031	NC_006448	TCG	2	6	1129659	1129664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821284
19032	NC_006448	TTG	2	6	1129794	1129799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821284
19033	NC_006448	TAAAG	2	10	1129804	1129813	60 %	20 %	20 %	0 %	55821284
19034	NC_006448	TTG	2	6	1129828	1129833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821284
19035	NC_006448	GTC	2	6	1129853	1129858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821284
19036	NC_006448	AT	3	6	1129935	1129940	50 %	50 %	0 %	0 %	55821284
19037	NC_006448	TCT	3	9	1129968	1129976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821284
19038	NC_006448	TCTTCA	2	12	1129986	1129997	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	55821284
19039	NC_006448	AAC	2	6	1130003	1130008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821284
19040	NC_006448	ACG	2	6	1130030	1130035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821284
19041	NC_006448	TGA	2	6	1130077	1130082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821284
19042	NC_006448	ATC	2	6	1130144	1130149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821284
19043	NC_006448	ACG	2	6	1130189	1130194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821284
19044	NC_006448	TGGCT	2	10	1130212	1130221	0 %	40 %	40 %	20 %	55821284
19045	NC_006448	AAT	2	6	1130291	1130296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821284
19046	NC_006448	GAT	2	6	1130314	1130319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821284
19047	NC_006448	TAA	2	6	1130330	1130335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821284
19048	NC_006448	CCTTAT	2	12	1130365	1130376	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	55821284
19049	NC_006448	ACG	2	6	1130387	1130392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821284
19050	NC_006448	AAGGA	2	10	1130442	1130451	60 %	0 %	40 %	0 %	55821284
19051	NC_006448	ACG	2	6	1130555	1130560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821284
19052	NC_006448	CTG	2	6	1130608	1130613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821284
19053	NC_006448	ACGA	2	8	1130645	1130652	50 %	0 %	25 %	25 %	55821284
19054	NC_006448	GTT	2	6	1130727	1130732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821284
19055	NC_006448	CGAA	2	8	1130747	1130754	50 %	0 %	25 %	25 %	55821284
19056	NC_006448	ACC	2	6	1130816	1130821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821284
19057	NC_006448	GAA	2	6	1130842	1130847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821284
19058	NC_006448	CAT	2	6	1130885	1130890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821284
19059	NC_006448	TG	3	6	1130923	1130928	0 %	50 %	50 %	0 %	55821284
19060	NC_006448	AAG	2	6	1130978	1130983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821284
19061	NC_006448	GAA	2	6	1131001	1131006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821284
19062	NC_006448	CCAT	2	8	1131138	1131145	25 %	25 %	0 %	50 %	55821284
19063	NC_006448	CAAC	2	8	1131169	1131176	50 %	0 %	0 %	50 %	55821284
19064	NC_006448	CCA	2	6	1131191	1131196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821284
19065	NC_006448	ATAG	2	8	1131221	1131228	50 %	25 %	25 %	0 %	55821284
19066	NC_006448	T	6	6	1131284	1131289	0 %	100 %	0 %	0 %	55821284
19067	NC_006448	TCAT	2	8	1131318	1131325	25 %	50 %	0 %	25 %	55821284
19068	NC_006448	ACG	2	6	1131338	1131343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821284
19069	NC_006448	AATTA	2	10	1131452	1131461	60 %	40 %	0 %	0 %	55821284
19070	NC_006448	AACTA	2	10	1131699	1131708	60 %	20 %	0 %	20 %	55821285
19071	NC_006448	A	6	6	1131712	1131717	100 %	0 %	0 %	0 %	55821285
19072	NC_006448	TTG	2	6	1131725	1131730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821285
19073	NC_006448	ATC	2	6	1131799	1131804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821285
19074	NC_006448	ATT	2	6	1131816	1131821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821285
19075	NC_006448	A	7	7	1131880	1131886	100 %	0 %	0 %	0 %	55821285
19076	NC_006448	CTG	2	6	1131938	1131943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821285
19077	NC_006448	CTC	2	6	1131947	1131952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821285
19078	NC_006448	TTG	2	6	1131980	1131985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821285
19079	NC_006448	CAA	2	6	1132002	1132007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821285
19080	NC_006448	GTT	2	6	1132024	1132029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821285
19081	NC_006448	GCT	2	6	1132060	1132065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821285
19082	NC_006448	GTTCA	2	10	1132202	1132211	20 %	40 %	20 %	20 %	55821285
19083	NC_006448	CAT	2	6	1132218	1132223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821285
19084	NC_006448	GAA	2	6	1132306	1132311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821285
19085	NC_006448	AAG	2	6	1132319	1132324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821285
19086	NC_006448	CAA	2	6	1132377	1132382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821285
19087	NC_006448	A	6	6	1132381	1132386	100 %	0 %	0 %	0 %	55821285
19088	NC_006448	TAC	2	6	1132396	1132401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821285
19089	NC_006448	AAG	2	6	1132481	1132486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821285
19090	NC_006448	ACA	2	6	1132502	1132507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821285
19091	NC_006448	AAC	2	6	1132583	1132588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821285
19092	NC_006448	TGA	2	6	1132629	1132634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821285
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19094	NC_006448	A	6	6	1132668	1132673	100 %	0 %	0 %	0 %	55821285
