MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 2457T

Total Repeats: 72410

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_004741	GCC	2	6	164352	164357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061713
3002	NC_004741	GCTG	2	8	164358	164365	0 %	25 %	50 %	25 %	30061713
3003	NC_004741	GTG	2	6	164382	164387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061713
3004	NC_004741	CG	3	6	164392	164397	0 %	0 %	50 %	50 %	30061713
3005	NC_004741	GCT	3	9	164434	164442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061713
3006	NC_004741	CGA	2	6	164469	164474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061713
3007	NC_004741	TTG	2	6	164496	164501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30061713
3008	NC_004741	GAT	2	6	164527	164532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061713
3009	NC_004741	GACG	2	8	164541	164548	25 %	0 %	50 %	25 %	30061713
3010	NC_004741	CA	3	6	164553	164558	50 %	0 %	0 %	50 %	30061713
3011	NC_004741	TGG	2	6	164574	164579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061713
3012	NC_004741	CTG	2	6	164588	164593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061713
3013	NC_004741	TTCCA	2	10	164628	164637	20 %	40 %	0 %	40 %	30061713
3014	NC_004741	CGG	2	6	164643	164648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061713
3015	NC_004741	GCT	2	6	164650	164655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061713
3016	NC_004741	GCA	2	6	164773	164778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061714
3017	NC_004741	CAT	2	6	164871	164876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061714
3018	NC_004741	GAA	2	6	164880	164885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30061714
3019	NC_004741	AGA	2	6	164954	164959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30061714
3020	NC_004741	ACC	2	6	164970	164975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061714
3021	NC_004741	CTT	2	6	165005	165010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30061714
3022	NC_004741	CAG	2	6	165021	165026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061714
3023	NC_004741	TTCA	2	8	165087	165094	25 %	50 %	0 %	25 %	30061714
3024	NC_004741	ACG	2	6	165189	165194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061714
3025	NC_004741	ACC	2	6	165195	165200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061714
3026	NC_004741	CCG	2	6	165223	165228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061714
3027	NC_004741	AAT	2	6	165269	165274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30061714
3028	NC_004741	TCA	2	6	165308	165313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061714
3029	NC_004741	GAT	2	6	165321	165326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061714
3030	NC_004741	TCG	2	6	165343	165348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061714
3031	NC_004741	GCG	2	6	165383	165388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061714
3032	NC_004741	TGCC	2	8	165404	165411	0 %	25 %	25 %	50 %	30061714
3033	NC_004741	CGA	2	6	165419	165424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061714
3034	NC_004741	TGGC	2	8	165540	165547	0 %	25 %	50 %	25 %	30061714
3035	NC_004741	CAG	2	6	165579	165584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061714
3036	NC_004741	AAC	2	6	165605	165610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30061714
3037	NC_004741	TCG	2	6	165671	165676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061714
3038	NC_004741	TCGG	2	8	165760	165767	0 %	25 %	50 %	25 %	30061714
3039	NC_004741	CGG	2	6	165791	165796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061714
3040	NC_004741	GCC	2	6	165936	165941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061714
3041	NC_004741	CG	3	6	165992	165997	0 %	0 %	50 %	50 %	30061714
3042	NC_004741	CAG	2	6	166283	166288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061715
3043	NC_004741	CG	3	6	166291	166296	0 %	0 %	50 %	50 %	30061715
3044	NC_004741	CTT	2	6	166325	166330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30061715
3045	NC_004741	GGC	2	6	166366	166371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061715
3046	NC_004741	GTC	2	6	166373	166378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061715
3047	NC_004741	GCTG	2	8	166393	166400	0 %	25 %	50 %	25 %	30061715
3048	NC_004741	CTG	2	6	166464	166469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061715
3049	NC_004741	CGG	2	6	166509	166514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061715
3050	NC_004741	TGG	2	6	166622	166627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061715
3051	NC_004741	CGG	2	6	166669	166674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061715
3052	NC_004741	CGG	2	6	166714	166719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061715
3053	NC_004741	TGA	2	6	166762	166767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061715
3054	NC_004741	GCT	2	6	166780	166785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061715
3055	NC_004741	TGC	3	9	166795	166803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061715
3056	NC_004741	GCTG	2	8	166807	166814	0 %	25 %	50 %	25 %	30061715
3057	NC_004741	CGC	2	6	166827	166832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061715
3058	NC_004741	TAT	2	6	166849	166854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30061715
3059	NC_004741	TATT	2	8	166905	166912	25 %	75 %	0 %	0 %	30061715
3060	NC_004741	TTGA	2	8	166964	166971	25 %	50 %	25 %	0 %	30061715
3061	NC_004741	TAT	2	6	167029	167034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30061715
3062	NC_004741	TAA	2	6	167059	167064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30061715
3063	NC_004741	TGC	2	6	167088	167093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061715
3064	NC_004741	CGG	2	6	167104	167109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061715
3065	NC_004741	G	6	6	167134	167139	0 %	0 %	100 %	0 %	30061715
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3067	NC_004741	GCG	2	6	167193	167198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061715
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3069	NC_004741	ACC	2	6	167279	167284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061715
3070	NC_004741	GC	3	6	167304	167309	0 %	0 %	50 %	50 %	30061715
