MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 30284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_006448	GCT	2	6	896794	896799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821032
15002	NC_006448	TGG	2	6	896865	896870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55821032
15003	NC_006448	TGC	2	6	896946	896951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821032
15004	NC_006448	TAT	2	6	896958	896963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821032
15005	NC_006448	A	7	7	896967	896973	100 %	0 %	0 %	0 %	55821032
15006	NC_006448	ATT	2	6	897014	897019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821032
15007	NC_006448	GAA	2	6	897061	897066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821032
15008	NC_006448	GGT	2	6	897147	897152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55821033
15009	NC_006448	T	6	6	897157	897162	0 %	100 %	0 %	0 %	55821033
15010	NC_006448	ACTT	2	8	897215	897222	25 %	50 %	0 %	25 %	55821033
15011	NC_006448	GGA	2	6	897234	897239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55821033
15012	NC_006448	AAG	2	6	897260	897265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821033
15013	NC_006448	AGC	2	6	897299	897304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821033
15014	NC_006448	TCT	2	6	897370	897375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821033
15015	NC_006448	GTTTA	2	10	897389	897398	20 %	60 %	20 %	0 %	55821033
15016	NC_006448	GCT	2	6	897412	897417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821033
15017	NC_006448	GCA	2	6	897475	897480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821033
15018	NC_006448	TGT	3	9	897606	897614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821033
15019	NC_006448	ATT	2	6	897656	897661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821033
15020	NC_006448	AGG	2	6	897813	897818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55821033
15021	NC_006448	GTT	2	6	897868	897873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821033
15022	NC_006448	TGG	2	6	897908	897913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55821033
15023	NC_006448	GATT	2	8	897945	897952	25 %	50 %	25 %	0 %	55821033
15024	NC_006448	AAAC	2	8	898061	898068	75 %	0 %	0 %	25 %	55821033
15025	NC_006448	GAT	2	6	898096	898101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821033
15026	NC_006448	A	6	6	898108	898113	100 %	0 %	0 %	0 %	55821033
15027	NC_006448	TAC	2	6	898139	898144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821033
15028	NC_006448	CGCA	2	8	898209	898216	25 %	0 %	25 %	50 %	55821033
15029	NC_006448	A	6	6	898243	898248	100 %	0 %	0 %	0 %	55821033
15030	NC_006448	AGT	2	6	898296	898301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821033
15031	NC_006448	A	6	6	898449	898454	100 %	0 %	0 %	0 %	55821033
15032	NC_006448	CTA	2	6	898455	898460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821033
15033	NC_006448	ACA	2	6	898592	898597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821034
15034	NC_006448	GGA	2	6	898602	898607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55821034
15035	NC_006448	A	7	7	898616	898622	100 %	0 %	0 %	0 %	55821034
15036	NC_006448	CAG	2	6	898713	898718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821034
15037	NC_006448	TAG	2	6	898743	898748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821034
15038	NC_006448	AGC	2	6	898750	898755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821034
15039	NC_006448	A	7	7	898773	898779	100 %	0 %	0 %	0 %	55821034
15040	NC_006448	AGTTGC	2	12	898924	898935	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	55821034
15041	NC_006448	ACA	2	6	898982	898987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821034
15042	NC_006448	AAC	2	6	898989	898994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821034
15043	NC_006448	TGG	2	6	899038	899043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55821034
15044	NC_006448	AGCT	2	8	899077	899084	25 %	25 %	25 %	25 %	55821034
15045	NC_006448	ATGG	2	8	899117	899124	25 %	25 %	50 %	0 %	55821034
15046	NC_006448	TGA	2	6	899227	899232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821034
15047	NC_006448	AAC	2	6	899355	899360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821034
15048	NC_006448	A	7	7	899405	899411	100 %	0 %	0 %	0 %	55821034
15049	NC_006448	AGA	2	6	899472	899477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821034
15050	NC_006448	GAG	2	6	899480	899485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55821034
15051	NC_006448	TGA	2	6	899507	899512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821035
15052	NC_006448	CTTT	2	8	899645	899652	0 %	75 %	0 %	25 %	55821035
15053	NC_006448	TAA	2	6	899655	899660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821035
15054	NC_006448	TGC	2	6	899796	899801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821035
15055	NC_006448	TAG	2	6	899864	899869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821035
15056	NC_006448	TGT	2	6	899880	899885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821035
15057	NC_006448	TGG	2	6	899937	899942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55821035
15058	NC_006448	ACA	2	6	900013	900018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821035
