MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSG

Total Repeats: 625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_005231	ACA	2	6	35945	35950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505813
502	NC_005231	AGG	2	6	35975	35980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505813
503	NC_005231	CCT	2	6	36059	36064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505813
504	NC_005231	ACG	2	6	36068	36073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505813
505	NC_005231	GT	3	6	36108	36113	0 %	50 %	50 %	0 %	38505813
506	NC_005231	TCA	2	6	36129	36134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505813
507	NC_005231	CAG	3	9	36183	36191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505813
508	NC_005231	GAAT	2	8	36272	36279	50 %	25 %	25 %	0 %	38505813
509	NC_005231	AGC	2	6	36315	36320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505813
510	NC_005231	TTC	2	6	36883	36888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505814
511	NC_005231	ACT	2	6	36896	36901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505814
512	NC_005231	CTT	2	6	36988	36993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505814
513	NC_005231	AATT	2	8	37015	37022	50 %	50 %	0 %	0 %	38505814
514	NC_005231	CTAC	2	8	37089	37096	25 %	25 %	0 %	50 %	38505814
515	NC_005231	TTC	2	6	37121	37126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505814
516	NC_005231	TGG	2	6	37341	37346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505815
517	NC_005231	CTT	2	6	37478	37483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505815
518	NC_005231	ATT	2	6	37596	37601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505815
519	NC_005231	GAT	2	6	37619	37624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505815
520	NC_005231	GATA	2	8	37709	37716	50 %	25 %	25 %	0 %	38505815
521	NC_005231	T	7	7	37720	37726	0 %	100 %	0 %	0 %	38505815
522	NC_005231	AGA	2	6	37768	37773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505815
523	NC_005231	TAAGTA	2	12	37803	37814	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	38505815
524	NC_005231	TAA	2	6	37874	37879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505815
525	NC_005231	GTT	2	6	37922	37927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505815
526	NC_005231	TCT	2	6	37928	37933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505815
527	NC_005231	GGA	2	6	37957	37962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505815
528	NC_005231	TGT	2	6	37999	38004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505815
529	NC_005231	GGAGT	2	10	38017	38026	20 %	20 %	60 %	0 %	38505815
530	NC_005231	GTT	2	6	38404	38409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505816
531	NC_005231	AAT	2	6	38443	38448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505816
532	NC_005231	CGGCAA	2	12	38458	38469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505816
533	NC_005231	ACC	2	6	38471	38476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505816
534	NC_005231	CGA	3	9	38530	38538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505816
535	NC_005231	TAG	2	6	38542	38547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505816
536	NC_005231	TCA	2	6	38596	38601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505816
537	NC_005231	A	7	7	38692	38698	100 %	0 %	0 %	0 %	38505817
538	NC_005231	CTT	2	6	38714	38719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505817
539	NC_005231	ATT	2	6	38767	38772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505817
540	NC_005231	GAGG	2	8	38790	38797	25 %	0 %	75 %	0 %	38505817
541	NC_005231	T	7	7	38877	38883	0 %	100 %	0 %	0 %	38505817
542	NC_005231	TCT	2	6	38889	38894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505817
543	NC_005231	CTA	2	6	38900	38905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505817
544	NC_005231	T	7	7	38949	38955	0 %	100 %	0 %	0 %	38505817
545	NC_005231	T	7	7	38958	38964	0 %	100 %	0 %	0 %	38505817
546	NC_005231	ACT	2	6	39030	39035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505817
547	NC_005231	TCC	2	6	39082	39087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505818
548	NC_005231	TTTC	2	8	39091	39098	0 %	75 %	0 %	25 %	38505818
549	NC_005231	T	9	9	39114	39122	0 %	100 %	0 %	0 %	38505818
550	NC_005231	ATTTTC	2	12	39129	39140	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	38505818
551	NC_005231	TCT	2	6	39216	39221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505818
552	NC_005231	T	7	7	39227	39233	0 %	100 %	0 %	0 %	38505818
553	NC_005231	TCC	2	6	39359	39364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505818
554	NC_005231	TA	3	6	39371	39376	50 %	50 %	0 %	0 %	38505818
555	NC_005231	CTA	2	6	39379	39384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505818
556	NC_005231	TA	3	6	39486	39491	50 %	50 %	0 %	0 %	38505819
557	NC_005231	CCG	2	6	39504	39509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505819
558	NC_005231	AAG	2	6	39510	39515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505819
559	NC_005231	GAC	2	6	39637	39642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505819
560	NC_005231	AGC	2	6	39666	39671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505819
561	NC_005231	AGA	2	6	39715	39720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505819
562	NC_005231	GACA	2	8	39727	39734	50 %	0 %	25 %	25 %	38505819
