MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS10394 chromosome

Total Repeats: 34266

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
27501	NC_006086	CAT	2	6	1523260	1523265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50914871
27502	NC_006086	T	6	6	1523419	1523424	0 %	100 %	0 %	0 %	50914871
27503	NC_006086	CAA	2	6	1523494	1523499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50914871
27504	NC_006086	T	6	6	1523655	1523660	0 %	100 %	0 %	0 %	50914872
27505	NC_006086	ATC	2	6	1523706	1523711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50914872
27506	NC_006086	CTG	2	6	1523724	1523729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50914872
27507	NC_006086	TGC	2	6	1523748	1523753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50914872
27508	NC_006086	TGT	2	6	1523754	1523759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50914872
27509	NC_006086	CACGTT	2	12	1523774	1523785	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	50914872
27510	NC_006086	TCA	2	6	1523807	1523812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50914872
27511	NC_006086	CCA	2	6	1523885	1523890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50914872
27512	NC_006086	ATC	2	6	1523980	1523985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50914872
27513	NC_006086	AAT	2	6	1524009	1524014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50914872
27514	NC_006086	CTT	2	6	1524017	1524022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50914872
27515	NC_006086	ATAG	2	8	1524051	1524058	50 %	25 %	25 %	0 %	50914872
27516	NC_006086	TTTGA	2	10	1524084	1524093	20 %	60 %	20 %	0 %	50914872
27517	NC_006086	ACG	2	6	1524288	1524293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50914872
27518	NC_006086	CATCA	2	10	1524324	1524333	40 %	20 %	0 %	40 %	50914872
27519	NC_006086	GAC	2	6	1524404	1524409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50914872
27520	NC_006086	TAA	2	6	1524425	1524430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50914872
27521	NC_006086	TCT	2	6	1524436	1524441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50914872
27522	NC_006086	TCA	2	6	1524497	1524502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50914872
27523	NC_006086	ATC	2	6	1524504	1524509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50914872
27524	NC_006086	GAC	2	6	1524551	1524556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50914872
27525	NC_006086	ACG	2	6	1524585	1524590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50914872
27526	NC_006086	CCA	2	6	1524625	1524630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50914872
27527	NC_006086	CAC	2	6	1524701	1524706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50914872
27528	NC_006086	CTT	2	6	1524734	1524739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50914872
27529	NC_006086	AAATC	2	10	1524800	1524809	60 %	20 %	0 %	20 %	50914872
27530	NC_006086	TTGG	2	8	1524952	1524959	0 %	50 %	50 %	0 %	50914872
27531	NC_006086	AAT	2	6	1524966	1524971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50914872
27532	NC_006086	TTC	3	9	1524996	1525004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50914872
27533	NC_006086	T	6	6	1525038	1525043	0 %	100 %	0 %	0 %	50914872
27534	NC_006086	TTC	2	6	1525092	1525097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50914872
27535	NC_006086	CTT	2	6	1525112	1525117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50914872
27536	NC_006086	CAA	2	6	1525187	1525192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50914872
27537	NC_006086	AAC	2	6	1525234	1525239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50914872
27538	NC_006086	ATA	2	6	1525240	1525245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50914872
27539	NC_006086	ATTG	2	8	1525439	1525446	25 %	50 %	25 %	0 %	50914872
27540	NC_006086	TCA	2	6	1525516	1525521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50914872
27541	NC_006086	AAC	2	6	1525566	1525571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50914872
27542	NC_006086	TGT	2	6	1525574	1525579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50914872
27543	NC_006086	GTTG	2	8	1525608	1525615	0 %	50 %	50 %	0 %	50914872
27544	NC_006086	CAG	2	6	1525652	1525657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50914872
27545	NC_006086	AGC	2	6	1525665	1525670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50914872
27546	NC_006086	TAA	2	6	1525757	1525762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50914872
27547	NC_006086	TGG	2	6	1525805	1525810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50914872
27548	NC_006086	GAA	2	6	1525862	1525867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50914872
27549	NC_006086	TCC	2	6	1525872	1525877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50914872
27550	NC_006086	AC	3	6	1525910	1525915	50 %	0 %	0 %	50 %	50914872
27551	NC_006086	TGC	2	6	1525920	1525925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50914872
27552	NC_006086	AAC	2	6	1525932	1525937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50914872
27553	NC_006086	GTT	2	6	1525958	1525963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50914872
27554	NC_006086	T	7	7	1526064	1526070	0 %	100 %	0 %	0 %	50914872
27555	NC_006086	T	6	6	1526075	1526080	0 %	100 %	0 %	0 %	50914872
27556	NC_006086	ATT	2	6	1526351	1526356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50914873
27557	NC_006086	C	6	6	1526462	1526467	0 %	0 %	0 %	100 %	50914873
27558	NC_006086	GAT	2	6	1526664	1526669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50914873
27559	NC_006086	TCA	2	6	1526721	1526726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50914873
27560	NC_006086	AGG	2	6	1526747	1526752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50914873
