MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSX

Total Repeats: 1895

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_005232	GCG	2	6	56412	56417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505884
1002	NC_005232	C	6	6	56435	56440	0 %	0 %	0 %	100 %	38505884
1003	NC_005232	GGC	2	6	56460	56465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505884
1004	NC_005232	TCA	2	6	56572	56577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505884
1005	NC_005232	T	6	6	56633	56638	0 %	100 %	0 %	0 %	38505884
1006	NC_005232	GTG	2	6	56662	56667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505884
1007	NC_005232	ACA	2	6	56732	56737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505884
1008	NC_005232	TGCC	2	8	56805	56812	0 %	25 %	25 %	50 %	38505884
1009	NC_005232	TTCA	2	8	56827	56834	25 %	50 %	0 %	25 %	38505884
1010	NC_005232	A	6	6	57223	57228	100 %	0 %	0 %	0 %	38505885
1011	NC_005232	T	6	6	57283	57288	0 %	100 %	0 %	0 %	38505885
1012	NC_005232	GTA	2	6	57289	57294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505885
1013	NC_005232	TCCT	2	8	57352	57359	0 %	50 %	0 %	50 %	38505885
1014	NC_005232	T	6	6	57431	57436	0 %	100 %	0 %	0 %	38505885
1015	NC_005232	GAT	2	6	57544	57549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505885
1016	NC_005232	TG	3	6	57559	57564	0 %	50 %	50 %	0 %	38505885
1017	NC_005232	TC	3	6	57631	57636	0 %	50 %	0 %	50 %	38505885
1018	NC_005232	GTT	2	6	57712	57717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505886
1019	NC_005232	GGAG	2	8	57745	57752	25 %	0 %	75 %	0 %	38505886
1020	NC_005232	CTG	2	6	57818	57823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505886
1021	NC_005232	GAA	2	6	57877	57882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505886
1022	NC_005232	TCA	2	6	58217	58222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505887
1023	NC_005232	GAA	2	6	58315	58320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505887
1024	NC_005232	CAA	2	6	58335	58340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505887
1025	NC_005232	CGG	2	6	58423	58428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505887
1026	NC_005232	ACA	2	6	58605	58610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505888
1027	NC_005232	TGA	2	6	58689	58694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505888
1028	NC_005232	TGA	2	6	58809	58814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505888
1029	NC_005232	GCTGA	2	10	58885	58894	20 %	20 %	40 %	20 %	38505888
1030	NC_005232	GCC	2	6	58900	58905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505888
1031	NC_005232	GCG	2	6	58915	58920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505888
1032	NC_005232	CTG	2	6	58949	58954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505888
1033	NC_005232	CGG	2	6	58982	58987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505888
1034	NC_005232	CGAAGG	2	12	59072	59083	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	38505888
1035	NC_005232	GGC	2	6	59115	59120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505888
1036	NC_005232	GATG	2	8	59180	59187	25 %	25 %	50 %	0 %	38505889
1037	NC_005232	TCGG	2	8	59213	59220	0 %	25 %	50 %	25 %	38505889
1038	NC_005232	CTG	2	6	59337	59342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505889
1039	NC_005232	CGC	2	6	59351	59356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505889
1040	NC_005232	CGA	2	6	59465	59470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505889
1041	NC_005232	A	6	6	59508	59513	100 %	0 %	0 %	0 %	38505889
1042	NC_005232	GGC	2	6	59543	59548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505889
1043	NC_005232	C	7	7	59556	59562	0 %	0 %	0 %	100 %	38505889
1044	NC_005232	T	6	6	59747	59752	0 %	100 %	0 %	0 %	38505889
1045	NC_005232	TGG	2	6	59815	59820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505889
1046	NC_005232	CAAT	2	8	59864	59871	50 %	25 %	0 %	25 %	38505889
1047	NC_005232	TGGC	2	8	59884	59891	0 %	25 %	50 %	25 %	38505889
1048	NC_005232	TGG	2	6	59894	59899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505889
1049	NC_005232	TACC	2	8	59934	59941	25 %	25 %	0 %	50 %	38505889
1050	NC_005232	GGA	2	6	59953	59958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505889
1051	NC_005232	GGC	2	6	59998	60003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505890
1052	NC_005232	GGC	2	6	60016	60021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505890
1053	NC_005232	ACC	2	6	60026	60031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505890
1054	NC_005232	GACATC	2	12	60077	60088	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	38505890
1055	NC_005232	CCG	2	6	60099	60104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505890
1056	NC_005232	TGCCA	2	10	60220	60229	20 %	20 %	20 %	40 %	38505890
1057	NC_005232	GGTT	2	8	60278	60285	0 %	50 %	50 %	0 %	38505890
1058	NC_005232	GTAATC	2	12	60354	60365	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	38505890
1059	NC_005232	GCC	2	6	60386	60391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505890
1060	NC_005232	TGG	2	6	60414	60419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505890
1061	NC_005232	CGG	2	6	60454	60459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505890
1062	NC_005232	GTG	2	6	60503	60508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505890
1063	NC_005232	G	6	6	60526	60531	0 %	0 %	100 %	0 %	38505890
1064	NC_005232	CCA	2	6	60612	60617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505890
1065	NC_005232	GGT	2	6	60652	60657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505890
