MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 30284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_006448	CAG	2	6	812062	812067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820929
13502	NC_006448	ACA	2	6	812093	812098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820929
13503	NC_006448	CAG	2	6	812137	812142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820929
13504	NC_006448	TAA	2	6	812180	812185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820929
13505	NC_006448	TTGA	2	8	812199	812206	25 %	50 %	25 %	0 %	55820929
13506	NC_006448	GCT	2	6	812322	812327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820929
13507	NC_006448	AAC	2	6	812350	812355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820929
13508	NC_006448	GTG	3	9	812401	812409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820929
13509	NC_006448	CTT	2	6	812535	812540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820929
13510	NC_006448	ATG	2	6	812569	812574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820929
13511	NC_006448	A	6	6	812577	812582	100 %	0 %	0 %	0 %	55820929
13512	NC_006448	GGA	2	6	812675	812680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55820929
13513	NC_006448	TAT	2	6	812773	812778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820929
13514	NC_006448	AGA	2	6	812789	812794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820929
13515	NC_006448	GTC	3	9	812824	812832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820929
13516	NC_006448	TTA	2	6	812881	812886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820929
13517	NC_006448	TCAA	2	8	812893	812900	50 %	25 %	0 %	25 %	55820929
13518	NC_006448	ATG	2	6	812910	812915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820929
13519	NC_006448	ATG	2	6	812946	812951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820929
13520	NC_006448	AAT	2	6	812973	812978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820929
13521	NC_006448	ATG	2	6	813042	813047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820929
13522	NC_006448	TGG	3	9	813098	813106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820929
13523	NC_006448	GAA	2	6	813170	813175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820929
13524	NC_006448	A	6	6	813183	813188	100 %	0 %	0 %	0 %	55820929
13525	NC_006448	TA	3	6	813251	813256	50 %	50 %	0 %	0 %	55820930
13526	NC_006448	A	7	7	813308	813314	100 %	0 %	0 %	0 %	55820930
13527	NC_006448	TAT	2	6	813373	813378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820930
13528	NC_006448	CTT	2	6	813405	813410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820930
13529	NC_006448	ATT	2	6	813433	813438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820930
13530	NC_006448	CTT	2	6	813499	813504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820930
13531	NC_006448	ATTGTT	2	12	813521	813532	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	55820930
13532	NC_006448	ATC	2	6	813551	813556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820930
13533	NC_006448	GTT	2	6	813561	813566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820930
13534	NC_006448	ATC	2	6	813616	813621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820930
13535	NC_006448	TG	3	6	813677	813682	0 %	50 %	50 %	0 %	55820930
13536	NC_006448	T	6	6	813684	813689	0 %	100 %	0 %	0 %	55820930
13537	NC_006448	GGA	2	6	813703	813708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55820930
13538	NC_006448	TTGT	2	8	813731	813738	0 %	75 %	25 %	0 %	55820930
13539	NC_006448	GCAA	2	8	813863	813870	50 %	0 %	25 %	25 %	55820931
13540	NC_006448	ATT	2	6	813873	813878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820931
13541	NC_006448	AAG	2	6	813899	813904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820931
13542	NC_006448	TGA	2	6	814035	814040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820931
13543	NC_006448	AAT	2	6	814084	814089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820931
13544	NC_006448	GAA	2	6	814093	814098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820931
13545	NC_006448	TGAT	2	8	814145	814152	25 %	50 %	25 %	0 %	55820931
13546	NC_006448	TTG	2	6	814180	814185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820931
13547	NC_006448	GTC	2	6	814196	814201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820931
13548	NC_006448	T	6	6	814215	814220	0 %	100 %	0 %	0 %	55820931
13549	NC_006448	AGC	2	6	814227	814232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820931
13550	NC_006448	ATC	2	6	814280	814285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820931
13551	NC_006448	TTG	2	6	814286	814291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820931
13552	NC_006448	CAA	2	6	814303	814308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820931
13553	NC_006448	CTC	2	6	814546	814551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55820932
13554	NC_006448	TCTG	2	8	814642	814649	0 %	50 %	25 %	25 %	55820932
13555	NC_006448	TTG	2	6	814659	814664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820932
13556	NC_006448	AAG	2	6	814698	814703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820932
13557	NC_006448	GGA	2	6	814729	814734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55820932
13558	NC_006448	AAG	2	6	814737	814742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820932
13559	NC_006448	AGA	2	6	814749	814754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820932
