MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSX

Total Repeats: 1895

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_005232	CCA	2	6	84597	84602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505915
1502	NC_005232	ACT	2	6	84647	84652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505915
1503	NC_005232	ACG	2	6	84684	84689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505915
1504	NC_005232	CGG	2	6	84782	84787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505915
1505	NC_005232	CCA	2	6	84797	84802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505915
1506	NC_005232	ACC	2	6	84848	84853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505915
1507	NC_005232	CTG	2	6	84910	84915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505915
1508	NC_005232	CTG	2	6	84956	84961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505915
1509	NC_005232	CTA	2	6	84997	85002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505915
1510	NC_005232	ATTT	2	8	85040	85047	25 %	75 %	0 %	0 %	38505915
1511	NC_005232	CCG	2	6	85146	85151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505915
1512	NC_005232	GGA	2	6	85191	85196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505915
1513	NC_005232	CTG	2	6	85291	85296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505915
1514	NC_005232	ATCG	2	8	85303	85310	25 %	25 %	25 %	25 %	38505915
1515	NC_005232	CCA	2	6	85364	85369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505915
1516	NC_005232	TGCT	2	8	85390	85397	0 %	50 %	25 %	25 %	38505915
1517	NC_005232	TCA	2	6	85424	85429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505915
1518	NC_005232	TGC	2	6	85478	85483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505915
1519	NC_005232	GGGGT	2	10	85485	85494	0 %	20 %	80 %	0 %	38505915
1520	NC_005232	ATT	2	6	85548	85553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505915
1521	NC_005232	GGC	2	6	85611	85616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505915
1522	NC_005232	GAG	2	6	85756	85761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505915
1523	NC_005232	ACC	2	6	85766	85771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505915
1524	NC_005232	CAG	2	6	85834	85839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505915
1525	NC_005232	CAC	2	6	86016	86021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505915
1526	NC_005232	GTC	2	6	86054	86059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505915
1527	NC_005232	AACTG	2	10	86130	86139	40 %	20 %	20 %	20 %	38505915
1528	NC_005232	GGA	2	6	86184	86189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505915
1529	NC_005232	GTG	2	6	86248	86253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505915
1530	NC_005232	AAC	2	6	86515	86520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505916
1531	NC_005232	TTG	2	6	86526	86531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505916
1532	NC_005232	TCC	2	6	86556	86561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505916
1533	NC_005232	CAC	2	6	86564	86569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505916
1534	NC_005232	A	6	6	86691	86696	100 %	0 %	0 %	0 %	38505916
1535	NC_005232	AGAA	2	8	86808	86815	75 %	0 %	25 %	0 %	38505916
1536	NC_005232	CTC	2	6	87047	87052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505917
1537	NC_005232	GGTG	2	8	87106	87113	0 %	25 %	75 %	0 %	38505917
1538	NC_005232	T	7	7	87136	87142	0 %	100 %	0 %	0 %	38505917
1539	NC_005232	GCT	2	6	87171	87176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505917
1540	NC_005232	TTTTG	2	10	87182	87191	0 %	80 %	20 %	0 %	38505917
1541	NC_005232	T	7	7	87249	87255	0 %	100 %	0 %	0 %	38505917
1542	NC_005232	ACGA	2	8	87333	87340	50 %	0 %	25 %	25 %	38505918
1543	NC_005232	GGC	2	6	87354	87359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505918
1544	NC_005232	GCG	2	6	87370	87375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505918
1545	NC_005232	CTG	2	6	87443	87448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505918
1546	NC_005232	TCA	2	6	87473	87478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505918
1547	NC_005232	TTC	2	6	87606	87611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505918
1548	NC_005232	ACG	2	6	87637	87642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505918
1549	NC_005232	TCA	2	6	87682	87687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505918
1550	NC_005232	ATCA	2	8	87750	87757	50 %	25 %	0 %	25 %	38505918
1551	NC_005232	TTG	2	6	87761	87766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505918
1552	NC_005232	GGC	2	6	87786	87791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505918
1553	NC_005232	TACC	2	8	87815	87822	25 %	25 %	0 %	50 %	38505918
1554	NC_005232	A	7	7	88140	88146	100 %	0 %	0 %	0 %	38505919
1555	NC_005232	GTTG	2	8	88154	88161	0 %	50 %	50 %	0 %	38505919
1556	NC_005232	TTA	2	6	88214	88219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505919
1557	NC_005232	AGG	2	6	88221	88226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505919
1558	NC_005232	TCA	2	6	88252	88257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505919
1559	NC_005232	TAA	2	6	88276	88281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505919
1560	NC_005232	ACC	2	6	88329	88334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505919
1561	NC_005232	TTGT	2	8	88398	88405	0 %	75 %	25 %	0 %	38505919
1562	NC_005232	CAA	2	6	88409	88414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505919
1563	NC_005232	GGC	2	6	88474	88479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304569843
1564	NC_005232	AGC	2	6	88569	88574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304569843
1565	NC_005232	CAG	2	6	88580	88585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304569843
1566	NC_005232	ATT	2	6	88586	88591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304569843
1567	NC_005232	GAG	2	6	88619	88624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304569843
1568	NC_005232	AAC	2	6	88632	88637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304569843
1569	NC_005232	AGT	2	6	88652	88657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304569843
1570	NC_005232	T	6	6	88667	88672	0 %	100 %	0 %	0 %	304569843
1571	NC_005232	TAAA	2	8	88737	88744	75 %	25 %	0 %	0 %	304569843
1572	NC_005232	GCT	2	6	88751	88756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304569843
