MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 plasmid pCP301

Total Repeats: 3479

< Previous1234567Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_004851	AAAG	2	8	125035	125042	75 %	0 %	25 %	0 %	31983567
2002	NC_004851	ATA	2	6	125100	125105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31983567
2003	NC_004851	TTC	2	6	125143	125148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31983567
2004	NC_004851	AGTC	2	8	125252	125259	25 %	25 %	25 %	25 %	31983567
2005	NC_004851	TAA	2	6	125272	125277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31983567
2006	NC_004851	TTG	2	6	125354	125359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31983567
2007	NC_004851	GGT	2	6	125363	125368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31983567
2008	NC_004851	ATA	2	6	125396	125401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31983567
2009	NC_004851	TC	3	6	125413	125418	0 %	50 %	0 %	50 %	31983567
2010	NC_004851	TTA	2	6	125521	125526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983567
2011	NC_004851	AAT	2	6	125584	125589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31983567
2012	NC_004851	ACT	2	6	125600	125605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983567
2013	NC_004851	ACTA	2	8	125646	125653	50 %	25 %	0 %	25 %	31983567
2014	NC_004851	CATT	2	8	125706	125713	25 %	50 %	0 %	25 %	31983568
2015	NC_004851	GAT	2	6	125741	125746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983568
2016	NC_004851	CTG	2	6	125757	125762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983568
2017	NC_004851	TGGCT	2	10	125779	125788	0 %	40 %	40 %	20 %	31983568
2018	NC_004851	TGA	2	6	125812	125817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983568
2019	NC_004851	AGA	2	6	125849	125854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31983568
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2021	NC_004851	AGAC	2	8	125992	125999	50 %	0 %	25 %	25 %	31983568
2022	NC_004851	TGAA	2	8	126054	126061	50 %	25 %	25 %	0 %	31983568
2023	NC_004851	CTG	2	6	126072	126077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983568
2024	NC_004851	ATT	2	6	126088	126093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983568
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2030	NC_004851	CAA	2	6	126249	126254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31983568
2031	NC_004851	TA	3	6	126263	126268	50 %	50 %	0 %	0 %	31983568
2032	NC_004851	AATT	2	8	126399	126406	50 %	50 %	0 %	0 %	31983568
2033	NC_004851	GAT	2	6	126415	126420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983568
2034	NC_004851	GAA	2	6	126445	126450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31983568
2035	NC_004851	AGC	2	6	126495	126500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983568
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2037	NC_004851	AT	3	6	126517	126522	50 %	50 %	0 %	0 %	31983568
2038	NC_004851	AAGTGA	2	12	126535	126546	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	31983568
2039	NC_004851	ATCT	2	8	126615	126622	25 %	50 %	0 %	25 %	31983568
2040	NC_004851	AT	3	6	126645	126650	50 %	50 %	0 %	0 %	31983568
2041	NC_004851	AGTGAA	2	12	126656	126667	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	31983568
2042	NC_004851	AAGA	2	8	126716	126723	75 %	0 %	25 %	0 %	31983568
2043	NC_004851	AAGT	2	8	126771	126778	50 %	25 %	25 %	0 %	31983569
2044	NC_004851	AATT	2	8	126789	126796	50 %	50 %	0 %	0 %	31983569
2045	NC_004851	TTG	2	6	126855	126860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31983569
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2047	NC_004851	TTG	2	6	126959	126964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31983569
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2049	NC_004851	GATGCG	2	12	127022	127033	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	31983569
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2051	NC_004851	T	6	6	127098	127103	0 %	100 %	0 %	0 %	31983569
2052	NC_004851	TGT	2	6	127114	127119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31983569
2053	NC_004851	GCT	2	6	127166	127171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983569
2054	NC_004851	ATT	2	6	127235	127240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983569
2055	NC_004851	AAAG	2	8	127256	127263	75 %	0 %	25 %	0 %	31983569
2056	NC_004851	CAT	2	6	127348	127353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983569
2057	NC_004851	TAT	2	6	127354	127359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983569
2058	NC_004851	AGG	2	6	127375	127380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	31983569
2059	NC_004851	ACTA	2	8	127444	127451	50 %	25 %	0 %	25 %	31983569
2060	NC_004851	TC	3	6	127467	127472	0 %	50 %	0 %	50 %	31983569
2061	NC_004851	ATA	2	6	127539	127544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31983569
2062	NC_004851	T	6	6	127643	127648	0 %	100 %	0 %	0 %	31983569
2063	NC_004851	T	7	7	127650	127656	0 %	100 %	0 %	0 %	31983569
2064	NC_004851	TAT	2	6	127688	127693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983569
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2068	NC_004851	ATA	2	6	127767	127772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31983569
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2096	NC_004851	TTG	2	6	129360	129365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31983538
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2098	NC_004851	A	6	6	129396	129401	100 %	0 %	0 %	0 %	31983538
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2104	NC_004851	T	6	6	129631	129636	0 %	100 %	0 %	0 %	31983538
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2109	NC_004851	A	7	7	129839	129845	100 %	0 %	0 %	0 %	31983538
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2113	NC_004851	T	6	6	129932	129937	0 %	100 %	0 %	0 %	31983538
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