15059	NC_006448	GTT	2	6	900190	900195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821035
15060	NC_006448	CAG	2	6	900233	900238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821035
15061	NC_006448	AAT	2	6	900298	900303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821035
15062	NC_006448	TGA	2	6	900335	900340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821035
15063	NC_006448	GA	3	6	900379	900384	50 %	0 %	50 %	0 %	55821035
15064	NC_006448	A	6	6	900404	900409	100 %	0 %	0 %	0 %	55821035
15065	NC_006448	ATT	2	6	900452	900457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821036
15066	NC_006448	AGC	2	6	900469	900474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821036
15067	NC_006448	CA	3	6	900507	900512	50 %	0 %	0 %	50 %	55821036
15068	NC_006448	TCA	2	6	900539	900544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821036
15069	NC_006448	GGA	2	6	900560	900565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55821036
15070	NC_006448	ATT	2	6	900589	900594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821036
15071	NC_006448	TTA	2	6	900603	900608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821036
15072	NC_006448	ATT	2	6	900614	900619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821036
15073	NC_006448	A	6	6	900668	900673	100 %	0 %	0 %	0 %	55821036
15074	NC_006448	TCA	2	6	900716	900721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821036
15075	NC_006448	GTG	2	6	900731	900736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55821036
15076	NC_006448	TGT	2	6	900763	900768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821036
15077	NC_006448	CAC	2	6	900872	900877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821036
15078	NC_006448	AGC	3	9	901006	901014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821036
15079	NC_006448	CAG	2	6	901026	901031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821036
15080	NC_006448	CTG	2	6	901179	901184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821036
15081	NC_006448	CAG	3	9	901188	901196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821036
15082	NC_006448	CGT	2	6	901235	901240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821036
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15084	NC_006448	GCTC	2	8	901343	901350	0 %	25 %	25 %	50 %	55821037
15085	NC_006448	CTA	2	6	901373	901378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821037
15086	NC_006448	AAG	2	6	901387	901392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821037
15087	NC_006448	A	7	7	901420	901426	100 %	0 %	0 %	0 %	55821037
15088	NC_006448	TTC	2	6	901474	901479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821037
15089	NC_006448	ATGA	2	8	901494	901501	50 %	25 %	25 %	0 %	55821037
15090	NC_006448	TCTA	2	8	901635	901642	25 %	50 %	0 %	25 %	55821037
15091	NC_006448	TTG	2	6	901705	901710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821037
15092	NC_006448	CT	3	6	901779	901784	0 %	50 %	0 %	50 %	55821037
15093	NC_006448	GGT	2	6	901785	901790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55821037
15094	NC_006448	CAA	3	9	901791	901799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821037
15095	NC_006448	TTC	2	6	901840	901845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821037
15096	NC_006448	CAG	2	6	901858	901863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821037
15097	NC_006448	CTA	2	6	901882	901887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821037
15098	NC_006448	AGA	2	6	901895	901900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821037
15099	NC_006448	AGA	2	6	901919	901924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821037
15100	NC_006448	ATT	2	6	901932	901937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821037
15101	NC_006448	CA	4	8	901943	901950	50 %	0 %	0 %	50 %	55821037
15102	NC_006448	CAA	2	6	901956	901961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821037
15103	NC_006448	ATG	2	6	902017	902022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821037
15104	NC_006448	TGC	2	6	902045	902050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821037
15105	NC_006448	TCAA	2	8	902124	902131	50 %	25 %	0 %	25 %	55821038
15106	NC_006448	A	6	6	902157	902162	100 %	0 %	0 %	0 %	55821038
15107	NC_006448	TAA	2	6	902168	902173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821038
15108	NC_006448	CAA	2	6	902382	902387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821038
15109	NC_006448	TCCCT	2	10	902393	902402	0 %	40 %	0 %	60 %	55821038
15110	NC_006448	TA	3	6	902408	902413	50 %	50 %	0 %	0 %	55821038
15111	NC_006448	AGA	2	6	902480	902485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821038
15112	NC_006448	GAG	2	6	902511	902516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55821038
15113	NC_006448	CAA	3	9	902562	902570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821038
15114	NC_006448	TTC	2	6	902614	902619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821038
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15117	NC_006448	TCA	2	6	902790	902795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821038
15118	NC_006448	CACAA	2	10	902818	902827	60 %	0 %	0 %	40 %	55821038
15119	NC_006448	ATTAC	2	10	902839	902848	40 %	40 %	0 %	20 %	55821038
