MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS10394 chromosome

Total Repeats: 34266

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_006086	GAT	2	6	1048167	1048172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50914399
19003	NC_006086	TCG	2	6	1048187	1048192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50914399
19004	NC_006086	TGC	2	6	1048221	1048226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50914399
19005	NC_006086	TTC	3	9	1048230	1048238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50914399
19006	NC_006086	CTGA	2	8	1048379	1048386	25 %	25 %	25 %	25 %	50914399
19007	NC_006086	TAA	2	6	1048391	1048396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50914399
19008	NC_006086	AGC	2	6	1048398	1048403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50914399
19009	NC_006086	AAT	2	6	1048500	1048505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50914399
19010	NC_006086	AAT	2	6	1048543	1048548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50914399
19011	NC_006086	ACCA	2	8	1048691	1048698	50 %	0 %	0 %	50 %	50914399
19012	NC_006086	TAA	2	6	1048706	1048711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50914399
19013	NC_006086	CAT	2	6	1048886	1048891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50914399
19014	NC_006086	CCT	2	6	1048933	1048938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50914400
19015	NC_006086	T	7	7	1048988	1048994	0 %	100 %	0 %	0 %	50914400
19016	NC_006086	CT	3	6	1049010	1049015	0 %	50 %	0 %	50 %	50914400
19017	NC_006086	CAAT	2	8	1049070	1049077	50 %	25 %	0 %	25 %	50914400
19018	NC_006086	GAT	2	6	1049143	1049148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50914400
19019	NC_006086	A	6	6	1049196	1049201	100 %	0 %	0 %	0 %	50914400
19020	NC_006086	CTT	2	6	1049203	1049208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50914400
19021	NC_006086	T	6	6	1049333	1049338	0 %	100 %	0 %	0 %	50914400
19022	NC_006086	AAAT	2	8	1049361	1049368	75 %	25 %	0 %	0 %	50914400
19023	NC_006086	ATA	2	6	1049432	1049437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50914400
19024	NC_006086	A	6	6	1049448	1049453	100 %	0 %	0 %	0 %	50914400
19025	NC_006086	TCA	2	6	1049484	1049489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50914400
19026	NC_006086	TAA	2	6	1049504	1049509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50914400
19027	NC_006086	CTG	2	6	1049539	1049544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50914400
19028	NC_006086	AC	3	6	1049548	1049553	50 %	0 %	0 %	50 %	50914400
19029	NC_006086	AGGA	2	8	1049571	1049578	50 %	0 %	50 %	0 %	50914400
19030	NC_006086	TTTGG	2	10	1049579	1049588	0 %	60 %	40 %	0 %	50914400
19031	NC_006086	AGC	2	6	1049606	1049611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50914400
19032	NC_006086	TG	3	6	1049730	1049735	0 %	50 %	50 %	0 %	50914400
19033	NC_006086	CTG	2	6	1049752	1049757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50914400
19034	NC_006086	ATA	2	6	1049786	1049791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50914400
19035	NC_006086	CAAT	2	8	1049974	1049981	50 %	25 %	0 %	25 %	50914400
19036	NC_006086	AAT	2	6	1049996	1050001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50914400
19037	NC_006086	AATC	2	8	1050065	1050072	50 %	25 %	0 %	25 %	50914400
19038	NC_006086	TTTC	2	8	1050112	1050119	0 %	75 %	0 %	25 %	50914400
19039	NC_006086	T	6	6	1050163	1050168	0 %	100 %	0 %	0 %	50914400
19040	NC_006086	TGA	2	6	1050183	1050188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50914400
19041	NC_006086	CTTT	2	8	1050348	1050355	0 %	75 %	0 %	25 %	50914400
19042	NC_006086	ACT	2	6	1050575	1050580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50914401
19043	NC_006086	AAGC	2	8	1050652	1050659	50 %	0 %	25 %	25 %	50914401
19044	NC_006086	CTT	2	6	1050677	1050682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50914401
19045	NC_006086	CT	3	6	1050696	1050701	0 %	50 %	0 %	50 %	50914401
19046	NC_006086	ATT	2	6	1050745	1050750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50914401
19047	NC_006086	T	6	6	1050749	1050754	0 %	100 %	0 %	0 %	50914401
19048	NC_006086	CCCT	2	8	1050824	1050831	0 %	25 %	0 %	75 %	50914401
19049	NC_006086	T	6	6	1050839	1050844	0 %	100 %	0 %	0 %	50914401
19050	NC_006086	A	6	6	1050880	1050885	100 %	0 %	0 %	0 %	50914401
19051	NC_006086	CTT	2	6	1051028	1051033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50914401
19052	NC_006086	ATGC	2	8	1051120	1051127	25 %	25 %	25 %	25 %	50914401
19053	NC_006086	GCCA	2	8	1051141	1051148	25 %	0 %	25 %	50 %	50914401
19054	NC_006086	TTA	2	6	1051181	1051186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50914401
19055	NC_006086	A	7	7	1051235	1051241	100 %	0 %	0 %	0 %	50914401
19056	NC_006086	A	6	6	1051246	1051251	100 %	0 %	0 %	0 %	50914401
