MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 30284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_006448	CAAGGT	2	12	719494	719505	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	55820824
12002	NC_006448	GCT	2	6	719673	719678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820825
12003	NC_006448	TGT	2	6	719714	719719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820825
12004	NC_006448	TA	3	6	719787	719792	50 %	50 %	0 %	0 %	55820825
12005	NC_006448	TTG	2	6	719833	719838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820825
12006	NC_006448	ATT	2	6	719859	719864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820825
12007	NC_006448	ACT	2	6	719946	719951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820825
12008	NC_006448	ACCC	2	8	719961	719968	25 %	0 %	0 %	75 %	55820825
12009	NC_006448	TGA	2	6	719978	719983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820825
12010	NC_006448	TTA	2	6	719987	719992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820825
12011	NC_006448	CAT	2	6	719993	719998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820825
12012	NC_006448	ATA	2	6	720046	720051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820825
12013	NC_006448	CTT	2	6	720054	720059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820825
12014	NC_006448	GAT	2	6	720074	720079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820825
12015	NC_006448	GGA	2	6	720183	720188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55820825
12016	NC_006448	CTTC	2	8	720201	720208	0 %	50 %	0 %	50 %	55820825
12017	NC_006448	CAT	2	6	720283	720288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820825
12018	NC_006448	TGT	2	6	720304	720309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820825
12019	NC_006448	AGA	2	6	720328	720333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820825
12020	NC_006448	CAG	2	6	720466	720471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820825
12021	NC_006448	TGA	2	6	720482	720487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820825
12022	NC_006448	GCTA	2	8	720491	720498	25 %	25 %	25 %	25 %	55820825
12023	NC_006448	TAT	2	6	720548	720553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820825
12024	NC_006448	CAG	2	6	720585	720590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820825
12025	NC_006448	TATCG	2	10	720599	720608	20 %	40 %	20 %	20 %	55820825
12026	NC_006448	AAT	2	6	720636	720641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820825
12027	NC_006448	CTT	2	6	720662	720667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820825
12028	NC_006448	TGA	2	6	720719	720724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820825
12029	NC_006448	CTT	2	6	720732	720737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820825
12030	NC_006448	AGA	2	6	720791	720796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820825
12031	NC_006448	TAA	2	6	720812	720817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820825
12032	NC_006448	CAG	2	6	720835	720840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820825
12033	NC_006448	ATG	2	6	720978	720983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820825
12034	NC_006448	ATG	2	6	720990	720995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820825
12035	NC_006448	CTA	2	6	720997	721002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820825
12036	NC_006448	TAA	2	6	721076	721081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820825
12037	NC_006448	GAT	2	6	721084	721089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820825
12038	NC_006448	CTT	2	6	721093	721098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820826
12039	NC_006448	ATCT	2	8	721145	721152	25 %	50 %	0 %	25 %	55820826
12040	NC_006448	TTA	2	6	721163	721168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820826
12041	NC_006448	GCTTT	2	10	721280	721289	0 %	60 %	20 %	20 %	55820826
12042	NC_006448	ATC	2	6	721307	721312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820826
12043	NC_006448	ATA	2	6	721350	721355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820826
12044	NC_006448	TCT	2	6	721362	721367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820826
12045	NC_006448	TTG	2	6	721383	721388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820826
12046	NC_006448	TTC	2	6	721389	721394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820826
12047	NC_006448	TCC	2	6	721542	721547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55820826
12048	NC_006448	GCT	2	6	721642	721647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820826
12049	NC_006448	AT	3	6	721672	721677	50 %	50 %	0 %	0 %	55820826
12050	NC_006448	GTTT	2	8	721699	721706	0 %	75 %	25 %	0 %	55820826
12051	NC_006448	ACC	2	6	721735	721740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55820826
12052	NC_006448	TCT	2	6	721821	721826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820826
12053	NC_006448	ATC	2	6	722060	722065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820826
12054	NC_006448	ATG	2	6	722069	722074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820826
12055	NC_006448	TTA	2	6	722145	722150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820826
12056	NC_006448	TAA	2	6	722182	722187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820826
12057	NC_006448	A	6	6	722195	722200	100 %	0 %	0 %	0 %	55820826
