MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSM

Total Repeats: 1908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005229	ATT	2	6	201	206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505536
2	NC_005229	A	6	6	229	234	100 %	0 %	0 %	0 %	38505536
3	NC_005229	CGG	2	6	356	361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505536
4	NC_005229	A	6	6	586	591	100 %	0 %	0 %	0 %	38505537
5	NC_005229	TAG	2	6	652	657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505537
6	NC_005229	TTG	2	6	698	703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505537
7	NC_005229	AAC	2	6	721	726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505537
8	NC_005229	CAT	2	6	766	771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505537
9	NC_005229	CCGA	2	8	865	872	25 %	0 %	25 %	50 %	38505537
10	NC_005229	TCT	2	6	1221	1226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505538
11	NC_005229	CGC	2	6	1238	1243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505538
12	NC_005229	ATA	2	6	1299	1304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505538
13	NC_005229	ACA	2	6	1362	1367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505538
14	NC_005229	TTAA	2	8	1416	1423	50 %	50 %	0 %	0 %	38505538
15	NC_005229	TCA	2	6	1500	1505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505538
16	NC_005229	CTA	2	6	1637	1642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505539
17	NC_005229	ATG	2	6	1643	1648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505539
18	NC_005229	CGC	2	6	1691	1696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505539
19	NC_005229	ATA	2	6	1699	1704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505539
20	NC_005229	CCT	2	6	2544	2549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505540
21	NC_005229	GCC	2	6	2552	2557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505540
22	NC_005229	TGT	2	6	2560	2565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505540
23	NC_005229	CAGT	2	8	2664	2671	25 %	25 %	25 %	25 %	38505540
24	NC_005229	GGC	2	6	2681	2686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505540
25	NC_005229	CGC	2	6	2788	2793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505540
26	NC_005229	AAC	2	6	2981	2986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505540
27	NC_005229	GGA	2	6	3001	3006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505540
28	NC_005229	TAC	2	6	3041	3046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505540
29	NC_005229	TAGAGC	2	12	3060	3071	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	38505540
30	NC_005229	CAC	2	6	3124	3129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505540
31	NC_005229	GAT	2	6	3140	3145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505540
32	NC_005229	CCTC	2	8	3230	3237	0 %	25 %	0 %	75 %	38505540
33	NC_005229	TTG	2	6	3281	3286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505540
34	NC_005229	CTT	2	6	3291	3296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505540
35	NC_005229	T	6	6	3316	3321	0 %	100 %	0 %	0 %	38505540
36	NC_005229	TGCC	2	8	3360	3367	0 %	25 %	25 %	50 %	38505540
37	NC_005229	TAC	2	6	3418	3423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505540
38	NC_005229	ACA	2	6	3431	3436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505540
39	NC_005229	AGA	2	6	3454	3459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505540
40	NC_005229	GTTT	2	8	3477	3484	0 %	75 %	25 %	0 %	38505540
41	NC_005229	GAT	2	6	3653	3658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505540
42	NC_005229	CGG	2	6	3667	3672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505540
43	NC_005229	GGAG	2	8	3877	3884	25 %	0 %	75 %	0 %	38505540
44	NC_005229	ATG	2	6	4011	4016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505540
45	NC_005229	TGG	2	6	4030	4035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505540
46	NC_005229	AGG	2	6	4036	4041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505540
47	NC_005229	ACA	2	6	4080	4085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505540
48	NC_005229	GCC	2	6	4163	4168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505540
49	NC_005229	TGA	2	6	4216	4221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505540
50	NC_005229	AG	3	6	4236	4241	50 %	0 %	50 %	0 %	38505540
51	NC_005229	TTA	2	6	4244	4249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505540
52	NC_005229	TGG	2	6	4267	4272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505540
53	NC_005229	GCC	2	6	4406	4411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505540
54	NC_005229	ACG	2	6	4454	4459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505540
55	NC_005229	AAT	2	6	4673	4678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505540
56	NC_005229	CTT	2	6	4744	4749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505540
57	NC_005229	GTT	2	6	4751	4756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505540
58	NC_005229	CAA	2	6	4808	4813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505540
59	NC_005229	TGG	2	6	4818	4823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505540
60	NC_005229	AAC	2	6	4850	4855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505540
61	NC_005229	TCAG	2	8	4872	4879	25 %	25 %	25 %	25 %	38505540
62	NC_005229	GGA	2	6	4883	4888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505540
63	NC_005229	TTAAT	2	10	4914	4923	40 %	60 %	0 %	0 %	38505540
64	NC_005229	CTAA	2	8	4943	4950	50 %	25 %	0 %	25 %	38505540
65	NC_005229	T	6	6	4982	4987	0 %	100 %	0 %	0 %	38505540
66	NC_005229	CAAT	2	8	5071	5078	50 %	25 %	0 %	25 %	38505540
67	NC_005229	ACC	2	6	5081	5086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505540
68	NC_005229	CTGG	2	8	5105	5112	0 %	25 %	50 %	25 %	38505540
69	NC_005229	TTA	2	6	5190	5195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505540
70	NC_005229	TTG	2	6	5216	5221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505540
71	NC_005229	GAT	2	6	5270	5275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505540
72	NC_005229	CTA	2	6	5314	5319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505540
