MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSA

Total Repeats: 1464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_005230	AAC	2	6	65912	65917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505740
1002	NC_005230	TAC	2	6	65981	65986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505740
1003	NC_005230	AGG	2	6	66017	66022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505740
1004	NC_005230	CCA	2	6	66100	66105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505740
1005	NC_005230	TGA	2	6	66336	66341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505741
1006	NC_005230	TGA	2	6	66369	66374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505741
1007	NC_005230	TGA	2	6	66402	66407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505741
1008	NC_005230	TGA	2	6	66435	66440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505741
1009	NC_005230	GGC	2	6	66531	66536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505741
1010	NC_005230	TTAATG	2	12	66564	66575	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	38505741
1011	NC_005230	GAT	2	6	66670	66675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505742
1012	NC_005230	TGCT	2	8	66695	66702	0 %	50 %	25 %	25 %	38505742
1013	NC_005230	TCC	2	6	66752	66757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505742
1014	NC_005230	ATC	2	6	66793	66798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505742
1015	NC_005230	GAT	2	6	66810	66815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505742
1016	NC_005230	CA	3	6	66902	66907	50 %	0 %	0 %	50 %	38505742
1017	NC_005230	TAC	2	6	66945	66950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505743
1018	NC_005230	TGG	2	6	67067	67072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505743
1019	NC_005230	TGG	2	6	67120	67125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505743
1020	NC_005230	ACG	2	6	67233	67238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505743
1021	NC_005230	CTT	2	6	67274	67279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505743
1022	NC_005230	CGG	2	6	67409	67414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505743
1023	NC_005230	AAT	2	6	67419	67424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505743
1024	NC_005230	CCA	2	6	67442	67447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505743
1025	NC_005230	TGT	2	6	67466	67471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505743
1026	NC_005230	TGGCG	2	10	67475	67484	0 %	20 %	60 %	20 %	38505743
1027	NC_005230	CCA	2	6	67496	67501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505743
1028	NC_005230	GTT	2	6	67555	67560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505743
1029	NC_005230	T	8	8	67559	67566	0 %	100 %	0 %	0 %	38505743
1030	NC_005230	TAC	2	6	67848	67853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505743
1031	NC_005230	T	6	6	67862	67867	0 %	100 %	0 %	0 %	38505743
1032	NC_005230	TCGTA	2	10	67957	67966	20 %	40 %	20 %	20 %	38505743
1033	NC_005230	AAC	2	6	69669	69674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505744
1034	NC_005230	GTG	2	6	69686	69691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505744
1035	NC_005230	GGT	2	6	69700	69705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505744
1036	NC_005230	ACT	2	6	72877	72882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505745
1037	NC_005230	ATA	2	6	72903	72908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505745
1038	NC_005230	TCAA	2	8	72909	72916	50 %	25 %	0 %	25 %	38505745
1039	NC_005230	AAT	2	6	72980	72985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505745
1040	NC_005230	T	6	6	73117	73122	0 %	100 %	0 %	0 %	38505745
1041	NC_005230	TGT	2	6	73131	73136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505745
1042	NC_005230	TC	3	6	73139	73144	0 %	50 %	0 %	50 %	38505745
1043	NC_005230	TCC	2	6	73257	73262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505745
1044	NC_005230	CAT	2	6	73267	73272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505745
1045	NC_005230	GCG	2	6	73281	73286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505745
1046	NC_005230	GCC	2	6	73304	73309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505745
1047	NC_005230	TTG	2	6	73379	73384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505745
1048	NC_005230	ATG	2	6	73589	73594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304569842
1049	NC_005230	GGTT	2	8	73639	73646	0 %	50 %	50 %	0 %	304569842
1050	NC_005230	TGT	2	6	73715	73720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304569842
1051	NC_005230	CTG	2	6	73741	73746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304569842
1052	NC_005230	CAG	2	6	73896	73901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304569842
1053	NC_005230	TGT	2	6	73913	73918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304569842
1054	NC_005230	TAA	2	6	74072	74077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304569842
1055	NC_005230	A	6	6	74242	74247	100 %	0 %	0 %	0 %	304569842
1056	NC_005230	T	6	6	74412	74417	0 %	100 %	0 %	0 %	304569842
1057	NC_005230	TTA	2	6	74450	74455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304569842
1058	NC_005230	CAT	2	6	74496	74501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304569842
1059	NC_005230	CTT	2	6	74510	74515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304569842
1060	NC_005230	TCT	2	6	74555	74560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304569842
1061	NC_005230	TGT	2	6	74597	74602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304569842
