MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 30284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_006448	TAA	2	6	639014	639019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820746
10502	NC_006448	T	7	7	639054	639060	0 %	100 %	0 %	0 %	55820746
10503	NC_006448	TTA	2	6	639116	639121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820746
10504	NC_006448	TGC	2	6	639135	639140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820746
10505	NC_006448	CGT	2	6	639178	639183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820746
10506	NC_006448	GAA	2	6	639199	639204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820746
10507	NC_006448	TTC	2	6	639215	639220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820746
10508	NC_006448	CAAA	2	8	639247	639254	75 %	0 %	0 %	25 %	55820746
10509	NC_006448	GGCTAA	2	12	639264	639275	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	55820746
10510	NC_006448	CT	3	6	639320	639325	0 %	50 %	0 %	50 %	55820746
10511	NC_006448	GCT	2	6	639388	639393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820746
10512	NC_006448	GCA	2	6	639403	639408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820746
10513	NC_006448	A	6	6	639475	639480	100 %	0 %	0 %	0 %	55820746
10514	NC_006448	A	6	6	639487	639492	100 %	0 %	0 %	0 %	55820746
10515	NC_006448	AGG	2	6	639495	639500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55820746
10516	NC_006448	ATT	2	6	639532	639537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820747
10517	NC_006448	GCA	2	6	639541	639546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820747
10518	NC_006448	GCA	2	6	639556	639561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820747
10519	NC_006448	TGA	2	6	639609	639614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820747
10520	NC_006448	TTCA	2	8	639624	639631	25 %	50 %	0 %	25 %	55820747
10521	NC_006448	AAG	2	6	639632	639637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820747
10522	NC_006448	AGT	2	6	639660	639665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820747
10523	NC_006448	A	6	6	639776	639781	100 %	0 %	0 %	0 %	55820747
10524	NC_006448	AG	3	6	639807	639812	50 %	0 %	50 %	0 %	55820747
10525	NC_006448	TCA	2	6	639821	639826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820747
10526	NC_006448	A	6	6	639830	639835	100 %	0 %	0 %	0 %	55820747
10527	NC_006448	TGA	2	6	639891	639896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820747
10528	NC_006448	GAA	2	6	639925	639930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820747
10529	NC_006448	AGA	2	6	640046	640051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820748
10530	NC_006448	AAGG	2	8	640086	640093	50 %	0 %	50 %	0 %	55820748
10531	NC_006448	TACTAT	2	12	640160	640171	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	55820748
10532	NC_006448	GAC	2	6	640205	640210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820748
10533	NC_006448	A	7	7	640501	640507	100 %	0 %	0 %	0 %	55820749
10534	NC_006448	A	6	6	640589	640594	100 %	0 %	0 %	0 %	55820749
10535	NC_006448	ATG	2	6	640714	640719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820749
10536	NC_006448	GAA	2	6	640750	640755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820749
10537	NC_006448	ATG	2	6	640838	640843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820749
10538	NC_006448	CAGG	2	8	640891	640898	25 %	0 %	50 %	25 %	55820749
10539	NC_006448	TCA	2	6	640946	640951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820749
10540	NC_006448	CAG	2	6	640973	640978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820749
10541	NC_006448	CAC	2	6	641008	641013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55820749
10542	NC_006448	CTT	2	6	641026	641031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820749
10543	NC_006448	ACT	2	6	641036	641041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820749
10544	NC_006448	CTTT	2	8	641088	641095	0 %	75 %	0 %	25 %	55820749
10545	NC_006448	ACT	2	6	641120	641125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820749
10546	NC_006448	AAT	2	6	641164	641169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820749
10547	NC_006448	ATG	2	6	641179	641184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820749
10548	NC_006448	TAAAA	2	10	641420	641429	80 %	20 %	0 %	0 %	55820749
10549	NC_006448	A	6	6	641536	641541	100 %	0 %	0 %	0 %	55820750
10550	NC_006448	CTG	2	6	641561	641566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820750
10551	NC_006448	TGG	2	6	641622	641627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820750
10552	NC_006448	ACGCTC	2	12	641696	641707	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	55820750
10553	NC_006448	TTGA	2	8	641833	641840	25 %	50 %	25 %	0 %	55820750
10554	NC_006448	GTT	2	6	641947	641952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820750
10555	NC_006448	GAA	2	6	641974	641979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820750
10556	NC_006448	GTG	2	6	642101	642106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820750
