MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS10394 chromosome

Total Repeats: 34266

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23001	NC_006086	AATC	2	8	1268334	1268341	50 %	25 %	0 %	25 %	50914624
23002	NC_006086	CTT	2	6	1268371	1268376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50914625
23003	NC_006086	TCA	2	6	1268479	1268484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50914625
23004	NC_006086	T	6	6	1268532	1268537	0 %	100 %	0 %	0 %	50914625
23005	NC_006086	TTG	2	6	1268543	1268548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50914625
23006	NC_006086	CAT	2	6	1268551	1268556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50914625
23007	NC_006086	T	6	6	1268758	1268763	0 %	100 %	0 %	0 %	50914626
23008	NC_006086	GCT	2	6	1268778	1268783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50914626
23009	NC_006086	CTT	2	6	1268812	1268817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50914626
23010	NC_006086	GCT	2	6	1268849	1268854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50914626
23011	NC_006086	AGGTAA	2	12	1268856	1268867	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	50914626
23012	NC_006086	CGCT	2	8	1268994	1269001	0 %	25 %	25 %	50 %	50914626
23013	NC_006086	T	6	6	1269157	1269162	0 %	100 %	0 %	0 %	50914626
23014	NC_006086	T	6	6	1269165	1269170	0 %	100 %	0 %	0 %	50914626
23015	NC_006086	CTT	2	6	1269175	1269180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50914626
23016	NC_006086	T	6	6	1269179	1269184	0 %	100 %	0 %	0 %	50914626
23017	NC_006086	GT	3	6	1269226	1269231	0 %	50 %	50 %	0 %	50914626
23018	NC_006086	ATA	2	6	1269237	1269242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50914626
23019	NC_006086	T	7	7	1269474	1269480	0 %	100 %	0 %	0 %	50914627
23020	NC_006086	T	6	6	1269512	1269517	0 %	100 %	0 %	0 %	50914627
23021	NC_006086	TAC	2	6	1269524	1269529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50914627
23022	NC_006086	TTGT	2	8	1269578	1269585	0 %	75 %	25 %	0 %	50914627
23023	NC_006086	AACT	2	8	1269590	1269597	50 %	25 %	0 %	25 %	50914627
23024	NC_006086	A	6	6	1269647	1269652	100 %	0 %	0 %	0 %	50914627
23025	NC_006086	TCT	2	6	1269653	1269658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50914627
23026	NC_006086	TAA	2	6	1269677	1269682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50914627
23027	NC_006086	GTTACT	2	12	1269722	1269733	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	50914627
23028	NC_006086	TAT	2	6	1269749	1269754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50914627
23029	NC_006086	ATT	2	6	1269842	1269847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50914627
23030	NC_006086	CTA	2	6	1269865	1269870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50914627
23031	NC_006086	TTA	2	6	1269874	1269879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50914627
23032	NC_006086	T	6	6	1269915	1269920	0 %	100 %	0 %	0 %	50914627
23033	NC_006086	TAGCT	2	10	1269930	1269939	20 %	40 %	20 %	20 %	50914627
23034	NC_006086	CGT	2	6	1269956	1269961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50914627
23035	NC_006086	TGCT	2	8	1270002	1270009	0 %	50 %	25 %	25 %	50914627
23036	NC_006086	ATT	2	6	1270059	1270064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50914627
23037	NC_006086	T	6	6	1270204	1270209	0 %	100 %	0 %	0 %	50914628
23038	NC_006086	CAC	2	6	1270270	1270275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50914628
23039	NC_006086	CAT	2	6	1270302	1270307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50914628
23040	NC_006086	CTA	2	6	1270337	1270342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50914628
23041	NC_006086	GCTT	2	8	1270433	1270440	0 %	50 %	25 %	25 %	50914628
23042	NC_006086	ACG	2	6	1270486	1270491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50914628
23043	NC_006086	T	6	6	1270497	1270502	0 %	100 %	0 %	0 %	50914628
23044	NC_006086	ATT	2	6	1270582	1270587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50914628
23045	NC_006086	TGCA	2	8	1270591	1270598	25 %	25 %	25 %	25 %	50914628
23046	NC_006086	ATC	2	6	1270708	1270713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50914628
23047	NC_006086	TGA	2	6	1270716	1270721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50914628
23048	NC_006086	GAA	2	6	1270725	1270730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50914628
23049	NC_006086	ACA	2	6	1270781	1270786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50914628
23050	NC_006086	GTC	2	6	1270934	1270939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50914628
23051	NC_006086	AAAT	2	8	1271008	1271015	75 %	25 %	0 %	0 %	50914628
23052	NC_006086	T	7	7	1271142	1271148	0 %	100 %	0 %	0 %	50914628
23053	NC_006086	ATT	2	6	1271256	1271261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50914629
23054	NC_006086	TCTT	2	8	1271264	1271271	0 %	75 %	0 %	25 %	50914629
23055	NC_006086	TGA	2	6	1271274	1271279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50914629
23056	NC_006086	CTTTT	2	10	1271392	1271401	0 %	80 %	0 %	20 %	50914629
23057	NC_006086	GCT	2	6	1271436	1271441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50914629
23058	NC_006086	CGA	2	6	1271462	1271467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50914629
