MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 30284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_006448	AAC	2	6	422704	422709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820528
7002	NC_006448	CAG	2	6	422710	422715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820528
7003	NC_006448	AG	3	6	422723	422728	50 %	0 %	50 %	0 %	55820528
7004	NC_006448	CAG	2	6	422740	422745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820528
7005	NC_006448	AAC	2	6	422746	422751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820528
7006	NC_006448	CAG	2	6	422752	422757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820528
7007	NC_006448	CAG	2	6	422794	422799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820528
7008	NC_006448	AAC	2	6	422800	422805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820528
7009	NC_006448	AGC	2	6	422807	422812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820528
7010	NC_006448	TAA	2	6	422897	422902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820528
7011	NC_006448	AGC	2	6	422939	422944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820528
7012	NC_006448	ATG	2	6	422998	423003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820528
7013	NC_006448	GTG	2	6	423004	423009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820528
7014	NC_006448	CATCAG	2	12	423034	423045	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	55820528
7015	NC_006448	ATTCA	2	10	423052	423061	40 %	40 %	0 %	20 %	55820528
7016	NC_006448	CAT	2	6	423127	423132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820528
7017	NC_006448	TGG	2	6	423140	423145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820528
7018	NC_006448	TATAT	2	10	423151	423160	40 %	60 %	0 %	0 %	55820528
7019	NC_006448	GTC	2	6	423415	423420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820529
7020	NC_006448	AGC	2	6	423433	423438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820529
7021	NC_006448	CAG	2	6	423495	423500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820529
7022	NC_006448	CAA	2	6	423564	423569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820529
7023	NC_006448	AGC	2	6	423628	423633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820529
7024	NC_006448	GGT	2	6	423656	423661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820529
7025	NC_006448	ACA	2	6	423805	423810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820529
7026	NC_006448	ATA	2	6	423828	423833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820529
7027	NC_006448	GAT	2	6	424047	424052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820530
7028	NC_006448	GAA	2	6	424098	424103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820530
7029	NC_006448	GAA	2	6	424161	424166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820530
7030	NC_006448	TGT	2	6	424244	424249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820530
7031	NC_006448	GAA	2	6	424305	424310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820530
7032	NC_006448	ACA	2	6	424324	424329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820530
7033	NC_006448	ATG	2	6	424393	424398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820530
7034	NC_006448	CGG	2	6	424507	424512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55820530
7035	NC_006448	ATG	2	6	424588	424593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820530
7036	NC_006448	GAC	2	6	424622	424627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820530
7037	NC_006448	ATT	2	6	424647	424652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820530
7038	NC_006448	TGA	2	6	424712	424717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820530
7039	NC_006448	CAT	2	6	424733	424738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820530
7040	NC_006448	GAT	2	6	424781	424786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820530
7041	NC_006448	CGT	2	6	424821	424826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820530
7042	NC_006448	GTT	2	6	424923	424928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820530
7043	NC_006448	GAA	2	6	425007	425012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820530
7044	NC_006448	AAGAT	2	10	426269	426278	60 %	20 %	20 %	0 %	55820531
7045	NC_006448	TGA	2	6	426291	426296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820531
7046	NC_006448	TTTACT	2	12	426299	426310	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	55820531
7047	NC_006448	ATA	2	6	426329	426334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820531
7048	NC_006448	ATACT	2	10	426342	426351	40 %	40 %	0 %	20 %	55820531
7049	NC_006448	ATC	2	6	426369	426374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820531
7050	NC_006448	CAGA	2	8	426439	426446	50 %	0 %	25 %	25 %	55820531
7051	NC_006448	CTA	2	6	426473	426478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820531
7052	NC_006448	GAA	2	6	426492	426497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820531
7053	NC_006448	ATT	2	6	426509	426514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820531
7054	NC_006448	TGC	2	6	426531	426536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820531
7055	NC_006448	GCT	2	6	426544	426549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820531
7056	NC_006448	GAA	2	6	426550	426555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820531
7057	NC_006448	GTGA	2	8	427161	427168	25 %	25 %	50 %	0 %	55820532
7058	NC_006448	A	6	6	427206	427211	100 %	0 %	0 %	0 %	55820532
7059	NC_006448	TAA	2	6	427264	427269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820532
7060	NC_006448	CTTT	2	8	427275	427282	0 %	75 %	0 %	25 %	55820532
7061	NC_006448	TGG	2	6	427283	427288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820532