10557	NC_006448	GTT	2	6	642107	642112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820750
10558	NC_006448	GAA	2	6	642193	642198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820750
10559	NC_006448	GGC	2	6	642333	642338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55820750
10560	NC_006448	GAT	2	6	642385	642390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820750
10561	NC_006448	TTA	2	6	642441	642446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820750
10562	NC_006448	CGT	2	6	642484	642489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820750
10563	NC_006448	TTG	2	6	642509	642514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820750
10564	NC_006448	AGT	2	6	642519	642524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820750
10565	NC_006448	TAA	2	6	642660	642665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820750
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10567	NC_006448	AAG	2	6	642716	642721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820750
10568	NC_006448	AAG	2	6	642752	642757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820750
10569	NC_006448	T	6	6	643199	643204	0 %	100 %	0 %	0 %	55820751
10570	NC_006448	ACCG	2	8	643282	643289	25 %	0 %	25 %	50 %	55820751
10571	NC_006448	ACC	2	6	643339	643344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55820751
10572	NC_006448	A	7	7	643435	643441	100 %	0 %	0 %	0 %	55820751
10573	NC_006448	AAG	2	6	643450	643455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820751
10574	NC_006448	AAG	2	6	643475	643480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820751
10575	NC_006448	CCT	2	6	643499	643504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55820751
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10578	NC_006448	GCA	2	6	643658	643663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820751
10579	NC_006448	ATA	2	6	643664	643669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820751
10580	NC_006448	GAA	2	6	643686	643691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820751
10581	NC_006448	TAT	2	6	643975	643980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820752
10582	NC_006448	GATA	2	8	643990	643997	50 %	25 %	25 %	0 %	55820752
10583	NC_006448	TAA	2	6	644002	644007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820752
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10587	NC_006448	T	11	11	644464	644474	0 %	100 %	0 %	0 %	55820754
10588	NC_006448	TTGAGA	2	12	644495	644506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820754
10589	NC_006448	AGGT	2	8	644537	644544	25 %	25 %	50 %	0 %	55820754
10590	NC_006448	T	6	6	644581	644586	0 %	100 %	0 %	0 %	55820754
10591	NC_006448	GTA	2	6	644593	644598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820754
10592	NC_006448	GGCAA	2	10	644621	644630	40 %	0 %	40 %	20 %	55820754
10593	NC_006448	ATG	2	6	644705	644710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820754
10594	NC_006448	GTA	2	6	644715	644720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820754
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10596	NC_006448	GGA	2	6	644772	644777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55820754
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10598	NC_006448	AG	3	6	644841	644846	50 %	0 %	50 %	0 %	55820754
10599	NC_006448	AG	3	6	644856	644861	50 %	0 %	50 %	0 %	55820754
10600	NC_006448	AGA	2	6	644958	644963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820754
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10602	NC_006448	CAC	2	6	644995	645000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55820754
10603	NC_006448	TCA	2	6	645065	645070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820754
10604	NC_006448	CAA	2	6	645144	645149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820754
10605	NC_006448	TGG	2	6	645170	645175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820754
10606	NC_006448	CAG	2	6	645186	645191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820754
10607	NC_006448	AG	3	6	645204	645209	50 %	0 %	50 %	0 %	55820754
10608	NC_006448	T	7	7	645324	645330	0 %	100 %	0 %	0 %	55820754
10609	NC_006448	AGT	2	6	645353	645358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820754
10610	NC_006448	GT	3	6	645492	645497	0 %	50 %	50 %	0 %	55820754
10611	NC_006448	TTG	2	6	645577	645582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820754
10612	NC_006448	AGA	2	6	645601	645606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820754
10613	NC_006448	ACA	2	6	645653	645658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820754
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10619	NC_006448	CTAT	2	8	646240	646247	25 %	50 %	0 %	25 %	55820755
10620	NC_006448	GCA	2	6	646284	646289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820755
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10744	NC_006448	TAC	2	6	652434	652439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820760
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