MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 30284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_006448	TTAT	2	8	957306	957313	25 %	75 %	0 %	0 %	55821097
16003	NC_006448	GT	3	6	957330	957335	0 %	50 %	50 %	0 %	55821097
16004	NC_006448	ACA	2	6	957371	957376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821097
16005	NC_006448	T	6	6	957607	957612	0 %	100 %	0 %	0 %	55821097
16006	NC_006448	GTT	2	6	957615	957620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821097
16007	NC_006448	TAT	2	6	957629	957634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821097
16008	NC_006448	TGT	2	6	957635	957640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821097
16009	NC_006448	GTTGA	2	10	957658	957667	20 %	40 %	40 %	0 %	55821097
16010	NC_006448	TTA	2	6	957837	957842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821098
16011	NC_006448	CAT	2	6	957951	957956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821098
16012	NC_006448	GAT	2	6	957976	957981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821098
16013	NC_006448	CTA	2	6	958043	958048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821098
16014	NC_006448	A	6	6	958055	958060	100 %	0 %	0 %	0 %	55821098
16015	NC_006448	CGT	2	6	958061	958066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821098
16016	NC_006448	AAG	2	6	958201	958206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821098
16017	NC_006448	CTG	2	6	958281	958286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821098
16018	NC_006448	ATC	2	6	958367	958372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821098
16019	NC_006448	CGC	2	6	958382	958387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55821098
16020	NC_006448	ACT	2	6	958391	958396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821098
16021	NC_006448	ACT	2	6	958404	958409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821098
16022	NC_006448	ACA	2	6	958435	958440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821098
16023	NC_006448	AAG	2	6	958598	958603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821098
16024	NC_006448	TC	3	6	958667	958672	0 %	50 %	0 %	50 %	55821098
16025	NC_006448	CAC	2	6	958710	958715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821098
16026	NC_006448	GTT	2	6	958721	958726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821098
16027	NC_006448	ACT	2	6	958761	958766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821098
16028	NC_006448	GCTTTT	2	12	958780	958791	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	55821098
16029	NC_006448	AG	3	6	958806	958811	50 %	0 %	50 %	0 %	55821098
16030	NC_006448	ATT	2	6	958860	958865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821098
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16032	NC_006448	AAG	2	6	959018	959023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821098
16033	NC_006448	TCA	2	6	959031	959036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821098
16034	NC_006448	ACAT	2	8	959043	959050	50 %	25 %	0 %	25 %	55821098
16035	NC_006448	A	7	7	959051	959057	100 %	0 %	0 %	0 %	55821098
16036	NC_006448	CTT	2	6	959166	959171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821100
16037	NC_006448	TCA	2	6	959192	959197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821100
16038	NC_006448	GATA	2	8	959268	959275	50 %	25 %	25 %	0 %	55821100
16039	NC_006448	TGG	2	6	959353	959358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55821100
16040	NC_006448	ACG	2	6	959418	959423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821100
16041	NC_006448	TAAG	2	8	959438	959445	50 %	25 %	25 %	0 %	55821100
16042	NC_006448	TAGG	2	8	959463	959470	25 %	25 %	50 %	0 %	55821100
16043	NC_006448	AAG	2	6	959519	959524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821100
16044	NC_006448	CATAT	2	10	959577	959586	40 %	40 %	0 %	20 %	55821100
16045	NC_006448	TCA	2	6	959587	959592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821100
16046	NC_006448	GTGATA	2	12	959593	959604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821100
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16048	NC_006448	TA	3	6	959716	959721	50 %	50 %	0 %	0 %	55821100
16049	NC_006448	TGG	2	6	959746	959751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55821099
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16052	NC_006448	ACA	2	6	960070	960075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821099