73	NC_005229	TCCG	2	8	5321	5328	0 %	25 %	25 %	50 %	38505540
74	NC_005229	ATG	2	6	5412	5417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505540
75	NC_005229	GGC	2	6	5465	5470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505540
76	NC_005229	GAA	2	6	5507	5512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505540
77	NC_005229	ATC	2	6	5698	5703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505540
78	NC_005229	AGGA	2	8	5796	5803	50 %	0 %	50 %	0 %	38505540
79	NC_005229	CGG	2	6	5826	5831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505540
80	NC_005229	CAA	2	6	5892	5897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505540
81	NC_005229	CCG	3	9	5934	5942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505540
82	NC_005229	AT	3	6	6099	6104	50 %	50 %	0 %	0 %	38505540
83	NC_005229	TAAC	2	8	6123	6130	50 %	25 %	0 %	25 %	38505540
84	NC_005229	GAT	2	6	6200	6205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505540
85	NC_005229	T	6	6	6205	6210	0 %	100 %	0 %	0 %	38505540
86	NC_005229	TGA	2	6	6232	6237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505540
87	NC_005229	CAT	2	6	6244	6249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505540
88	NC_005229	TGT	2	6	6268	6273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505540
89	NC_005229	CCG	2	6	6298	6303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505540
90	NC_005229	AGA	2	6	6331	6336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505540
91	NC_005229	A	6	6	6360	6365	100 %	0 %	0 %	0 %	38505540
92	NC_005229	ACA	2	6	6435	6440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505540
93	NC_005229	C	6	6	6461	6466	0 %	0 %	0 %	100 %	38505540
94	NC_005229	TC	3	6	6474	6479	0 %	50 %	0 %	50 %	38505540
95	NC_005229	AACTTT	2	12	6494	6505	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	38505540
96	NC_005229	AGA	2	6	6649	6654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505540
97	NC_005229	TGT	2	6	6751	6756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505540
98	NC_005229	CAC	2	6	6772	6777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505540
99	NC_005229	AAG	2	6	6807	6812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505540
100	NC_005229	TGG	2	6	6861	6866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505540
101	NC_005229	TGT	2	6	6967	6972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505540
102	NC_005229	GA	3	6	7024	7029	50 %	0 %	50 %	0 %	38505540
103	NC_005229	GAA	2	6	7049	7054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505540
104	NC_005229	TAC	2	6	7061	7066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505540
105	NC_005229	CCCAA	2	10	7129	7138	40 %	0 %	0 %	60 %	38505540
106	NC_005229	AAC	2	6	7316	7321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505540
107	NC_005229	AAG	2	6	7425	7430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505540
108	NC_005229	TGA	2	6	7447	7452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505540
109	NC_005229	TCAG	2	8	7462	7469	25 %	25 %	25 %	25 %	38505540
110	NC_005229	TGG	2	6	7504	7509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505540
111	NC_005229	C	7	7	7516	7522	0 %	0 %	0 %	100 %	38505540
112	NC_005229	GCAGTA	2	12	7557	7568	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	38505540
113	NC_005229	AAG	2	6	7602	7607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505540
114	NC_005229	GTG	2	6	7632	7637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505540
115	NC_005229	ATT	2	6	7640	7645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505540
116	NC_005229	CGC	2	6	7678	7683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505540
117	NC_005229	CCG	2	6	7779	7784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505540
118	NC_005229	TAA	2	6	7789	7794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505540
119	NC_005229	A	6	6	7825	7830	100 %	0 %	0 %	0 %	38505540
120	NC_005229	TGA	2	6	7831	7836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505540
121	NC_005229	CAG	2	6	7842	7847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505540
122	NC_005229	TGA	2	6	7927	7932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505540
123	NC_005229	CGGATG	2	12	7950	7961	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	38505540
124	NC_005229	A	6	6	7964	7969	100 %	0 %	0 %	0 %	38505540
125	NC_005229	TCA	2	6	7983	7988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505540
126	NC_005229	AC	3	6	8011	8016	50 %	0 %	0 %	50 %	38505540
127	NC_005229	CT	3	6	8029	8034	0 %	50 %	0 %	50 %	38505540
128	NC_005229	GTG	2	6	8048	8053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505540
129	NC_005229	GGC	2	6	8095	8100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505540
130	NC_005229	TGA	2	6	8125	8130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505540
131	NC_005229	T	6	6	8212	8217	0 %	100 %	0 %	0 %	38505540
132	NC_005229	TAA	2	6	8248	8253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505540
133	NC_005229	AAGT	2	8	8287	8294	50 %	25 %	25 %	0 %	38505540
134	NC_005229	CAAT	2	8	8317	8324	50 %	25 %	0 %	25 %	38505540
135	NC_005229	GTCC	2	8	8357	8364	0 %	25 %	25 %	50 %	38505540
136	NC_005229	TTG	2	6	8409	8414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505540
137	NC_005229	CCG	2	6	8490	8495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505540
138	NC_005229	TGG	2	6	8602	8607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505540
139	NC_005229	ATG	2	6	8637	8642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505540
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141	NC_005229	TGA	2	6	8959	8964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505540
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400	NC_005229	GA	3	6	23780	23785	50 %	0 %	50 %	0 %	38505553
401	NC_005229	TGT	2	6	23834	23839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505553
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432	NC_005229	CAAT	2	8	25661	25668	50 %	25 %	0 %	25 %	38505557
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