23059	NC_006086	TTTGAT	2	12	1271468	1271479	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	50914629
23060	NC_006086	TTTC	2	8	1271488	1271495	0 %	75 %	0 %	25 %	50914629
23061	NC_006086	TTGG	2	8	1271499	1271506	0 %	50 %	50 %	0 %	50914629
23062	NC_006086	CTC	2	6	1271509	1271514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50914629
23063	NC_006086	TCT	2	6	1271594	1271599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50914629
23064	NC_006086	CAA	2	6	1271685	1271690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50914629
23065	NC_006086	TCT	2	6	1271762	1271767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50914629
23066	NC_006086	TAT	2	6	1271838	1271843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50914629
23067	NC_006086	T	6	6	1271869	1271874	0 %	100 %	0 %	0 %	50914629
23068	NC_006086	CTTAAG	2	12	1272182	1272193	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	50914630
23069	NC_006086	TCA	2	6	1272288	1272293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50914630
23070	NC_006086	CGG	2	6	1272423	1272428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50914631
23071	NC_006086	TGA	2	6	1272455	1272460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50914631
23072	NC_006086	ATAA	2	8	1272478	1272485	75 %	25 %	0 %	0 %	50914631
23073	NC_006086	TCA	2	6	1272503	1272508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50914631
23074	NC_006086	TAT	2	6	1272514	1272519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50914631
23075	NC_006086	TTG	2	6	1272612	1272617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50914631
23076	NC_006086	TCAAAA	2	12	1272659	1272670	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	50914631
23077	NC_006086	CA	4	8	1272681	1272688	50 %	0 %	0 %	50 %	50914631
23078	NC_006086	AGCT	2	8	1272723	1272730	25 %	25 %	25 %	25 %	50914631
23079	NC_006086	TTA	2	6	1272774	1272779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50914631
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23081	NC_006086	GCC	2	6	1272818	1272823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50914631
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23085	NC_006086	CAG	2	6	1272951	1272956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50914631
23086	NC_006086	GAA	2	6	1272966	1272971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50914631
23087	NC_006086	TTC	3	9	1272985	1272993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50914631
23088	NC_006086	T	7	7	1273127	1273133	0 %	100 %	0 %	0 %	50914632
23089	NC_006086	GTAAT	2	10	1273167	1273176	40 %	40 %	20 %	0 %	50914632
23090	NC_006086	GCT	2	6	1273186	1273191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50914632
23091	NC_006086	CAT	2	6	1273208	1273213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50914632
23092	NC_006086	CTT	2	6	1273271	1273276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50914632
23093	NC_006086	CCT	2	6	1273309	1273314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50914632
23094	NC_006086	TTATT	2	10	1273712	1273721	20 %	80 %	0 %	0 %	50914633
23095	NC_006086	CTT	2	6	1273806	1273811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50914633
23096	NC_006086	T	6	6	1273840	1273845	0 %	100 %	0 %	0 %	50914633
23097	NC_006086	ATT	2	6	1273864	1273869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50914633
23098	NC_006086	A	6	6	1273876	1273881	100 %	0 %	0 %	0 %	50914633
23099	NC_006086	GCT	2	6	1273901	1273906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50914633
23100	NC_006086	ACT	2	6	1273910	1273915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50914633
23101	NC_006086	CAC	2	6	1273926	1273931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50914633
23102	NC_006086	TCT	2	6	1274000	1274005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50914633
23103	NC_006086	AT	4	8	1274020	1274027	50 %	50 %	0 %	0 %	50914633
23104	NC_006086	TCC	2	6	1274056	1274061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50914633
23105	NC_006086	TCT	2	6	1274090	1274095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50914633
23106	NC_006086	ATA	2	6	1274159	1274164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50914633
23107	NC_006086	T	6	6	1274176	1274181	0 %	100 %	0 %	0 %	50914633
23108	NC_006086	TTA	2	6	1274186	1274191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50914633
23109	NC_006086	CTG	2	6	1274256	1274261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50914633
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23115	NC_006086	TCT	2	6	1274600	1274605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50914633
23116	NC_006086	ATA	2	6	1274662	1274667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50914633
23117	NC_006086	A	6	6	1274677	1274682	100 %	0 %	0 %	0 %	50914633
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23119	NC_006086	ACC	2	6	1274724	1274729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50914633
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23353	NC_006086	TCCCA	2	10	1288480	1288489	20 %	20 %	0 %	60 %	50914647
23354	NC_006086	AGGA	2	8	1288490	1288497	50 %	0 %	50 %	0 %	50914647
23355	NC_006086	A	6	6	1288500	1288505	100 %	0 %	0 %	0 %	50914647
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