1066	NC_005232	CAT	2	6	60685	60690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505890
1067	NC_005232	CCG	2	6	60723	60728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505890
1068	NC_005232	CGA	2	6	60754	60759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505890
1069	NC_005232	TGA	2	6	60826	60831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505890
1070	NC_005232	GCCTTT	2	12	60860	60871	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	38505890
1071	NC_005232	GGA	2	6	60890	60895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505890
1072	NC_005232	TCCAA	2	10	61124	61133	40 %	20 %	0 %	40 %	38505891
1073	NC_005232	AGT	2	6	61189	61194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505891
1074	NC_005232	GGGA	2	8	61200	61207	25 %	0 %	75 %	0 %	38505891
1075	NC_005232	CAT	2	6	61267	61272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505891
1076	NC_005232	AAACCC	2	12	61293	61304	50 %	0 %	0 %	50 %	38505891
1077	NC_005232	TGG	2	6	61335	61340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505891
1078	NC_005232	CAT	2	6	61348	61353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505891
1079	NC_005232	GGC	2	6	61460	61465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505891
1080	NC_005232	ACT	2	6	61540	61545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505891
1081	NC_005232	C	6	6	61593	61598	0 %	0 %	0 %	100 %	38505891
1082	NC_005232	GTTG	2	8	61602	61609	0 %	50 %	50 %	0 %	38505891
1083	NC_005232	GGA	2	6	61648	61653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505891
1084	NC_005232	CCA	2	6	61701	61706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505891
1085	NC_005232	CAA	2	6	61726	61731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505891
1086	NC_005232	C	6	6	61739	61744	0 %	0 %	0 %	100 %	38505891
1087	NC_005232	C	7	7	61781	61787	0 %	0 %	0 %	100 %	38505891
1088	NC_005232	TGA	2	6	61827	61832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505891
1089	NC_005232	CAC	2	6	61835	61840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505891
1090	NC_005232	TGA	2	6	61882	61887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505891
1091	NC_005232	GCG	2	6	61928	61933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505891
1092	NC_005232	TGGGC	2	10	61948	61957	0 %	20 %	60 %	20 %	38505891
1093	NC_005232	TTC	2	6	62041	62046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505891
1094	NC_005232	GAG	2	6	62084	62089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505891
1095	NC_005232	GGC	2	6	62334	62339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505892
1096	NC_005232	ACT	2	6	62358	62363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505892
1097	NC_005232	AAT	2	6	62376	62381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505892
1098	NC_005232	ACT	2	6	62391	62396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505892
1099	NC_005232	AAG	2	6	62494	62499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505892
1100	NC_005232	CCT	2	6	62537	62542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505892
1101	NC_005232	C	6	6	62610	62615	0 %	0 %	0 %	100 %	38505892
1102	NC_005232	GAA	2	6	62631	62636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505892
1103	NC_005232	GCCAAG	2	12	62721	62732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505892
1104	NC_005232	GCC	2	6	62825	62830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505892
1105	NC_005232	CCG	2	6	62942	62947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505892
1106	NC_005232	G	6	6	62989	62994	0 %	0 %	100 %	0 %	38505892
1107	NC_005232	GGC	2	6	63023	63028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505892
1108	NC_005232	ACC	2	6	63058	63063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505892
1109	NC_005232	CCG	2	6	63077	63082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505892
1110	NC_005232	GGA	2	6	63086	63091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505892
1111	NC_005232	GGA	2	6	63179	63184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505892
1112	NC_005232	TCAAA	2	10	63203	63212	60 %	20 %	0 %	20 %	38505892
1113	NC_005232	CGC	2	6	63234	63239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505892
1114	NC_005232	ACT	2	6	63294	63299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505892
1115	NC_005232	TGG	2	6	63428	63433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505893
1116	NC_005232	ACA	2	6	63434	63439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505893
1117	NC_005232	CAA	2	6	63460	63465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505893
1118	NC_005232	CAC	2	6	63492	63497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505893
1119	NC_005232	A	6	6	63566	63571	100 %	0 %	0 %	0 %	38505893
1120	NC_005232	CCATTG	2	12	63623	63634	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	38505893
1121	NC_005232	CCG	2	6	63703	63708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505893
1122	NC_005232	AAT	2	6	63712	63717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505893
1123	NC_005232	CGC	2	6	63798	63803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505893
1124	NC_005232	CAA	2	6	63817	63822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505893
1125	NC_005232	TCAAA	2	10	63846	63855	60 %	20 %	0 %	20 %	38505893
1126	NC_005232	AGCTG	2	10	63879	63888	20 %	20 %	40 %	20 %	38505893
1127	NC_005232	GTA	2	6	63910	63915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505893
1128	NC_005232	GAA	2	6	63934	63939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505893
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