19057	NC_006086	TTC	2	6	1051334	1051339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50914402
19058	NC_006086	CTG	2	6	1051363	1051368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50914402
19059	NC_006086	ATCCTT	2	12	1051385	1051396	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	50914402
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19061	NC_006086	ATG	2	6	1051604	1051609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161761309
19062	NC_006086	CAT	3	9	1051680	1051688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161761309
19063	NC_006086	CTT	2	6	1051737	1051742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161761309
19064	NC_006086	CCA	2	6	1051746	1051751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161761309
19065	NC_006086	TCA	2	6	1051760	1051765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161761309
19066	NC_006086	TAA	2	6	1051768	1051773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161761309
19067	NC_006086	CTG	2	6	1051800	1051805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161761309
19068	NC_006086	TCA	2	6	1051871	1051876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161761309
19069	NC_006086	T	6	6	1051900	1051905	0 %	100 %	0 %	0 %	161761309
19070	NC_006086	TTA	2	6	1051949	1051954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161761309
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19072	NC_006086	TTA	2	6	1052009	1052014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161761309
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19075	NC_006086	AACC	2	8	1052121	1052128	50 %	0 %	0 %	50 %	161761309
19076	NC_006086	TCAA	2	8	1052144	1052151	50 %	25 %	0 %	25 %	161761309
19077	NC_006086	TGA	2	6	1052257	1052262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161761309
19078	NC_006086	TCTAAC	2	12	1052336	1052347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161761309
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19084	NC_006086	TCT	2	6	1052546	1052551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161761309
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19087	NC_006086	TCC	2	6	1052689	1052694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161761309
19088	NC_006086	ACG	2	6	1052725	1052730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161761309
19089	NC_006086	TACCA	2	10	1052737	1052746	40 %	20 %	0 %	40 %	161761309
19090	NC_006086	CCA	2	6	1052750	1052755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161761309
19091	NC_006086	CATACT	2	12	1052794	1052805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161761309
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19094	NC_006086	T	7	7	1052954	1052960	0 %	100 %	0 %	0 %	50914404
19095	NC_006086	T	7	7	1053222	1053228	0 %	100 %	0 %	0 %	50914405
19096	NC_006086	A	6	6	1053303	1053308	100 %	0 %	0 %	0 %	50914405
19097	NC_006086	AT	3	6	1053336	1053341	50 %	50 %	0 %	0 %	50914405
19098	NC_006086	TTGA	2	8	1053349	1053356	25 %	50 %	25 %	0 %	50914405
19099	NC_006086	AAT	2	6	1053391	1053396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50914405
19100	NC_006086	TAT	2	6	1053397	1053402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50914405
19101	NC_006086	ATA	2	6	1053424	1053429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50914405
19102	NC_006086	AAAC	2	8	1053460	1053467	75 %	0 %	0 %	25 %	50914405
19103	NC_006086	GGT	2	6	1053509	1053514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50914405
19104	NC_006086	A	6	6	1053672	1053677	100 %	0 %	0 %	0 %	50914405
19105	NC_006086	GA	3	6	1053681	1053686	50 %	0 %	50 %	0 %	50914405
19106	NC_006086	GA	3	6	1053696	1053701	50 %	0 %	50 %	0 %	50914405
19107	NC_006086	GA	3	6	1053865	1053870	50 %	0 %	50 %	0 %	50914406
19108	NC_006086	ATG	2	6	1053874	1053879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50914406
19109	NC_006086	TCG	2	6	1053902	1053907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50914406
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19111	NC_006086	TCA	2	6	1053940	1053945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50914406
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19113	NC_006086	TCG	2	6	1053998	1054003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50914406
19114	NC_006086	CTT	2	6	1054018	1054023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50914406
19115	NC_006086	AAG	2	6	1054041	1054046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50914406
19116	NC_006086	GAAA	2	8	1054131	1054138	75 %	0 %	25 %	0 %	50914406
19117	NC_006086	ATT	2	6	1054179	1054184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50914406
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19119	NC_006086	T	6	6	1054322	1054327	0 %	100 %	0 %	0 %	50914406
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