MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. WH 8102

Total Repeats: 49312

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_005070	CTG	2	6	618774	618779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33865170
13002	NC_005070	CAA	2	6	618794	618799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33865170
13003	NC_005070	TGG	2	6	618811	618816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33865170
13004	NC_005070	TGG	2	6	618853	618858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33865170
13005	NC_005070	AGG	3	9	618859	618867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33865170
13006	NC_005070	GAG	2	6	618942	618947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33865170
13007	NC_005070	GAG	2	6	618975	618980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33865170
13008	NC_005070	CTG	2	6	618987	618992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33865170
13009	NC_005070	TTC	2	6	618997	619002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33865170
13010	NC_005070	CAG	2	6	619005	619010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33865170
13011	NC_005070	CTG	2	6	619158	619163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33865170
13012	NC_005070	TGT	2	6	619192	619197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33865170
13013	NC_005070	TGCCA	2	10	619198	619207	20 %	20 %	20 %	40 %	33865170
13014	NC_005070	CGT	2	6	619211	619216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33865170
13015	NC_005070	AGGC	2	8	619279	619286	25 %	0 %	50 %	25 %	33865170
13016	NC_005070	GGA	2	6	619314	619319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33865170
13017	NC_005070	CCAGG	2	10	619400	619409	20 %	0 %	40 %	40 %	33865170
13018	NC_005070	AGC	2	6	619471	619476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33865170
13019	NC_005070	GAA	2	6	619478	619483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33865170
13020	NC_005070	GGA	2	6	619499	619504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33865170
13021	NC_005070	GAG	2	6	619521	619526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33865170
13022	NC_005070	TGC	2	6	619537	619542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33865170
13023	NC_005070	TTC	2	6	619591	619596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33865170
13024	NC_005070	TGA	2	6	619613	619618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33865170
13025	NC_005070	GGC	2	6	619649	619654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33865170
13026	NC_005070	GTG	2	6	619660	619665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33865170
13027	NC_005070	TGA	2	6	619693	619698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33865170
13028	NC_005070	GGC	2	6	619733	619738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33865170
13029	NC_005070	TCCC	2	8	619792	619799	0 %	25 %	0 %	75 %	33865170
13030	NC_005070	GGA	2	6	619811	619816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33865170
13031	NC_005070	TC	3	6	619829	619834	0 %	50 %	0 %	50 %	33865170
13032	NC_005070	GTT	2	6	619850	619855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33865170
13033	NC_005070	GGTGT	2	10	619875	619884	0 %	40 %	60 %	0 %	33865170
13034	NC_005070	TGG	2	6	619893	619898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33865170
13035	NC_005070	TGG	2	6	619918	619923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33865170
13036	NC_005070	ACTG	2	8	619941	619948	25 %	25 %	25 %	25 %	33865170
13037	NC_005070	CTG	2	6	620019	620024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33865170
13038	NC_005070	GCGA	2	8	620087	620094	25 %	0 %	50 %	25 %	33865170
13039	NC_005070	GGC	2	6	620168	620173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33865170
13040	NC_005070	GATC	2	8	620209	620216	25 %	25 %	25 %	25 %	33865171
13041	NC_005070	GGC	2	6	620258	620263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33865171
13042	NC_005070	GCA	2	6	620446	620451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33865171
13043	NC_005070	C	6	6	620513	620518	0 %	0 %	0 %	100 %	33865171
13044	NC_005070	TGGG	2	8	620589	620596	0 %	25 %	75 %	0 %	33865171
13045	NC_005070	CAG	2	6	620645	620650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33865171
13046	NC_005070	CAGCC	2	10	620657	620666	20 %	0 %	20 %	60 %	33865171
13047	NC_005070	CAG	2	6	620681	620686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33865171
13048	NC_005070	AGC	2	6	620709	620714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33865171
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13050	NC_005070	GTCG	2	8	620953	620960	0 %	25 %	50 %	25 %	33865171
13051	NC_005070	TGA	2	6	621028	621033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33865171
13052	NC_005070	GCA	2	6	621091	621096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33865171
13053	NC_005070	CTG	2	6	621101	621106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33865171
13054	NC_005070	TC	3	6	621214	621219	0 %	50 %	0 %	50 %	33865171
13055	NC_005070	AGC	2	6	621230	621235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33865171
13056	NC_005070	ATC	2	6	621314	621319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33865171
13057	NC_005070	GCCC	2	8	621344	621351	0 %	0 %	25 %	75 %	33865171
13058	NC_005070	GCA	2	6	621410	621415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33865171
13059	NC_005070	TGA	2	6	621462	621467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33865171
13060	NC_005070	GTT	2	6	621479	621484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33865171
13061	NC_005070	GA	3	6	621485	621490	50 %	0 %	50 %	0 %	33865171
13062	NC_005070	ATGC	2	8	621608	621615	25 %	25 %	25 %	25 %	33865171