7062	NC_006448	AGA	2	6	427325	427330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820532
7063	NC_006448	A	7	7	427356	427362	100 %	0 %	0 %	0 %	55820532
7064	NC_006448	GAT	2	6	427363	427368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820532
7065	NC_006448	AAGT	2	8	427393	427400	50 %	25 %	25 %	0 %	55820533
7066	NC_006448	GTTAAA	2	12	427418	427429	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	55820533
7067	NC_006448	CGA	2	6	427627	427632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820533
7068	NC_006448	A	6	6	427637	427642	100 %	0 %	0 %	0 %	55820533
7069	NC_006448	A	6	6	427730	427735	100 %	0 %	0 %	0 %	55820533
7070	NC_006448	AGA	2	6	427747	427752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820533
7071	NC_006448	CTA	2	6	427997	428002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820534
7072	NC_006448	ATG	2	6	428076	428081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820534
7073	NC_006448	ATG	2	6	428086	428091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820534
7074	NC_006448	TCT	2	6	428092	428097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820534
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7077	NC_006448	GAA	2	6	428145	428150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820534
7078	NC_006448	CAC	2	6	428161	428166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55820534
7079	NC_006448	ATTC	2	8	428237	428244	25 %	50 %	0 %	25 %	55820534
7080	NC_006448	GTT	2	6	428271	428276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820534
7081	NC_006448	TGGT	2	8	428333	428340	0 %	50 %	50 %	0 %	55820534
7082	NC_006448	GAA	2	6	428355	428360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820534
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7084	NC_006448	TGA	2	6	428396	428401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820534
7085	NC_006448	TGG	2	6	428417	428422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820534
7086	NC_006448	GAA	2	6	428460	428465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820534
7087	NC_006448	ATGA	2	8	428553	428560	50 %	25 %	25 %	0 %	55820534
7088	NC_006448	TG	3	6	428666	428671	0 %	50 %	50 %	0 %	55820534
7089	NC_006448	ATC	2	6	428769	428774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820534
7090	NC_006448	ATC	2	6	428823	428828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820534
7091	NC_006448	TTG	2	6	428863	428868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820534
7092	NC_006448	TGGT	2	8	428873	428880	0 %	50 %	50 %	0 %	55820534
7093	NC_006448	GTCTAA	2	12	428903	428914	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	55820534
7094	NC_006448	TAC	2	6	428973	428978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820534
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7096	NC_006448	CTT	2	6	429075	429080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820534
7097	NC_006448	ATG	2	6	429154	429159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820534
7098	NC_006448	CAAA	2	8	429203	429210	75 %	0 %	0 %	25 %	55820534
7099	NC_006448	TG	3	6	429245	429250	0 %	50 %	50 %	0 %	55820534
7100	NC_006448	ATC	2	6	429255	429260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820534
7101	NC_006448	AGA	2	6	429311	429316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820534
7102	NC_006448	GTA	2	6	429372	429377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820534
7103	NC_006448	ATG	2	6	429399	429404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820534
7104	NC_006448	CAT	2	6	429419	429424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820534
7105	NC_006448	GAA	2	6	429543	429548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820534
7106	NC_006448	AGA	2	6	429608	429613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820534
7107	NC_006448	CAAAT	2	10	429639	429648	60 %	20 %	0 %	20 %	55820534
7108	NC_006448	AAG	2	6	429691	429696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820534
7109	NC_006448	GAT	2	6	429857	429862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820534
7110	NC_006448	GAA	2	6	429863	429868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820534
7111	NC_006448	TTCT	2	8	429889	429896	0 %	75 %	0 %	25 %	55820534
7112	NC_006448	GTG	2	6	430249	430254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820535
7113	NC_006448	GTA	2	6	430257	430262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820535
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7116	NC_006448	TTGTTT	2	12	430306	430317	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	55820535
7117	NC_006448	TTG	2	6	430319	430324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820535
7118	NC_006448	CAGG	2	8	430488	430495	25 %	0 %	50 %	25 %	55820535
7119	NC_006448	T	6	6	430588	430593	0 %	100 %	0 %	0 %	55820535
7120	NC_006448	ATAA	2	8	430714	430721	75 %	25 %	0 %	0 %	55820535
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7490	NC_006448	TGC	2	6	455710	455715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820559
7491	NC_006448	CAG	2	6	455757	455762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820559
7492	NC_006448	TAT	2	6	455798	455803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820559
7493	NC_006448	TCCT	2	8	455814	455821	0 %	50 %	0 %	50 %	55820559
7494	NC_006448	ATC	2	6	455907	455912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820559
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7496	NC_006448	ATG	2	6	455922	455927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820559
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7498	NC_006448	TTGA	2	8	456000	456007	25 %	50 %	25 %	0 %	55820559
7499	NC_006448	TGA	2	6	456306	456311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161611294
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