563	NC_005231	AGG	2	6	39823	39828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505819
564	NC_005231	TA	3	6	39836	39841	50 %	50 %	0 %	0 %	38505819
565	NC_005231	CT	3	6	39892	39897	0 %	50 %	0 %	50 %	38505819
566	NC_005231	AC	3	6	39936	39941	50 %	0 %	0 %	50 %	38505819
567	NC_005231	GCG	2	6	39951	39956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505819
568	NC_005231	AAG	2	6	40092	40097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505819
569	NC_005231	GCA	2	6	40106	40111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505819
570	NC_005231	TAA	2	6	40225	40230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505819
571	NC_005231	GCT	2	6	40324	40329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505819
572	NC_005231	TAA	2	6	40404	40409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505819
573	NC_005231	AGA	2	6	40426	40431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505819
574	NC_005231	CCAAG	2	10	40450	40459	40 %	0 %	20 %	40 %	38505819
575	NC_005231	GCA	2	6	40480	40485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505819
576	NC_005231	TAC	2	6	40494	40499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505819
577	NC_005231	GCG	2	6	40542	40547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505819
578	NC_005231	ACA	2	6	40557	40562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505819
579	NC_005231	AAC	2	6	40572	40577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505819
580	NC_005231	AAG	2	6	40579	40584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505819
581	NC_005231	ACAAA	2	10	40687	40696	80 %	0 %	0 %	20 %	38505819
582	NC_005231	CTT	2	6	40726	40731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505819
583	NC_005231	TTC	2	6	40739	40744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505819
584	NC_005231	CGC	2	6	40795	40800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505819
585	NC_005231	AG	3	6	40818	40823	50 %	0 %	50 %	0 %	38505819
586	NC_005231	CAG	2	6	40825	40830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505819
587	NC_005231	TAG	2	6	40881	40886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505819
588	NC_005231	GTA	2	6	41086	41091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505820
589	NC_005231	TA	3	6	41095	41100	50 %	50 %	0 %	0 %	38505820
590	NC_005231	GGA	2	6	41107	41112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505820
591	NC_005231	A	7	7	41238	41244	100 %	0 %	0 %	0 %	38505820
592	NC_005231	AGA	2	6	41250	41255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505820
593	NC_005231	GAAAAT	2	12	41331	41342	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	38505820
594	NC_005231	A	9	9	41349	41357	100 %	0 %	0 %	0 %	38505820
595	NC_005231	GAAA	2	8	41373	41380	75 %	0 %	25 %	0 %	38505820
596	NC_005231	GGA	2	6	41384	41389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505820
597	NC_005231	TAG	2	6	41435	41440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505821
598	NC_005231	A	7	7	41507	41513	100 %	0 %	0 %	0 %	38505821
599	NC_005231	A	7	7	41516	41522	100 %	0 %	0 %	0 %	38505821
600	NC_005231	TAG	2	6	41566	41571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505821
601	NC_005231	GAA	2	6	41578	41583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505821
602	NC_005231	A	7	7	41588	41594	100 %	0 %	0 %	0 %	38505821
603	NC_005231	CCCT	2	8	41673	41680	0 %	25 %	0 %	75 %	38505821
604	NC_005231	TAA	2	6	41698	41703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505821
605	NC_005231	AAG	2	6	41752	41757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505821
606	NC_005231	T	7	7	41773	41779	0 %	100 %	0 %	0 %	38505821
607	NC_005231	TGA	2	6	41870	41875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505821
608	NC_005231	CTA	2	6	42018	42023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505822
609	NC_005231	ATT	2	6	42108	42113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505822
610	NC_005231	TCT	2	6	42149	42154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505822
611	NC_005231	GAA	2	6	42159	42164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505822
612	NC_005231	CTAT	2	8	42261	42268	25 %	50 %	0 %	25 %	38505823
613	NC_005231	TAG	2	6	42302	42307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505823
614	NC_005231	ACG	2	6	42327	42332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505823
615	NC_005231	AGGC	2	8	42339	42346	25 %	0 %	50 %	25 %	38505823
616	NC_005231	T	6	6	42354	42359	0 %	100 %	0 %	0 %	38505823
617	NC_005231	TTG	2	6	42506	42511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505823
618	NC_005231	TGG	2	6	42534	42539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505823
619	NC_005231	G	6	6	42550	42555	0 %	0 %	100 %	0 %	38505823
620	NC_005231	TGG	2	6	42605	42610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505823
621	NC_005231	CCA	2	6	42622	42627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505823
622	NC_005231	GTT	2	6	42721	42726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505823
623	NC_005231	CAAG	2	8	42735	42742	50 %	0 %	25 %	25 %	38505823
624	NC_005231	GGA	2	6	42816	42821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505823
625	NC_005231	GTG	3	9	42891	42899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505823

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