13063	NC_005070	GCCT	2	8	621621	621628	0 %	25 %	25 %	50 %	33865172
13064	NC_005070	TGC	2	6	621645	621650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33865172
13065	NC_005070	TGC	2	6	621682	621687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33865172
13066	NC_005070	GCC	2	6	621720	621725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33865172
13067	NC_005070	CTG	2	6	621881	621886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33865172
13068	NC_005070	AGG	2	6	621955	621960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33865172
13069	NC_005070	AGGCTC	2	12	621967	621978	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	33865172
13070	NC_005070	GGGC	2	8	622097	622104	0 %	0 %	75 %	25 %	33865172
13071	NC_005070	ACT	2	6	622372	622377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33865173
13072	NC_005070	TCG	2	6	622528	622533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33865173
13073	NC_005070	GTCTTC	2	12	622601	622612	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	33865173
13074	NC_005070	AATC	2	8	622771	622778	50 %	25 %	0 %	25 %	33865173
13075	NC_005070	GCTT	2	8	622779	622786	0 %	50 %	25 %	25 %	33865173
13076	NC_005070	T	6	6	622803	622808	0 %	100 %	0 %	0 %	33865173
13077	NC_005070	AC	3	6	622818	622823	50 %	0 %	0 %	50 %	33865173
13078	NC_005070	TGC	2	6	622863	622868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33865173
13079	NC_005070	CTTG	2	8	622936	622943	0 %	50 %	25 %	25 %	33865173
13080	NC_005070	TG	3	6	622942	622947	0 %	50 %	50 %	0 %	33865173
13081	NC_005070	ACT	2	6	622972	622977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33865173
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13085	NC_005070	GCC	2	6	623276	623281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33865174
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13088	NC_005070	TGA	2	6	623468	623473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33865174
13089	NC_005070	AGC	2	6	623488	623493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33865174
13090	NC_005070	CTG	2	6	623572	623577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33865174
13091	NC_005070	TGC	2	6	623579	623584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33865174
13092	NC_005070	TAA	2	6	623594	623599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33865174
13093	NC_005070	TCT	2	6	623603	623608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33865174
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13099	NC_005070	TAAA	2	8	623971	623978	75 %	25 %	0 %	0 %	33865174
13100	NC_005070	GTCAGC	2	12	624076	624087	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	33865174
13101	NC_005070	AAGC	2	8	624107	624114	50 %	0 %	25 %	25 %	33865174
13102	NC_005070	AGG	2	6	624200	624205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33865174
13103	NC_005070	GCG	2	6	624224	624229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33865174
13104	NC_005070	CTG	2	6	624416	624421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33865175
13105	NC_005070	CTT	2	6	624433	624438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33865175
13106	NC_005070	CGA	2	6	624468	624473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33865175
13107	NC_005070	TTCC	2	8	624491	624498	0 %	50 %	0 %	50 %	33865175
13108	NC_005070	AAGC	2	8	624533	624540	50 %	0 %	25 %	25 %	33865175
13109	NC_005070	TGA	2	6	624547	624552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33865175
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13111	NC_005070	GAA	2	6	624658	624663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33865175
13112	NC_005070	AG	3	6	624665	624670	50 %	0 %	50 %	0 %	33865175
13113	NC_005070	TGC	2	6	624694	624699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33865175
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13119	NC_005070	TTCT	2	8	625191	625198	0 %	75 %	0 %	25 %	33865175
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13245	NC_005070	ATG	2	6	631459	631464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33865179
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13353	NC_005070	AGA	2	6	636824	636829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33865184
13354	NC_005070	GAGCA	2	10	636857	636866	40 %	0 %	40 %	20 %	33865184
13355	NC_005070	GGA	2	6	636912	636917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33865184
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13361	NC_005070	CGC	2	6	637134	637139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33865184
13362	NC_005070	AGCC	2	8	637151	637158	25 %	0 %	25 %	50 %	33865184
13363	NC_005070	CCAG	2	8	637174	637181	25 %	0 %	25 %	50 %	33865184
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13485	NC_005070	GCC	2	6	641868	641873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33865189
13486	NC_005070	TGC	2	6	641928	641933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33865189
13487	NC_005070	GGA	2	6	641989	641994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33865190
13488	NC_005070	GGAA	2	8	642096	642103	50 %	0 %	50 %	0 %	33865190
13489	NC_005070	CGGC	2	8	642137	642144	0 %	0 %	50 %	50 %	33865190
13490	NC_005070	AGC	2	6	642174	642179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33865190
13491	NC_005070	AGC	2	6	642195	642200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33865190
13492	NC_005070	CGC	2	6	642251	642256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33865190
13493	NC_005070	CCTGG	2	10	642277	642286	0 %	20 %	40 %	40 %	33865190
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13495	NC_005070	ATC	2	6	642470	642475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33865191
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