16053	NC_006448	TCCTA	2	10	960159	960168	20 %	40 %	0 %	40 %	55821099
16054	NC_006448	ATTTC	2	10	960214	960223	20 %	60 %	0 %	20 %	55821099
16055	NC_006448	TTC	2	6	960245	960250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821099
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16057	NC_006448	TCA	2	6	960390	960395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821099
16058	NC_006448	A	6	6	960443	960448	100 %	0 %	0 %	0 %	55821099
16059	NC_006448	A	6	6	960517	960522	100 %	0 %	0 %	0 %	55821099
16060	NC_006448	CT	3	6	960553	960558	0 %	50 %	0 %	50 %	55821101
16061	NC_006448	ATA	2	6	960615	960620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821101
16062	NC_006448	CAA	2	6	960632	960637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821101
16063	NC_006448	T	6	6	960650	960655	0 %	100 %	0 %	0 %	55821101
16064	NC_006448	T	6	6	960801	960806	0 %	100 %	0 %	0 %	55821101
16065	NC_006448	T	6	6	960833	960838	0 %	100 %	0 %	0 %	55821101
16066	NC_006448	GTTG	2	8	960861	960868	0 %	50 %	50 %	0 %	55821101
16067	NC_006448	CTG	2	6	960874	960879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821101
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16072	NC_006448	CCCA	2	8	961073	961080	25 %	0 %	0 %	75 %	55821101
16073	NC_006448	ATAA	2	8	961314	961321	75 %	25 %	0 %	0 %	55821102
16074	NC_006448	AGTC	2	8	961328	961335	25 %	25 %	25 %	25 %	55821102
16075	NC_006448	TGT	2	6	961356	961361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821102
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16077	NC_006448	ACGCC	2	10	961477	961486	20 %	0 %	20 %	60 %	55821102
16078	NC_006448	A	6	6	961515	961520	100 %	0 %	0 %	0 %	55821102
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16082	NC_006448	AATA	2	8	961604	961611	75 %	25 %	0 %	0 %	55821102
16083	NC_006448	CTAG	2	8	961653	961660	25 %	25 %	25 %	25 %	55821102
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16093	NC_006448	TA	3	6	963157	963162	50 %	50 %	0 %	0 %	55821103
16094	NC_006448	GATT	2	8	963168	963175	25 %	50 %	25 %	0 %	55821103
16095	NC_006448	TC	3	6	963179	963184	0 %	50 %	0 %	50 %	55821103
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16098	NC_006448	TA	3	6	963284	963289	50 %	50 %	0 %	0 %	55821103
16099	NC_006448	GTCT	2	8	963400	963407	0 %	50 %	25 %	25 %	55821103
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16101	NC_006448	TTTC	2	8	963492	963499	0 %	75 %	0 %	25 %	55821103
16102	NC_006448	CAT	2	6	963550	963555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821103
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16106	NC_006448	ATA	2	6	963623	963628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821103
16107	NC_006448	AAG	2	6	963659	963664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821103
16108	NC_006448	ATCT	2	8	963677	963684	25 %	50 %	0 %	25 %	55821103
16109	NC_006448	TATC	2	8	963711	963718	25 %	50 %	0 %	25 %	55821103
16110	NC_006448	AATT	2	8	963728	963735	50 %	50 %	0 %	0 %	55821103
16111	NC_006448	ATA	2	6	963873	963878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821103
16112	NC_006448	CTA	2	6	963891	963896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821103
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16114	NC_006448	TAT	2	6	963935	963940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821104
16115	NC_006448	T	7	7	963999	964005	0 %	100 %	0 %	0 %	55821104
16116	NC_006448	ATT	2	6	964072	964077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821104
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16118	NC_006448	GTA	2	6	964211	964216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821104
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16121	NC_006448	ATT	2	6	964524	964529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821104
16122	NC_006448	AAGCA	2	10	964583	964592	60 %	0 %	20 %	20 %	55821104
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16496	NC_006448	ACCTGT	2	12	980933	980944	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	55821124
16497	NC_006448	ATT	2	6	981050	981055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821124
16498	NC_006448	TGCT	2	8	981191	981198	0 %	50 %	25 %	25 %	55821124
16499	NC_006448	TG	3	6	981243	981248	0 %	50 %	50 %	0 %	55821124
16500	NC_006448	CAC	2	6	981274	981279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821124

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