MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 30284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_006448	TGAT	2	8	1100574	1100581	25 %	50 %	25 %	0 %	55821259
18502	NC_006448	T	6	6	1100702	1100707	0 %	100 %	0 %	0 %	55821259
18503	NC_006448	CAAC	2	8	1100821	1100828	50 %	0 %	0 %	50 %	55821259
18504	NC_006448	GT	3	6	1100839	1100844	0 %	50 %	50 %	0 %	55821259
18505	NC_006448	TTG	2	6	1100848	1100853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821259
18506	NC_006448	GTC	2	6	1100877	1100882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821259
18507	NC_006448	TAGA	2	8	1100888	1100895	50 %	25 %	25 %	0 %	55821259
18508	NC_006448	CAT	2	6	1100902	1100907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821259
18509	NC_006448	TAT	2	6	1101004	1101009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821259
18510	NC_006448	CAC	2	6	1101129	1101134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821260
18511	NC_006448	TCCAA	2	10	1101136	1101145	40 %	20 %	0 %	40 %	55821260
18512	NC_006448	CAA	2	6	1101181	1101186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821260
18513	NC_006448	A	6	6	1101233	1101238	100 %	0 %	0 %	0 %	55821260
18514	NC_006448	ACA	2	6	1101281	1101286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821260
18515	NC_006448	TGTT	2	8	1101301	1101308	0 %	75 %	25 %	0 %	55821260
18516	NC_006448	AGC	2	6	1101322	1101327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821260
18517	NC_006448	TTA	2	6	1101359	1101364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821260
18518	NC_006448	TGT	2	6	1101394	1101399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821260
18519	NC_006448	TTA	2	6	1101404	1101409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821260
18520	NC_006448	CAT	2	6	1101429	1101434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821260
18521	NC_006448	GCG	2	6	1101438	1101443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55821260
18522	NC_006448	CAC	2	6	1101481	1101486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821260
18523	NC_006448	A	6	6	1101641	1101646	100 %	0 %	0 %	0 %	55821260
18524	NC_006448	GTCC	2	8	1101656	1101663	0 %	25 %	25 %	50 %	55821260
18525	NC_006448	CGAA	2	8	1101679	1101686	50 %	0 %	25 %	25 %	55821260
18526	NC_006448	CTG	2	6	1101708	1101713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821260
18527	NC_006448	TGA	2	6	1101729	1101734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821260
18528	NC_006448	TCA	2	6	1101741	1101746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821260
18529	NC_006448	TCG	2	6	1101756	1101761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821260
18530	NC_006448	ATAA	2	8	1101797	1101804	75 %	25 %	0 %	0 %	55821260
18531	NC_006448	TAA	2	6	1101852	1101857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821260
18532	NC_006448	A	6	6	1101869	1101874	100 %	0 %	0 %	0 %	55821260
18533	NC_006448	CAA	2	6	1101876	1101881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821260
18534	NC_006448	TCA	2	6	1101975	1101980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821260
18535	NC_006448	ACT	2	6	1102086	1102091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821261
18536	NC_006448	TC	3	6	1102127	1102132	0 %	50 %	0 %	50 %	55821261
18537	NC_006448	AC	3	6	1102198	1102203	50 %	0 %	0 %	50 %	55821261
18538	NC_006448	TCG	2	6	1102222	1102227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821261
18539	NC_006448	AAG	2	6	1102285	1102290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821261
18540	NC_006448	TAAC	2	8	1102306	1102313	50 %	25 %	0 %	25 %	55821261
18541	NC_006448	TGA	2	6	1102406	1102411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821261
18542	NC_006448	AGCC	2	8	1102412	1102419	25 %	0 %	25 %	50 %	55821261
18543	NC_006448	GAT	2	6	1102520	1102525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821261
18544	NC_006448	TGC	2	6	1102535	1102540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821261
18545	NC_006448	AC	3	6	1102659	1102664	50 %	0 %	0 %	50 %	55821261
18546	NC_006448	TG	3	6	1102682	1102687	0 %	50 %	50 %	0 %	55821261
18547	NC_006448	TTC	2	6	1102705	1102710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821261
18548	NC_006448	TG	3	6	1102748	1102753	0 %	50 %	50 %	0 %	55821261
18549	NC_006448	G	6	6	1102869	1102874	0 %	0 %	100 %	0 %	55821261
18550	NC_006448	ACA	2	6	1102879	1102884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821261
18551	NC_006448	TGC	2	6	1102898	1102903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821261
18552	NC_006448	TTC	2	6	1102920	1102925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821261
18553	NC_006448	CTT	2	6	1103106	1103111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821261
18554	NC_006448	TGG	2	6	1103204	1103209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55821261
18555	NC_006448	CGT	2	6	1103232	1103237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821261
18556	NC_006448	TC	3	6	1103429	1103434	0 %	50 %	0 %	50 %	55821262
18557	NC_006448	TCT	2	6	1103494	1103499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821262
18558	NC_006448	ATG	2	6	1103531	1103536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821262
18559	NC_006448	CGA	2	6	1103593	1103598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821262
18560	NC_006448	TCT	2	6	1103625	1103630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821262
18561	NC_006448	GGT	2	6	1103636	1103641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55821262
18562	NC_006448	TGG	2	6	1103740	1103745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55821262
