MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 2457T

Total Repeats: 72410

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35501	NC_004741	TGA	2	6	2287260	2287265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30063631
35502	NC_004741	CGG	2	6	2287290	2287295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30063631
35503	NC_004741	TCCATC	2	12	2287338	2287349	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	30063631
35504	NC_004741	GC	3	6	2287400	2287405	0 %	0 %	50 %	50 %	30063631
35505	NC_004741	TCA	2	6	2287422	2287427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30063631
35506	NC_004741	TTATT	2	10	2287437	2287446	20 %	80 %	0 %	0 %	30063631
35507	NC_004741	CGT	2	6	2287499	2287504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30063631
35508	NC_004741	CG	3	6	2287513	2287518	0 %	0 %	50 %	50 %	30063631
35509	NC_004741	TTAT	2	8	2287535	2287542	25 %	75 %	0 %	0 %	30063631
35510	NC_004741	GC	3	6	2287612	2287617	0 %	0 %	50 %	50 %	30063631
35511	NC_004741	ACT	2	6	2287818	2287823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30063631
35512	NC_004741	ATTA	2	8	2287993	2288000	50 %	50 %	0 %	0 %	30063631
35513	NC_004741	TCA	2	6	2288039	2288044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30063631
35514	NC_004741	TTG	2	6	2288078	2288083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30063631
35515	NC_004741	CTGG	2	8	2288149	2288156	0 %	25 %	50 %	25 %	30063631
35516	NC_004741	AAG	2	6	2288169	2288174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30063631
35517	NC_004741	TTTC	2	8	2288196	2288203	0 %	75 %	0 %	25 %	30063631
35518	NC_004741	GAC	2	6	2288219	2288224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30063631
35519	NC_004741	CAG	2	6	2288231	2288236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30063631
35520	NC_004741	GGCA	2	8	2288263	2288270	25 %	0 %	50 %	25 %	30063631
35521	NC_004741	GGT	2	6	2288335	2288340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30063631
35522	NC_004741	GAA	2	6	2288381	2288386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30063631
35523	NC_004741	CTGA	2	8	2288468	2288475	25 %	25 %	25 %	25 %	30063631
35524	NC_004741	TGA	2	6	2288487	2288492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30063631
35525	NC_004741	CTG	2	6	2288510	2288515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30063631
35526	NC_004741	CTG	2	6	2288592	2288597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30063631
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35529	NC_004741	ATTA	2	8	2288767	2288774	50 %	50 %	0 %	0 %	30063631
35530	NC_004741	CTGA	2	8	2289088	2289095	25 %	25 %	25 %	25 %	30063632
35531	NC_004741	CAT	2	6	2289167	2289172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30063632
35532	NC_004741	CGG	2	6	2289233	2289238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30063632
35533	NC_004741	CGT	2	6	2289258	2289263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30063632
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35535	NC_004741	CG	3	6	2289339	2289344	0 %	0 %	50 %	50 %	30063632
35536	NC_004741	ATGG	2	8	2289516	2289523	25 %	25 %	50 %	0 %	30063632
35537	NC_004741	CAC	2	6	2289546	2289551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30063632
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35539	NC_004741	TTC	2	6	2289693	2289698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30063632
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35542	NC_004741	CACG	2	8	2289851	2289858	25 %	0 %	25 %	50 %	30063632
35543	NC_004741	GC	3	6	2289935	2289940	0 %	0 %	50 %	50 %	30063632
35544	NC_004741	CAA	2	6	2290007	2290012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30063632
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35550	NC_004741	TGG	2	6	2290220	2290225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30063632
35551	NC_004741	CAT	2	6	2290284	2290289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30063632
35552	NC_004741	TCG	2	6	2290346	2290351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30063632
35553	NC_004741	ATG	2	6	2290366	2290371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30063632
35554	NC_004741	AAG	2	6	2290436	2290441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30063632
35555	NC_004741	CCA	2	6	2290466	2290471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30063632
35556	NC_004741	ATTT	2	8	2290488	2290495	25 %	75 %	0 %	0 %	30063632
35557	NC_004741	CAT	2	6	2290520	2290525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30063632
35558	NC_004741	CTGA	2	8	2290531	2290538	25 %	25 %	25 %	25 %	30063632
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35560	NC_004741	TCA	2	6	2290720	2290725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30063632
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35562	NC_004741	CAT	2	6	2290775	2290780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30063632
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35568	NC_004741	CCAT	2	8	2290915	2290922	25 %	25 %	0 %	50 %	30063632
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35584	NC_004741	TAT	2	6	2291444	2291449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30063632
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35601	NC_004741	T	7	7	2293190	2293196	0 %	100 %	0 %	0 %	30063634
35602	NC_004741	TCT	2	6	2293235	2293240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30063634
35603	NC_004741	CTG	2	6	2293306	2293311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30063634
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35605	NC_004741	GTA	2	6	2293345	2293350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30063634
35606	NC_004741	GCCA	2	8	2293357	2293364	25 %	0 %	25 %	50 %	30063634
35607	NC_004741	CCA	2	6	2293374	2293379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30063634
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35964	NC_004741	CAACAT	2	12	2312603	2312614	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	30063654
35965	NC_004741	TCG	3	9	2312629	2312637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30063654
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35968	NC_004741	CCCAA	2	10	2312759	2312768	40 %	0 %	0 %	60 %	30063654
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35972	NC_004741	ACC	2	6	2312844	2312849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30063654
35973	NC_004741	TCA	2	6	2312890	2312895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30063654
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