13560	NC_006448	ATG	2	6	814842	814847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820932
13561	NC_006448	GAA	2	6	814862	814867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820932
13562	NC_006448	CAT	2	6	814884	814889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820932
13563	NC_006448	ACCT	3	12	814912	814923	25 %	25 %	0 %	50 %	55820932
13564	NC_006448	CAAA	2	8	814945	814952	75 %	0 %	0 %	25 %	55820932
13565	NC_006448	ATG	2	6	814965	814970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820932
13566	NC_006448	GAG	2	6	815027	815032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55820932
13567	NC_006448	TAA	2	6	815056	815061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820932
13568	NC_006448	ATG	2	6	815088	815093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820932
13569	NC_006448	ATC	2	6	815105	815110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820932
13570	NC_006448	TTG	2	6	815118	815123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820932
13571	NC_006448	CTA	2	6	815281	815286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820933
13572	NC_006448	TGG	2	6	815368	815373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820933
13573	NC_006448	TTG	2	6	815419	815424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820933
13574	NC_006448	TGC	2	6	815573	815578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820933
13575	NC_006448	ATT	2	6	815652	815657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820933
13576	NC_006448	TGA	2	6	815686	815691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820933
13577	NC_006448	TGT	2	6	815717	815722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820933
13578	NC_006448	TAA	2	6	815768	815773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820933
13579	NC_006448	TTGG	2	8	815829	815836	0 %	50 %	50 %	0 %	55820933
13580	NC_006448	TTA	2	6	815874	815879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820933
13581	NC_006448	ACT	2	6	815911	815916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820933
13582	NC_006448	TAC	2	6	815925	815930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820933
13583	NC_006448	GAA	3	9	815970	815978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820933
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13585	NC_006448	TTG	2	6	816100	816105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820933
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13587	NC_006448	GAC	2	6	816169	816174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820934
13588	NC_006448	GAA	2	6	816268	816273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820934
13589	NC_006448	CTT	2	6	816286	816291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820934
13590	NC_006448	CTAT	2	8	816464	816471	25 %	50 %	0 %	25 %	55820934
13591	NC_006448	AGG	2	6	816485	816490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55820934
13592	NC_006448	GGTATT	2	12	816502	816513	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	55820934
13593	NC_006448	TGAT	2	8	816527	816534	25 %	50 %	25 %	0 %	55820934
13594	NC_006448	TCTA	2	8	816681	816688	25 %	50 %	0 %	25 %	55820934
13595	NC_006448	GCA	2	6	816691	816696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820934
13596	NC_006448	TAG	2	6	816704	816709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820934
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13599	NC_006448	AAT	2	6	816870	816875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820934
13600	NC_006448	A	6	6	816876	816881	100 %	0 %	0 %	0 %	55820934
13601	NC_006448	GGA	2	6	816917	816922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55820935
13602	NC_006448	TTA	2	6	816927	816932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820935
13603	NC_006448	TGA	3	9	816946	816954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820935
13604	NC_006448	GAC	2	6	817001	817006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820935
13605	NC_006448	TCA	2	6	817034	817039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820935
13606	NC_006448	TTA	2	6	817191	817196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820935
13607	NC_006448	ATG	2	6	817197	817202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820935
13608	NC_006448	TGC	2	6	817261	817266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820935
13609	NC_006448	TAA	2	6	817435	817440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820935
13610	NC_006448	GAT	2	6	817526	817531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820935
13611	NC_006448	GTT	2	6	817628	817633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820935
13612	NC_006448	TGG	2	6	817636	817641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820935
13613	NC_006448	GAA	2	6	817706	817711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820935
13614	NC_006448	TCAAT	2	10	817736	817745	40 %	40 %	0 %	20 %	55820935
13615	NC_006448	AGC	2	6	817780	817785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820935
13616	NC_006448	GCT	2	6	817914	817919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820936
13617	NC_006448	A	7	7	817960	817966	100 %	0 %	0 %	0 %	55820936
13618	NC_006448	A	6	6	817974	817979	100 %	0 %	0 %	0 %	55820936
13619	NC_006448	AGC	2	6	818062	818067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820936
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13621	NC_006448	TCC	2	6	818155	818160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55820936
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