18563	NC_006448	GAA	2	6	1103873	1103878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821262
18564	NC_006448	TAT	2	6	1103891	1103896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821262
18565	NC_006448	CCTT	2	8	1103922	1103929	0 %	50 %	0 %	50 %	55821262
18566	NC_006448	GAT	2	6	1103933	1103938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821262
18567	NC_006448	GGTAAT	2	12	1103966	1103977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821262
18568	NC_006448	TTCT	2	8	1104045	1104052	0 %	75 %	0 %	25 %	55821262
18569	NC_006448	AAC	2	6	1104082	1104087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821262
18570	NC_006448	ATG	2	6	1104132	1104137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821262
18571	NC_006448	AAT	2	6	1104201	1104206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821262
18572	NC_006448	TTC	2	6	1104275	1104280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821263
18573	NC_006448	CAAA	2	8	1104330	1104337	75 %	0 %	0 %	25 %	55821263
18574	NC_006448	GA	3	6	1104384	1104389	50 %	0 %	50 %	0 %	55821263
18575	NC_006448	TCT	2	6	1104482	1104487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821263
18576	NC_006448	TTGC	2	8	1104532	1104539	0 %	50 %	25 %	25 %	55821263
18577	NC_006448	ATG	2	6	1104584	1104589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821263
18578	NC_006448	CTT	2	6	1104687	1104692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821263
18579	NC_006448	TTG	2	6	1104718	1104723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821263
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18582	NC_006448	AT	3	6	1104783	1104788	50 %	50 %	0 %	0 %	55821263
18583	NC_006448	GGA	2	6	1104830	1104835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55821263
18584	NC_006448	TTGG	2	8	1104875	1104882	0 %	50 %	50 %	0 %	55821263
18585	NC_006448	CTT	2	6	1104892	1104897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821263
18586	NC_006448	GTC	2	6	1104923	1104928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821263
18587	NC_006448	CT	3	6	1104996	1105001	0 %	50 %	0 %	50 %	55821263
18588	NC_006448	ATAAA	2	10	1105012	1105021	80 %	20 %	0 %	0 %	55821263
18589	NC_006448	ATA	2	6	1105075	1105080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821263
18590	NC_006448	CA	3	6	1105111	1105116	50 %	0 %	0 %	50 %	55821263
18591	NC_006448	AAG	2	6	1105237	1105242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821263
18592	NC_006448	GGT	2	6	1105397	1105402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55821263
18593	NC_006448	ACC	2	6	1105426	1105431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821263
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18595	NC_006448	A	7	7	1105463	1105469	100 %	0 %	0 %	0 %	55821263
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18598	NC_006448	AAATA	2	10	1105699	1105708	80 %	20 %	0 %	0 %	55821263
18599	NC_006448	TAA	2	6	1105755	1105760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821263
18600	NC_006448	AAG	2	6	1105805	1105810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821263
18601	NC_006448	A	6	6	1105817	1105822	100 %	0 %	0 %	0 %	55821263
18602	NC_006448	CCA	2	6	1105856	1105861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821263
18603	NC_006448	AGA	2	6	1105923	1105928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821263
18604	NC_006448	TAA	2	6	1105936	1105941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821263
18605	NC_006448	TAG	2	6	1105955	1105960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821263
18606	NC_006448	TAG	2	6	1105978	1105983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821263
18607	NC_006448	AATCA	2	10	1106035	1106044	60 %	20 %	0 %	20 %	55821263
18608	NC_006448	CAG	2	6	1106187	1106192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821263
18609	NC_006448	AGGT	2	8	1106281	1106288	25 %	25 %	50 %	0 %	55821263
18610	NC_006448	TTA	2	6	1106510	1106515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821263
18611	NC_006448	TA	3	6	1106545	1106550	50 %	50 %	0 %	0 %	55821263
18612	NC_006448	AAT	2	6	1106559	1106564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821263
18613	NC_006448	TCGT	2	8	1106700	1106707	0 %	50 %	25 %	25 %	55821263
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18616	NC_006448	TC	3	6	1106791	1106796	0 %	50 %	0 %	50 %	55821263
18617	NC_006448	CCA	2	6	1106813	1106818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821264
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18619	NC_006448	TTG	2	6	1106877	1106882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821264
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18857	NC_006448	TCA	2	6	1119238	1119243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821273
18858	NC_006448	ATA	2	6	1119253	1119258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821273
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18974	NC_006448	GGGCT	2	10	1126170	1126179	0 %	20 %	60 %	20 %	55821279
18975	NC_006448	A	6	6	1126211	1126216	100 %	0 %	0 %	0 %	55821279
18976	NC_006448	CA	3	6	1126221	1126226	50 %	0 %	0 %	50 %	55821279
18977	NC_006448	CA	3	6	1126228	1126233	50 %	0 %	0 %	50 %	55821279
18978	NC_006448	AT	3	6	1126243	1126248	50 %	50 %	0 %	0 %	55821279
18979	NC_006448	ATTG	2	8	1126273	1126280	25 %	50 %	25 %	0 %	55821279
18980	NC_006448	GCT	2	6	1126375	1126380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821279
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18984	NC_006448	GATT	2	8	1126951	1126958	25 %	50 %	25 %	0 %	55821280
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