27561	NC_006086	AAC	2	6	1526831	1526836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50914873
27562	NC_006086	TCA	2	6	1526949	1526954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50914873
27563	NC_006086	CTA	2	6	1527102	1527107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50914873
27564	NC_006086	GA	3	6	1527130	1527135	50 %	0 %	50 %	0 %	50914873
27565	NC_006086	AAC	2	6	1527192	1527197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50914873
27566	NC_006086	GCT	2	6	1527214	1527219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50914873
27567	NC_006086	ATCA	2	8	1527232	1527239	50 %	25 %	0 %	25 %	50914873
27568	NC_006086	T	6	6	1527332	1527337	0 %	100 %	0 %	0 %	50914873
27569	NC_006086	GTT	2	6	1527599	1527604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50914874
27570	NC_006086	TGGC	2	8	1527630	1527637	0 %	25 %	50 %	25 %	50914874
27571	NC_006086	CTG	2	6	1527760	1527765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50914874
27572	NC_006086	GCAT	2	8	1527797	1527804	25 %	25 %	25 %	25 %	50914874
27573	NC_006086	A	6	6	1527824	1527829	100 %	0 %	0 %	0 %	50914874
27574	NC_006086	ATC	2	6	1527862	1527867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50914874
27575	NC_006086	TCT	2	6	1527899	1527904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50914874
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27577	NC_006086	CAT	2	6	1528011	1528016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50914874
27578	NC_006086	CTT	2	6	1528080	1528085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50914874
27579	NC_006086	TGT	2	6	1528227	1528232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50914874
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27581	NC_006086	AAT	2	6	1528295	1528300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50914874
27582	NC_006086	ATA	2	6	1528310	1528315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50914874
27583	NC_006086	TTGC	2	8	1528624	1528631	0 %	50 %	25 %	25 %	50914875
27584	NC_006086	GCT	2	6	1528635	1528640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50914875
27585	NC_006086	CTG	2	6	1528732	1528737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50914875
27586	NC_006086	ATC	2	6	1528796	1528801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50914875
27587	NC_006086	AGCA	2	8	1528934	1528941	50 %	0 %	25 %	25 %	50914875
27588	NC_006086	TGT	2	6	1528970	1528975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50914875
27589	NC_006086	AGC	2	6	1528997	1529002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50914875
27590	NC_006086	GAC	2	6	1529076	1529081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50914875
27591	NC_006086	ATCAAT	2	12	1529084	1529095	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	50914875
27592	NC_006086	CG	3	6	1529163	1529168	0 %	0 %	50 %	50 %	50914875
27593	NC_006086	TCT	2	6	1529175	1529180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50914875
27594	NC_006086	GTG	2	6	1529184	1529189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50914875
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27598	NC_006086	T	7	7	1529557	1529563	0 %	100 %	0 %	0 %	50914876
27599	NC_006086	AGC	2	6	1529564	1529569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50914876
27600	NC_006086	AGCATT	2	12	1529602	1529613	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	50914876
27601	NC_006086	AAG	2	6	1529646	1529651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50914876
27602	NC_006086	TCA	2	6	1529681	1529686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50914876
27603	NC_006086	TTG	2	6	1529713	1529718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50914876
27604	NC_006086	AGT	2	6	1529734	1529739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50914876
27605	NC_006086	ACT	2	6	1529801	1529806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50914876
27606	NC_006086	TATC	2	8	1529816	1529823	25 %	50 %	0 %	25 %	50914876
27607	NC_006086	ATT	2	6	1529866	1529871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50914876
27608	NC_006086	CT	4	8	1529895	1529902	0 %	50 %	0 %	50 %	50914876
27609	NC_006086	TCA	3	9	1529942	1529950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50914876
27610	NC_006086	CAA	2	6	1529968	1529973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50914876
27611	NC_006086	GAA	2	6	1530067	1530072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50914876
27612	NC_006086	TTA	2	6	1530084	1530089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50914876
27613	NC_006086	TCT	2	6	1530095	1530100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50914876
27614	NC_006086	ATA	2	6	1530113	1530118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50914876
27615	NC_006086	TCC	2	6	1530211	1530216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50914876
27616	NC_006086	CAT	2	6	1530247	1530252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50914876
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27977	NC_006086	CCA	2	6	1551375	1551380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50914896
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27979	NC_006086	GT	3	6	1551458	1551463	0 %	50 %	50 %	0 %	50914896
27980	NC_006086	GGT	2	6	1551563	1551568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50914896
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27982	NC_006086	GATT	2	8	1551630	1551637	25 %	50 %	25 %	0 %	50914896
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27991	NC_006086	TAACT	2	10	1552408	1552417	40 %	40 %	0 %	20 %	50914897
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28000	NC_006086	TCA	2	6	1552679	1552684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50914897

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