1062	NC_005230	TTA	2	6	74666	74671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304569842
1063	NC_005230	TGA	2	6	74702	74707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304569842
1064	NC_005230	AAG	2	6	74723	74728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304569842
1065	NC_005230	GGTA	2	8	74748	74755	25 %	25 %	50 %	0 %	304569842
1066	NC_005230	GTTA	2	8	75160	75167	25 %	50 %	25 %	0 %	38505748
1067	NC_005230	GCCA	2	8	75253	75260	25 %	0 %	25 %	50 %	38505748
1068	NC_005230	TTGA	2	8	75472	75479	25 %	50 %	25 %	0 %	38505748
1069	NC_005230	GGC	2	6	75490	75495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505748
1070	NC_005230	CTG	2	6	75502	75507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505748
1071	NC_005230	GT	3	6	75517	75522	0 %	50 %	50 %	0 %	38505748
1072	NC_005230	TCCCTA	2	12	75594	75605	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	38505748
1073	NC_005230	AAT	2	6	75661	75666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505748
1074	NC_005230	CGG	3	9	75731	75739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505748
1075	NC_005230	TGG	2	6	75783	75788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505748
1076	NC_005230	AGCC	2	8	75825	75832	25 %	0 %	25 %	50 %	38505748
1077	NC_005230	ATT	2	6	75838	75843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505748
1078	NC_005230	ACC	2	6	75903	75908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505748
1079	NC_005230	GCCAT	2	10	76226	76235	20 %	20 %	20 %	40 %	38505749
1080	NC_005230	CAA	2	6	76237	76242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505749
1081	NC_005230	AAT	2	6	76267	76272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505749
1082	NC_005230	T	6	6	76399	76404	0 %	100 %	0 %	0 %	38505749
1083	NC_005230	GAT	2	6	76453	76458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505749
1084	NC_005230	TGA	2	6	76479	76484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505749
1085	NC_005230	ATGGA	2	10	76509	76518	40 %	20 %	40 %	0 %	38505749
1086	NC_005230	TCAGC	2	10	76567	76576	20 %	20 %	20 %	40 %	38505749
1087	NC_005230	CAA	2	6	76585	76590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505749
1088	NC_005230	ACC	2	6	76628	76633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505749
1089	NC_005230	ATG	2	6	76637	76642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505749
1090	NC_005230	CCA	2	6	76682	76687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505749
1091	NC_005230	TGC	2	6	76725	76730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505749
1092	NC_005230	TGT	2	6	76767	76772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505749
1093	NC_005230	CAG	2	6	76801	76806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505749
1094	NC_005230	CCG	2	6	76847	76852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505749
1095	NC_005230	CAA	2	6	76966	76971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505749
1096	NC_005230	TTAC	2	8	77006	77013	25 %	50 %	0 %	25 %	38505749
1097	NC_005230	CAA	2	6	77046	77051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505749
1098	NC_005230	GAT	2	6	77065	77070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505749
1099	NC_005230	T	6	6	77072	77077	0 %	100 %	0 %	0 %	38505749
1100	NC_005230	ACA	2	6	77081	77086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505749
1101	NC_005230	GAA	2	6	77098	77103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505749
1102	NC_005230	GA	3	6	77106	77111	50 %	0 %	50 %	0 %	38505749
1103	NC_005230	TGG	2	6	77125	77130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505749
1104	NC_005230	GAA	2	6	77149	77154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505749
1105	NC_005230	GCC	2	6	77159	77164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505749
1106	NC_005230	CCG	2	6	77206	77211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505749
1107	NC_005230	CAT	3	9	77241	77249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505749
1108	NC_005230	TGA	2	6	77250	77255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505749
1109	NC_005230	ACT	2	6	77264	77269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505749
1110	NC_005230	TGG	2	6	77270	77275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505749
1111	NC_005230	GGA	2	6	77395	77400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505749
1112	NC_005230	TAA	2	6	77409	77414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505749
1113	NC_005230	CAC	2	6	77445	77450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505749
1114	NC_005230	CAAG	2	8	77482	77489	50 %	0 %	25 %	25 %	38505749
1115	NC_005230	TGG	2	6	77630	77635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505750
1116	NC_005230	CAA	2	6	77647	77652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505750
1117	NC_005230	CT	3	6	77676	77681	0 %	50 %	0 %	50 %	38505750
1118	NC_005230	CCCGTT	2	12	77891	77902	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	38505750
1119	NC_005230	GAA	2	6	77944	77949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505750
1120	NC_005230	CAG	2	6	78066	78071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505750
1121	NC_005230	TAT	2	6	78163	78168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505750
1122	NC_005230	TTTA	2	8	78234	78241	25 %	75 %	0 %	0 %	38505750
1123	NC_005230	GGC	2	6	78351	78356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505750
1124	NC_005230	AAG	2	6	78401	78406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505750
1125	NC_005230	CAG	2	6	78421	78426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505750
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