19095	NC_006448	ATT	2	6	1132769	1132774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821286
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19097	NC_006448	TGGT	2	8	1132809	1132816	0 %	50 %	50 %	0 %	55821286
19098	NC_006448	AAG	2	6	1132828	1132833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821286
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19100	NC_006448	CTA	2	6	1133036	1133041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821286
19101	NC_006448	CTG	2	6	1133042	1133047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821286
19102	NC_006448	ATAG	2	8	1133109	1133116	50 %	25 %	25 %	0 %	55821286
19103	NC_006448	CAC	3	9	1133156	1133164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821286
19104	NC_006448	TTA	2	6	1133305	1133310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821286
19105	NC_006448	AAC	2	6	1133388	1133393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821286
19106	NC_006448	CAA	2	6	1133561	1133566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821286
19107	NC_006448	CTT	2	6	1133582	1133587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821286
19108	NC_006448	CTT	2	6	1133693	1133698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821286
19109	NC_006448	CTT	2	6	1133762	1133767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821286
19110	NC_006448	CAA	2	6	1133858	1133863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821286
19111	NC_006448	TA	3	6	1133913	1133918	50 %	50 %	0 %	0 %	55821286
19112	NC_006448	CTT	2	6	1133945	1133950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821286
19113	NC_006448	ACT	2	6	1134052	1134057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821286
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19115	NC_006448	CTC	2	6	1134668	1134673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821287
19116	NC_006448	CTT	2	6	1134812	1134817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821287
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19118	NC_006448	CGA	2	6	1134929	1134934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821287
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19238	NC_006448	CTA	2	6	1142872	1142877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821296
19239	NC_006448	AGT	2	6	1142975	1142980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821296
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19355	NC_006448	GCT	2	6	1149706	1149711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821300
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19358	NC_006448	AAGG	2	8	1149987	1149994	50 %	0 %	50 %	0 %	55821300
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19373	NC_006448	AG	3	6	1150707	1150712	50 %	0 %	50 %	0 %	55821301
19374	NC_006448	GAAT	2	8	1150725	1150732	50 %	25 %	25 %	0 %	55821301
19375	NC_006448	GCT	2	6	1150745	1150750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821301
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19445	NC_006448	A	7	7	1155523	1155529	100 %	0 %	0 %	0 %	55821307
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19472	NC_006448	TTG	2	6	1157289	1157294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821309
19473	NC_006448	GAG	2	6	1157322	1157327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55821309
19474	NC_006448	TTTG	2	8	1157330	1157337	0 %	75 %	25 %	0 %	55821309
19475	NC_006448	TAC	2	6	1157390	1157395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821309
19476	NC_006448	AGG	2	6	1157452	1157457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55821309
19477	NC_006448	CTC	2	6	1157463	1157468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821309
19478	NC_006448	TTGGT	2	10	1157521	1157530	0 %	60 %	40 %	0 %	55821309
19479	NC_006448	GATA	2	8	1157562	1157569	50 %	25 %	25 %	0 %	55821309
19480	NC_006448	TGACC	2	10	1157606	1157615	20 %	20 %	20 %	40 %	55821309
19481	NC_006448	ACC	2	6	1157619	1157624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821309
19482	NC_006448	TGG	2	6	1157643	1157648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55821309
19483	NC_006448	CGA	2	6	1157683	1157688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821309
19484	NC_006448	T	6	6	1157757	1157762	0 %	100 %	0 %	0 %	55821309
19485	NC_006448	ATG	2	6	1157815	1157820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821309
19486	NC_006448	AAG	2	6	1157919	1157924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821309
19487	NC_006448	TA	3	6	1158117	1158122	50 %	50 %	0 %	0 %	55821309
19488	NC_006448	CAT	2	6	1158143	1158148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821309
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19490	NC_006448	GTA	2	6	1158237	1158242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821309
19491	NC_006448	TTTG	2	8	1158284	1158291	0 %	75 %	25 %	0 %	55821309
19492	NC_006448	CTG	2	6	1158332	1158337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821309
19493	NC_006448	ATC	2	6	1158402	1158407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821309
19494	NC_006448	GGT	2	6	1158462	1158467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55821309
19495	NC_006448	GTA	2	6	1158504	1158509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821309
19496	NC_006448	TTG	2	6	1158520	1158525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821309
19497	NC_006448	CTT	2	6	1158570	1158575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821309
19498	NC_006448	ACC	2	6	1158621	1158626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821309
19499	NC_006448	CTT	2	6	1158630	1158635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821309
19500	NC_006448	T	6	6	1158874	1158879	0 %	100 %	0 %	0 %	55821309

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