MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS10394 chromosome

Total Repeats: 34266

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30011	NC_006086	TATCTT	2	12	1661431	1661442	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	50915006
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30014	NC_006086	TAAA	2	8	1661525	1661532	75 %	25 %	0 %	0 %	50915007
30015	NC_006086	ACT	2	6	1661548	1661553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50915007
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30017	NC_006086	T	7	7	1661641	1661647	0 %	100 %	0 %	0 %	50915007
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30020	NC_006086	TAG	2	6	1661717	1661722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50915007
30021	NC_006086	TGAT	2	8	1661766	1661773	25 %	50 %	25 %	0 %	50915007
30022	NC_006086	TCG	2	6	1661807	1661812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50915007
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30032	NC_006086	ATA	2	6	1662289	1662294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50915007
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30118	NC_006086	T	6	6	1667654	1667659	0 %	100 %	0 %	0 %	50915014
30119	NC_006086	CAA	2	6	1667767	1667772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50915014
30120	NC_006086	AATT	2	8	1667798	1667805	50 %	50 %	0 %	0 %	50915014
30121	NC_006086	ATG	2	6	1667844	1667849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50915014
30122	NC_006086	TCT	2	6	1667850	1667855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50915014
30123	NC_006086	CTT	2	6	1667893	1667898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50915014
30124	NC_006086	TGA	3	9	1667956	1667964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50915014
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30126	NC_006086	AAGA	2	8	1668088	1668095	75 %	0 %	25 %	0 %	50915014
30127	NC_006086	TCAA	2	8	1668159	1668166	50 %	25 %	0 %	25 %	50915014
30128	NC_006086	CCT	2	6	1668219	1668224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50915014
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30132	NC_006086	GCTT	2	8	1668363	1668370	0 %	50 %	25 %	25 %	50915014
30133	NC_006086	CAA	3	9	1668388	1668396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50915014
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30136	NC_006086	AT	3	6	1668438	1668443	50 %	50 %	0 %	0 %	50915014
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30139	NC_006086	GATA	2	8	1668886	1668893	50 %	25 %	25 %	0 %	50915015
30140	NC_006086	CAA	2	6	1668920	1668925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50915015
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30148	NC_006086	T	7	7	1669436	1669442	0 %	100 %	0 %	0 %	50915015
30149	NC_006086	TCA	2	6	1669444	1669449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50915015
30150	NC_006086	TCT	2	6	1669467	1669472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50915016
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30185	NC_006086	TCA	3	9	1671237	1671245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50915018
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30209	NC_006086	AG	3	6	1672162	1672167	50 %	0 %	50 %	0 %	50915018
30210	NC_006086	GTA	2	6	1672220	1672225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50915018
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30212	NC_006086	TGA	2	6	1672321	1672326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50915018
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30216	NC_006086	GCT	2	6	1672351	1672356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50915018
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30220	NC_006086	AAATC	2	10	1672558	1672567	60 %	20 %	0 %	20 %	50915018
30221	NC_006086	TCC	2	6	1672614	1672619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50915018
30222	NC_006086	TGC	2	6	1672625	1672630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50915018
30223	NC_006086	CGC	2	6	1672737	1672742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50915018
30224	NC_006086	A	7	7	1672763	1672769	100 %	0 %	0 %	0 %	50915018
30225	NC_006086	CTG	2	6	1672857	1672862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50915018
30226	NC_006086	CAT	2	6	1672910	1672915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50915018
30227	NC_006086	GTC	2	6	1672961	1672966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50915018
30228	NC_006086	AGGT	2	8	1672969	1672976	25 %	25 %	50 %	0 %	50915018
30229	NC_006086	CAA	2	6	1672988	1672993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50915018
30230	NC_006086	TGA	2	6	1673182	1673187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50915018
30231	NC_006086	TCC	2	6	1673210	1673215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50915018
30232	NC_006086	TTTTCA	2	12	1673241	1673252	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	50915018
30233	NC_006086	TGT	2	6	1673423	1673428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50915019
30234	NC_006086	TAAA	2	8	1673429	1673436	75 %	25 %	0 %	0 %	50915019
30235	NC_006086	ATC	2	6	1673437	1673442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50915019
30236	NC_006086	A	7	7	1673450	1673456	100 %	0 %	0 %	0 %	50915019
30237	NC_006086	AACA	2	8	1673491	1673498	75 %	0 %	0 %	25 %	50915019
30238	NC_006086	ACG	2	6	1673558	1673563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50915019
30239	NC_006086	ACG	2	6	1673609	1673614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50915020
30240	NC_006086	CAA	2	6	1673624	1673629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50915020
30241	NC_006086	ACG	2	6	1673633	1673638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50915020
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30243	NC_006086	T	6	6	1673681	1673686	0 %	100 %	0 %	0 %	50915020
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30356	NC_006086	TAA	2	6	1680623	1680628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50915026
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30471	NC_006086	TTG	2	6	1687687	1687692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50915033
30472	NC_006086	ATG	2	6	1687750	1687755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50915033
30473	NC_006086	TTG	2	6	1687764	1687769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50915033
30474	NC_006086	ACGCA	2	10	1687857	1687866	40 %	0 %	20 %	40 %	50915033
30475	NC_006086	TTTG	2	8	1687888	1687895	0 %	75 %	25 %	0 %	50915033
30476	NC_006086	ATCA	2	8	1688007	1688014	50 %	25 %	0 %	25 %	50915033
30477	NC_006086	ATC	2	6	1688037	1688042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50915033
30478	NC_006086	GCT	2	6	1688075	1688080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50915033
30479	NC_006086	TCT	2	6	1688173	1688178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50915033
30480	NC_006086	CAT	2	6	1688219	1688224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50915033
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30482	NC_006086	CCA	2	6	1688341	1688346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50915033
30483	NC_006086	TAA	2	6	1688348	1688353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50915033
30484	NC_006086	GCT	2	6	1688356	1688361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50915033
30485	NC_006086	ATC	2	6	1688403	1688408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50915033
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30487	NC_006086	T	6	6	1688466	1688471	0 %	100 %	0 %	0 %	50915033
30488	NC_006086	TCA	2	6	1688476	1688481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50915033
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30490	NC_006086	CAT	2	6	1688570	1688575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50915033
30491	NC_006086	CAT	2	6	1688583	1688588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50915033
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30494	NC_006086	ACG	2	6	1688652	1688657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50915033
30495	NC_006086	GAC	2	6	1688681	1688686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50915033
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30497	NC_006086	TAG	2	6	1688734	1688739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50915033
30498	NC_006086	AGT	2	6	1688906	1688911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50915033
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30500	NC_006086	ATA	2	6	1689151	1689156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50915033

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