15120	NC_006448	ATG	2	6	902889	902894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821039
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15122	NC_006448	TGC	2	6	902963	902968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821039
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15238	NC_006448	AAAG	2	8	909546	909553	75 %	0 %	25 %	0 %	55821044
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15245	NC_006448	TCA	2	6	909846	909851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821044
15246	NC_006448	AT	3	6	909863	909868	50 %	50 %	0 %	0 %	55821044
15247	NC_006448	ATG	2	6	909871	909876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821044
15248	NC_006448	TG	3	6	910014	910019	0 %	50 %	50 %	0 %	55821045
15249	NC_006448	GAA	2	6	910062	910067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821045
15250	NC_006448	TGT	2	6	910082	910087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821045
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15252	NC_006448	CTT	3	9	910136	910144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821045
15253	NC_006448	TCT	2	6	910145	910150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821045
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15255	NC_006448	GCT	2	6	910276	910281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821045
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15257	NC_006448	CTT	2	6	910325	910330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821045
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15259	NC_006448	GAT	2	6	910344	910349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821045
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15261	NC_006448	TACCTG	2	12	910469	910480	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	55821045
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15264	NC_006448	ATG	2	6	910642	910647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821045
15265	NC_006448	GCT	2	6	910672	910677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821045
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15272	NC_006448	ATC	2	6	910917	910922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821045
15273	NC_006448	ATC	2	6	910968	910973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821045
15274	NC_006448	CCAA	2	8	911021	911028	50 %	0 %	0 %	50 %	55821045
15275	NC_006448	GTTT	2	8	911046	911053	0 %	75 %	25 %	0 %	55821045
15276	NC_006448	TGT	2	6	911054	911059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821045
15277	NC_006448	TG	3	6	911118	911123	0 %	50 %	50 %	0 %	55821045
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15280	NC_006448	ACGA	2	8	911232	911239	50 %	0 %	25 %	25 %	55821045
15281	NC_006448	TGA	2	6	911255	911260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821045
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15284	NC_006448	TCA	2	6	911377	911382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821045
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15290	NC_006448	AACC	2	8	911805	911812	50 %	0 %	0 %	50 %	55821045
15291	NC_006448	TGAT	2	8	911814	911821	25 %	50 %	25 %	0 %	55821045
15292	NC_006448	TTGT	2	8	911850	911857	0 %	75 %	25 %	0 %	55821045
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15312	NC_006448	TG	3	6	912620	912625	0 %	50 %	50 %	0 %	55821046
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15333	NC_006448	GTA	2	6	913628	913633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821046
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15346	NC_006448	TAAAT	2	10	914323	914332	60 %	40 %	0 %	0 %	55821047
15347	NC_006448	AT	3	6	914348	914353	50 %	50 %	0 %	0 %	55821047
15348	NC_006448	ATC	2	6	914389	914394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821047
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15350	NC_006448	A	6	6	914432	914437	100 %	0 %	0 %	0 %	55821047
15351	NC_006448	CTT	2	6	914445	914450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821047
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15353	NC_006448	CTG	2	6	914505	914510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821047
15354	NC_006448	CAA	2	6	914514	914519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821047
15355	NC_006448	TTTC	2	8	914535	914542	0 %	75 %	0 %	25 %	55821047
15356	NC_006448	GTTT	2	8	914566	914573	0 %	75 %	25 %	0 %	55821047
15357	NC_006448	AAT	2	6	914584	914589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821047
15358	NC_006448	TTC	2	6	914641	914646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821047
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15363	NC_006448	TGC	2	6	914812	914817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821047
15364	NC_006448	CCT	2	6	914935	914940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821047
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15489	NC_006448	CTT	2	6	923008	923013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821056
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15491	NC_006448	TCTA	2	8	923075	923082	25 %	50 %	0 %	25 %	55821056
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15493	NC_006448	TCT	2	6	923103	923108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821056
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