MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS10394 chromosome

Total Repeats: 34266

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33002	NC_006086	CTTG	2	8	1832492	1832499	0 %	50 %	25 %	25 %	50915169
33003	NC_006086	A	6	6	1832531	1832536	100 %	0 %	0 %	0 %	50915169
33004	NC_006086	GGA	2	6	1832818	1832823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50915170
33005	NC_006086	AGA	2	6	1832824	1832829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50915170
33006	NC_006086	ATTAA	2	10	1832939	1832948	60 %	40 %	0 %	0 %	50915170
33007	NC_006086	CAA	2	6	1832985	1832990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50915170
33008	NC_006086	AGAA	2	8	1833009	1833016	75 %	0 %	25 %	0 %	50915170
33009	NC_006086	AG	3	6	1833053	1833058	50 %	0 %	50 %	0 %	50915170
33010	NC_006086	AAC	2	6	1833109	1833114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50915170
33011	NC_006086	GGA	2	6	1833143	1833148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50915170
33012	NC_006086	CGA	2	6	1833214	1833219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50915170
33013	NC_006086	ACC	2	6	1833236	1833241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50915170
33014	NC_006086	CGTGA	2	10	1833281	1833290	20 %	20 %	40 %	20 %	50915170
33015	NC_006086	CATC	2	8	1833331	1833338	25 %	25 %	0 %	50 %	50915170
33016	NC_006086	AT	3	6	1833350	1833355	50 %	50 %	0 %	0 %	50915170
33017	NC_006086	AAC	2	6	1833944	1833949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50915171
33018	NC_006086	TCA	2	6	1834046	1834051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50915171
33019	NC_006086	GCT	2	6	1834084	1834089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50915171
33020	NC_006086	CT	3	6	1834167	1834172	0 %	50 %	0 %	50 %	50915171
33021	NC_006086	CCG	2	6	1834230	1834235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50915171
33022	NC_006086	GAAG	2	8	1834254	1834261	50 %	0 %	50 %	0 %	50915171
33023	NC_006086	AT	3	6	1834388	1834393	50 %	50 %	0 %	0 %	50915171
33024	NC_006086	AAT	2	6	1834396	1834401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50915171
33025	NC_006086	TCA	2	6	1834451	1834456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50915171
33026	NC_006086	AG	3	6	1834466	1834471	50 %	0 %	50 %	0 %	50915171
33027	NC_006086	CAT	2	6	1834507	1834512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50915171
33028	NC_006086	CCA	2	6	1834515	1834520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50915171
33029	NC_006086	AAATC	2	10	1834539	1834548	60 %	20 %	0 %	20 %	50915171
33030	NC_006086	CAG	2	6	1834551	1834556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50915171
33031	NC_006086	CAG	2	6	1834605	1834610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50915171
33032	NC_006086	CAA	2	6	1834770	1834775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50915171
33033	NC_006086	GAC	2	6	1834782	1834787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50915171
33034	NC_006086	CTT	2	6	1834788	1834793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50915171
33035	NC_006086	CTG	2	6	1835022	1835027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50915171
33036	NC_006086	T	6	6	1835045	1835050	0 %	100 %	0 %	0 %	50915171
33037	NC_006086	A	6	6	1835066	1835071	100 %	0 %	0 %	0 %	50915171
33038	NC_006086	CTAAG	2	10	1835082	1835091	40 %	20 %	20 %	20 %	50915171
33039	NC_006086	ATA	2	6	1835113	1835118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50915171
33040	NC_006086	T	6	6	1835125	1835130	0 %	100 %	0 %	0 %	50915171
33041	NC_006086	TTA	2	6	1835150	1835155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50915171
33042	NC_006086	GCTT	2	8	1835161	1835168	0 %	50 %	25 %	25 %	50915171
33043	NC_006086	TCA	2	6	1835243	1835248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50915171
33044	NC_006086	AAT	2	6	1835260	1835265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50915171
33045	NC_006086	AAT	2	6	1835560	1835565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50915171
33046	NC_006086	CTT	2	6	1835586	1835591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50915171
33047	NC_006086	T	6	6	1835683	1835688	0 %	100 %	0 %	0 %	50915171
33048	NC_006086	AAT	2	6	1835748	1835753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50915171
33049	NC_006086	TTC	2	6	1835899	1835904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50915171
33050	NC_006086	AGC	2	6	1835912	1835917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50915171
33051	NC_006086	TTC	3	9	1835947	1835955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50915171
33052	NC_006086	CTT	2	6	1835979	1835984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50915171
33053	NC_006086	CAC	2	6	1836190	1836195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50915171
33054	NC_006086	GCTT	2	8	1836203	1836210	0 %	50 %	25 %	25 %	50915171
33055	NC_006086	TTG	2	6	1836274	1836279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50915171
33056	NC_006086	ATG	2	6	1836286	1836291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50915171
33057	NC_006086	TTG	2	6	1836329	1836334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50915171
33058	NC_006086	TGC	2	6	1836364	1836369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50915171
33059	NC_006086	CAT	3	9	1836378	1836386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50915171