12058	NC_006448	AAAT	2	8	722224	722231	75 %	25 %	0 %	0 %	55820826
12059	NC_006448	A	6	6	722324	722329	100 %	0 %	0 %	0 %	55820826
12060	NC_006448	ATT	2	6	722377	722382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820827
12061	NC_006448	ATG	2	6	722413	722418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820827
12062	NC_006448	TGA	2	6	722529	722534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820827
12063	NC_006448	TAA	2	6	722547	722552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820827
12064	NC_006448	TTG	2	6	722555	722560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820827
12065	NC_006448	GTA	3	9	722636	722644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820828
12066	NC_006448	TA	3	6	722647	722652	50 %	50 %	0 %	0 %	55820828
12067	NC_006448	ATC	2	6	722769	722774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820828
12068	NC_006448	AGTG	2	8	722798	722805	25 %	25 %	50 %	0 %	55820828
12069	NC_006448	CAA	2	6	722921	722926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820828
12070	NC_006448	A	6	6	722987	722992	100 %	0 %	0 %	0 %	55820828
12071	NC_006448	CAG	2	6	723014	723019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820828
12072	NC_006448	TAA	2	6	723025	723030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820828
12073	NC_006448	TAG	2	6	723040	723045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820828
12074	NC_006448	TGC	2	6	723085	723090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820828
12075	NC_006448	ATTCA	2	10	723188	723197	40 %	40 %	0 %	20 %	55820828
12076	NC_006448	AGC	2	6	723241	723246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820828
12077	NC_006448	AAG	2	6	723269	723274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820828
12078	NC_006448	TTC	2	6	723276	723281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820828
12079	NC_006448	ATG	2	6	723315	723320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820828
12080	NC_006448	CAAAT	2	10	723361	723370	60 %	20 %	0 %	20 %	55820828
12081	NC_006448	TGA	2	6	723382	723387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820828
12082	NC_006448	AAG	2	6	723413	723418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820828
12083	NC_006448	ATG	2	6	723591	723596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820828
12084	NC_006448	AATT	2	8	723896	723903	50 %	50 %	0 %	0 %	55820829
12085	NC_006448	TGT	3	9	723968	723976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820829
12086	NC_006448	AAT	2	6	723977	723982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820829
12087	NC_006448	AGTG	2	8	724018	724025	25 %	25 %	50 %	0 %	55820829
12088	NC_006448	TCT	2	6	724031	724036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820829
12089	NC_006448	AAAG	2	8	724071	724078	75 %	0 %	25 %	0 %	55820829
12090	NC_006448	CAT	2	6	724083	724088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820829
12091	NC_006448	CTC	2	6	724218	724223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55820830
12092	NC_006448	GA	3	6	724276	724281	50 %	0 %	50 %	0 %	55820830
12093	NC_006448	TG	3	6	724339	724344	0 %	50 %	50 %	0 %	55820830
12094	NC_006448	GAA	2	6	724460	724465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820831
12095	NC_006448	ACG	2	6	724477	724482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820831
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12098	NC_006448	CGA	2	6	724574	724579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820831
12099	NC_006448	TCA	2	6	724601	724606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820831
12100	NC_006448	GATT	2	8	724634	724641	25 %	50 %	25 %	0 %	55820831
12101	NC_006448	TAA	2	6	724673	724678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820831
12102	NC_006448	TC	3	6	724795	724800	0 %	50 %	0 %	50 %	55820832
12103	NC_006448	TCT	2	6	724882	724887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820832
12104	NC_006448	CTT	2	6	724920	724925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820832
12105	NC_006448	AAG	2	6	724931	724936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820832
12106	NC_006448	AACC	2	8	725026	725033	50 %	0 %	0 %	50 %	55820833
12107	NC_006448	ATCA	2	8	725049	725056	50 %	25 %	0 %	25 %	55820833
12108	NC_006448	AAT	2	6	725078	725083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820833
12109	NC_006448	TGA	2	6	725102	725107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820833
12110	NC_006448	AATT	2	8	725127	725134	50 %	50 %	0 %	0 %	55820833
12111	NC_006448	AT	3	6	725140	725145	50 %	50 %	0 %	0 %	55820833
12112	NC_006448	AT	3	6	725217	725222	50 %	50 %	0 %	0 %	55820833
12113	NC_006448	ATA	2	6	725251	725256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820833
12114	NC_006448	TTAG	2	8	725460	725467	25 %	50 %	25 %	0 %	55820834
12115	NC_006448	CTG	2	6	725485	725490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820834
12116	NC_006448	AAG	2	6	725510	725515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820834
12117	NC_006448	CCA	2	6	725565	725570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55820834
12118	NC_006448	AAT	2	6	725576	725581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820834
12119	NC_006448	AAC	2	6	725591	725596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820834
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