1573	NC_005232	GGA	2	6	88759	88764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304569843
1574	NC_005232	AATT	2	8	88854	88861	50 %	50 %	0 %	0 %	304569843
1575	NC_005232	TTTCA	2	10	88862	88871	20 %	60 %	0 %	20 %	304569843
1576	NC_005232	TTG	2	6	88883	88888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304569843
1577	NC_005232	TGC	2	6	88921	88926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304569843
1578	NC_005232	CAG	2	6	88959	88964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304569843
1579	NC_005232	G	8	8	88972	88979	0 %	0 %	100 %	0 %	304569843
1580	NC_005232	TG	3	6	89060	89065	0 %	50 %	50 %	0 %	304569843
1581	NC_005232	G	7	7	89071	89077	0 %	0 %	100 %	0 %	304569843
1582	NC_005232	GAG	2	6	89105	89110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304569843
1583	NC_005232	ATA	2	6	89151	89156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304569843
1584	NC_005232	TGG	2	6	89158	89163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304569843
1585	NC_005232	TGT	2	6	89190	89195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304569843
1586	NC_005232	AGA	2	6	89490	89495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304569843
1587	NC_005232	TTGA	2	8	89507	89514	25 %	50 %	25 %	0 %	304569843
1588	NC_005232	ATT	2	6	89534	89539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304569843
1589	NC_005232	CCG	2	6	89546	89551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	304569843
1590	NC_005232	ATGCGG	2	12	89649	89660	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	304569843
1591	NC_005232	ATT	2	6	89685	89690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304569843
1592	NC_005232	A	6	6	89709	89714	100 %	0 %	0 %	0 %	304569843
1593	NC_005232	GCG	2	6	89756	89761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304569843
1594	NC_005232	GCT	2	6	89783	89788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304569843
1595	NC_005232	GAG	2	6	89789	89794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304569843
1596	NC_005232	CCA	2	6	89837	89842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304569843
1597	NC_005232	G	7	7	89875	89881	0 %	0 %	100 %	0 %	304569843
1598	NC_005232	T	6	6	89996	90001	0 %	100 %	0 %	0 %	38505921
1599	NC_005232	ATG	2	6	90046	90051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505921
1600	NC_005232	AGG	2	6	90067	90072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505921
1601	NC_005232	GTG	3	9	90098	90106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505921
1602	NC_005232	T	6	6	90171	90176	0 %	100 %	0 %	0 %	38505921
1603	NC_005232	TGG	2	6	90249	90254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505921
1604	NC_005232	TGG	2	6	90307	90312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505921
1605	NC_005232	GGA	2	6	90344	90349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505921
1606	NC_005232	GAT	3	9	90354	90362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505921
1607	NC_005232	GGA	2	6	90434	90439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505921
1608	NC_005232	GCG	2	6	90447	90452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505921
1609	NC_005232	TGG	2	6	90460	90465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505921
1610	NC_005232	GAT	3	9	90504	90512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505921
1611	NC_005232	GAA	2	6	90516	90521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505921
1612	NC_005232	GAG	2	6	90534	90539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505921
1613	NC_005232	CGC	2	6	90668	90673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505921
1614	NC_005232	AAAG	2	8	90676	90683	75 %	0 %	25 %	0 %	38505921
1615	NC_005232	ACG	2	6	90696	90701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505921
1616	NC_005232	GGC	2	6	90869	90874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505921
1617	NC_005232	GAG	2	6	90891	90896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505921
1618	NC_005232	GGC	2	6	90917	90922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505921
1619	NC_005232	GCG	2	6	90963	90968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505921
1620	NC_005232	CAG	2	6	90975	90980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505921
1621	NC_005232	GTG	2	6	90981	90986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505921
1622	NC_005232	GCG	2	6	90987	90992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505921
1623	NC_005232	TGG	2	6	91002	91007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505921
1624	NC_005232	GCG	2	6	91056	91061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505921
1625	NC_005232	TAA	2	6	91101	91106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505921
1626	NC_005232	AT	3	6	91112	91117	50 %	50 %	0 %	0 %	38505922
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1628	NC_005232	GTG	2	6	91178	91183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505922
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1881	NC_005232	CTG	2	6	103656	103661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505933
1882	NC_005232	CAA	2	6	103684	103689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505933
1883	NC_005232	ATT	2	6	103699	103704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505933
1884	NC_005232	T	6	6	103713	103718	0 %	100 %	0 %	0 %	38505933
1885	NC_005232	TTG	2	6	103775	103780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505934
1886	NC_005232	CAT	2	6	103893	103898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505934
1887	NC_005232	GCG	2	6	103911	103916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505934
1888	NC_005232	C	6	6	103934	103939	0 %	0 %	0 %	100 %	38505934
1889	NC_005232	AGC	2	6	103959	103964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505934
1890	NC_005232	TTG	3	9	104052	104060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505934
1891	NC_005232	TCA	2	6	104068	104073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505934
1892	NC_005232	T	6	6	104129	104134	0 %	100 %	0 %	0 %	38505934
1893	NC_005232	GTG	2	6	104158	104163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505934
1894	NC_005232	TGCC	2	8	104301	104308	0 %	25 %	25 %	50 %	38505934
1895	NC_005232	TTCA	2	8	104323	104330	25 %	50 %	0 %	25 %	38505934

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