33060	NC_006086	AAT	2	6	1836389	1836394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50915171
33061	NC_006086	A	6	6	1836422	1836427	100 %	0 %	0 %	0 %	50915171
33062	NC_006086	T	6	6	1836442	1836447	0 %	100 %	0 %	0 %	50915171
33063	NC_006086	CAAG	2	8	1836894	1836901	50 %	0 %	25 %	25 %	50915172
33064	NC_006086	CAT	2	6	1836942	1836947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50915172
33065	NC_006086	TCAA	2	8	1836950	1836957	50 %	25 %	0 %	25 %	50915172
33066	NC_006086	TC	3	6	1837106	1837111	0 %	50 %	0 %	50 %	50915172
33067	NC_006086	CTT	2	6	1837173	1837178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50915172
33068	NC_006086	TCT	2	6	1837199	1837204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50915172
33069	NC_006086	TG	3	6	1837205	1837210	0 %	50 %	50 %	0 %	50915172
33070	NC_006086	CTG	2	6	1837243	1837248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50915172
33071	NC_006086	GTT	2	6	1837599	1837604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50915173
33072	NC_006086	CTTG	2	8	1837634	1837641	0 %	50 %	25 %	25 %	50915173
33073	NC_006086	A	6	6	1837649	1837654	100 %	0 %	0 %	0 %	50915173
33074	NC_006086	TTTAG	2	10	1837686	1837695	20 %	60 %	20 %	0 %	50915173
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33078	NC_006086	TTG	2	6	1838065	1838070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50915173
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33080	NC_006086	CTG	2	6	1838095	1838100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50915173
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33082	NC_006086	GCTGAA	2	12	1838151	1838162	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	50915173
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33084	NC_006086	AAG	2	6	1838224	1838229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50915173
33085	NC_006086	TGA	2	6	1838255	1838260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50915173
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33087	NC_006086	CTT	2	6	1838382	1838387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50915173
33088	NC_006086	GTT	2	6	1838409	1838414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50915173
33089	NC_006086	A	6	6	1838454	1838459	100 %	0 %	0 %	0 %	50915173
33090	NC_006086	TGT	2	6	1838546	1838551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50915173
33091	NC_006086	GCT	2	6	1838565	1838570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50915173
33092	NC_006086	ATGAC	2	10	1838623	1838632	40 %	20 %	20 %	20 %	50915173
33093	NC_006086	AC	3	6	1838631	1838636	50 %	0 %	0 %	50 %	50915173
33094	NC_006086	TTC	2	6	1838698	1838703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50915173
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33096	NC_006086	ATGCTC	2	12	1838914	1838925	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	50915173
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33098	NC_006086	TAT	2	6	1839074	1839079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50915173
33099	NC_006086	GAC	2	6	1839144	1839149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50915173
33100	NC_006086	CT	3	6	1839175	1839180	0 %	50 %	0 %	50 %	50915173
33101	NC_006086	AAG	2	6	1839205	1839210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50915173
33102	NC_006086	CGCTT	2	10	1839211	1839220	0 %	40 %	20 %	40 %	50915173
33103	NC_006086	AAATG	2	10	1839239	1839248	60 %	20 %	20 %	0 %	50915173
33104	NC_006086	ATGCC	2	10	1839334	1839343	20 %	20 %	20 %	40 %	50915174
33105	NC_006086	GAT	2	6	1839405	1839410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50915174
33106	NC_006086	ATCA	2	8	1839498	1839505	50 %	25 %	0 %	25 %	50915174
33107	NC_006086	TAT	2	6	1839608	1839613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50915174
33108	NC_006086	AAAATA	2	12	1839641	1839652	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	50915174
33109	NC_006086	TTTA	2	8	1839673	1839680	25 %	75 %	0 %	0 %	50915175
33110	NC_006086	TTC	2	6	1839688	1839693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50915175
33111	NC_006086	TAA	2	6	1839715	1839720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50915175
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33113	NC_006086	AAGT	2	8	1839861	1839868	50 %	25 %	25 %	0 %	50915175
33114	NC_006086	GATT	2	8	1839877	1839884	25 %	50 %	25 %	0 %	50915175
33115	NC_006086	TAA	3	9	1839925	1839933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50915175
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33117	NC_006086	CCA	2	6	1840066	1840071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50915175
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33238	NC_006086	T	6	6	1847107	1847112	0 %	100 %	0 %	0 %	50915182
33239	NC_006086	GTT	2	6	1847184	1847189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50915182
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33475	NC_006086	ACC	2	6	1860170	1860175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50915199
33476	NC_006086	CTT	2	6	1860181	1860186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50915199
33477	NC_006086	ATT	2	6	1860290	1860295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50915199
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33481	NC_006086	T	7	7	1860417	1860423	0 %	100 %	0 %	0 %	50915199
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