3071	NC_004741	GGC	2	6	167446	167451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061715
3072	NC_004741	CG	3	6	167459	167464	0 %	0 %	50 %	50 %	30061715
3073	NC_004741	TTCTGG	2	12	167481	167492	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	30061715
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3076	NC_004741	GC	3	6	167600	167605	0 %	0 %	50 %	50 %	30061715
3077	NC_004741	CAGC	2	8	167655	167662	25 %	0 %	25 %	50 %	30061715
3078	NC_004741	TGA	2	6	167761	167766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061716
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3080	NC_004741	CAA	2	6	167803	167808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30061716
3081	NC_004741	TGA	2	6	167908	167913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061716
3082	NC_004741	TGG	2	6	167961	167966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061716
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3084	NC_004741	TGCGGT	2	12	168071	168082	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	30061716
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3087	NC_004741	TAA	2	6	168274	168279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30061717
3088	NC_004741	CCG	2	6	168298	168303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061717
3089	NC_004741	ATA	2	6	168304	168309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30061717
3090	NC_004741	CGC	2	6	168380	168385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061717
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3092	NC_004741	TGT	2	6	168839	168844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30061718
3093	NC_004741	ATA	2	6	168854	168859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30061718
3094	NC_004741	GGTCC	2	10	168951	168960	0 %	20 %	40 %	40 %	30061718
3095	NC_004741	T	6	6	169141	169146	0 %	100 %	0 %	0 %	30061718
3096	NC_004741	CAG	2	6	169189	169194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061718
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3100	NC_004741	TGA	2	6	169527	169532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061718
3101	NC_004741	CG	3	6	169533	169538	0 %	0 %	50 %	50 %	30061718
3102	NC_004741	GCG	2	6	169541	169546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061718
3103	NC_004741	ACA	2	6	169728	169733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30061719
3104	NC_004741	TGA	2	6	169843	169848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061719
3105	NC_004741	CGC	2	6	169855	169860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061719
3106	NC_004741	CGT	2	6	170002	170007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061719
3107	NC_004741	TAA	2	6	170083	170088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30061719
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3109	NC_004741	CCG	2	6	170211	170216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061719
3110	NC_004741	GCA	2	6	170251	170256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061719
3111	NC_004741	CTT	3	9	170263	170271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30061719
3112	NC_004741	ATG	2	6	170283	170288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061719
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3114	NC_004741	A	8	8	170403	170410	100 %	0 %	0 %	0 %	30061720
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3123	NC_004741	AGC	2	6	170769	170774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061720
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3232	NC_004741	CA	4	8	177597	177604	50 %	0 %	0 %	50 %	30061724
3233	NC_004741	TGGCGC	2	12	177610	177621	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	30061724
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3241	NC_004741	TCG	2	6	178048	178053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061724
3242	NC_004741	GCA	3	9	178088	178096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061724
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3245	NC_004741	GAC	2	6	178242	178247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061724
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3247	NC_004741	AAG	2	6	178321	178326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30061724
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3249	NC_004741	GCC	2	6	178407	178412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061724
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3355	NC_004741	CATGG	2	10	184800	184809	20 %	20 %	40 %	20 %	30061730
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3364	NC_004741	CAA	2	6	185507	185512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30061731
3365	NC_004741	TAG	2	6	185543	185548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061731
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3369	NC_004741	GCA	2	6	185819	185824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061731
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3371	NC_004741	ACTTT	2	10	185972	185981	20 %	60 %	0 %	20 %	30061731
3372	NC_004741	CGT	2	6	186054	186059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061731
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3487	NC_004741	CA	3	6	193061	193066	50 %	0 %	0 %	50 %	30061738
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3490	NC_004741	CAA	2	6	193398	193403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30061738
3491	NC_004741	GAC	2	6	193432	193437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061738
3492	NC_004741	ATC	2	6	193444	193449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061738
3493	NC_004741	GGC	2	6	193450	193455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061738
3494	NC_004741	CAT	2	6	193479	193484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061738
3495	NC_004741	GGC	2	6	193504	193509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061738
3496	NC_004741	CCT	2	6	193534	193539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	30061738
3497	NC_004741	CG	3	6	193760	193765	0 %	0 %	50 %	50 %	30061738
3498	NC_004741	TGAC	2	8	193780	193787	25 %	25 %	25 %	25 %	30061739
3499	NC_004741	TTG	2	6	193891	193896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30061739
3500	NC_004741	GAA	2	6	193950	193955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30061739

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